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群体感应淬灭酶对副溶血性弧菌影响的综合实验设计
被引量:
2
1
作者
马磊
常晶
刘尊英
《实验技术与管理》
CAS
北大核心
2022年第5期49-54,共6页
该文设计了以水产致病菌群体感应系统为靶点的新型防治策略实验,构建了群体感应淬灭酶AiiA酶的原核表达系统,测定了重组酶的酶学性质,探究了该酶对副溶血性弧菌群体感应系统的调控以及对其生长、生物膜、蛋白酶、运动能力和毒力基因tlh...
该文设计了以水产致病菌群体感应系统为靶点的新型防治策略实验,构建了群体感应淬灭酶AiiA酶的原核表达系统,测定了重组酶的酶学性质,探究了该酶对副溶血性弧菌群体感应系统的调控以及对其生长、生物膜、蛋白酶、运动能力和毒力基因tlh表达的影响。结果表明重组AiiA酶可抑制副溶血性弧菌胞外基质的产生,减少生物膜的形成,显著降低细菌蛋白酶活性、运动能力并减少毒力基因tlh的表达。该综合性实验结合了基因工程、酶工程、食品贮藏原理等多领域实验技术,有利于提升学生的创新思维和实验技能。
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关键词
群体感应淬灭酶
副溶血性弧菌
AIIA
综合性实验
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职称材料
盐单胞菌Fosmid文库构建及群体感应淬灭酶的筛选
被引量:
3
2
作者
薛鹏飞
柳鹏福
+1 位作者
史吉平
李丽霞
《江苏农业科学》
北大核心
2016年第10期88-88,89,90,91,共4页
通过构建盐单胞菌Fosmid基因组文库,以求筛选到群体感应淬灭酶(AHL降解酶)。采用改良的SDSCTAB法提取1株盐单胞菌基因组DNA,经平末端连接、包装和转染后,成功构建盐单胞菌Fosmid基因组文库。该文库库容1 700个克隆,平均插入片段约35 kb...
通过构建盐单胞菌Fosmid基因组文库,以求筛选到群体感应淬灭酶(AHL降解酶)。采用改良的SDSCTAB法提取1株盐单胞菌基因组DNA,经平末端连接、包装和转染后,成功构建盐单胞菌Fosmid基因组文库。该文库库容1 700个克隆,平均插入片段约35 kb,共包含约60 Mb的DNA容量,覆盖该菌基因组10倍以上。然后以加X-gal的MM基本培养基筛选AHL降解酶阳性克隆,对文库进行功能驱动的蓝白斑筛选。通过初筛,筛选到3个Fosmid阳性克隆,证实了所构建的Fosmid基因组文库能够应用于AHL降解酶的活性筛选。同时该Fosmid文库亦可进一步用于其他功能基因的开发。
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关键词
盐单胞菌
Fosmid基因组文库
蓝白斑筛选
群体感应淬灭酶
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职称材料
细菌群体感应淬灭酶及其病害防治研究进展
被引量:
7
3
作者
范兴辉
王惠杉
+3 位作者
何杰华
叶田
阳芳
陈少华
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期80-87,共8页
微生物细胞间通过信号分子进行信息交流的现象即群体感应(Quorum sensing,QS),QS广泛存在于微生物群体中,且可以调控特定基因尤其是很多致病基因的表达。群体感应淬灭(Quorum quenching,QQ)是基于群体感应现象提出的新型病害防治策略,...
