出芽短梗霉ATMT体系构建及聚苹果酸高产菌株筛选

1

作者 白丽君 杜榕 +2 位作者 贾宜萱 陶佩 魏培莲 《食品工业科技》 北大核心 2025年第21期217-227,共11页

本研究基于优化根癌农杆菌介导转化技术(Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation,ATMT),构建出芽短梗霉(Aureobasidium pullulans)遗传转化体系,旨在筛选高产聚苹果酸菌株。通过优化农杆菌初始浓度、预培养时间、共培养时... 本研究基于优化根癌农杆菌介导转化技术(Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation,ATMT),构建出芽短梗霉(Aureobasidium pullulans)遗传转化体系,旨在筛选高产聚苹果酸菌株。通过优化农杆菌初始浓度、预培养时间、共培养时间、共培养pH、乙酰丁香酮(AS)浓度、共培养温度等关键参数,利用潮霉素磷酸转移酶(hph)基因和增强型绿色荧光蛋白(eGFP)基因作为筛选标记,从中筛选出高产聚苹果酸的出芽短梗霉菌株。最佳转化条件为:农杆菌初始OD_(600)值为0.6、预培养时间为8 h、共培养时间为72 h、共培养pH为5.2、AS浓度为100μmol/L,共培养温度为22℃。在优化条件下,成功构建了一批具有稳定T-DNA插入的转化菌株,其中高产突变株的聚苹果酸产量相比野生型菌株显著提升,最高提高74.59%。本研究为聚苹果酸工业化生产的菌株优化提供了重要的技术支持,并为其他工业微生物的遗传改造提供了宝贵的参考路径。 展开更多

关键词 出芽短梗霉 根癌农杆菌 增强型绿色荧光蛋白 遗传转化 聚苹果酸

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出芽短梗霉积累聚苹果酸途径及调控研究 被引量：10

2

作者 程若东 王浩 +3 位作者 周华 程媛媛 何若平 韦萍 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第11期3639-3644,共6页

引言聚苹果酸[poly（β-malic acid）,PMLA]是新近开发的一种生物高聚物,因其良好的水溶性、生物可降解性、生物相容性以及易代谢性[1]、易修饰性[2],PMLA及其衍生物在生物医用材料、

关键词 出芽短梗霉 聚苹果酸 合成途径 代谢中间体

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β-聚苹果酸高产菌株的筛选及鉴定 被引量：8

3

作者 徐玲芬 陈忠华 +2 位作者 赵婧 阮红 刘森泉 《浙江大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期434-440,共7页

目的:从自然界筛选β-聚苹果酸(PMLA)高产菌株,并对其进行菌种鉴定。方法:从自然界取样,经过单菌落分离,根据菌落形态特征、聚苹果酸的定性检测和核酸序列分类鉴定手段,筛选PMLA高产菌株。结果:分离得到一株PMLA高产菌株,编号为Ⅱ04,经... 目的:从自然界筛选β-聚苹果酸(PMLA)高产菌株,并对其进行菌种鉴定。方法:从自然界取样,经过单菌落分离,根据菌落形态特征、聚苹果酸的定性检测和核酸序列分类鉴定手段,筛选PMLA高产菌株。结果:分离得到一株PMLA高产菌株,编号为Ⅱ04,经形态学研究和ITS序列分析,确定为短梗霉菌Aureobasidium pullulans,命名为Aureobasidium pullulans ZUCC-41。该菌在25℃,220 r/min振荡培养7 d,采用高效液相色谱法(HPLC)进行产物定量分析,检测到PMLA产量可达26.23 g/L。结论:从自然界中分离得到一株PMLA高产菌株,经鉴定为短梗霉菌Aureobasidium pullulans,其发酵产量可达26.23 g/L。 展开更多

关键词 苹果酸盐 有丝分裂孢子真菌/分离和提纯 聚苹果酸 高产菌株 鉴定

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响应面法优化β-聚苹果酸发酵培养基的研究 被引量：6

4

作者 程媛媛 郑谊丰 +2 位作者 王丽燕 周华 韦萍 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期197-199,共3页

