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野大麦肌动蛋白基因片段的克隆及其表达特征分析
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作者 袁惠君 关玉晨 +3 位作者 王春梅 冯欢 张欢欢 袁毅君 《中国草食动物科学》 CAS 北大核心 2024年第4期30-38,共9页
野大麦(Hordeum brevisubulatum)是重要的野生禾本科牧草,具有多种抗逆性。为深入挖掘野大麦的抗逆基因,本研究以RT-PCR法克隆了野大麦肌动蛋白基因(Actin,ACT)的核心片段。采用BLAST序列比对,qRT-PCR实时定量方法对其序列特征和表达特... 野大麦(Hordeum brevisubulatum)是重要的野生禾本科牧草,具有多种抗逆性。为深入挖掘野大麦的抗逆基因,本研究以RT-PCR法克隆了野大麦肌动蛋白基因(Actin,ACT)的核心片段。采用BLAST序列比对,qRT-PCR实时定量方法对其序列特征和表达特性进行了分析。结果表明,野大麦ACT的基因片段长518 bp,编码171个氨基酸。BLAST分析表明,野大麦的肌动蛋白基因片段与大麦(Hordeum vulgare)ACT基因核苷酸序列的一致性达97%,与ACT蛋白氨基酸序列的同源性达91%,并将其命名为HbACT。与11种相关植物进行ACT氨基酸序列比对发现,HbACT含152个保守氨基酸和19个非保守氨基酸,说明HbACT蛋白具有高度保守性。qRT-PCR分析表明,在不同盐浓度处理条件下,不同处理时间野大麦各器官的HbACT的Ct平均值为19.30,地上部的变异系数为3.5,峰度系数为0.262;地下部的变异系数为5.3,峰度系数为0.409,均属于尖峰分布,Ct值的稳定系数均小于1.7。综上所述,HbACT基因表达稳定,可作为内参基因用于研究野大麦功能基因的表达模式分析。 展开更多
关键词 野大麦 肌动蛋白基因 克隆 表达模式分析
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结缕草肌动蛋白基因全长cDNA的克隆及序列分析 被引量:15
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作者 王舟 宗俊勤 +2 位作者 宣继萍 郭爱桂 刘建秀 《草业学报》 CSCD 北大核心 2010年第6期154-163,共10页
根据植物肌动蛋白(Actin)基因编码区的保守序列设计引物,提取结缕草叶片的总RNA,进行RT-PCR。并采用RACE技术扩增出1 560 bp的Actin基因全长cDNA序列。序列分析表明,该基因的开放阅读框(ORF)为1 134 bp,编码377个氨基酸,5′非编码区117 ... 根据植物肌动蛋白(Actin)基因编码区的保守序列设计引物,提取结缕草叶片的总RNA,进行RT-PCR。并采用RACE技术扩增出1 560 bp的Actin基因全长cDNA序列。序列分析表明,该基因的开放阅读框(ORF)为1 134 bp,编码377个氨基酸,5′非编码区117 bp,3′非编码区309 bp。所得序列与GenBank中收录的其他植物肌动蛋白核苷酸序列的一致性均在85%以上,氨基酸序列的一致性高达97%以上。将其命名为ZjACT,GenBank登录号为GU290545。根据高等植物肌动蛋白相似性构建的系统进化树显示,结缕草肌动蛋白与大麦和圆锥小麦肌动蛋白之间的亲缘关系最为密切,在进化中分化时间最为接近。进一步分离克隆了结缕草Actin基因的基因组DNA序列(登录号GU290546),它由4个外显子和3个内含子组成。本研究有助于揭示植物Actin基因家族的进化历史,为研究植物Actin基因家族功能和进化上的多样性奠定理论基础,同时也为开展草坪草和牧草Actin基因的功能分析和利用研究提供参考。 展开更多
关键词 结缕草 肌动蛋白基因 克隆 序列分析
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大叶龙茶解剖学、肌动蛋白基因及分子标记的研究 被引量:4
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作者 徐玲玲 张美云 +5 位作者 李同建 秦红霞 赵中伟 樊启水 廖亮 张大明 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期263-270,共8页