微生物细胞间通过信号分子进行信息交流的现象即群体感应(Quorum sensing,QS),QS广泛存在于微生物群体中,且可以调控特定基因尤其是很多致病基因的表达。群体感应淬灭(Quorum quenching,QQ)是基于群体感应现象提出的新型病害防治策略,即通过抑制信号分子的合成、监测或对信号分子进行酶降解、修饰的途径来干扰群体感应以达到防治病害的目的。利用群体感应淬灭酶(Quorum quenching enzymes)降解微生物信号分子,是目前毒性最小、最为有效的群体感应淬灭途径。迄今为止,多种细菌信号分子的群体感应淬灭酶都已有报道,其中,酰基高丝氨酸内酯(N-acyl homoserine lactones,AHLs)和顺-11-甲基-2-癸烯酸(cis-11-Methyl-2-dodecenoic acid)群体感应淬灭酶研究最为深入。综述并分析了群体感应淬灭酶及其病害防治的研究现状、存在的问题和未来研究方向,为今后发展新型绿色安全病害防控措施提供关键理论和技术支撑。
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关键词
群体
感应
群体感应淬灭酶
酰基高丝氨酸内酯
顺-11-甲基-2-癸烯酸
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职称材料
群体感应淬灭酶YtnP对草鱼肠道菌群结构的影响
被引量:
2
4
作者
赵祯
肖翎
+4 位作者
戚建华
刘韵怡
王年
郁小娟
宋增福
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第11期2817-2826,共10页
【目的】揭示群体感应淬灭作用与宿主肠道菌群结构间的作用关系,为具有群体感应淬灭作用益生菌及其淬灭酶在水产养殖上的推广应用提供理论依据。【方法】选取30尾规格为25±1 g/尾的草鱼随机分为对照组和试验组,试验组每尾草鱼腹腔...
【目的】揭示群体感应淬灭作用与宿主肠道菌群结构间的作用关系,为具有群体感应淬灭作用益生菌及其淬灭酶在水产养殖上的推广应用提供理论依据。【方法】选取30尾规格为25±1 g/尾的草鱼随机分为对照组和试验组,试验组每尾草鱼腹腔注射100μL溶解稀释后的YtnP(25μg/mL),对照组每尾草鱼腹腔注射等量的300 mmol/L分子筛缓冲液,分别在注射后24和48 h采集草鱼前肠、中肠和后肠的肠道组织及内容物,提取各肠段总DNA及PCR扩增16S rRNA序列V3~V4可变区,然后基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析外源添加YtnP对草鱼肠道菌群多样性与丰度的影响。【结果】12份草鱼肠道样品测序共获得原始序列(Raw reads)660205条,有效序列(Valid reads)416614条;对照组和试验组样品的OTU数目分别为142±102和143±67个。在门分类水平上,对照组和试验组草鱼肠道优势菌群均为放线菌门(Actinobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes);相对于对照组,试验组草鱼肠道中浮霉菌门(Planctomycetes)相对丰度显著增加(P<0.05,下同),放线菌门、梭杆菌门和变形菌门的相对丰度也呈升高趋势,但差异不显著(P>0.05,下同),厚壁菌门、TM7和拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度则呈下降趋势。在属分类水平上,对照组和试验组草鱼肠道均以鲸杆菌属(Cetobacterium)和诺卡氏菌属(Nocardia)为优势菌群;相对于对照组,试验组草鱼肠道中鲸杆菌属相对丰度呈升高趋势、诺卡氏菌属相对丰度呈下降趋势,但变化差异均不显著,未特指微杆菌属(UnspecifiedMicrobacteriaceae)相对丰度则显著增加。草鱼肠道菌群结构Alpha多样性分析发现,试验组样品的Chao1和ACE指数低于对照组样品,Shannon和Simpson指数略高于对照组样品,但差异均不显著;Beta多样性分析结果显示,对照组与试验组间的菌群特点存在差异,且组间区分效果明显。【结论】外源添加YtnP不会导致草鱼肠道优势菌群种类发生明显变化,但能在一定程度影响肠道菌群的相对丰度。
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关键词
草鱼
群体感应淬灭酶
YtnP
肠道菌群
微生态平衡
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职称材料
题名
群体感应淬灭酶对副溶血性弧菌影响的综合实验设计
被引量:
2
1
作者
马磊
常晶
刘尊英
机构
中国海洋大学食品科学与工程学院
出处
《实验技术与管理》
CAS
北大核心
2022年第5期49-54,共6页
基金
