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环介导等温扩增技术的发展及其在耐药基因检测中的应用
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作者 廖怡雯 叶景芬 +4 位作者 武绍碧 陈世雄 杨婉 罗雪 杨琦 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第4期1621-1631,共11页
本文介绍了环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)技术的原理、过程和特点,以及其在耐药基因检测中的应用。LAMP技术以其高效、特异、灵敏和简便的特点,在分子生物学领域得到了广泛应用。除了基本的LAMP检测方... 本文介绍了环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)技术的原理、过程和特点,以及其在耐药基因检测中的应用。LAMP技术以其高效、特异、灵敏和简便的特点,在分子生物学领域得到了广泛应用。除了基本的LAMP检测方法外,本文还对一些新型LAMP技术,如IMS-LAMP、LAMP与CRISPR/Cas系统的联用、LAMP与Argonaute系统的联用、LAMP传感器以及LAMP与微流控芯片的结合等做了介绍。针对耐药基因的检测中,LAMP技术展现了很好的应用前景,为快速、准确地检测耐药基因提供了有效的工具。 展开更多
关键词 环介导等温扩增 恒温扩增 快速扩增 检测方法 耐药基因检测
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宠物犬源沙门氏菌和葡萄球菌耐药性及耐药基因检测 被引量:9
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作者 轩慧勇 林亚军 +2 位作者 高超 吾买尔江.牙合甫 夏利宁 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2019年第3期14-20,共7页
【目的】了解新疆乌鲁木齐市宠物犬源沙门氏菌和葡萄球菌的耐药性及耐药基因携带情况。【方法从77份宠物犬直肠粪便样品中分离沙门氏菌和葡萄球菌,采用琼脂稀释法对分离的菌株进行药敏试验,通过PCR方法对沙门氏菌6类23种耐药基因和葡萄... 【目的】了解新疆乌鲁木齐市宠物犬源沙门氏菌和葡萄球菌的耐药性及耐药基因携带情况。【方法从77份宠物犬直肠粪便样品中分离沙门氏菌和葡萄球菌,采用琼脂稀释法对分离的菌株进行药敏试验,通过PCR方法对沙门氏菌6类23种耐药基因和葡萄球菌5类9种耐药基因进行检测。【结果】从77份宠物犬粪便样品中分离到沙门氏菌36株,葡萄球菌75株。除头孢噻呋、安普霉素、阿米卡星、硫酸庆大霉素和多黏菌素外,宠物犬源沙门氏菌对其他被捡抗菌药物的耐药率高达97.0%以上,多重耐药以8耐为主,tetB、blaTEM、blaOXA、qnrS、oqxA、oqxB、aac(6′)-Ib-cr、ant(3″)-Ia和floR基因检出率在97.0%以上。宠物犬源葡萄球菌对左氧氟沙星(93.5%)、苯唑西林(90.7%)和氟苯尼考(82.9%)耐药率在80.0%以上,多重耐药集中在4耐、6耐和9耐,主要检出的基因为fexA(40.0%,30/75)和femA(18.7%,14/75),其次为tetM(16.0%,12/75)、ermB(14.7%,11/75)和mecA(1.3%,1/75)。【结论】宠物犬源沙门氏菌和葡萄球菌耐药情况严重,耐药基因携带率高,使宠物犬的细菌性疾病治疗难度加大,应加强耐药菌的监测,降低宠物犬源耐药菌转移给人的潜在风险。 展开更多
关键词 宠物犬 沙门氏菌 葡萄球菌 耐药基因检测
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分离鉴定及耐药基因检测 被引量:5
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作者 台晓媛 赵谦 +3 位作者 施德佳 王晓春 杨贵树 尹革芬 《上海畜牧兽医通讯》 2019年第1期6-9,共4页
为了解动物源性金黄色葡萄球菌对市售常见的各种兽用抗生素药物的耐药情况,掌握并分析其耐药性,指导临床合理使用抗菌药物。本研究通过常规细菌分离鉴定患病动物炎性分泌物,对分离菌株进行生化试验、耐药性试验、耐甲氧西林金黄色葡萄球... 为了解动物源性金黄色葡萄球菌对市售常见的各种兽用抗生素药物的耐药情况,掌握并分析其耐药性,指导临床合理使用抗菌药物。本研究通过常规细菌分离鉴定患病动物炎性分泌物,对分离菌株进行生化试验、耐药性试验、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant S.aureus,MRSA)鉴定和耐药基因鉴定,获得4株耐药金黄色葡萄球菌,2株为MRSA,2株为甲氧西林敏感的金黄色葡萄球菌(Methicillinsusceptible S.aureus,MSSA);4株金黄色葡萄球菌均检测出tetA、aac(6')/aph(2')、sul1耐药基因,其中2株MRSA检测出mecA。MRSA与MSSA均表现出了多重耐药现象,其中MRSA比MSSA的耐药现象更为广泛。因此,要更加关注MRSA的流行情况,制定规范的用药行为,严控抗生素药物的滥用。 展开更多
