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基于线粒体ND2基因序列的少鳞鱚遗传多样性研究
被引量：
6
1
作者
郑德育
郭易佳
+4 位作者
杨天燕
高天翔
郑瑶
袁冬皓
斯舒谨
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期84-91,共8页
以莱州、胶南、舟山、厦门、汕头和北海6个群体119尾少鳞鱚(Sillago japonica)为研究对象,采用PCR扩增测序获得长度为450 bp的线粒体DNA NADH脱氢酶亚基2(ND2)基因片段,共检测到77个变异位点,其中简约信息位点30个,单变异位点28个,无碱...
以莱州、胶南、舟山、厦门、汕头和北海6个群体119尾少鳞鱚(Sillago japonica)为研究对象,采用PCR扩增测序获得长度为450 bp的线粒体DNA NADH脱氢酶亚基2(ND2)基因片段,共检测到77个变异位点,其中简约信息位点30个,单变异位点28个,无碱基缺失。119条序列定义了61个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.945 3±0.015 5和0.009 718±0.005 445。6个群体间的平均遗传距离为0.008 3,遗传分化指数FST均小于0.05,各群体间无显著遗传分化。AMOVA分析得出少鳞鱚的遗传变异主要来自于种群内个体间(99.96%)。中性检验的Tajima's D和Fu's Fs统计值均为负值且显著偏离中性,核苷酸不配对分布图呈现明显的单峰分布,表明少鳞鱚历史上经历了群体扩张事件,估算扩张时间大约在(0.12~0.29)百万年前的第四纪更新世晚期。
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关键词
少鳞鱚
ND2基因
遗传多样性
群体扩张
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职称材料
题名
基于线粒体ND2基因序列的少鳞鱚遗传多样性研究
被引量：
6
1
作者
郑德育
郭易佳
杨天燕
高天翔
郑瑶
袁冬皓
斯舒谨
机构
浙江海洋大学水产学院
出处
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期84-91,共8页
基金
浙江省大学生科技创新活动计划暨新苗人才计划(2018R411057)
国家自然科学基金项目(31572227,41776171)
+1 种基金
浙江海洋大学2016—2017年度人才引进科研基金
浙江海洋大学水产省一流学科大学生创新性科研项目
文摘
以莱州、胶南、舟山、厦门、汕头和北海6个群体119尾少鳞鱚(Sillago japonica)为研究对象,采用PCR扩增测序获得长度为450 bp的线粒体DNA NADH脱氢酶亚基2(ND2)基因片段,共检测到77个变异位点,其中简约信息位点30个,单变异位点28个,无碱基缺失。119条序列定义了61个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.945 3±0.015 5和0.009 718±0.005 445。6个群体间的平均遗传距离为0.008 3,遗传分化指数FST均小于0.05,各群体间无显著遗传分化。AMOVA分析得出少鳞鱚的遗传变异主要来自于种群内个体间(99.96%)。中性检验的Tajima's D和Fu's Fs统计值均为负值且显著偏离中性,核苷酸不配对分布图呈现明显的单峰分布,表明少鳞鱚历史上经历了群体扩张事件,估算扩张时间大约在(0.12~0.29)百万年前的第四纪更新世晚期。
关键词
少鳞鱚
ND2基因
遗传多样性
群体扩张
Keywords
Sillago japonica
NADH dehydrogenase subunit 2 gene
genetic diversity
population expansion
分类号
S913.4 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线粒体ND2基因序列的少鳞鱚遗传多样性研究
郑德育
郭易佳
杨天燕
高天翔
郑瑶
袁冬皓
斯舒谨
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019
6
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