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羊流产嗜衣原体ompA基因克隆及生物信息学分析
被引量：
2
1
作者
龙冲冲
江楠
+4 位作者
彭中友
龙胜基
罗意
周碧君
文明
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第8期113-118,共6页
分析羊流产嗜衣原体ompA基因结构并预测其编码蛋白的结构和功能。采用DNA Star、DNA MAN、vector NTI suite11.5序列分析软件和在线网站ExPASy分析该基因的结构和预测其编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、一级结构修饰位点、二级结构特...
分析羊流产嗜衣原体ompA基因结构并预测其编码蛋白的结构和功能。采用DNA Star、DNA MAN、vector NTI suite11.5序列分析软件和在线网站ExPASy分析该基因的结构和预测其编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、一级结构修饰位点、二级结构特征及三维空间构象、潜在抗原表位等。结果显示,该基因全长1 170 bp,可编码389个氨基酸,编码蛋白理化性质较稳定,无各种亚细胞定位序列,含有多个能被其他酶修饰的位点,该蛋白以无规则卷曲为主,大部分氨基酸残基包埋在分子内部,含5个跨膜区,3个亲水性较强的抗原表位。ompA基因生物信息学分析结果为ompA蛋白功能的深入研究和新型多价疫苗的开发提供了基础数据。
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关键词
羊流产嗜衣原体
ompA基因
生物信息学分析
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职称材料
羊流产嗜性衣原体蛋白-蛋白相互作用网络的构建
2
作者
刘威
袁芳艳
+7 位作者
周丹娜
刘泽文
高婷
郭锐
杨克礼
段正赢
梁婉
田永祥
《湖北农业科学》
2021年第22期124-128,共5页
病原菌的相互作用组学研究是揭示潜在信号转导通路和新型药物靶标的有力工具。通过同源蛋白映射的方法构建了羊流产嗜性衣原体(Chlamydia abortus)的蛋白-蛋白相互作用网络。结果表明,所构建的互作网络包含220个蛋白和1276个相互作用关...
病原菌的相互作用组学研究是揭示潜在信号转导通路和新型药物靶标的有力工具。通过同源蛋白映射的方法构建了羊流产嗜性衣原体(Chlamydia abortus)的蛋白-蛋白相互作用网络。结果表明,所构建的互作网络包含220个蛋白和1276个相互作用关系。通过分析蛋白的互作频率,确定了在羊流产嗜性衣原体中互作频率最高的20个蛋白,主要与转录、翻译、分子伴侣等功能相关。进一步分析发现,伴侣蛋白DnaK、GroEL、DnaJ发生互作的频率较高,能与核糖体蛋白、代谢相关蛋白等多种功能蛋白发生相互作用。若DnaK、GroEL、DnaJ的功能受到抑制,将会对羊流产嗜性衣原体的正常生命活动造成较大的影响。
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关键词
羊
流产
嗜
性
衣
原体
(Chlamydia
abortus)
蛋白相互作用
互作网络
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职称材料
羊流产嗜性衣原体MOMP基因的克隆及序列分析
3
作者
姚菊霞
王光华
+2 位作者
陆艳
李秀萍
王戈平
《青海畜牧兽医杂志》
2015年第2期1-4,共4页
为探讨羊流产嗜性衣原体MOMP蛋白的生物学功能、揭示其在流产衣原体病诊断和防治中的作用。本试验根据Gen Bank公布的流产嗜性衣原体主要外膜蛋白(MOMP)基因序列,设计并合成4条特异性引物,以羊流产嗜性衣原体青海分离株感染的鸡胚卵黄...
为探讨羊流产嗜性衣原体MOMP蛋白的生物学功能、揭示其在流产衣原体病诊断和防治中的作用。本试验根据Gen Bank公布的流产嗜性衣原体主要外膜蛋白(MOMP)基因序列,设计并合成4条特异性引物,以羊流产嗜性衣原体青海分离株感染的鸡胚卵黄囊中提取的衣原体基因组为模板,应用套式PCR扩增到MOMP全基因序列。通过生物信息学软件对该基因的结构及其推导的氨基酸序列进行了预测分析,同时分析了与其他流产嗜性衣原体的同源性。结果显示,该基因全长1 170 bp,可编码389个氨基酸,蛋白分子量理论值为41.8 ku,理论等电点7.54,编码蛋白理化性质较稳定。其第1位到第19位氨基酸残基为信号肽序列,具有3处N-糖基化位点。含有多个能被其他酶修饰的位点,以无规则卷曲为主,含5个跨膜区,3个亲水性较强的抗原表位。同源性分析表明与其他流产嗜性衣原体分离株的一致性高在93%以上,系统进化分析表明与OCLH196株(序列号为AJ440239)位于同一进化分支。
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关键词
羊
流产
嗜
性
衣
原体
MOMP基因
克隆
序列
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职称材料
题名
羊流产嗜衣原体ompA基因克隆及生物信息学分析
被引量：
2
1
作者
龙冲冲
江楠
彭中友
龙胜基
罗意
周碧君
文明
机构
贵州大学动物科学学院
华南农业大学动物科学学院
贵州大学精细化工研究开发中心
贵州省动物疫病研究室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第8期113-118,共6页
基金