关键词 甲氧西林金黄色葡萄球菌 敏试验 耐药基因检测
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江苏省HIV-1基因型抗病毒治疗失败患者耐药检测结果分析 被引量:14
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作者 卢静 徐晓琴 +3 位作者 周莹 陈远方 傅更锋 还锡萍 《中国感染控制杂志》 CAS 北大核心 2018年第10期884-888,共5页
目的了解江苏省2010—2014年HIV-1感染者抗病毒失败人群的HIV-1耐药情况,为临床抗病毒治疗提供参考。方法根据耐药检测实验室网络收集江苏省2010—2014年的HIV-1基因型耐药检测结果,对各年度相关药物耐药情况、耐药基因位点及病毒基因... 目的了解江苏省2010—2014年HIV-1感染者抗病毒失败人群的HIV-1耐药情况,为临床抗病毒治疗提供参考。方法根据耐药检测实验室网络收集江苏省2010—2014年的HIV-1基因型耐药检测结果,对各年度相关药物耐药情况、耐药基因位点及病毒基因亚型进行统计分析。结果 2010—2014年分别纳入样本74、113、197、278、346份,其中检测出现耐药结果的比率分别为68.92%、48.67%、51.27%、52.52%和57.80%。各年度间HIV-1主要耐药药物类似,核苷类主要有3TC、ABC、DDI和FTC,非核苷类药物以EFV和NVP为主。HIV-1对蛋白酶类药物耐药差别较大,且目前使用的LPV/r的耐药率在1%以下。年度间HIV-1主要耐药位点为184、181、190及103位,其中184位突变主要引起3TC和FTC耐药,而181、190、103位突变与EFV和NVP耐药相关。HIV-1病毒基因亚型均以CRF01_AE为主,且呈上升趋势。结论江苏省HIV感染者抗病毒治疗失败人群HIV-1基因型耐药率有上升趋势,应加强对抗病毒治疗患者的耐药检测,从而及时合理调整抗病毒治疗方案。 展开更多
关键词 艾滋病 基因检测 抗病毒治疗 基因亚型
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PCR法及环介导等温扩增法筛查食源微生物的耐药基因 被引量:2
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作者 鲁曦 张志刚 +2 位作者 陈妙瑞 闫鹤 石磊 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期180-185,共6页
耐药基因可通过垂直传播和水平传播等途径在微生物的种内和种间进行传递,食用受到耐药菌污染的食品,具有威胁人类健康的潜在可能。为建立耐药基因快速检测方法并应用于食源性微生物耐药基因的筛查,对食源性耐药菌在食品中的存在状况、... 耐药基因可通过垂直传播和水平传播等途径在微生物的种内和种间进行传递,食用受到耐药菌污染的食品,具有威胁人类健康的潜在可能。为建立耐药基因快速检测方法并应用于食源性微生物耐药基因的筛查,对食源性耐药菌在食品中的存在状况、耐药种类进行了探讨。采集了3个不同菜市场的9份食品样本,对食源菌进行了分离培养,使用四环素、链霉素、红霉素、氯霉素、甲氧苄胺嘧啶进行抗性菌筛选,并利用聚合酶链式反应(PCR)技术及环介导等温扩增(LAMP)法对8种抗性基因进行筛查,同时用实时荧光定量技术对结果进行了验证。9份食品样本中,菌落总数在105CFU/g至107CFU/g。红霉素抗性的菌落数最多,除1份样本外均在105CFU/g以上;氯霉素抗性菌菌落数最低,除1份样本之外均在103CFU/g以下。在对8种耐药基因筛查时发现,在四环素抗性菌中耐药基因tetA阳性率最高,为75.56%。采用LAMP法筛查耐药基因,阳性率高于PCR法。结果表明,具有抗药性的食源菌在样本中大量存在,这提示食品可以作为抗性菌存在和传播的重要介质。而LAMP作为一种简单、快速的基因检测技术可以用于耐药基因的快速筛查,为了解抗性菌在食品加工环境的污染和分布情况,以及消杀防控措施的采取和评估提供了基础信息。 展开更多
关键词 基因 快速检测 环介导等温扩增法
