猪源肠出血性大肠杆菌的分离、鉴定及特性研究 被引量：6

1

作者 满晓营 吴斌 +5 位作者 张璇 余腾 罗勇 刘峰 金梅林 陈焕春 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期984-987,共4页

目的探讨猪源肠出血性大肠埃希菌病原学特征。方法对所分离的菌株进行生化鉴定、药敏试验,并使用聚合酶链反应(PCR)技术检测毒力基因、耐药基因,同时对致病性的菌株进行外膜蛋白分型、REP-PCR和ERIC-PCR分析。结果从315株大肠杆菌中筛... 目的探讨猪源肠出血性大肠埃希菌病原学特征。方法对所分离的菌株进行生化鉴定、药敏试验,并使用聚合酶链反应(PCR)技术检测毒力基因、耐药基因,同时对致病性的菌株进行外膜蛋白分型、REP-PCR和ERIC-PCR分析。结果从315株大肠杆菌中筛选到山梨醇阴性的EHEC21株,其中含有stx1基因的菌株有4株,含有stx2基因3株,含有eae基因的17株,外膜蛋白分型属于三个型,其中OMP-1型最多,有15株,OMP-2型3株,OMP-3型3株,REP-PCR和ERIC-PCR结果显示这些致病性菌株带型差异性较大,分属于不同的亚群。结论华中地区是养殖业比较发达的地区,而且人均消费猪肉比例也较高,EHEC的存在对人是一种潜在的威胁,应加强监测力度,防止该菌在人群中感染和流行。 展开更多

关键词 肠出血性大肠杆菌 外膜蛋白 肠杆菌基因间重复一致序列聚合酶链式反应(ERIC-PCR)和重复一致回文序列 聚合酶链式反应(REP—PCR)

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仔猪黄白痢大肠杆菌耐药性检测及ERIC图谱分析 被引量：8

2

作者 陈俭 姜中其 唐一鸣 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期125-132,共8页

以47株黄白痢临床分离大肠杆菌为材料，通过Kirby-Bauer法检测细菌耐药表型并用PCR扩增I型整合酶基因，进而对不同耐药谱菌株进行以肠杆菌科基因间重复一致序列为引物的聚合酶链反应（ERIC-PCR）基因分型并用统计分析软件SPSS16，0聚类... 以47株黄白痢临床分离大肠杆菌为材料，通过Kirby-Bauer法检测细菌耐药表型并用PCR扩增I型整合酶基因，进而对不同耐药谱菌株进行以肠杆菌科基因间重复一致序列为引物的聚合酶链反应（ERIC-PCR）基因分型并用统计分析软件SPSS16，0聚类．耐药表型检测结果显示：47株大肠杆菌均呈多重耐药，共9种耐药表型；I型整合子阳性菌株检出率为95．7％（45／47）；ERIC-PCR扩增出现稳定可重复的基因指纹图谱，耐9～13种药物菌株（85．1％，40／47）的ERIC指纹图谱分别显示出2种主要谱型，各代表1个猪场的菌株类型．聚类分析提示，相同耐药谱的来自同一猪场和不同猪场分离株的平均相似率分别为68．7％和53．5％，显著高于47株菌的平均相似率37．3％．说明菌株耐药性可能与特定的ERIC指纹图谱相关，ERIC指纹图谱分析可作为考察猪源致病性大肠杆菌多重耐药表型与基因型特征的新视角． 展开更多

关键词 大肠杆菌 耐药表型 肠杆菌科基因间重复一致(ERIC)序列 聚类分析

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大肠埃希菌耐药谱型、基因型和生物膜表型关系研究 被引量：7

3

作者 陈朝喜 朱恒乾 +1 位作者 廖晓萍 刘雅红 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2011年第4期59-62,共4页

以ATCC25922为研究对象,采用改良结晶紫染色,快速银染法和扫描电镜技术对其生物被膜进行定量和定性研究,建立大肠埃希菌生物被膜体外模型,利用优化的模型条件对249株临床分离株进行验证。采用琼脂平板计数法绘制大肠埃希菌浮游菌和被膜... 以ATCC25922为研究对象,采用改良结晶紫染色,快速银染法和扫描电镜技术对其生物被膜进行定量和定性研究,建立大肠埃希菌生物被膜体外模型,利用优化的模型条件对249株临床分离株进行验证。采用琼脂平板计数法绘制大肠埃希菌浮游菌和被膜菌生长曲线,比较其生长特性的异同。对不同成膜能力的大肠埃希菌临床分离株进行色氨酸定量试验,分析不同培养条件对生物被膜菌胞外基质分泌量的影响。快速银染法和扫描电镜定性研究结果表明,大肠埃希菌形成生物被膜后,形成一种浮游细菌和生物被膜细菌共同分布于同一生存空间内的特殊生理结构;不同稀释度的接种量对细菌生物被膜生物量的变化影响不显著(P>0.05)。249株大肠埃希菌分为强成膜能力、中等成膜能力、弱成膜能力和无成膜能力4个表型,分别占3.21%、18.88%、51.81%、26.10%。 展开更多

