小肠结肠炎耶尔森菌耐热性肠毒素B基因(ystB)初步研究 被引量：16

1

作者 王鑫 邱海燕 +11 位作者 肖玉春 许彦梅 金东 崔志刚 郑翰 罗霞 顾玲 汪华 朱凤才 史智扬 景怀琦 徐建国 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第6期449-453,共5页

目的研究小肠结肠炎耶尔森菌的耐热性肠毒素B基因(ystB)的分布特征。方法通过聚合酶链反应(PCR)、DNA探针杂交方法与序列分析检测致病性和非致病性小肠结肠炎耶尔森菌携带ystB基因的情况。结果98株非致病性小肠结肠炎耶尔森菌中52株携带... 目的研究小肠结肠炎耶尔森菌的耐热性肠毒素B基因(ystB)的分布特征。方法通过聚合酶链反应(PCR)、DNA探针杂交方法与序列分析检测致病性和非致病性小肠结肠炎耶尔森菌携带ystB基因的情况。结果98株非致病性小肠结肠炎耶尔森菌中52株携带ystB基因,占53.06%。全部48株致病性小肠结肠炎耶尔森菌均不携带该基因。结论ystB基因仅存在于部分生物1A型非致病性小肠结肠炎耶尔森菌,而不存在于致病性菌株中。 展开更多

关键词 小肠结肠炎耶尔森菌 耐热性肠毒素b基因dna序列

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小眼高原鳅线粒体DNA细胞色素b基因序列分析 被引量：4

2

作者 李太平 李均祥 《青海畜牧兽医杂志》 2003年第3期10-11,共2页

对小眼高原鳅线粒体DNA细胞色素b基因进行了PCR扩增、克隆及其序列测定 ,得到全序列长度为 114 0bp ,其T、C、A、G含量分别为 3 62 ( 3 1 8% )、2 91( 2 5 5 % )、3 0 1( 2 6 4% )、186( 16 3 ) ,GC含量 41 8%。分子质量为 3 49782。

关键词 小眼高原鳅 线粒体dna 细胞色素b基因 序列分析 PCR

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石爬(鱼兆)属2种鱼线粒体DNA细胞色素b基因序列的比较研究

3

作者 杨成 晁燕 +3 位作者 申志新 祁得林 唐文家 王国杰 《水产科学》 CAS 北大核心 2010年第1期23-26,共4页

对采于青海省玛柯河的6尾黄石爬(鱼兆)和四川省都江堰的1尾青石爬(鱼兆)线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)基因进行了PCR扩增并进行序列测定。结果表明,黄石爬(鱼兆)6个个体均属同一单倍型。在Cyt b基因全长1140 bp中,2种鱼类存在29个变异位点(... 对采于青海省玛柯河的6尾黄石爬(鱼兆)和四川省都江堰的1尾青石爬(鱼兆)线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)基因进行了PCR扩增并进行序列测定。结果表明,黄石爬(鱼兆)6个个体均属同一单倍型。在Cyt b基因全长1140 bp中,2种鱼类存在29个变异位点(2.54%),其中23个(79.3%)突变位点为转换,6个(20.7%)突变位点为颠换。2种鱼类序列差异偏低,提示分化较晚,致使物种间在Cyt b基因上未能积累丰富的碱基变异。黄石爬(鱼兆)遗传多样度较低,可能与其栖息环境的改变有关。 展开更多

关键词 黄石爬(鱼兆) 青石爬(鱼兆) 线粒体dna细胞色素b基因 序列特征 系统发育

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羚牛细胞色素b基因序列分析和系统进化研究 被引量：12

4

作者 蒙世杰 王静 +2 位作者 刘佩 宿兵 张亚平 《西北大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期347-350,354,共5页