采用响应面法对出芽短梗霉菌发酵制备β-聚苹果酸的培养基进行优化。使用Plackett-Burman(P-B)实验设计对培养基中相关因素进行评价,筛选出有显著影响效应的因素。通过最陡爬坡实验、中心复合实验设计及响应面分析确定主要影响因素的最... 采用响应面法对出芽短梗霉菌发酵制备β-聚苹果酸的培养基进行优化。使用Plackett-Burman(P-B)实验设计对培养基中相关因素进行评价,筛选出有显著影响效应的因素。通过最陡爬坡实验、中心复合实验设计及响应面分析确定主要影响因素的最佳浓度及回归模型,并经实验验证模型的可行性。优化后三种显著影响因素:葡萄糖、丁二酸铵和碳酸钙,最佳浓度分别为:110.91、3.66、45.30g/L,β-聚苹果酸的发酵产量达到41.36g/L,较优化前的20.74g/L提高了199%。 展开更多

关键词 β-聚苹果酸 出芽短梗霉菌 响应面 优化

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生物降解材料聚苹果酸的合成方法及应用进展 被引量：12

5

作者 余文兵 周华 韦萍 《化工进展》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第10期1086-1090,共5页

详细介绍了近年来化学合成和微生物发酵合成聚苹果酸的方法 ,介绍了其作为药物载体、胶囊和生物医学材料及其他的主要应用 。

关键词 生物降解材料 聚苹果酸 应用 合成

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反相高效液相色谱法测定发酵液中β-聚苹果酸含量 被引量：2

6

作者 刘森泉 阮红 +2 位作者 徐玲芬 赵婧 陈忠华 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期142-145,共4页

建立了一种利用反相高效液相色谱法测定发酵液中β-聚苹果酸(PMLA)含量的方法。以A(0.01mol/LKH2PO4)∶B(乙腈)=95∶5(体积化)为流动相,采用色谱柱Synergi4uPolar-RP(4.6×250mm,5μm);Agilent1200seires液相色谱系统测定发酵液酸... 建立了一种利用反相高效液相色谱法测定发酵液中β-聚苹果酸(PMLA)含量的方法。以A(0.01mol/LKH2PO4)∶B(乙腈)=95∶5(体积化)为流动相,采用色谱柱Synergi4uPolar-RP(4.6×250mm,5μm);Agilent1200seires液相色谱系统测定发酵液酸水解前后的苹果酸含量,两者差值间接反映发酵液中聚苹果酸的含量。结果显示,目的峰和杂峰在8min内可以得到完全分离,定量的相对标准偏差为0.6%～1.5%,回收率为98.2%～100%。该法准确度高,重现性好,可作为发酵液中聚苹果酸的检测方法。 展开更多

关键词 反相高效液相色谱 发酵 β-聚苹果酸

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β-聚苹果酸/明胶微胶囊的制备 被引量：3

7

作者 吴艳丽 马霞 俞鸿千 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2013年第15期234-237,共4页

文章对β-聚苹果酸(β-poly malic acid,β-PMA)和明胶(gelatin)通过复凝聚法制备微胶囊进行了描述。在常温常压下,通过Plackett-Burman设计得出主要的影响因素是β-PMA和明胶的浓度、明胶的pH、反应时间。根据Box-Behnke设计得出了较... 文章对β-聚苹果酸(β-poly malic acid,β-PMA)和明胶(gelatin)通过复凝聚法制备微胶囊进行了描述。在常温常压下,通过Plackett-Burman设计得出主要的影响因素是β-PMA和明胶的浓度、明胶的pH、反应时间。根据Box-Behnke设计得出了较好的制备条件,在该模型下优化得出的最佳条件为:PMLA浓度0.1%,明胶浓度0.13%,明胶pH4.0,反应时间25min时,微胶囊粒径为288.37nm。 展开更多

关键词 β-聚苹果酸 明胶 Box-Behnken 微胶囊

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氨基酸对出芽短梗霉发酵生产聚苹果酸的影响 被引量：5

8

作者 殷海松 范栩嘉 +3 位作者 汤卫华 边艳慧 陈珊 乔长晟 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期242-246,267,共6页