关键词 耐药谱型 生物被膜表型 基因型 肠杆菌基因间重复一致序列聚合酶链反应

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青岛两所医院鲍曼不动杆菌碳青霉烯酶基因及同源性分析 被引量：4

4

作者 李茜 李庆淑 +2 位作者 李智 曲彦 胡丹 《中国感染控制杂志》 CAS 北大核心 2015年第7期437-442,共6页

目的了解青岛市两所医院鲍曼不动杆菌(AB)耐药情况、分布特征,碳青霉烯酶基因携带情况。方法收集两所医院临床分离的145株(A院78株,B院67株)AB进行药敏试验,采用聚合酶链反应(PCR)扩增碳青霉烯酶基因,肠杆菌科基因间一致重复序列(ERIC)-... 目的了解青岛市两所医院鲍曼不动杆菌(AB)耐药情况、分布特征,碳青霉烯酶基因携带情况。方法收集两所医院临床分离的145株(A院78株,B院67株)AB进行药敏试验,采用聚合酶链反应(PCR)扩增碳青霉烯酶基因,肠杆菌科基因间一致重复序列(ERIC)-PCR对菌株进行同源性分析。结果 A院AB对临床常用的16种抗菌药物普遍耐药,对头孢哌酮/舒巴坦耐药率最低(3.85%),其次是米诺环素(16.67%),对其他抗菌药物耐药率均>73%。B院AB对常用的23种抗菌药物普遍耐药,对米诺环素和替加环素均不耐药,对阿米卡星和左氧氟沙星的耐药率分别为23.88%、38.81%,对其他抗菌药物的耐药率均>64%。两院所有菌株均携带OXA-51基因,A、B两院碳青霉烯耐药组OXA-23基因的携带率分别为86.76%(59/68),56.67%(34/60),差异有统计学意义(χ2=14.53,P<0.001);A院3株菌携带OXA-58基因,B院未检出OXA-58基因。145菌株共分为8个基因型,其中A型71株和E型37株,为主要流行株;A院主要流行A型(46.15%)和E型(41.03%),B院主要流行A型(52.24%)和C型(17.91%)。结论两所医院临床分离的AB耐药情况严重,且存在医院流行,OXA型酶OXA-23、OXA-51基因在介导AB对碳青霉烯类药物耐药中发挥重要作用。 展开更多

关键词 鲍曼不动杆菌 碳青霉烯酶 多重耐药 抗药性 微生物 肠杆菌科基因间重复序列-聚合酶链反应

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进口蜂蜜中幼虫芽孢杆菌分子分型方法的比较研究

5

作者 俞佳 高有领 +6 位作者 王建峰 赵秀玲 李如松 王春 杨伯龙 于纪棉 江玲丽 《动物医学进展》 北大核心 2024年第8期78-82,共5页

为研究来自不同地域幼虫芽孢杆菌的进化关系,建立其分子分型方法,对来自11个国家和地区的50株幼虫芽孢杆菌分离株进行MLST分型分析,并与ERIC分型比较。结果显示,ERIC法将50株分离株分为ERICⅠ、ERICⅡ与ERICⅣ型,但不能区分不同区域菌株... 为研究来自不同地域幼虫芽孢杆菌的进化关系,建立其分子分型方法,对来自11个国家和地区的50株幼虫芽孢杆菌分离株进行MLST分型分析,并与ERIC分型比较。结果显示,ERIC法将50株分离株分为ERICⅠ、ERICⅡ与ERICⅣ型,但不能区分不同区域菌株;MLST法将菌株分为ST1至ST8共8种序列型,其中ST1为优势型,占比高且分布广泛;其次为ST5(主要为加拿大分离株),ST3(澳大利亚分离株),ST4(法国与匈牙利分离株),ST6(新西兰分离株),ST2(西班牙分离株),ST7(匈牙利分离株)和ST8(澳大利亚分离株)。与ERIC相比,MLST可以对不同地域的幼虫芽孢杆菌进行有效分型,具有更高的分辨率,可作为后续进口蜂蜜中幼虫芽孢杆菌流行病学调查的工具。 展开更多