贵州省农业攻关项目(黔科合NY字[2011]3105号)
贵州省科技基金项目(黔科合J字[2010]2108号)
+1 种基金
贵州省重大科技专项(黔科合重大专项字[2011]6009号)
贵州省重点实验室项目(黔科合计Z字[2011]4008号)
文摘
分析羊流产嗜衣原体ompA基因结构并预测其编码蛋白的结构和功能。采用DNA Star、DNA MAN、vector NTI suite11.5序列分析软件和在线网站ExPASy分析该基因的结构和预测其编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、一级结构修饰位点、二级结构特征及三维空间构象、潜在抗原表位等。结果显示,该基因全长1 170 bp,可编码389个氨基酸,编码蛋白理化性质较稳定,无各种亚细胞定位序列,含有多个能被其他酶修饰的位点,该蛋白以无规则卷曲为主,大部分氨基酸残基包埋在分子内部,含5个跨膜区,3个亲水性较强的抗原表位。ompA基因生物信息学分析结果为ompA蛋白功能的深入研究和新型多价疫苗的开发提供了基础数据。
关键词
羊流产嗜衣原体
ompA基因
生物信息学分析
Keywords
Goat Chlamydophila abortus
ompA gene
Bioinformatics
分类号
S852.67 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
羊流产嗜性衣原体蛋白-蛋白相互作用网络的构建
2
作者
刘威
袁芳艳
周丹娜
刘泽文
高婷
郭锐
杨克礼
段正赢
梁婉
田永祥
机构
湖北省农业科学院畜牧兽医研究所/农业农村部兽用药物与诊断技术湖北科学观测实验站
出处
《湖北农业科学》
2021年第22期124-128,共5页
基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0500906)
国家自然科学基金项目(315020069)
湖北省农业科技创新中心资助项目(2016-620-000-001-026)。
文摘
病原菌的相互作用组学研究是揭示潜在信号转导通路和新型药物靶标的有力工具。通过同源蛋白映射的方法构建了羊流产嗜性衣原体(Chlamydia abortus)的蛋白-蛋白相互作用网络。结果表明,所构建的互作网络包含220个蛋白和1276个相互作用关系。通过分析蛋白的互作频率,确定了在羊流产嗜性衣原体中互作频率最高的20个蛋白,主要与转录、翻译、分子伴侣等功能相关。进一步分析发现,伴侣蛋白DnaK、GroEL、DnaJ发生互作的频率较高,能与核糖体蛋白、代谢相关蛋白等多种功能蛋白发生相互作用。若DnaK、GroEL、DnaJ的功能受到抑制,将会对羊流产嗜性衣原体的正常生命活动造成较大的影响。
关键词
羊
流产
嗜
性
衣
原体
(Chlamydia
abortus)
蛋白相互作用
互作网络
Keywords
Chlamydia abortus
protein interaction
interaction network
分类号
S852.67 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
羊流产嗜性衣原体MOMP基因的克隆及序列分析
3
作者
姚菊霞
王光华
陆艳
李秀萍
王戈平
机构
青海省畜牧兽医科学院
甘肃省通渭县动物疫病预防控制中心
出处
《青海畜牧兽医杂志》
2015年第2期1-4,共4页
基金
现代农业产业技术体系建设专项经费资助(CARS-40-08B)
青海省现代农牧业产业科技创新平台-羊产业科技创新平台
文摘
为探讨羊流产嗜性衣原体MOMP蛋白的生物学功能、揭示其在流产衣原体病诊断和防治中的作用。本试验根据Gen Bank公布的流产嗜性衣原体主要外膜蛋白(MOMP)基因序列,设计并合成4条特异性引物,以羊流产嗜性衣原体青海分离株感染的鸡胚卵黄囊中提取的衣原体基因组为模板,应用套式PCR扩增到MOMP全基因序列。通过生物信息学软件对该基因的结构及其推导的氨基酸序列进行了预测分析,同时分析了与其他流产嗜性衣原体的同源性。结果显示,该基因全长1 170 bp,可编码389个氨基酸,蛋白分子量理论值为41.8 ku,理论等电点7.54,编码蛋白理化性质较稳定。其第1位到第19位氨基酸残基为信号肽序列,具有3处N-糖基化位点。含有多个能被其他酶修饰的位点,以无规则卷曲为主,含5个跨膜区,3个亲水性较强的抗原表位。同源性分析表明与其他流产嗜性衣原体分离株的一致性高在93%以上,系统进化分析表明与OCLH196株(序列号为AJ440239)位于同一进化分支。
关键词
羊
流产
嗜
性
衣
原体
MOMP基因
克隆
序列
Keywords
Goat Chlamydophila abortus
MOMP gene
Cloning
Sequence analysis
分类号
S852.67 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
羊流产嗜衣原体ompA基因克隆及生物信息学分析
龙冲冲
江楠
彭中友
龙胜基
罗意
周碧君
文明
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
羊流产嗜性衣原体蛋白-蛋白相互作用网络的构建
刘威
袁芳艳
周丹娜
刘泽文
高婷
郭锐
杨克礼
段正赢
梁婉
田永祥
《湖北农业科学》
2021
0
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下载PDF
职称材料
3
羊流产嗜性衣原体MOMP基因的克隆及序列分析
姚菊霞
王光华
陆艳
李秀萍
王戈平
《青海畜牧兽医杂志》
2015
0
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