大叶龙茶是来源于江西修水茶科所宁州群体茶园中一株自然突变体形成的大叶并无蕾无性繁殖新品种。对大叶龙茶及其母株的成熟叶片和不同时期的芽进行石蜡切片研究表明,大叶龙茶叶片栅栏组织细胞较长、海绵组织层数增加;大叶龙茶无蕾的原... 大叶龙茶是来源于江西修水茶科所宁州群体茶园中一株自然突变体形成的大叶并无蕾无性繁殖新品种。对大叶龙茶及其母株的成熟叶片和不同时期的芽进行石蜡切片研究表明,大叶龙茶叶片栅栏组织细胞较长、海绵组织层数增加;大叶龙茶无蕾的原因是由于所有的芽始终保持营养芽的状态所致。首次克隆了茶树3个肌动蛋白基因片段(CS-ACT1,CS-ACT2,CS-ACT3),且都编码225个氨基酸,大叶龙茶与母株及500个BlastX分析获得的肌动蛋白序列在保守结构域F、G、H区有相应的四个氨基酸不同。对大叶龙茶及其母株进行AFLP分析表明,大叶龙茶总带数比母株少,并出现一部分特有带;利用EST-SSR分子标记技术对大叶龙茶及其它常见品种进行研究,表明大叶龙茶等4个修水品种与龙井43有相似的遗传基础。 展开更多
关键词 大叶龙茶 解剖学 肌动蛋白基因 AFLP EST-SSR
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‘甘肃红豆草’肌动蛋白基因片段的克隆及序列分析 被引量:4
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作者 陈春艳 马晖玲 董文科 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期151-156,共6页
以‘甘肃红豆草’叶片总RNA为模板,通过RT-PCR方法扩增出肌动蛋白(Actin)基因片段,并克隆到pMD18-T载体,阳性克隆经PCR鉴定后测序.结果表明:序列分析表明,该片段长258bp,编码86个氨基酸,所得序列与GenBank中注册的Actin基因核苷酸序列... 以‘甘肃红豆草’叶片总RNA为模板,通过RT-PCR方法扩增出肌动蛋白(Actin)基因片段,并克隆到pMD18-T载体,阳性克隆经PCR鉴定后测序.结果表明:序列分析表明,该片段长258bp,编码86个氨基酸,所得序列与GenBank中注册的Actin基因核苷酸序列的相似性在88%以上,与其他肌动蛋白的氨基酸序列的相似性达92%以上.注册该基因到GenBank中,注册号为KP159623.采用半定量RT-PCR方法,分析Actin基因在甘肃红豆草不同组织器官中的表达量相对恒定,而编码花青素还原酶的BAN基因在器官间的表达量差异较大,表明其可作为研究其它重要功能基因在‘甘肃红豆草’中的表达和调控的内参基因. 展开更多
关键词 甘肃红豆草 肌动蛋白基因 克隆 序列分析
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巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因的克隆和分析 被引量:2
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作者 尚常花 朱顺妮 +1 位作者 袁振宏 王忠铭 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第28期17172-17175,共4页
[目的]获得巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因cDNA全长序列。[方法]以巴夫杜氏藻cDNA为模板,采用简并引物进行PCR扩增,获得533bp特异cDNA片段。在此基础上,设计特异引物,采用5'-Genome Walking和3'-RACE的方法,获得基因的5'-端DNA... [目的]获得巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因cDNA全长序列。[方法]以巴夫杜氏藻cDNA为模板,采用简并引物进行PCR扩增,获得533bp特异cDNA片段。在此基础上,设计特异引物,采用5'-Genome Walking和3'-RACE的方法,获得基因的5'-端DNA序列和3'-端cDNA序列,进而获得β-肌动蛋白基因cDNA全长序列。[结果]获得了巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因的特异cDNA片段、5'-端DNA和3'-端cDNA片段。经拼接后,扩增出全长cDNA。β-肌动蛋白基因cDNA全长1754bp,包括1137bp的开放读码框和617bp的3'-非翻译区序列。氨基酸序列相似性分析发现,巴夫杜氏藻β-肌动蛋白氨基酸序列与杜氏盐藻、莱茵衣藻等的同源性较高。系统发育分析表明,巴夫杜氏藻β-肌动蛋白与杜氏盐藻的相似性最高。[结论]首次获得了巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因cDNA全长序列,并发现巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因非常保守。 展开更多
关键词 巴夫杜氏藻 β-肌动蛋白基因 克隆