应用聚合酶链式反应 ( PCR)分别扩增了羚牛、绵羊、山羊、黄牛细胞色素 b基因 ,并对其全序列 ( 1 1 40 bp)进行了测定。其中羚牛细胞色素 b基因序列属首次报道。通过对 8种偶蹄类动物细胞色素 b基因序列差异分析和基于序列差异所构建的... 应用聚合酶链式反应 ( PCR)分别扩增了羚牛、绵羊、山羊、黄牛细胞色素 b基因 ,并对其全序列 ( 1 1 40 bp)进行了测定。其中羚牛细胞色素 b基因序列属首次报道。通过对 8种偶蹄类动物细胞色素 b基因序列差异分析和基于序列差异所构建的分子系统树 ,发现羚牛与羊亚科的动物亲缘关系最近 ,与其他动物亲缘关系较远 ,表明将羚牛放入羊亚科较为合理。序列差异分析还表明羚牛约在距今 5 0 0万年前 (上新世 )从牛类动物中分化出来 ,牛类分化时间约在 60 0万年前的中新世( Miocene) 展开更多

关键词 羚牛 偶蹄目 细胞色素b基因 dna序列分析 系统进化 羊亚科 分类

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基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的高邮湖湖鲚(Coilia nasus)遗传多样性分析 被引量：15

5

作者 李大命 张彤晴 +4 位作者 关浩勇 唐晟凯 刘燕山 刘小维 潘建林 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2017年第6期3-8,共6页

本研究利用线粒体细胞色素b(Cytb)基因和控制区(D-loop)序列作为分子标记,调查了高邮湖湖鲚(Coilia nasus)种群遗传多样性。结果显示,Cytb基因和D-loop区序列碱基A+T含量均高于G+C含量,显示碱基组成具有偏倚性。38条Cytb基因序列检出26... 本研究利用线粒体细胞色素b(Cytb)基因和控制区(D-loop)序列作为分子标记,调查了高邮湖湖鲚(Coilia nasus)种群遗传多样性。结果显示,Cytb基因和D-loop区序列碱基A+T含量均高于G+C含量,显示碱基组成具有偏倚性。38条Cytb基因序列检出26个变异位点,定义13个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.716±0.078和0.002 70±0.000 57;40条D-loop区序列检出53个变异位点,定义21个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.906±0.034和0.006 27±0.000 99。13个Cytb基因单倍型之间的遗传距离在0.001~0.014之间,NJ系统进化树显示单倍型聚为1支;21个D-loop区单倍型之间的遗传距离在0.001~0.019之间,NJ系统进化树显示单倍型聚为2支。中性检测结果和歧点分布图均表明高邮湖湖鲚种群稳定,近期没有发生种群扩张。整体来看,高邮湖湖鲚种质资源遗传多样性水平较高,具有高单倍型多样性和低核苷酸多样性的特征。 展开更多

关键词 湖鲚(Coilia nasus) 遗传多样性 线粒体dna 细胞色素b基因 控制区序列

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中华鳖(Pelodiscus sinensis)5个不同地理种群细胞色素b基因序列变异及种群遗传结构分析 被引量：18

6

作者 张永正 张海琪 +3 位作者 何中央 徐晓林 李智强 杜建明 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期234-239,共6页

利用线粒体细胞色素b基因序列对中华鳖5个不同地理种群(太湖群体、日本群体、江西群体、台湾群体和乌鳖群体)的种群遗传结构进行分析。以特异引物进行PCR扩增,获得了408bp的基因片断序列。序列分析结果表明,在31个中华鳖个体中,共检测... 利用线粒体细胞色素b基因序列对中华鳖5个不同地理种群(太湖群体、日本群体、江西群体、台湾群体和乌鳖群体)的种群遗传结构进行分析。以特异引物进行PCR扩增,获得了408bp的基因片断序列。序列分析结果表明,在31个中华鳖个体中,共检测到17个变异位点,获得8种单倍型。日本群体的2种单倍型在其他4个群体中都未检测到,为该群体所特有,日本种群与其他4个群体的遗传距离最远。除日本群体缺乏主体单倍型外,其他4个群体共同拥有主体单倍型Hap.1,江西群体、台湾群体和乌鳖群体的单倍型类型都和其他群体共同享有,没有其特异的单倍型。MP法和NJ法构建的系统发生树显示日本群体的两种单倍型以很高的置信度聚成一支,这与其地理分布存在一定的相关性,其序列上的差异,可以成为种群鉴别的分子标记;另外4个群体的6种单倍型聚合成一大支,但同一个地理区域的群体并未聚成一类,未按照地理位置形成明显的地理格局。 展开更多