关键词 幼虫芽孢杆菌 多位点序列分型 管家基因 肠杆菌基因间重复共有序列分型

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猕猴肠道菌群基因组DNA提取及其ERIC-PCR分析

6

作者 张蒙 《四川畜牧兽医》 2018年第3期27-29,共3页

本试验采用反复冻融法、酶裂解法和试剂盒法分别提取猕猴肠道菌群的总DNA,根据提取的DNA浓度和纯度最终确定酶裂解法为较好的方法。将酶裂解法提取的DNA进行ERIC-PCR扩增,结果显示:同年龄组猕猴粪样的ERIC条带数量和位置变化不大;幼年... 本试验采用反复冻融法、酶裂解法和试剂盒法分别提取猕猴肠道菌群的总DNA,根据提取的DNA浓度和纯度最终确定酶裂解法为较好的方法。将酶裂解法提取的DNA进行ERIC-PCR扩增,结果显示:同年龄组猕猴粪样的ERIC条带数量和位置变化不大;幼年组猕猴的菌群种类较丰富,但优势菌群不明显;青年组猕猴的菌群种类和优势菌群最为丰富;老年组猕猴的菌群种类最少。 展开更多

关键词 肠道菌群 总DNA提取 酶裂解法 肠杆菌基因间重复共有序列

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肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性分析及ERIC-PCR分型 被引量：10

7

作者 李楠 赵思俊 +7 位作者 王娟 赵建梅 李玉清 黄秀梅 王君玮 丁宜宝 刘焕奇 曲志娜 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第3期120-124,共5页

目的：了解肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性情况以及各生产环节菌株间亲缘关系,为临床用药及菌株追踪溯源提供依据。方法：采用微量肉汤稀释法对171株肠炎沙门氏菌进行13种抗菌药物药敏实验;采用肠杆菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反... 目的：了解肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性情况以及各生产环节菌株间亲缘关系,为临床用药及菌株追踪溯源提供依据。方法：采用微量肉汤稀释法对171株肠炎沙门氏菌进行13种抗菌药物药敏实验;采用肠杆菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应（enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR）法对33株不同生产环节耐药菌株进行分子分型;采用SPSS 20.0软件、Gel-Pro Analyer 4.0和NTSYS pc 2.1软件进行分析。结果：171株肠炎沙门氏菌对13种药物耐药情况不同,其中对氨苄西林耐药情况最严重,耐药率高达90.06%,对恩诺沙星、氧氟沙星最为敏感,耐药率均仅为5.26%;不同环节间耐药性差异极显著（P〈0.01）;多重耐药率高达95.32%,共有26种耐药谱型。不同环节的33株肠炎沙门氏菌分为4种（Ⅰ~Ⅳ）基因型,遗传相似性在66%~100%,Ⅰ型为优势基因型;基因型相同的菌株耐药谱不一定相同,反之,耐药谱相同的菌株基因型不一定相同。结论：肉鸡生产链条中沙门氏菌对多种抗菌药物产生耐药性,且耐药谱种类繁多;沙门氏菌能够沿着生产链进行水平传播,肉鸡场环节菌株基因型相对复杂,菌株基因型与耐药表型之间无明显相关性。 展开更多

关键词 肠炎沙门氏菌 肉鸡 耐药性 肠杆菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应

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长沙地区临床分离碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌的分子流行病学特征 被引量：17

8

作者 梁伟 邹明祥 +4 位作者 邬靖敏 邬国军 李军 豆清娅 刘文恩 《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期521-526,共6页

目的:了解长沙地区临床分离鲍曼不动杆菌的耐药性,探讨碳青霉烯类抗生素耐药菌株的分子流行病学特征。方法:收集长沙地区10所综合性医院2010年3月至2010年12月间临床分离的非重复鲍曼不动杆菌株205株;采用K-B法检测药物敏感性,改良双纸... 目的:了解长沙地区临床分离鲍曼不动杆菌的耐药性,探讨碳青霉烯类抗生素耐药菌株的分子流行病学特征。方法:收集长沙地区10所综合性医院2010年3月至2010年12月间临床分离的非重复鲍曼不动杆菌株205株;采用K-B法检测药物敏感性,改良双纸片协同试验检测金属β-内酰胺酶(金属酶),改良Hodge试验筛查碳青霉烯酶;PCR扩增OXA-23,OXA-24,OXA-51,OXA-58及IMP-1和VIM-2型碳青霉烯酶基因,并进行测序分析。应用肠杆菌科基因间一致重复序列聚合酶链反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus PCR,ERIC-PCR)对菌株进行DNA分型及同源性分析。结果:在监测的18种药物中,耐药率超过50%的达14种。其中哌拉西林耐药率最高(80.5%),头孢哌酮/舒巴坦耐药率最低(2.5%)。共筛选出耐碳青霉烯类药物鲍曼不动杆菌115株,其金属酶表型及基因检测均为阴性;改良Hodge试验阳性71株,其中64株OXA-23基因扩增阳性。115株菌株OXA-51均阳性,未检出OXA-24,OXA-58基因。115株菌株共分为7个ERIC基因型。其中A型19株,B型72株,为主要的流行克隆。结论:长沙地区临床分离鲍曼不动杆菌多重耐药十分严重;产OXA-23和OXA-51型碳青霉烯酶是鲍曼不动杆菌对碳青霉烯类药物耐药的重要机制,且碳青霉烯类耐药菌株存在克隆流行。 展开更多