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伴肌动蛋白基因突变杆状体肌病2型1例报告并文献复习 被引量:1
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作者 黄坤玲 刘建华 +5 位作者 牛波 路素坤 曹丽洁 及立立 吕文山 帅金凤 《山东医药》 CAS 2021年第26期68-70,共3页
目的总结伴肌动蛋白(NEB)基因突变导致的杆状体肌病(NM)的临床表现及遗传学特点。方法回顾性分析1例NM2型患者的病史、体征、实验室检查结果、NEB基因检测结果,并结合文献进行分析。结果先证者发病年龄为2岁半,因下肢肌无力、走路不稳就... 目的总结伴肌动蛋白(NEB)基因突变导致的杆状体肌病(NM)的临床表现及遗传学特点。方法回顾性分析1例NM2型患者的病史、体征、实验室检查结果、NEB基因检测结果,并结合文献进行分析。结果先证者发病年龄为2岁半,因下肢肌无力、走路不稳就诊,多次反复呼吸道感染,15岁时因重症肺炎就诊,查血清肝酶心肌酶正常。二代测序结果提示患儿NEB基因存在c.23122-1G>C杂合突变,同时NEB基因的40~60号外显子存在杂合缺失,经一代测序验证c.23122-1G>C杂合突变来自于母亲。结论幼儿期起病、病程长,存在肌无力、肌张力低下的患者应警惕先天性NM可能,病理检查和基因检测是NM诊断的金标准;NEB基因c.23122-1G>C杂合突变为新发现的突变位点。 展开更多
关键词 杆状体肌病 肌无力 肌动蛋白基因 遗传学特征
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水葫芦肌动蛋白基因片段的克隆及序列分析 被引量:1
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作者 蒋丽花 傅明辉 彭进平 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期143-146,共4页
利用植物肌动蛋白保守片段设计简并引物,通过RT-PCR扩增出水葫芦肌动蛋白基因片段并连接到pMD19-T载体,转化E.coli,测序。序列分析结果表明,该序列与油棕、小野果蕉等植物的相似性程度达到85%以上,分子进化分析水葫芦肌动蛋白基因序列... 利用植物肌动蛋白保守片段设计简并引物,通过RT-PCR扩增出水葫芦肌动蛋白基因片段并连接到pMD19-T载体,转化E.coli,测序。序列分析结果表明,该序列与油棕、小野果蕉等植物的相似性程度达到85%以上,分子进化分析水葫芦肌动蛋白基因序列与油棕、小野果蕉等单子叶植物亲缘关系较近,但并没有与某些植物的肌动蛋白很好地聚成一类。本研究所克隆得到的水葫芦肌动蛋白基因序列能够为进一步研究水葫芦其他基因的表达提供内标。 展开更多
关键词 水葫芦 肌动蛋白基因 内标
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黄垂网不同发育时期肌动蛋白基因的序列分析 被引量:1
8
作者 陈小姝 谷硕 王琦 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第24期14538-14539,共2页
[目的]对黄垂网不同发育时期(幼孢囊和成熟孢囊时期)的肌动蛋白基因的序列进行测定、比对。[方法]基于肌动蛋白基因,利用分子生物学方法对黄垂网不同发育时期的DNA进行提取、测序。[结果]不同发育时期的序列同源性在99%以上,具有的氨基... [目的]对黄垂网不同发育时期(幼孢囊和成熟孢囊时期)的肌动蛋白基因的序列进行测定、比对。[方法]基于肌动蛋白基因,利用分子生物学方法对黄垂网不同发育时期的DNA进行提取、测序。[结果]不同发育时期的序列同源性在99%以上,具有的氨基酸数量相同,都为19种,没有色氨酸。丝氨酸含量最高,组氨酸含量最低。[结论]除丙氨酸、苯丙氨酸、异亮氨酸和脯氨酸外,黄垂网在不同发育时期的氨基酸含量均相同。 展开更多
关键词 黏菌 黄垂网 不同发育时期 肌动蛋白基因
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盐生盐藻肌动蛋白基因及其5′上游片段的克隆 被引量:3
9
作者 谈峥 林志新 +1 位作者 杨志勇 许政恺 《上海交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第7期1057-1061,共5页
