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基于COI序列的翡翠股贻贝Perna viridis线粒体遗传特性分析及其近缘种间的系统关系探讨
被引量:
7
1
作者
位正鹏
孔晓瑜
+1 位作者
吴相云
喻子牛
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期72-78,共7页
应用通用引物COIL 1490和COIH 2198对翡翠股贻贝Perna viridis的性腺和体细胞线粒体DNA进行PCR扩增,获得661bp长度的COI基因片段,经过比对性腺与体细胞的COI片段,发现雄性性腺与体细胞COI基因均为一个单倍型,即体内只有一种线粒体DNA类...
应用通用引物COIL 1490和COIH 2198对翡翠股贻贝Perna viridis的性腺和体细胞线粒体DNA进行PCR扩增,获得661bp长度的COI基因片段,经过比对性腺与体细胞的COI片段,发现雄性性腺与体细胞COI基因均为一个单倍型,即体内只有一种线粒体DNA类型,没有发现双单性遗传现象,雌、雄性腺的COI基因片段变异率很低(0.31%)。应用PAUP构建NJ树、MP树以及贝叶斯法构建了贝叶斯树,对股贻贝属3种间的系统关系进行了分析,结果表明,翡翠股贻贝P.viridis、P.canaliculus和P.perna之间的分化与分歧年代的估算是相吻合的。
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关键词
线粒体DNA(mt
DNA)
细胞色素氧化酶Ⅰ亚基基因(COI)
翡翠股贻贝perna
VIRIDIS
双单性遗传(DUI)
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职称材料
翡翠贻贝3个野生种群遗传多样性分析
被引量:
12
2
作者
杜晓东
李康
+2 位作者
黄荣莲
王庆恒
邓岳文
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期51-55,共5页
采用表型性状、RAPD和ISSR分子标记对取自广西北海、广东湛江和汕尾的3个翡翠贻贝Perna viridis种群进行遗传多样性分析。翡翠贻贝种群间表型性状(壳长、壳高、壳宽、软体部重、体重和肥满度指数)存在显著的差异(p<0.05)。11个RAPD...
采用表型性状、RAPD和ISSR分子标记对取自广西北海、广东湛江和汕尾的3个翡翠贻贝Perna viridis种群进行遗传多样性分析。翡翠贻贝种群间表型性状(壳长、壳高、壳宽、软体部重、体重和肥满度指数)存在显著的差异(p<0.05)。11个RAPD引物共扩增出114条带,扩增片断大小为237—2099 bp,种群的多态性位点比例和遗传多样性指数分别为57.14%—60.78%和0.174 8—0.190 1。10个ISSR引物共扩增出134条带,扩增片断大小为218—2 695 bp,种群的多态性位点比例和遗传多样性指数分别为72.48%—75.22%和0.245 7—0.253 4。RAPD和ISSR分析都表明汕尾与北海翡翠贻贝种群间的遗传距离最大。结果表明,(1)翡翠贻贝种群具有较高的遗传多样性;(2)RAPD与ISSR标记适合于翡翠贻贝遗传多样性分析,但ISSR比RAPD能检测到种群间更高的遗传变异。
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关键词
翡翠
贻贝
perna
VIRIDIS
表型性状
RAPD
ISSR
遗传多样性
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职称材料
翡翠贻贝CYP4基因克隆及其表达水平分析
被引量:
7
3
作者
周驰
李纯厚
+1 位作者
张为民
贾晓平
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期82-88,共7页
利用简并引物PCR以及cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术获得了总长度为1197bp的翡翠贻贝Perna viridis CYP4基因cDNA序列。根据所获得的翡翠贻贝cDNA序列设计定量PCR引物,利用实时荧光定量PCR(Real-time qua...