关键词 鲍曼不动杆菌 碳青霉烯酶 肠杆菌基因间一致重复序列聚合酶链反应 分子流行病学特征

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副溶血性弧菌ERIC-PCR分型及毒力基因检测研究 被引量：12

9

作者 丁久法 潘迎捷 +4 位作者 陈洪友 唐明未 秦红友 赵勇 陈敏 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期137-141,共5页

目的:建立副溶血性弧菌ERIC-PCR分子分型技术,分析副溶血性弧菌标准菌株及分离株基因组DNAERIC-PCR指纹图谱,并对副溶血性弧菌毒力基因进行检测,以了解不同来源副溶血性弧菌毒力基因携带情况。方法:提取副溶血性弧菌基因组DNA,以肠杆菌... 目的:建立副溶血性弧菌ERIC-PCR分子分型技术,分析副溶血性弧菌标准菌株及分离株基因组DNAERIC-PCR指纹图谱,并对副溶血性弧菌毒力基因进行检测,以了解不同来源副溶血性弧菌毒力基因携带情况。方法:提取副溶血性弧菌基因组DNA,以肠杆菌基因间共有重复序列(ERIC)为引物进行PCR扩增,PCR产物经琼脂糖凝胶电泳后用凝胶成像分析仪对图谱进行观察分析,并以相似性系数构建聚类图;通过PCR方法对直接耐热溶血素(TDH)和耐热直接相关溶血素(TRH)进行检测。结果:26株副溶血性弧菌均可扩增产生可重复的DNA指纹图谱,ERIC-PCR可将26株菌分为12个型,分辨力指数为0.926;只在临床分离株中检测到TDH基因,而除一株标准菌株外,所有菌株都未检测到TRH基因。结论:研究显示ERIC-PCR可从分子水平对副溶血性弧菌基因组DNA进行快速指纹图谱分析,同时结合毒力基因检测,能够为副溶血性弧菌食物中毒疾病的预防和流行病学调查提供科学依据。 展开更多

关键词 副溶血性弧菌 肠杆菌基因间共有重复序列-PCR 基因分型 流行病学

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西安地区耐亚胺培南鲍曼不动杆菌的碳青霉烯酶及同源性研究 被引量：15

10

作者 刘原 谭湘淑 韩新鹏 《中国感染与化疗杂志》 CAS 2009年第1期37-41,共5页

目的调查西安地区耐亚胺培南鲍曼不动杆菌的耐药性,研究其同源性及分子耐药机制。方法收集西安地区6所三级甲等医院1年间临床分离的非重复鲍曼不动杆菌株146株,采用K-B法进行药敏试验,E试验检测金属酶(MBL),PCR扩增OXA-23,-24,-58,-51l... 目的调查西安地区耐亚胺培南鲍曼不动杆菌的耐药性,研究其同源性及分子耐药机制。方法收集西安地区6所三级甲等医院1年间临床分离的非重复鲍曼不动杆菌株146株,采用K-B法进行药敏试验,E试验检测金属酶(MBL),PCR扩增OXA-23,-24,-58,-51like型及IMP-1型和VIM-2型碳青霉烯酶基因,其阳性产物经测序分析,应用肠杆菌科基因组内重复序列(ERIC)-PCR对菌株进行DNA分型和同源性分析。结果筛选出对亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌(IRAB)非重复株15株,其中1株经E试验检测产金属酶,但扩增blaIMP-1,blaVIM-2均阴性,另外14株扩增blaOXA-66均阳性,11株blaOXA-23阳性,1株blaOXA-58阳性;ERIC-PCR将15株IRAB分为A型和B型,其中部分菌株的亲缘关系很近,同源性达90%以上。结论产OXA型碳青霉烯酶是西安地区该菌对亚胺培南耐药的主要原因,其中OXA-23型普遍存在,OXA-58型和OXA-66型基因在国内尚属新型碳青霉烯酶基因型;15株IRAB为2种克隆型,可能存在局部暴发流行。 展开更多