国家重点研发计划项目(2021YFD2100504)
国家自然科学基金项目(31972141)
+2 种基金
中央高校基本科研业务费专项基金项目(202151012)
中国项目海洋大学教学研究项目(2022JY059)
中国海洋大学教学研究项目(2022ZD05)。
文摘
该文设计了以水产致病菌群体感应系统为靶点的新型防治策略实验,构建了群体感应淬灭酶AiiA酶的原核表达系统,测定了重组酶的酶学性质,探究了该酶对副溶血性弧菌群体感应系统的调控以及对其生长、生物膜、蛋白酶、运动能力和毒力基因tlh表达的影响。结果表明重组AiiA酶可抑制副溶血性弧菌胞外基质的产生,减少生物膜的形成,显著降低细菌蛋白酶活性、运动能力并减少毒力基因tlh的表达。该综合性实验结合了基因工程、酶工程、食品贮藏原理等多领域实验技术,有利于提升学生的创新思维和实验技能。
关键词
群体感应淬灭酶
副溶血性弧菌
AIIA
综合性实验
Keywords
quorum quenching enzymes
Vibrio parahaemolyticus
AiiA
comprehensive experiment
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
盐单胞菌Fosmid文库构建及群体感应淬灭酶的筛选
被引量:
3
2
作者
薛鹏飞
柳鹏福
史吉平
李丽霞
机构
烟台大学生命科学学院
中国科学院上海高等研究院绿色化学工程技术研究中心
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2016年第10期88-88,89,90,91,共4页
基金
国家自然科学基金(编号:41306142)
文摘
通过构建盐单胞菌Fosmid基因组文库,以求筛选到群体感应淬灭酶(AHL降解酶)。采用改良的SDSCTAB法提取1株盐单胞菌基因组DNA,经平末端连接、包装和转染后,成功构建盐单胞菌Fosmid基因组文库。该文库库容1 700个克隆,平均插入片段约35 kb,共包含约60 Mb的DNA容量,覆盖该菌基因组10倍以上。然后以加X-gal的MM基本培养基筛选AHL降解酶阳性克隆,对文库进行功能驱动的蓝白斑筛选。通过初筛,筛选到3个Fosmid阳性克隆,证实了所构建的Fosmid基因组文库能够应用于AHL降解酶的活性筛选。同时该Fosmid文库亦可进一步用于其他功能基因的开发。
关键词
盐单胞菌
Fosmid基因组文库
蓝白斑筛选
群体感应淬灭酶
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
细菌群体感应淬灭酶及其病害防治研究进展
被引量:
7
3
作者
范兴辉
王惠杉
何杰华
叶田
阳芳
陈少华
机构
华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室 广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室 群体微生物研究中心
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期80-87,共8页
基金
国家重点基础研究发展计划(2015CB150600)
广东省杰出青年科学基金(2015A030306038)
广东省高校青年创新人才项目(2014KQNCX036)
文摘
微生物细胞间通过信号分子进行信息交流的现象即群体感应(Quorum sensing,QS),QS广泛存在于微生物群体中,且可以调控特定基因尤其是很多致病基因的表达。群体感应淬灭(Quorum quenching,QQ)是基于群体感应现象提出的新型病害防治策略,即通过抑制信号分子的合成、监测或对信号分子进行酶降解、修饰的途径来干扰群体感应以达到防治病害的目的。利用群体感应淬灭酶(Quorum quenching enzymes)降解微生物信号分子,是目前毒性最小、最为有效的群体感应淬灭途径。迄今为止,多种细菌信号分子的群体感应淬灭酶都已有报道,其中,酰基高丝氨酸内酯(N-acyl homoserine lactones,AHLs)和顺-11-甲基-2-癸烯酸(cis-11-Methyl-2-dodecenoic acid)群体感应淬灭酶研究最为深入。综述并分析了群体感应淬灭酶及其病害防治的研究现状、存在的问题和未来研究方向,为今后发展新型绿色安全病害防控措施提供关键理论和技术支撑。
关键词
群体
感应
群体感应淬灭酶
酰基高丝氨酸内酯
顺-11-甲基-2-癸烯酸
Keywords
quorum sensing
quorum quenching enzymes
N-acyl homoserine lactones
cis-11-methyl-2-dodecenoic acid
分类号
S476 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
群体感应淬灭酶YtnP对草鱼肠道菌群结构的影响
被引量:
