目的对湖泊放线菌SIIA-A16124进行分类鉴定和基因组挖掘。方法采用多相分类法对菌株的形态学、生理生化、细胞壁化学组分、16S r RNA基因序列进行测定和分类鉴定,采用基因组挖掘分析生物合成基因簇,经发酵培养、抗菌活性检测及活性产物...目的对湖泊放线菌SIIA-A16124进行分类鉴定和基因组挖掘。方法采用多相分类法对菌株的形态学、生理生化、细胞壁化学组分、16S r RNA基因序列进行测定和分类鉴定,采用基因组挖掘分析生物合成基因簇,经发酵培养、抗菌活性检测及活性产物质谱分析,推测其活性产物的化合物结构类别。结果菌株SIIA-A16124的16S r RNA基因与菌株Actinokineospora inagensis NRRL B-24050T同源性最高为99%;菌株SIIA-A16124在ISP3培养基上中等产孢和水解淀粉的特性与模式菌株存在明显差异;鉴定菌株SIIA-A16124为动孢菌Actinokineospora sp.,具有羊毛硫肽生物合成基因簇,其活性次级代谢产物属于羊毛硫肽类抗生素。结论首次发现动孢菌属放线菌具有生物合成羊毛硫肽类抗生素的能力。展开更多
文摘目的对湖泊放线菌SIIA-A16124进行分类鉴定和基因组挖掘。方法采用多相分类法对菌株的形态学、生理生化、细胞壁化学组分、16S r RNA基因序列进行测定和分类鉴定,采用基因组挖掘分析生物合成基因簇,经发酵培养、抗菌活性检测及活性产物质谱分析,推测其活性产物的化合物结构类别。结果菌株SIIA-A16124的16S r RNA基因与菌株Actinokineospora inagensis NRRL B-24050T同源性最高为99%;菌株SIIA-A16124在ISP3培养基上中等产孢和水解淀粉的特性与模式菌株存在明显差异;鉴定菌株SIIA-A16124为动孢菌Actinokineospora sp.,具有羊毛硫肽生物合成基因簇,其活性次级代谢产物属于羊毛硫肽类抗生素。结论首次发现动孢菌属放线菌具有生物合成羊毛硫肽类抗生素的能力。