关键词 鲍曼不动杆菌 碳青霉烯酶 OXA-58 肠杆菌基因组内重复序列聚合酶链反应

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广西地区副猪嗜血杆菌ERIC-PCR指纹图谱分型研究 被引量：1

11

作者 彭昊 李军 +8 位作者 谢宇舟 马春霞 禤雄标 胡帅 杨威 许力干 谢永平 陈泽祥 潘艳 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2011年第11期49-52,共4页

为探讨肠道细菌基因间重复序列(ERIC)的聚合酶链反应(PCR)技术用于副猪嗜血杆菌基因分型的可行性,对分离自广西地区不同猪场的22株副猪嗜血杆菌进行ERIC-PCR指纹图谱分型研究。结果发现,22株分离株显示出12种指纹图谱,可以区分无法进行... 为探讨肠道细菌基因间重复序列(ERIC)的聚合酶链反应(PCR)技术用于副猪嗜血杆菌基因分型的可行性,对分离自广西地区不同猪场的22株副猪嗜血杆菌进行ERIC-PCR指纹图谱分型研究。结果发现,22株分离株显示出12种指纹图谱,可以区分无法进行血清分型的菌株。表明ERIC-PCR可适用于对副猪嗜血杆菌进行分子流行病学调查及基因分型快速诊断。 展开更多

关键词 副猪嗜血杆菌 基因间重复序列的聚合酶链反应 指纹图谱 分型

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呼吸重症监护病房2008～2011年鲍曼不动杆菌的耐药性变迁及同源性分析 被引量：5

12

作者 谭湘淑 韩新鹏 葛淑华 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期371-374,共4页

目的监测呼吸重症监护室(RICU)临床分离的非重复性鲍曼不动杆菌的耐药性变迁趋势及基因同源性状况。方法收集RICU 2008年～2011年临床分离的非重复性鲍曼不动杆菌,采用K-B(Kirby-Bauer)法进行药敏试验,并应用ERIC-PCR进行基因同源性分... 目的监测呼吸重症监护室(RICU)临床分离的非重复性鲍曼不动杆菌的耐药性变迁趋势及基因同源性状况。方法收集RICU 2008年～2011年临床分离的非重复性鲍曼不动杆菌,采用K-B(Kirby-Bauer)法进行药敏试验,并应用ERIC-PCR进行基因同源性分析。结果①2008年～2011年RICU共分离非重复性鲍曼不动杆菌232株,其中标本来源以痰液为主,占89.66%;②除米诺环素外,对常见抗生素的耐药率均有增加的趋势;对碳青霉烯类抗生素的耐药率已高达85%以上;③所收集的菌株可分为的5个克隆型,其中A型45株,B型61株,C型79株,D型32株,E型15株。结论 RICU检出的鲍曼不动杆菌对抗生素耐药率较高,且具有基因同源性,提示有耐药基因的水平转移。 展开更多

关键词 呼吸ICU 鲍曼不动杆菌 耐药率 肠杆菌科基因间重复序列聚合酶链反应

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耐碳青霉烯粘质沙雷菌耐药基因及分子流行病学研究 被引量：7

13

作者 袁园 陈继中 +2 位作者 潘亚萍 徐元宏 王中新 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2019年第1期33-39,共7页

目的探究耐碳青霉烯粘质沙雷菌耐药表型和碳青霉烯酶基因,同时分析其分子流行病学特征。方法收集临床分离非重复的67株碳青霉烯类耐药的粘质沙雷菌,以纸片扩散法和Vitek-2 Compact检测常见药物敏感性;采用改良碳青霉烯类灭活试验(mCIM)... 目的探究耐碳青霉烯粘质沙雷菌耐药表型和碳青霉烯酶基因,同时分析其分子流行病学特征。方法收集临床分离非重复的67株碳青霉烯类耐药的粘质沙雷菌,以纸片扩散法和Vitek-2 Compact检测常见药物敏感性;采用改良碳青霉烯类灭活试验(mCIM)、Carba NP试验、改良Hodge试验(MHT)对碳青霉烯酶进行筛查; PCR检测碳青霉烯酶基因; PCR检测肠杆菌科细菌基因重复序列(ERIC)对耐药菌进行克隆型分析。结果碳青霉烯耐药的粘质沙雷菌主要来自重症监护室(ICU),以痰液标本为主;药敏结果显示67株细菌对头孢噻肟、头孢曲松100%耐药,对亚胺培南、美罗培南、厄他培南、氨曲南耐药率均大于90%,对环丙沙星、庆大霉素、妥布霉素、哌拉西林/他唑巴坦、头孢他啶、头孢吡肟、左氧氟沙星耐药率较高,仅对阿米卡星和复方新诺明保持高度敏感; mCIM、Carba NP试验、MHT阳性率分别为92. 54%、89. 55%、91. 04%; PCR显示67株粘质沙雷菌中,检出bla_(KPC)基因32株、bla_(OXA-23)组基因7株、bla_(OXA-51)组基因7株、bla_(GES)基因3株、bla_(OXA-58)组基因1株,其中有8株细菌同时含有多种耐药基因; 67株耐碳青霉烯的粘质沙雷菌可分为8个型别(以A～H表示),其中A型(50株)最多。结论分离的耐碳青霉烯粘质沙雷菌呈现多重耐药性,主要携带bla_(KPC)和bla_(OXA)基因,且有多基因联合共存现象。同种克隆集中趋势明显,有引起院内感染爆发流行可能。 展开更多