利用简并引物PCR以及cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术获得了总长度为1197bp的翡翠贻贝Perna viridis CYP4基因cDNA序列。根据所获得的翡翠贻贝cDNA序列设计定量PCR引物,利用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR)技术测定了CYP4基因在野生翡翠贻贝消化腺、足和性腺中的表达水平。此外,本研究还应用实时荧光定量PCR技术对经过Aroclor1254暴露处理对翡翠贻贝性腺中CYP4表达水平的影响进行了定量测定。研究结果表明,CYP4基因在野生翡翠贻贝消化腺、足和性腺中均有表达,且其表达水平具有组织差异和性别差异;Aroclor1254暴露处理对翡翠贻贝性腺CYP4基因的表达水平有明显的诱导作用,并且这种诱导作用有明显的时间和剂量效应。本研究为CYP4基因作为生物大分子标记物在环境监测领域的应用提供了分子生物学水平的支持。
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关键词
CYP4基因
翡翠
贻贝
perna
VIRIDIS
荧光定量PCR
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职称材料
翡翠贻贝三个野生群体的生化遗传分析
被引量:
7
4
作者
黄荣莲
李康
杜晓东
《海洋通报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第1期42-47,共6页
采用聚丙烯酰胺梯度凝胶垂直平板电泳对湛江、北海和汕尾三地翡翠贻贝(Perna viridis)野生群体10种同工酶21个的位点的生化遗传特性进行分析。分析结果表明8个位点(Alp-1,Alp-2,G6pdh-1,Me-1,Me-2,Sdh-1,α-Est-5,β-Est-2)具有多态性...
采用聚丙烯酰胺梯度凝胶垂直平板电泳对湛江、北海和汕尾三地翡翠贻贝(Perna viridis)野生群体10种同工酶21个的位点的生化遗传特性进行分析。分析结果表明8个位点(Alp-1,Alp-2,G6pdh-1,Me-1,Me-2,Sdh-1,α-Est-5,β-Est-2)具有多态性。湛江、北海、汕尾群体的多态位点比例分别为0.381,0.286,0.381,平均期望杂合度分别为0.6 097,0.5 407和0.6 893。群体内杂合度较高,遗传多样性较丰富。群体间的基因分化系数在0.0 140~0.0 389范围内,北海和湛江群体间,湛江和汕尾群体间以及北海和汕尾群体间的遗传相似性分别为0.9 838,0.9 861和0.9 630;聚类分析表明湛江和汕尾群体遗传距离极小,而与北海群体分歧稍明显。上述的结果表明,翡翠贻贝3个群体种质资源遗传多样性依然处于良好状态。
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关键词
翡翠
贻贝
(
perna
viridis)
同工酶
遗传变异
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职称材料
题名
基于COI序列的翡翠股贻贝Perna viridis线粒体遗传特性分析及其近缘种间的系统关系探讨
被引量:
7
1
作者
位正鹏
孔晓瑜
吴相云
喻子牛
机构
中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室
中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室
出处
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期72-78,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30570242)
国家"863"计划项目(2006AA10A409)
文摘
应用通用引物COIL 1490和COIH 2198对翡翠股贻贝Perna viridis的性腺和体细胞线粒体DNA进行PCR扩增,获得661bp长度的COI基因片段,经过比对性腺与体细胞的COI片段,发现雄性性腺与体细胞COI基因均为一个单倍型,即体内只有一种线粒体DNA类型,没有发现双单性遗传现象,雌、雄性腺的COI基因片段变异率很低(0.31%)。应用PAUP构建NJ树、MP树以及贝叶斯法构建了贝叶斯树,对股贻贝属3种间的系统关系进行了分析,结果表明,翡翠股贻贝P.viridis、P.canaliculus和P.perna之间的分化与分歧年代的估算是相吻合的。
关键词
线粒体DNA(mt
DNA)
细胞色素氧化酶Ⅰ亚基基因(COI)
翡翠股贻贝perna
VIRIDIS
双单性遗传(DUI)
Keywords
mitochondrial DNA, COI gene,
perna
viridis, doubly uniparental inheritance (DUI)
分类号
Q343.35 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
翡翠贻贝3个野生种群遗传多样性分析
被引量:
12
2
作者
杜晓东
李康
黄荣莲
王庆恒
邓岳文
机构
广东海洋大学水产学院
出处
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期51-55,共5页
基金
广东省科技厅攻关项目(2002C60115)
广东省教育厅科技项目
文摘