在盐生盐藻 c DNA文库和基因组文库中对肌动蛋白基因进行了筛选 ,结果得到了一个c DNA克隆和两个基因克隆 ,并进一步从基因克隆中克隆出该基因的 5′上游片段 .检索结果表明 ,所得到的 c DNA和基因属于盐生盐藻的肌动蛋白基因 .通过将... 在盐生盐藻 c DNA文库和基因组文库中对肌动蛋白基因进行了筛选 ,结果得到了一个c DNA克隆和两个基因克隆 ,并进一步从基因克隆中克隆出该基因的 5′上游片段 .检索结果表明 ,所得到的 c DNA和基因属于盐生盐藻的肌动蛋白基因 .通过将盐生盐藻肌动蛋白基因序列同其c DNA序列及其他生物的肌动蛋白序列相比较 ,给出了一个此基因 展开更多
关键词 盐藻 肌动蛋白基因 基因文库 序列比较 基因克隆 5'上游片段 序列分析
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可在鱼体内表达hu-IFN-α的基因重组构建及转化 被引量:9
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作者 张学文 章怀云 +3 位作者 符少辉 陈韬 陈立祥 肖调义 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2001年第4期1-5,共5页
通过分子重组 ,将人α 干扰素 (hu IFN α)基因编码序列克隆到鲤鱼β 肌动蛋白基因启动子下游 ,构建成能在鱼体内组成型表达hu IFN α的基因重组分子。经限制性酶切分析、Southern杂交和序列测定 ,证明重组分子构建的正确性。采用显微... 通过分子重组 ,将人α 干扰素 (hu IFN α)基因编码序列克隆到鲤鱼β 肌动蛋白基因启动子下游 ,构建成能在鱼体内组成型表达hu IFN α的基因重组分子。经限制性酶切分析、Southern杂交和序列测定 ,证明重组分子构建的正确性。采用显微注射法将这一重组基因转化草鱼受精卵 ,获得了表达人α 展开更多
关键词 人α-干扰素 鲤鱼β-肌动蛋白基因启动子 基因重组 出血病 基因草鱼
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白菜花药特异基因BcACT的克隆与表达分析 被引量:1
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作者 蒋明 曹家树 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期591-598,共8页
根据GenBank数据库中已发布的肌动蛋白基因序列设计全长扩增引物,分别从白菜混合花蕾cDNA和叶片基因组DNA中克隆到各自的全长,其基因命名为BcACT,并利用RT-PCR技术研究该基因在白菜3个材料的不同器官以及保持系花蕾各部位的表达模式.结... 根据GenBank数据库中已发布的肌动蛋白基因序列设计全长扩增引物,分别从白菜混合花蕾cDNA和叶片基因组DNA中克隆到各自的全长,其基因命名为BcACT,并利用RT-PCR技术研究该基因在白菜3个材料的不同器官以及保持系花蕾各部位的表达模式.结果表明:BcACT的DNA全长为1704bp,具有3个内含子,编码区长度为1134bp,编码377个氨基酸;基因表达结果显示,BcACT基因在保持系Bcajh97-01B和Polima不育系Bcpol97-05A的花蕾中表达,但表达模式存在差异,而在Ogura不育系Bcogu97-06A中未检测到;此外,BcACT基因的表达具有花药特异性,并且在花药发育过程中上调表达. 展开更多
关键词 白菜 花药特异 雄性不育 肌动蛋白基因
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甘肃特产药材红芪actin基因片段的克隆及序列分析 被引量:2
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作者 何军刚 强正泽 +2 位作者 马冬妮 冯晓莉 李成义 《中国现代中药》 CAS 2020年第12期1972-1976,共5页
目的:研究红芪Hedysari Radix次生代谢产物与基因表达的相关性,克隆红芪的肌动蛋白基因(actin)并进行序列分析和定量研究。方法:通过查找GenBank中的其他豆科植物的编码序列(CDS)设计简并引物,采用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术克... 目的:研究红芪Hedysari Radix次生代谢产物与基因表达的相关性,克隆红芪的肌动蛋白基因(actin)并进行序列分析和定量研究。方法:通过查找GenBank中的其他豆科植物的编码序列(CDS)设计简并引物,采用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术克隆红芪actin基因的核心片段,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析该基因在不同部位中的稳定性表达。结果:克隆出了长度946 bp的红芪actin基因,其中编码蛋白框855 bp,编码284个氨基酸,经Blast比对序列,红芪的actin基因与甘草Glycyrrhiza uralensis Fisch.、花苜蓿Medicago ruthenica(L.)Trautv.、红车轴草Trifolium pratense L.的核苷酸序列同源性分别为95.44%、94.42%、94.20%,氨基酸序列的相似性也高达97%以上,红芪actin基因在根、茎、叶不同部位中的表达量基本稳定。结论:首次在国内成功克隆出了红芪的actin基因,并且证实了该基因可作为红芪其他优良基因表达调控的内参基因,为红芪质量研究提供参考。 展开更多