关键词 粘质沙雷菌 碳青霉烯酶 耐药基因 肠杆菌科细菌基因重复序列 同源性分析

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市售鲜肉中奇异变形杆菌的ERIC-PCR分型与耐药性分析 被引量：2

14

作者 孙冷宁 陈善娇 +1 位作者 王观杏 毕水莲 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2019年第2期131-135,共5页

目的:研究中山市市售生鲜肉中分离的奇异变形杆菌的同源性和耐药性,分析其基因型与耐药表型之间的关系。方法:采用肠杆菌基因间重复序列(Entrobacter repetive intergenic consensus,ERIC)-PCR分型方法对71株奇异变形杆菌进行分型,所得... 目的:研究中山市市售生鲜肉中分离的奇异变形杆菌的同源性和耐药性,分析其基因型与耐药表型之间的关系。方法:采用肠杆菌基因间重复序列(Entrobacter repetive intergenic consensus,ERIC)-PCR分型方法对71株奇异变形杆菌进行分型,所得分型指纹图谱使用Quantity One软件进行处理分析。耐药性检测采用K-B纸片扩散法,参照CLSI制定的标准判读药敏结果。结果:71株奇异变形杆菌的相似性系数为0.64～1.00,以75%为界可分为9个簇。测试的18种抗生素中,对链霉素和红霉素的耐药率最高,均为100%;对青霉素和头孢曲松耐药率最低,分别为16.90%、11.27%。所有菌株均为多重耐药菌,且至少耐6种药物。结论:市售生鲜肉中分离的71株奇异变形杆菌相似性高,耐药情况严重,其基因型与耐药表型之间没有明显的相关性。 展开更多

关键词 奇异变形杆菌 肠杆菌科间重复序列 基因分型 耐药性 鲜肉

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神经外科ICU耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌感染疑似暴发调查与控制 被引量：1

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作者 黄平平 袁军 +1 位作者 高佳 沈艳 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1271-1278,共8页

目的调查神经外科重症监护病房(ICU)耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)医院感染暴发原因,查找传染源及传播途径,为有效控制多重耐药菌医院感染提供依据。方法对某院2023年7月28日-8月2日神经外科ICU 3例CRKP感染患者进行流行病学调查,按... 目的调查神经外科重症监护病房(ICU)耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)医院感染暴发原因,查找传染源及传播途径,为有效控制多重耐药菌医院感染提供依据。方法对某院2023年7月28日-8月2日神经外科ICU 3例CRKP感染患者进行流行病学调查,按照环境卫生监测方法采集标本,查找病房环境中的CRKP,分析CRKP菌株耐药性及携带的耐药基因,采用肠杆菌基因间重复一致序列(ERIC)及多位点序列分析(MLST)分析患者与环境监测分离CRKP菌株的同源性。结果共有3例CRKP医院感染,罹患率为3.85%(3/78),与2022年同期及2023年5-6月罹患率相比,差异具有统计学意义(P<0.05)。环境卫生学监测显示,1床呼吸机接口、治疗台和9床被服检出CRKP,检出率为4.84%(3/62);15份医务人员手标本和3份神经外科ICU空气监测标本均未检出CRKP;环境卫生监测检出3株CRKP;其耐药性、耐药基因及同源性与患者临床标本分离的CRKP一致。在采取集中隔离,严格进行病房环境清洁和消毒,严格执行侵入性器械消毒和管理,加强医护人员分组诊疗,工作服消毒,以及手卫生等一系列针对性措施后,此次事件得到有效控制。结论此次事件可判定为一起疑似CRKP医院感染暴发事件,推测侵入性器械消毒管理不到位、患者住院环境消毒不彻底、医护人员未分组诊疗及手卫生不到位是本次疑似医院感染暴发的主要原因。早期识别感染暴发,调查传染源及传播途径,以及及时采取针对性措施是控制感染暴发的关键。 展开更多