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Xpert MTB/RIF Ultra快速诊断涂阴肺结核的临床价值 被引量:14
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作者 丁彩红 王余余 +3 位作者 王庆 高绪胜 解丹 熊瑜 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期761-767,共7页
目的评估超敏结核分枝杆菌和利福平耐药基因检测(XpertUltra)方案检测痰液及支气管肺泡灌洗液(BALF)标本在涂阴肺结核患者中早期、快速诊断的价值。方法选择2020年5月-2021年12月在山东省公共卫生临床中心就诊的痰涂片阴性疑似肺结核患... 目的评估超敏结核分枝杆菌和利福平耐药基因检测(XpertUltra)方案检测痰液及支气管肺泡灌洗液(BALF)标本在涂阴肺结核患者中早期、快速诊断的价值。方法选择2020年5月-2021年12月在山东省公共卫生临床中心就诊的痰涂片阴性疑似肺结核患者93例,其中临床诊断为涂阴肺结核57例,非肺结核36例。收集所有患者的痰液及BALF标本,分别采用Xpert Ultra、GeneXpert MTB/RIF(Xpert)、BACTEC MGIT 960培养(MGIT 960培养)进行检测。以临床诊断为参考标准,评价3种检测方案及相互联合检测痰液及BALF标本时诊断涂阴肺结核的敏感度、特异度及符合率。结果以临床诊断结果为参考标准,Xpert Ultra检测痰液标本对涂阴肺结核诊断的敏感度明显高于Xpert[56.14%(32/57)vs.36.84%(21/57),P=0.03]和MGIT960培养[56.14%(32/57)vs.33.33%(19/57),P=0.014];Xpert Ultra检测BALF标本对涂阴肺结核诊断的敏感度明显高于Xpert[75.44%(43/57)vs.56.14%(32/57),P=0.030]和MGIT960培养[75.44%(43/57)vs.38.60%(22/57),P<0.01]。3种检测方案及相互联合检测痰液标本诊断涂阴肺结核,受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)依次为:三者联合(0.807)>Xpert Ultra+Xpert(0.798)>Xpert Ultra+MGIT 960培养(0.789)>Xpert Ultra(0.781)>Xpert(0.684)>MGIT 960培养(0.667);检测BALF标本,AUC依次为:三者联合(0.895)=Xpert Ultra+Xpert(0.895)>XpertUltra+MGIT960培养(0.877)=XpertUltra(0.877)>Xpert(0.781)>MGIT960培养(0.693)。3种检测方案均未在入组患者中检测到利福平耐药。结论Xpert Ultra对早期、快速诊断涂阴肺结核具有较高的临床应用价值;其检测BALF的敏感度高于痰液标本,建议优先选择BALF标本。 展开更多
关键词 超敏结核分枝杆菌和利福平耐药基因检测 涂阴肺结核 分子诊断技术 早期诊断
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一株羊源致病性大肠杆菌分离鉴定 被引量:2
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作者 张国华 金振华 +8 位作者 张备 王丽坤 薛沾枚 海龙 张艳 刘雪松 南景东 沈思思 吕明哲 《云南畜牧兽医》 2022年第5期9-12,共4页
为了研究齐齐哈尔市周边某羊场羔羊发生腹泻的原因,通过对1例腹泻羔羊的粪便进行细菌分离鉴定、生化试验、K-B试纸法进行药物敏感性试验、菌体16S rDNA序列鉴定、动物致病性试验、耐药基因检测。结果从羔羊粪便中分离出一株细菌,菌落形... 为了研究齐齐哈尔市周边某羊场羔羊发生腹泻的原因,通过对1例腹泻羔羊的粪便进行细菌分离鉴定、生化试验、K-B试纸法进行药物敏感性试验、菌体16S rDNA序列鉴定、动物致病性试验、耐药基因检测。结果从羔羊粪便中分离出一株细菌,菌落形态和生化试验结果与大肠杆菌相符,药物敏感性试验显示对头孢噻肟、头孢他定耐药,对四环素、环丙沙星中介,对阿米卡星、庆大霉素、氨苄西林敏感。扩增的16S rDNA序列片段大小约1500 bp,与GenBank对比显示和序列号为NC_054923.1的大肠杆菌同源性高达99.15%,将细菌接种于小白鼠体内24 h全部死亡,并检测到该大肠杆菌携带EBC耐药基因。为齐齐哈尔市羊源致病性大肠杆菌的研究提供了一定的依据。 展开更多
关键词 羔羊腹泻 大肠杆菌 Β-内酰胺类 性分析 耐药基因检测
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