本文研究了添加氨基酸对出芽短梗霉A.pullulans CGMCC3337发酵生产聚苹果酸(PMLA)的影响。通过单因素实验和正交实验分别对氨基酸种类及其添加量进行优化。由单因素实验可知:天冬氨酸(Asp)、亮氨酸(Leu)、缬氨酸(Val)和苏氨酸(Thr)对菌... 本文研究了添加氨基酸对出芽短梗霉A.pullulans CGMCC3337发酵生产聚苹果酸(PMLA)的影响。通过单因素实验和正交实验分别对氨基酸种类及其添加量进行优化。由单因素实验可知:天冬氨酸(Asp)、亮氨酸(Leu)、缬氨酸(Val)和苏氨酸(Thr)对菌体生长和PMLA合成最有利。由正交实验可知:氨基酸的最优组合为(g/L):天冬氨酸(Asp)0.4、亮氨酸(Leu)0.4、缬氨酸(Val)0.4、苏氨酸(Thr)0.4。在最优组合条件下获得的PMLA产量和分子量分别达到了57.89 g/L和8879 u,比未添加氨基酸获得的PMLA产量和分子量分别提高了40.92%和45.20%。 展开更多

关键词 出芽短梗霉 聚苹果酸 氨基酸

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聚苹果酸的发酵制备及其应用 被引量：3

9

作者 吴艳丽 马霞 《中国酿造》 CAS 2012年第4期14-17,共4页

聚苹果酸(Poly malic acid,PMLA)是一种新型的材料,具有优良的生物特性,是国内外研究的热点。简要论述了聚苹果酸的化学制备和生物制备方法,对生物发酵的优化进行了分析,对聚苹果酸的分离提纯、测定及其产生的主要副产物做了简要的论述... 聚苹果酸(Poly malic acid,PMLA)是一种新型的材料,具有优良的生物特性,是国内外研究的热点。简要论述了聚苹果酸的化学制备和生物制备方法,对生物发酵的优化进行了分析,对聚苹果酸的分离提纯、测定及其产生的主要副产物做了简要的论述。因其具有很好的生物特性,被广泛用于医药材料、药物载体、化妆品、香精香料等领域,有着广阔的发展前景。 展开更多

关键词 聚苹果酸 生物发酵 优化 分离 测定

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聚苹果酸发酵条件的优化 被引量：2

10

作者 吴艳丽 马霞 刘长虹 《中国酿造》 CAS 2012年第9期46-50,共5页

聚苹果酸(Polymalic acid,PMA)是一种新型的生物高分子材料,具有优良的生物特性,能够作为药物载体并对药物进行包埋,同时在化妆品行业、污水治理方面也有广泛的应用。根据本实验室菌种,对发酵条件进行优化,得出最优发酵条件。通过选择... 聚苹果酸(Polymalic acid,PMA)是一种新型的生物高分子材料,具有优良的生物特性,能够作为药物载体并对药物进行包埋,同时在化妆品行业、污水治理方面也有广泛的应用。根据本实验室菌种,对发酵条件进行优化,得出最优发酵条件。通过选择最佳的碳源、氮源和碳酸钙的添加量,进行Box-Benhken实验设计。根据实验得出最优条件为葡萄糖120g/L,丁二酸铵3.02g/L,pH值为4.68,CaCO330g/L,最大产量为17.48g/L。 展开更多

关键词 聚苹果酸 生物材料 发酵 Box—Benhken

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出芽短梗霉发酵液中聚苹果酸测定方法的比较 被引量：6

11

作者 王凤荣 乔长晟 +3 位作者 江建梅 钟堃 李鹏举 贾士儒 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期347-349,352,共4页

应用α-2,7-萘二酚法和酶试剂盒法分别对L-苹果酸标准品和出芽短梗霉(Aureobasidium pullulans)发酵液中的聚苹果酸进行检测,比较二者的差异,并研究了酸解过程对两种检测方法的影响。结果表明:检测L-苹果酸标准品,α-2,7-萘二酚法回收率... 应用α-2,7-萘二酚法和酶试剂盒法分别对L-苹果酸标准品和出芽短梗霉(Aureobasidium pullulans)发酵液中的聚苹果酸进行检测,比较二者的差异,并研究了酸解过程对两种检测方法的影响。结果表明:检测L-苹果酸标准品,α-2,7-萘二酚法回收率为99.58%～100.1%,相对标准偏差为0.71%～0.95%,酶试剂盒法回收率为99.6%～100.22%,相对标准偏差为0.55%～0.6%,经统计学分析两种方法的准确度和精密度无显著性差异;检测发酵液中聚苹果酸,α-2,7-萘二酚法相对标准偏差为2.49%～3.61%,酶试剂盒法相对标准偏差为0.81%～1.18%,经统计学分析两种方法的准确度和精密度无显著性差异;酸解过程对两种检测方法均无显著影响。 展开更多