关键词 红芪 肌动蛋白基因 克隆 序列分析 逆转录-聚合酶链式反应
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A modified one-step procedure for rapid RNA isolation from insect 被引量:4
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作者 景天忠 王志英 +1 位作者 刘宽余 齐凤慧 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2006年第2期129-131,共3页
A modified guanidinium isothiocyanate method was used to extract total RNA from two forest insect species Clostera anastomosis and Saperda populnea. The integrity of RNA was demonstrated by the methods of gel electrop... A modified guanidinium isothiocyanate method was used to extract total RNA from two forest insect species Clostera anastomosis and Saperda populnea. The integrity of RNA was demonstrated by the methods of gel electrophoresis and cDNA analysis. Typical A260/ A280 absorbance ratio of the total RNA was in range of 1.8 to 2.0. The size of double strand cDNAs obtained by RT-PCR was more than 2 kb, which indicated that intact mRNA was obtained. The fragments of β-actin and chitinase gene from the RNA of C. anastomosis were obtained by RT-PCR, which indicated that the RNA could be used for other molecular operation. By this procedure, RNAs could be extracted and analyzed by electrophoresis from at least 8 samples within 4 hours. These results showed that this method was time- and cost-saving and effective. 展开更多
关键词 RNA isolation β-actin gene Clostera anastomosis Saperda populnea
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医学遗传学
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《国外科技资料目录(医药卫生)》 CAS 1997年第3期39-43,共5页
9708833 推荐标准化的人类系谱的专业术语/Bennett R L//Am J Hum Genet.-1995,56(3).-745~752 哈医图9708834 对于性状位点和一个或更多多态标记位点的连锁不平衡的一种新的有力的可能性分析方法/Terwilliger J D//
关键词 基因组结构 分析方法 聚合酶链反应 基因启动子 基因小鼠 分子克隆 肌动蛋白基因 连锁不平衡 受体基因 标记位点
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