2
4
作者
赵祯
肖翎
戚建华
刘韵怡
王年
郁小娟
宋增福
机构
水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学)
水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心(上海海洋大学)
水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室(上海海洋大学)
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第11期2817-2826,共10页
基金
上海市协同创新中心基金项目(ZF1206)
南京创业人才“321”计划项目(D-8005-14-0005)。
文摘
【目的】揭示群体感应淬灭作用与宿主肠道菌群结构间的作用关系,为具有群体感应淬灭作用益生菌及其淬灭酶在水产养殖上的推广应用提供理论依据。【方法】选取30尾规格为25±1 g/尾的草鱼随机分为对照组和试验组,试验组每尾草鱼腹腔注射100μL溶解稀释后的YtnP(25μg/mL),对照组每尾草鱼腹腔注射等量的300 mmol/L分子筛缓冲液,分别在注射后24和48 h采集草鱼前肠、中肠和后肠的肠道组织及内容物,提取各肠段总DNA及PCR扩增16S rRNA序列V3~V4可变区,然后基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析外源添加YtnP对草鱼肠道菌群多样性与丰度的影响。【结果】12份草鱼肠道样品测序共获得原始序列(Raw reads)660205条,有效序列(Valid reads)416614条;对照组和试验组样品的OTU数目分别为142±102和143±67个。在门分类水平上,对照组和试验组草鱼肠道优势菌群均为放线菌门(Actinobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes);相对于对照组,试验组草鱼肠道中浮霉菌门(Planctomycetes)相对丰度显著增加(P<0.05,下同),放线菌门、梭杆菌门和变形菌门的相对丰度也呈升高趋势,但差异不显著(P>0.05,下同),厚壁菌门、TM7和拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度则呈下降趋势。在属分类水平上,对照组和试验组草鱼肠道均以鲸杆菌属(Cetobacterium)和诺卡氏菌属(Nocardia)为优势菌群;相对于对照组,试验组草鱼肠道中鲸杆菌属相对丰度呈升高趋势、诺卡氏菌属相对丰度呈下降趋势,但变化差异均不显著,未特指微杆菌属(UnspecifiedMicrobacteriaceae)相对丰度则显著增加。草鱼肠道菌群结构Alpha多样性分析发现,试验组样品的Chao1和ACE指数低于对照组样品,Shannon和Simpson指数略高于对照组样品,但差异均不显著;Beta多样性分析结果显示,对照组与试验组间的菌群特点存在差异,且组间区分效果明显。【结论】外源添加YtnP不会导致草鱼肠道优势菌群种类发生明显变化,但能在一定程度影响肠道菌群的相对丰度。
关键词
草鱼
群体感应淬灭酶
YtnP
肠道菌群
微生态平衡
Keywords
Ctenopharyngodon idellus
quorum quenching enzyme
YtnP
intestinal microbiota
microecology equilibrium
分类号
S965.112 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
群体感应淬灭酶对副溶血性弧菌影响的综合实验设计
马磊
常晶
刘尊英
《实验技术与管理》
CAS
北大核心
2022
2
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职称材料
2
盐单胞菌Fosmid文库构建及群体感应淬灭酶的筛选
薛鹏飞
柳鹏福
史吉平
李丽霞
《江苏农业科学》
北大核心
2016
3
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职称材料
3
细菌群体感应淬灭酶及其病害防治研究进展
范兴辉
王惠杉
何杰华
叶田
阳芳
陈少华
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
7
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职称材料
4
群体感应淬灭酶YtnP对草鱼肠道菌群结构的影响
赵祯
肖翎
戚建华
刘韵怡
王年
郁小娟
宋增福
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
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