采用表型性状、RAPD和ISSR分子标记对取自广西北海、广东湛江和汕尾的3个翡翠贻贝Perna viridis种群进行遗传多样性分析。翡翠贻贝种群间表型性状(壳长、壳高、壳宽、软体部重、体重和肥满度指数)存在显著的差异(p<0.05)。11个RAPD引物共扩增出114条带,扩增片断大小为237—2099 bp,种群的多态性位点比例和遗传多样性指数分别为57.14%—60.78%和0.174 8—0.190 1。10个ISSR引物共扩增出134条带,扩增片断大小为218—2 695 bp,种群的多态性位点比例和遗传多样性指数分别为72.48%—75.22%和0.245 7—0.253 4。RAPD和ISSR分析都表明汕尾与北海翡翠贻贝种群间的遗传距离最大。结果表明,(1)翡翠贻贝种群具有较高的遗传多样性;(2)RAPD与ISSR标记适合于翡翠贻贝遗传多样性分析,但ISSR比RAPD能检测到种群间更高的遗传变异。
关键词
翡翠
贻贝
perna
VIRIDIS
表型性状
RAPD
ISSR
遗传多样性
Keywords
Penera viridis
phenotypic traits
RAPD
ISSR
genetic diversity
分类号
Q959.215 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
翡翠贻贝CYP4基因克隆及其表达水平分析
被引量:
7
3
作者
周驰
李纯厚
张为民
贾晓平
机构
中国水产科学研究院南海水产研究所
上海水产大学
中山大学水生经济动物研究所
出处
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期82-88,共7页
基金
科技部科研院所社会公益研究专项(2005DIB3J020)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(中国水产科学研究院南海水产研究所)资助项目(2007ZD08)
文摘
利用简并引物PCR以及cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术获得了总长度为1197bp的翡翠贻贝Perna viridis CYP4基因cDNA序列。根据所获得的翡翠贻贝cDNA序列设计定量PCR引物,利用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR)技术测定了CYP4基因在野生翡翠贻贝消化腺、足和性腺中的表达水平。此外,本研究还应用实时荧光定量PCR技术对经过Aroclor1254暴露处理对翡翠贻贝性腺中CYP4表达水平的影响进行了定量测定。研究结果表明,CYP4基因在野生翡翠贻贝消化腺、足和性腺中均有表达,且其表达水平具有组织差异和性别差异;Aroclor1254暴露处理对翡翠贻贝性腺CYP4基因的表达水平有明显的诱导作用,并且这种诱导作用有明显的时间和剂量效应。本研究为CYP4基因作为生物大分子标记物在环境监测领域的应用提供了分子生物学水平的支持。
关键词
CYP4基因
翡翠
贻贝
perna
VIRIDIS
荧光定量PCR
Keywords
CYP4 gene
perna
viridis
Quantitative-PCR
分类号
Q958.116 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
翡翠贻贝三个野生群体的生化遗传分析
被引量:
7
4
作者
黄荣莲
李康
杜晓东
机构
广东海洋大学水产学院
出处
《海洋通报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第1期42-47,共6页
基金
广东省科技厅科技计划项目(2002C60115)
文摘
采用聚丙烯酰胺梯度凝胶垂直平板电泳对湛江、北海和汕尾三地翡翠贻贝(Perna viridis)野生群体10种同工酶21个的位点的生化遗传特性进行分析。分析结果表明8个位点(Alp-1,Alp-2,G6pdh-1,Me-1,Me-2,Sdh-1,α-Est-5,β-Est-2)具有多态性。湛江、北海、汕尾群体的多态位点比例分别为0.381,0.286,0.381,平均期望杂合度分别为0.6 097,0.5 407和0.6 893。群体内杂合度较高,遗传多样性较丰富。群体间的基因分化系数在0.0 140~0.0 389范围内,北海和湛江群体间,湛江和汕尾群体间以及北海和汕尾群体间的遗传相似性分别为0.9 838,0.9 861和0.9 630;聚类分析表明湛江和汕尾群体遗传距离极小,而与北海群体分歧稍明显。上述的结果表明,翡翠贻贝3个群体种质资源遗传多样性依然处于良好状态。
关键词
翡翠
贻贝
(
perna
viridis)
同工酶
遗传变异
Keywords
perna
viridis
isozyme
Genetic variation
分类号
S968.316 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于COI序列的翡翠股贻贝Perna viridis线粒体遗传特性分析及其近缘种间的系统关系探讨
位正鹏
孔晓瑜
吴相云
喻子牛
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
翡翠贻贝3个野生种群遗传多样性分析
杜晓东
李康
黄荣莲
王庆恒
邓岳文
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
12
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
翡翠贻贝CYP4基因克隆及其表达水平分析
周驰
李纯厚
张为民
贾晓平
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
翡翠贻贝三个野生群体的生化遗传分析
黄荣莲
李康
杜晓东
《海洋通报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
7
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职称材料
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