关键词 中华鳖 线粒体dna 细胞色素b基因 序列分析 种群遗传结构

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4个绵羊品种线粒体细胞色素b基因的序列差异和系统进化研究 被引量：27

7

作者 张传生 耿立英 +2 位作者 万海伟 李吉涛 杜立新 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期313-317,共5页

测定了小尾寒羊、大尾寒羊、洼地绵羊、滩羊和鲁北白山羊5个品种羊415bp线粒体DNA细胞色素b基因片段,其中44个位点检出变异。分析其碱基组成和变异情况,并以鲁北白山羊为外群,用UPGMA和NJ法构建了一系列分子系统树,得到相同的拓扑结构,... 测定了小尾寒羊、大尾寒羊、洼地绵羊、滩羊和鲁北白山羊5个品种羊415bp线粒体DNA细胞色素b基因片段,其中44个位点检出变异。分析其碱基组成和变异情况,并以鲁北白山羊为外群,用UPGMA和NJ法构建了一系列分子系统树,得到相同的拓扑结构,在分子水平从母系遗传的角度澄清4个绵羊品种的起源分化关系。结果显示:在4个绵羊品种之间,洼地绵羊与滩羊关系最近与小尾寒羊亲缘关系最远。绵羊品种内的平均差异为0185%,线粒体DNA多态性相对贫乏,推测4个品种绵羊具有共同的母系祖先。 展开更多

关键词 线粒体细胞色素b基因 绵羊品种 系统进化 序列差异 线粒体dna多态性 鲁北白山羊 小尾寒羊 洼地绵羊 分子系统树 UPGMA 大尾寒羊 基因片段 碱基组成 拓扑结构 起源分化 母系遗传 分子水平 亲缘关系 平均差 滩羊 变异 种羊

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4种鲷科鱼种内细胞色素b基因序列的保守性 被引量：6

8

作者 刘红艳 苏天凤 +2 位作者 周发林 吕俊霖 江世贵 《湛江海洋大学学报》 2003年第1期8-12,共5页

对真鲷 (Pagrosomusmajor)、黄鳍鲷 (Sparuslatus)、黑鲷 (S .macrocephalus)和平鲷 (Rhabdosar gussarba )的线粒体DNA细胞色素b 4 0 5bp序列进行测定。结果发现 ,4种鲷科鱼种内碱基的变异较低 ,真鲷为 0 .2 5% ,黄鳍鲷为 0 .74 % ,黑... 对真鲷 (Pagrosomusmajor)、黄鳍鲷 (Sparuslatus)、黑鲷 (S .macrocephalus)和平鲷 (Rhabdosar gussarba )的线粒体DNA细胞色素b 4 0 5bp序列进行测定。结果发现 ,4种鲷科鱼种内碱基的变异较低 ,真鲷为 0 .2 5% ,黄鳍鲷为 0 .74 % ,黑鲷和平鲷均为 0 ;真鲷有 4种单倍型 ,黄鳍鲷有 2种单倍型 ,黑鲷和平鲷分别为 1种单倍型 ,且单倍型间变异位点很少 ,真鲷有 3个变异位点 ,黄鳍鲷仅有 1个变异位点 ,而黑鲷和平鲷无变异位点。结果表明 ,细胞色素b基因在这 4种鲷科鱼种内是相当保守的。 展开更多

关键词 鲷科鱼类 细胞色素b 基因序列 保守性 线粒体dna

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5种壁虎科动物Cyt b基因的序列分析 被引量：2

9

作者 韦素玲 曾振华 +1 位作者 李翠凤 秦新民 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第6期2268-2269,共2页