关键词 α-2 7-茶二酚法 L-苹果酸酶试剂盒法 L-苹果酸 聚苹果酸

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两步超滤膜法分离提取发酵液中聚苹果酸 被引量：4

12

作者 毕艺成 陆宏艳 +3 位作者 王浩 程若东 周华 韦萍 《膜科学与技术》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期97-102,共6页

采用两步超滤法对出芽短梗霉发酵产生的聚苹果酸进行分离与提取.发酵液经离心去除菌体后,先采用截留相对分子质量为30 000的超滤膜除去多糖及大分子杂质,接着采用截留相对分子质量为1 000的超滤膜对料液进行浓缩并除去小分子杂质,浓缩... 采用两步超滤法对出芽短梗霉发酵产生的聚苹果酸进行分离与提取.发酵液经离心去除菌体后,先采用截留相对分子质量为30 000的超滤膜除去多糖及大分子杂质,接着采用截留相对分子质量为1 000的超滤膜对料液进行浓缩并除去小分子杂质,浓缩液经有机溶剂沉淀和冷冻干燥获得聚苹果酸.采取单因素实验法优化了超滤条件,结果表明:离心除菌后的发酵上清液稀释4倍,跨膜压差0.075 MPa,控制料液pH=6、温度35℃,使用相对分子质量30 000超滤膜稀释超滤1次,分子量1 000超滤膜浓缩4倍后,经甲醇沉淀和冷冻干燥,PMLA的纯度达到82.3%,PMLA的提取收率为57.56%. 展开更多

关键词 聚苹果酸 两步超滤 分离

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生物可降解材料聚苹果酸的研究进展 被引量：2

13

作者 戴翀 李云政 +1 位作者 张青山 郭炳南 《材料导报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第F11期359-362,共4页

聚苹果酸及其衍生物是一类新型的生物高分子材料，具有良好的生物降解性和生物相容性。介绍了聚苹果酸及其衍生物的结构和性能特点，综述了它们的合成方法的研究进展，并展望了它们在药物载体及生物医用材料等领域的应用前景。

关键词 聚苹果酸 衍生物 生物降解性 生物相容性

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短梗霉生产聚苹果酸合成机制研究进展 被引量：2

14

作者 刘滨 曹伟锋 于海峰 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2017年第17期347-352,共6页

聚苹果酸是一种可完全生物降解的高分子材料,具有高度水溶性、无免疫原性等优良特性,在生物医药及生物材料领域具有广泛应用前景。文章介绍了微生物法合成聚苹果酸的代谢途径、关键酶系及其代谢调控机制,展望了聚苹果酸合成代谢的研究... 聚苹果酸是一种可完全生物降解的高分子材料,具有高度水溶性、无免疫原性等优良特性,在生物医药及生物材料领域具有广泛应用前景。文章介绍了微生物法合成聚苹果酸的代谢途径、关键酶系及其代谢调控机制,展望了聚苹果酸合成代谢的研究方向。 展开更多

关键词 聚苹果酸 代谢途径 关键酶系 代谢调控

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出芽短梗霉发酵液中聚苹果酸定量近红外模型的建立与应用 被引量：1

15

作者 张英昊 薛照阳 +2 位作者 赵廷彬 殷海松 乔长晟 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第8期152-158,共7页

利用高效液相色谱法测量发酵液聚苹果酸浓度。联合使用间隔偏最小二乘法与移动窗口偏最小二乘法定位建模波段为5638~6024 cm-1。依次使用多元散射校正+标准正规化+Savitzky-Golay 55点平滑+一阶导数光谱的预处理方法结合前5维因子偏最... 利用高效液相色谱法测量发酵液聚苹果酸浓度。联合使用间隔偏最小二乘法与移动窗口偏最小二乘法定位建模波段为5638~6024 cm-1。依次使用多元散射校正+标准正规化+Savitzky-Golay 55点平滑+一阶导数光谱的预处理方法结合前5维因子偏最小二乘回归建模,可以达到最佳的拟合精度,模型内部验证集预测均方误差(root mean square error of prediction,RMSEP)为1.553 g/L,Rp为0.9700,外部验证集RMSEP为1.378 g/L,Rp为0.9924,配对t检验在95%置信度下的最大偏差分别为1.48 g/L和0.83 g/L,模型对同一样品的3次预测平行无显著差异。将模型应用于单因素培养基优化和诱变菌株样品的预测,结合配对t检验发现模型的预测误差较大,但是可以在样品间模型计算值偏差分别大于3.19 g/L和1.44 g/L的前提下可靠地比较聚苹果酸浓度的大小,从而验证近红外模型在培养基组分优化和诱变菌株筛选领域中的应用价值。 展开更多