关键词 重症监护病房 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌 医院感染 肠杆菌基因间重复一致序列 聚合酶链反应

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REP-PCR及ERIC-PCR法对分离自海产品副溶血性弧菌分型分析 被引量：10

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作者 马月姣 孙晓红 +3 位作者 赵勇 卢瑛 吴启华 潘迎捷 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第10期263-267,共5页

目的:采用细菌基因外重复回文序列扩增(REP-PCR)和肠道细菌基因间重复序列扩增(ERIC-PCR)两种方法对副溶血性弧菌2株标准株,13株实验室保存菌株和73株分离菌株共88株进行分子分型。方法:通过REP和ERIC-PCR指纹图谱扩增,利用NTsys-pc软... 目的:采用细菌基因外重复回文序列扩增(REP-PCR)和肠道细菌基因间重复序列扩增(ERIC-PCR)两种方法对副溶血性弧菌2株标准株,13株实验室保存菌株和73株分离菌株共88株进行分子分型。方法:通过REP和ERIC-PCR指纹图谱扩增,利用NTsys-pc软件采用Dice系数对指纹图谱进行聚类结果分析。结果:所有供试菌株可通过此两种方法进行分型得到清晰的指纹图谱,并反映出副溶血性弧菌具有丰富的遗传多样性,REP-PCR扩增出5～9条分布在609～4200bp之间的条带,可将副溶血性弧菌分为5个群12类型,分辨指数达0.93,其中tdh+株在相似系数0.86时可聚类在第Ⅰ群;ERIC-PCR扩增出5～11条分布在400～7593bp之间的条带,将副溶血性弧菌分为7个群11个类型,分辨指数为0.94,其中tdh+株在相似系数0.76时可聚类在第Ⅰ群。结论:两种方法均显现出很好的分型能力,能够很好地将环境分离tdh+菌株和标准菌株聚类在一起,其中REP-PCR较ERIC-PCR重复性更好。 展开更多

关键词 副溶血性弧菌 TDH 肠内细菌基因组间重复序列分析 细菌基因外重复回文序列扩增 分型

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菜豆萎蔫病菌的PCR检测技术 被引量：9

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作者 张晓梅 林友伟 +1 位作者 吴新华 郭坚华 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期42-45,共4页

根据在GenBank已登录的萎蔫短小杆菌 (Curtobacterium flaccumfaciens)的基因间重复序列 ,用DNAman 5 0软件比较同源性 ,设计了一对引物CffF1和CffR2 ,并以菜豆萎蔫病菌的基因组DNA为模板进行扩增 ,得到了一段长 2 80bp的PCR特异产物... 根据在GenBank已登录的萎蔫短小杆菌 (Curtobacterium flaccumfaciens)的基因间重复序列 ,用DNAman 5 0软件比较同源性 ,设计了一对引物CffF1和CffR2 ,并以菜豆萎蔫病菌的基因组DNA为模板进行扩增 ,得到了一段长 2 80bp的PCR特异产物。参试的其他属如棒形细菌属 (Clavibacter)、节杆菌属 (Arthrobacter)、拉氏杆菌属 (Rathayibac ter)、红球菌属 (Rhodococcus)细菌和萎蔫短小杆菌的其他致病变种 (Cur f pv oortii、Cur f pv poinsettiae、Cur f pv betae) ,以及其他植物病原细菌的基因组DNA均无扩增产物。该检测方法特异性强、灵敏度高 ,在 10 展开更多

关键词 菜豆 萎蔫病菌 PCR 检测技术 萎蔫短小杆菌 基因间重复序列 基因组DNA

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耐亚胺培南铜绿假单胞菌耐药机制研究 被引量：10

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作者 应春妹 应骏 +3 位作者 罗柳林 汪雅萍 叶杨芹 张灏旻 《中国感染与化疗杂志》 CAS 2008年第4期300-302,共3页