以红斑大壁虎、黑斑大壁虎、蹼趾壁虎和中国石龙子为材料,采用改进的SDS/蛋白酶K裂解法提取DNA,用特异引物进行PCR扩增线粒体Cyt b基因部分序列,PCR产物经纯化后,进行序列测序。用邻接法和最大简约法构建了其系统发育关系,结果显示红斑... 以红斑大壁虎、黑斑大壁虎、蹼趾壁虎和中国石龙子为材料,采用改进的SDS/蛋白酶K裂解法提取DNA,用特异引物进行PCR扩增线粒体Cyt b基因部分序列,PCR产物经纯化后,进行序列测序。用邻接法和最大简约法构建了其系统发育关系,结果显示红斑大壁虎和黑斑大壁虎首先聚在一起,再先后与同为壁虎属的蹼趾壁虎和白脊壁虎相聚,然后与同为壁虎科的沙虎相聚,最后与石龙子科的中国石龙子相聚。 展开更多

关键词 壁虎科 线粒体dna CYT b基因 序列分析

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利用Cytb基因序列研究翘嘴红鲌的系统发生 被引量：6

10

作者 黄丽英 丁诗华 +2 位作者 张海琪 杜建明 何中央 《西南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2005年第6期909-913,共5页

线粒体细胞色素b基因序列分析可显示种间及种内遗传差异,广泛用于种类鉴定和系统发生研究。为了阐明翘嘴红鲌与其他鳊亚科鱼类的亲缘关系,扩增并测定了翘嘴红鲌的414 bp细胞色素b基因片段序列。所获序列与4种鳊亚科鱼类细胞色素b基因的... 线粒体细胞色素b基因序列分析可显示种间及种内遗传差异,广泛用于种类鉴定和系统发生研究。为了阐明翘嘴红鲌与其他鳊亚科鱼类的亲缘关系,扩增并测定了翘嘴红鲌的414 bp细胞色素b基因片段序列。所获序列与4种鳊亚科鱼类细胞色素b基因的相应序列进行比较,发现共有61个多态性核苷酸位点(14.73%),大多数位点出现在密码子的第3位且主要为碱基转换。翘嘴红鲌与鳊之间的序列同源性最高,为93.48%,与广东鲂、三角鲂和团头鲂的序列同源性则分别为90.58%,90.82%,91.30%。以鲤为外群,分别利用MP法和NJ法分析上述序列数据,获得相似的系统发生树。该结果显示,翘嘴红鲌和鳊聚为1个支系,广东鲂、三角鲂以及团头鲂则聚为另1个支系,说明翘嘴红鲌与鳊的亲缘关系较近,而与广东鲂、三角鲂及团头鲂的亲缘关系则较远。 展开更多

关键词 翘嘴红鲌 线粒体dna 细胞色素b基因 序列分析 系统发生

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两种鼠蛲虫线粒体cytb基因的种间及种内序列变异研究

11

作者 杨言川 鲁力 +3 位作者 田伟鹏 刘光学 朱兴全 孙晓林 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期29-32,共4页

首次研究了小鼠四翼无刺线虫和隐管状线虫在线粒体细胞色素b(cytb)基因部分序列的种间及种内变异.从甘肃兰州地区LY和LS两个实验动物中心的小鼠肠道内收集了41个蛲虫样品(LY1-20、LS1-21),PCR扩增其cytb基因部分序列,经测序和序列分析... 首次研究了小鼠四翼无刺线虫和隐管状线虫在线粒体细胞色素b(cytb)基因部分序列的种间及种内变异.从甘肃兰州地区LY和LS两个实验动物中心的小鼠肠道内收集了41个蛲虫样品(LY1-20、LS1-21),PCR扩增其cytb基因部分序列,经测序和序列分析结果发现:四翼无刺线虫cytb有效序列为531bp,而隐管状线虫有效序列为567bp.用软件ClustalX1.83截取两种鼠蛲虫cytb基因长度共同的序列,比对后发现无种内差异,但种间差异高达31.51%.研究结果初步表明,cytb基因序列在鼠蛲虫种内较保守,但种间存在较高的变异率,可作为两种常见鼠蛲虫种间分子鉴定的遗传标记. 展开更多