关键词 近红外建模 偏最小二乘法 聚苹果酸 单因素培养基优化 诱变菌种筛选 配对t-检验

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磷酸甜菜碱对产黑色素短梗霉发酵产聚苹果酸的影响 被引量：1

16

作者 杨东霖 李佳谦 +5 位作者 鲁亮 王舸楠 王纪 赵廷彬 殷海松 乔长晟 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2022年第13期33-41,共9页

聚苹果酸是一种主要由微生物合成的有机生物高分子材料,可应用于生物制药与可降解材料等领域。该研究以产黑色素短梗霉(Aureobasidium melanogenum)为研究对象,探究磷酸甜菜碱对菌体发酵聚苹果酸的影响。结果发现:磷酸甜菜碱最适添加量... 聚苹果酸是一种主要由微生物合成的有机生物高分子材料,可应用于生物制药与可降解材料等领域。该研究以产黑色素短梗霉(Aureobasidium melanogenum)为研究对象,探究磷酸甜菜碱对菌体发酵聚苹果酸的影响。结果发现:磷酸甜菜碱最适添加量为0.9 g/L,5 L罐实验在通风量为8 L/min、恒定转速450 r/min的最适条件下聚苹果酸产量最后可达到53.10 g/L远高于空白组(17.29 g/L)。通过转录组分析发现,菌体的己糖激酶与磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶等关键酶表达量提高,说明菌体对糖的利用能力与聚苹果酸合成的能力增强,该研究为聚苹果酸工业化生产提供了一种可行方案,为磷酸甜菜碱在其他发酵领域中的应用提供了参考。 展开更多

关键词 产黑色素短梗霉 聚苹果酸 磷酸甜菜碱 工艺优化 转录组学

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聚苹果酸高产菌的筛选与鉴定 被引量：2

17

作者 吕磊磊 周丹凤 +1 位作者 陈林杰 魏培莲 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2021年第11期116-121,共6页

从校园周边取样进行了聚苹果酸(Poly malic acid, PMA)高产菌株的分离筛选。经离心管发酵初筛获得了21株产PMA菌株,并初步判断编号Ⅰ-2、Ⅰ-13a、Ⅲ-16菌株的产PMA能力较强,经摇瓶发酵复筛,确定编号Ⅰ-13a菌株的产PMA能力最强,产量达到(... 从校园周边取样进行了聚苹果酸(Poly malic acid, PMA)高产菌株的分离筛选。经离心管发酵初筛获得了21株产PMA菌株,并初步判断编号Ⅰ-2、Ⅰ-13a、Ⅲ-16菌株的产PMA能力较强,经摇瓶发酵复筛,确定编号Ⅰ-13a菌株的产PMA能力最强,产量达到(43.08±0.36) g/L。通过形态学特征观察和分子生物学分析,对高产菌株进行了菌种鉴定,结果表明该菌株生长初期呈浅粉色,后期变绿变暗;细胞呈芽殖,卵圆形,单个存在;ITS核苷酸序列长度为560 bp,与Aureobasidium melanogenum菌株同源相似度为97%。由此确定该菌株为产黑色素短梗霉(Aureobasidium melanogenum),命名为ZUST-HD,GenBank库登录号为MK754072.1。 展开更多

关键词 短梗霉 聚苹果酸 筛选 鉴定

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β聚苹果酸/壳聚糖硝苯地平微胶囊的制备研究

18

作者 王风楼 吴艳丽 +1 位作者 王文扬 马霞 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2014年第17期244-247,共4页

