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题名一株羊冠状病毒的分离鉴定及全基因组序列分析
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作者
余秋蓉
蔡旭航
何艺
李基棕
毛立
许信刚
李彬
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机构
西北农林科技大学动物医学院
江苏省农业科学院兽医研究所农业农村部兽用生物制品工程技术重点实验室
阜康市城关镇农业(畜牧业)发展服务中心
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出处
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第9期4604-4614,共11页
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基金
国家重点研发计划(2023YFD1801302)
江苏省重点研发计划(BE2022330)
兽医生物技术国家重点实验室开放基金(SKLVBF202106)。
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文摘
冠状病毒在全世界广泛流行,能够引起人和动物呼吸道和消化道疾病,动物感染冠状病毒对养殖业造成巨大经济损失。为进一步丰富我国草食动物冠状病毒的流行病学资料,笔者拟对新疆腹泻山羊样品进行羊冠状病毒(caprine coronavirus,cpCoV)分离研究,并开展生物学特性鉴定。用RT-PCR方法从新疆昌吉某羊场腹泻山羊肛拭子样品中检测到cpCoV阳性,成功分离一株羊冠状病毒,命名为cpCoV/XJCJ2301G。该毒株接种细胞后可观察到明显的细胞病变,IFA试验、RT-PCR检测均为cpCoV阳性,电镜观察可见直径100 nm,周围呈皇冠状的特异病毒颗粒。病毒的遗传演化结果表明,XJCJ2301G株处于β-CoVs Embecovirus分支,与现有羊冠状病毒共同组成独立进化分支,独立于牛冠状病毒的四个亚型。经分析NS4a-NS4b基因序列,发现在两段区域内有75 nt缺失突变,导致非结构蛋白截短或延长。S基因序列比对分析发现,cpCoV与BCoV的差异主要集中于CTD区域。本研究首次从新疆地区分离到的羊冠状病毒,丰富了我国冠状病毒的流行病学资料,其NS4a-NS4b碱基数量在牛、羊和兔冠状病毒之间形成阶梯式依次缺失,提示该毒株可能是动物冠状病毒演化过程中的节点,在草食动物冠状病毒的遗传演化过程中具有重要意义。
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关键词
羊冠状病毒
分离鉴定
全基因组测序
进化分析
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Keywords
caprine coronavirus
isolation and identification
whole genome sequencing
evolutionary analysis
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分类号
S852.659.6
[农业科学—基础兽医学]
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