目的了解我院分离的耐亚胺培南铜绿假单胞菌(PA)耐药机制及同源性分型情况。方法收集临床分离耐亚胺培南PA,用K-B法检测28株耐亚胺培南PA对12种抗菌药的敏感性,用肠杆菌科细菌基因间重复序列(ERIC)进行同源性分析,并用PCR法检测外膜孔蛋... 目的了解我院分离的耐亚胺培南铜绿假单胞菌(PA)耐药机制及同源性分型情况。方法收集临床分离耐亚胺培南PA,用K-B法检测28株耐亚胺培南PA对12种抗菌药的敏感性,用肠杆菌科细菌基因间重复序列(ERIC)进行同源性分析,并用PCR法检测外膜孔蛋白OprD2和金属β内酰胺酶(IMP、VIM)基因。结果28株耐亚胺培南PA对其他12种抗菌药的耐药率在14.8%~42.3%。经ERIC-PCR分析后共有11个基因型。其中A型为11株:A1型9株,A2型2株;B型为5株:B1型2株,B2型2株,B3型1株;C型3株;D型2株;E^K型各1株。PCR检测到OprD2基因仅4株,其缺失率为85.7%,28株PA中检测到1株VIM基因,经测序证实为VIM-2型。结论本院耐亚胺培南PA的主要耐药机制为外膜孔蛋白缺失。在外科和高干病房中出现多种基因型的耐亚胺培南PA传播。 展开更多

关键词 耐亚胺培南 铜绿假单胞菌 外膜孔蛋白 金属Β内酰胺酶 肠杆菌科细菌基因间重复序列

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ERIC-PCR与PFGE检测铜绿假单胞菌同源性的方法学比较 被引量：13

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作者 孙晶 常军霞 刘巍 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期297-302,共6页

目的比较肠杆菌基因间重复一致序列PCR(ERIC-PCR)与限制性内切酶联合脉冲场凝胶电泳(PFGE)检测铜绿假单胞菌同源性的方法学一致性。方法分别用ERIC-PCR和PFGE对北京某医院48株铜绿假单胞菌株进行分型,明确其是否有克隆传播。结果 ERIC-... 目的比较肠杆菌基因间重复一致序列PCR(ERIC-PCR)与限制性内切酶联合脉冲场凝胶电泳(PFGE)检测铜绿假单胞菌同源性的方法学一致性。方法分别用ERIC-PCR和PFGE对北京某医院48株铜绿假单胞菌株进行分型,明确其是否有克隆传播。结果 ERIC-PCR方法鉴定有34株为同一克隆来源,其余14株被分为9种基因型。PFGE方法分型鉴定有38株为同一克隆来源,其余10株表现为7种基因型,均提示脑外科内的铜绿假单胞菌在2010年存在一个克隆株传播。两种方法学结果的符合率为89.5%,PFGE重复3次结果相似度达96.6%,ERIC-PCR重复5次结果相似度达75.4%。结论 ERIC-PC操作简便快速,重复性较好,与PFGE结果一致性高,适合在基层医院进行细菌流行病学分析。 展开更多

关键词 铜绿假单胞菌 脉冲场凝胶电泳 肠杆菌基因间重复一致序列PCR

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PCR指纹图谱技术在酸奶质量监测中的应用 被引量：7

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作者 李武 赵勇 +2 位作者 王凌华 张晓君 赵立平 《中国乳业》 2006年第4期47-49,共3页

用PCR指纹图谱技术对市售某品牌酸奶进行了短期动态监测,对于收集的3个生产批次的9个酸奶样品,用ERIC(EnterobacterialRepetitiveIntergenicConsensus,肠杆菌基因间保守重复序列)-PCR和PCR-DGGE(DenaturingGradientGelElectrophoresis,... 用PCR指纹图谱技术对市售某品牌酸奶进行了短期动态监测,对于收集的3个生产批次的9个酸奶样品,用ERIC(EnterobacterialRepetitiveIntergenicConsensus,肠杆菌基因间保守重复序列)-PCR和PCR-DGGE(DenaturingGradientGelElectrophoresis,变性梯度凝胶电泳)指纹图谱技术对其菌种组成及其稳定性进行评价。ER-IC-PCR指纹图谱聚类分析结果显示,同一生产批次内3个不同包装的样品ERIC-PCR指纹图谱相似性为90%左右,而不同生产批次样品之间ERIC-PCR指纹图谱相似性有所下降,为82%。该结果进一步用DGGE指纹图谱进行证实。DGGE分析结果表明,G2样品明显缺少一条主带,经割胶回收测序发现,这条主带代表的微生物是Lacto-bacillusdelbrueckiisubsp.Bulgaricus,说明该产品不同生产批次间的稳定性不是很好。DGGE图谱和测序结果还显示,除G2样品外,该酸奶样品的菌种组成与产品标签说明是一致的。 展开更多

关键词 酸奶 ERIC(Enterobacterial Repetitive INTERGENIC Consensus 肠杆菌基因间保守重复序列)-PCR DGGE(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis 变性梯度凝胶电泳)指纹图谱

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