目的:将聚苹果酸(poly malic acid,PMLA)与壳聚糖(CS)发生复凝聚形成微胶囊并对药物硝苯地平进行包埋,制得粒度均一的微胶囊颗粒。方法:根据预实验确定添加顺序和范围,进行Plackette-Burman实验选择影响较强的几个因素,根据(Box-Behnke... 目的:将聚苹果酸(poly malic acid,PMLA)与壳聚糖(CS)发生复凝聚形成微胶囊并对药物硝苯地平进行包埋,制得粒度均一的微胶囊颗粒。方法:根据预实验确定添加顺序和范围,进行Plackette-Burman实验选择影响较强的几个因素,根据(Box-Behnken设计)正交设计得到最优的制备条件。结果:根据实验得出,当条件为β-聚苹果酸浓度1.0g/L、壳聚糖浓度0.5g/L、β-聚苹果酸与壳聚糖溶液体积比2∶1、壳聚糖pH4.0、硝苯地平溶液浓度1.0g/L、硝苯地平添加量3.0mL、β-聚苹果酸溶液滴加速度10.0mL/h、搅拌速度600r/min、体系反应时间45min,所得微胶囊平均粒径525.6nm,平均分散系数0.186. 展开更多

关键词 β-聚苹果酸 壳聚糖 微胶囊 Plackette—Burman Box—Behnken

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聚乙烯醇/聚苹果酸复合水凝胶的制备及性能研究 被引量：5

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作者 马争发 谭维群 +3 位作者 余甜甜 崔世煜 廖秋香 张丽杰 《功能材料》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期10200-10206,共7页

以PVA和PMLA为原料,采用冷冻-解冻法制备复合水凝胶,考察了复合水凝胶的凝胶分率、溶胀性、保湿性、力学性能,并验证了复合水凝胶的抗菌性和细胞毒性。通过红外吸收光谱证实复合水凝胶内PVA和PMLA的分子间以氢键结合,电镜扫描观察到复... 以PVA和PMLA为原料,采用冷冻-解冻法制备复合水凝胶,考察了复合水凝胶的凝胶分率、溶胀性、保湿性、力学性能,并验证了复合水凝胶的抗菌性和细胞毒性。通过红外吸收光谱证实复合水凝胶内PVA和PMLA的分子间以氢键结合,电镜扫描观察到复合水凝胶具有更大孔径的三维立体结构;随着PMLA的增加,复合水凝胶的凝胶分数和拉伸强度略有降低,但保湿性和断裂伸长率增加。当聚乙烯醇含量为5%(质量分数)、聚苹果酸含量为0.25%时,复合水凝胶24 h的溶胀率达到10倍左右;PVA/PMLA复合水凝胶对大肠杆菌和金黄葡萄球菌均具有较好的抑菌效果,随着PMLA增加抑菌性增强;且无细胞毒性,具有良好的生物相容性。 展开更多

关键词 聚苹果酸 聚乙烯醇 水凝胶 伤口敷料

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高产聚苹果酸黑色素短梗霉CGMCC18996全基因组组装注释及关键蛋白分析

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作者 王舸楠 李佳谦 +5 位作者 李雨桐 陈世伟 王淑贤 赵廷彬 贾士儒 乔长晟 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第16期213-219,共7页

通过PacBio Sequel II及Illumina NovaSeq 6000测序平台对高产聚苹果酸(polymalic acid,PMLA)产黑色素短梗霉(Aureobasidium melanogenum)基因组进行测序,对测序得到的下机文件进行组装,并结合转录组数据进行基因结构注释。结果表明,产... 通过PacBio Sequel II及Illumina NovaSeq 6000测序平台对高产聚苹果酸(polymalic acid,PMLA)产黑色素短梗霉(Aureobasidium melanogenum)基因组进行测序,对测序得到的下机文件进行组装,并结合转录组数据进行基因结构注释。结果表明,产黑色素短梗霉基因组中共有6202个基因,主要参与碳水化合物转运及代谢、氨基酸转运代谢、转录后修饰、RNA加工及修饰等生物活动。功能注释结果显示基因组中有大部分基因与过氧化物体有关,进而对菌株进行透射电镜拍摄,发现菌体中存在圆形的类过氧化物体(乙醛酸体)结构,提示菌体可通过乙醛酸循环途径生成苹果酸。最后,对可能与PMLA合成有关的磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶激酶和苹果酸合成酶进行了蛋白质结构预测,发现这两种蛋白可能具备合成苹果酸的能力。本研究结果可为产黑色短梗霉菌株的PMLA代谢提供一定的参考,同时,组装的基因组文件已上传至相关数据库,为后续的菌株开发利用提供基础。 展开更多

关键词 聚苹果酸 产黑色素短梗霉 基因组测序 基因组组装 蛋白质预测

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