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题名翻转距离星树问题的计算复杂度和近似算法
被引量：3
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作者
朱大铭
马绍汉
雷鹏
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机构
山东大学计算机科学技术学院
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出处
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2002年第6期1117-1122,共6页
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基金
国家自然科学基金资助项目(60073042)
国家教育部青年教师基金资助项目(y66053
+1 种基金
060602)
山东省中青年科学家奖励基金资助项目(01bs03)~~
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文摘
讨论基于基因组翻转距离的星型进化树问题的算法和复杂性.首先证明星树问题是NP-难解的,再证明该问题不存在绝对近似求解算法,最后给出一个求解星树问题的常数近似算法,近似性能比为2.
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关键词
翻转距离星树问题
计算复杂度
近似算法
数据结构
星型进化树
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Keywords
algorithm
phylogeny
genome
NP-completeness
approximation ratio
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分类号
TP311.12
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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题名目标序列部分确定的翻转距离星树问题
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作者
栾峻峰
朱大铭
马绍汉
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机构
山东大学计算机科学与技术学院
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出处
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2003年第2期183-189,共7页
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基金
国家自然科学基金~~
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文摘
讨论翻转距离星树问题,将3SAT问题归约到目标序列部分固定的翻转距离星树问题,证明实例中当有向符号序列个数为3时,若目标序列符号顺序固定,且有部分符号方向给定,则只确定其余符号方向以使得目标序列与已知3条给定序列翻转距离之和最小所对应的翻转距离星树问题也是NP-难解问题.同时,还给出了该问题的多项式时间近似算法.
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关键词
目标序列
翻转距离星树问题
NP问题
算法
计算复杂性
进化树
基因组
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Keywords
algorithm
computational complexity
evolutionary tree
genome
reversal distance
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分类号
O22
[理学—运筹学与控制论]
TP301.6
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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