关键词 蛲虫 小鼠 线粒体dna 细胞色素 b基因 序列分析

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基于线粒体和核基因DNA序列分析的大河乌猪群体结构和遗传多样性研究

12

作者 Tang L 晋大鹏 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第4期112-112,共1页

为了研究大河乌猪的遗传多样性和群体结构,试验选取5个地理种群的175个大河乌猪样品,分析所有个体的线粒体细胞色素b和主要组织相容性复合体(MHC)DRB基因序列。AMOVA、系统进化树和基因流分析结果显示,在5个种群间检测到高水平的基因流... 为了研究大河乌猪的遗传多样性和群体结构,试验选取5个地理种群的175个大河乌猪样品,分析所有个体的线粒体细胞色素b和主要组织相容性复合体(MHC)DRB基因序列。AMOVA、系统进化树和基因流分析结果显示,在5个种群间检测到高水平的基因流,尤其是从大河镇(Pop1)或营上镇(Pop2)到其他种群(Pop3、Pop4和Pop5)间。遗传多样性分析结果显示,5个种群间多样性指数无显著性变化,但较低于其他中国猪种。结果表明,不同的基因流、不稳定的种群格局和较低的遗传多样性主要受以经济效益为前提的人为引入的影响。本试验对其遗传信息的检测和分析,可用于大河乌猪遗传资源的保存及进一步的遗传改良,为该品种遗传资源的保护、利用和评价提供重要参考。 展开更多

关键词 线粒体细胞色素b 遗传多样性 大河乌猪 群体结构 dna序列分析 主要组织相容性复合体 核基因 地理种群

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CSTB基因启动子区十二核苷酸重复序列d[CGCGGGGCGGGG]n形成串联G-四链体的研究

13

作者 李馨妍 刘亚泠 +1 位作者 于凯男 崔晓杰 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1374-1380,共7页

DNA串联重复序列扩展是引起多种神经性疾病的一个重要因素。对重复序列形成的高级结构研究可为相关疾病的发病机制和治疗策略提供重要的理论基础。位于半胱氨酸蛋白酶抑制剂B(cystatin B,CSTB)基因启动子区的一段十二核苷酸重复序列d[CG... DNA串联重复序列扩展是引起多种神经性疾病的一个重要因素。对重复序列形成的高级结构研究可为相关疾病的发病机制和治疗策略提供重要的理论基础。位于半胱氨酸蛋白酶抑制剂B(cystatin B,CSTB)基因启动子区的一段十二核苷酸重复序列d[CGCGGGGCGGGG]n的扩展是导致其表达异常,进而引起神经退行性疾病进行性肌阵挛癫痫(progressive myoclonus epilepsy,EPM1)的主要原因。但对其可能机制及高级结构的研究尚未见报道。本研究采用圆二色光谱法(circular dichroism spectroscopy,CD)和核磁共振波谱法(nuclear magnetic resonance spectroscopy,NMR),对含有多个重复单元的d[CGCGGGGCGGGG]n(n=2,4)形成的高级结构进行了解析。结果发现,含有2个重复单元的d[CGCGGGGCGGGG]2序列,可在1价阳离子K+诱导下,形成稳定的平行链G-四链体结构。而含4个重复单元的d[CGCGGGGCGGGG]4序列,可在分子内形成串联G-四链体堆叠排列。说明含多个重复单元的十二核苷酸重复序列,可形成分子内串联堆叠G-四链体高级结构。这些结果为十二核苷酸重复序列扩展,导致CSTB基因表达异常的分子机制提供了一种可能的合理假说,并为后续寻找小分子配体识别十二核苷酸串联重复扩展序列,进而调控CSTB基因表达的EPM1治疗策略提供了理论基础。 展开更多

关键词 dna串联重复序列 G-四链体 半胱氨酸蛋白酶抑制剂b(cystatin b CSTb)基因 进行性肌阵挛癫痫(EPM1)

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k-长DNA子序列计数算法研究 被引量：2

14

作者 王树林 王戟 +1 位作者 陈火旺 张鼎兴 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期40-42,共3页

基因组的结构与功能存在密切联系,其功能主要通过DNA子序列来表达,因此研究DNA序列结构对于生物信息学来说具有重要的意义。该文研究了k-长DNA子序列在DNA全序列中出现频数的计数问题,设计并实现了k-长DNA子序列内部计数算法和外部计数... 基因组的结构与功能存在密切联系,其功能主要通过DNA子序列来表达,因此研究DNA序列结构对于生物信息学来说具有重要的意义。该文研究了k-长DNA子序列在DNA全序列中出现频数的计数问题,设计并实现了k-长DNA子序列内部计数算法和外部计数算法。该算法通过一个哈希函数把k-长DNA子序列映射为整数关键字从而把k-长DNA子序列出现频数的计数问题转化为整数关键字的重复计数问题,使得能够利用经典B树算法来解决k-长DNA子序列的出现频数计数问题。针对所要解决的问题提出3种改进措施以进一步提高算法的性能。 展开更多

关键词 k-长dna子序列 dna序列 b树 全基因组

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人ZP3B-细胞表位嵌合肽DNA的设计和合成 被引量：2

15

作者 曹佐武 杨林 +1 位作者 潘善培 王自能 《暨南大学学报（自然科学与医学版）》 CAS CSCD 2000年第4期42-45,共4页

目的 :设计和合成适合在昆虫细胞中表达的一个人ZP3B细胞表位的DNA序列。方法 :根据国外的研究基础 ,设计由人ZP3的B细胞表位肽段和外源Th细胞表位肽段串联而成的 4 5肽嵌合肽序列 ,并根据昆虫细胞对密码子的偏爱性设计出该嵌合肽的DNA... 目的 :设计和合成适合在昆虫细胞中表达的一个人ZP3B细胞表位的DNA序列。方法 :根据国外的研究基础 ,设计由人ZP3的B细胞表位肽段和外源Th细胞表位肽段串联而成的 4 5肽嵌合肽序列 ,并根据昆虫细胞对密码子的偏爱性设计出该嵌合肽的DNA序列。然后人工合成该嵌合肽的DNA链 ,并克隆到PUC18载体上。结果 :通过酶切分析和测序证明 ,合成的DNA与所设计的嵌合肽DNA序列一致。结论 :　按设计合成了人ZP3的B细胞表位和外源Th细胞表位串联而成的嵌合肽DNA序列。 展开更多

关键词 人ZP3 透明带基因 b细胞表位 嵌合肽 dna序列

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大鼠乳腺肿瘤线粒体基因突变研究 被引量：4

16

作者 王平忠 蒙世杰 +1 位作者 刘佩 姚养正 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期297-301,共5页

目的 :了解大鼠乳腺癌组织、癌旁组织和正常组织的线粒体细胞色素b基因变异 ,探讨线粒体基因突变与肿瘤发生的关系。方法 :提取细胞总DNA ,用PCR法扩增细胞色素b基因 ,产物用DNA自动测序法进行序列分析。结果 :癌组织发生了nt14931C→G ... 目的 :了解大鼠乳腺癌组织、癌旁组织和正常组织的线粒体细胞色素b基因变异 ,探讨线粒体基因突变与肿瘤发生的关系。方法 :提取细胞总DNA ,用PCR法扩增细胞色素b基因 ,产物用DNA自动测序法进行序列分析。结果 :癌组织发生了nt14931C→G ,nt 15 0 0 4C→G和nt15 435T→C 3处点突变。癌旁组织发生了nt15 436A→C突变。正常组织没有突变。结论 :mtDNA突变可能是诱导核基因突变的内源性因素之一 ,对肿瘤的发生可能有促进作用。癌旁组织在DNA水平属非正常组织。 展开更多

关键词 大鼠 乳腺肿瘤 dna 线粒体 细胞色素b 基因突变 序列排列

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