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新生儿呼吸窘迫综合征并发支气管肺发育不良风险基因巢式病例对照研究
被引量：
5
1
作者
陈辉耀
董欣然
+5 位作者
杨琳
卢宇蓝
胡黎园
蒋思远
钱莉玲
周文浩
《中国循证儿科杂志》
CSCD
北大核心
2022年第2期128-133,共6页
背景既往已有许多针对支气管肺发育不良(BPD)风险基因的研究,但不同研究遗传表型差异大,无法作为呼吸窘迫综合征(RDS)并发BPD的遗传风险基因。目的筛选RDS并发BPD的遗传风险因素,明确其对RDS患儿预后的影响。设计巢式病例对照研究。方法...
背景既往已有许多针对支气管肺发育不良(BPD)风险基因的研究,但不同研究遗传表型差异大,无法作为呼吸窘迫综合征(RDS)并发BPD的遗传风险基因。目的筛选RDS并发BPD的遗传风险因素,明确其对RDS患儿预后的影响。设计巢式病例对照研究。方法以2016年1月1日至2021年8月1日在复旦大学附属儿科医院住院治疗、临床确诊RDS的患儿为队列人群,以是否并发BPD分为BPD组和非BPD组。采用倾向性评分策略平衡2组胎龄,采用罕见变异关联性分析和功能富集分析,探索罕见变异基因富集的生物学过程,并筛选在BPD组中存在显著较多有害变异的候选风险基因。从GEO数据库检索RDS并发BPD高度相关基因表达数据,行基因表达模式的时间序列分析,验证本文高变异负荷基因的表达特征。主要结局指标RDS并发BPD风险基因。结果倾向性评分匹配后BPD组111例,非BPD组157例,2组的胎龄差异无统计学意义。基于2742个背景基因显著富集的1558个生物学过程(P<0.01),蛋白质截断变异最显著富集的基因集与蛋白激酶活性有关(P=0.011),BPD组中携带蛋白质截断变异的基因总数最多的是阳离子跨膜转运相关基因(P=0.027)。错义/非同义变异最显著富集的基因集与生长发育的调节有关(P=0.001)。BPD组中有26个基因的错义/非同义罕见变异负荷显著高于非BPD组(P<0.05),其中3个基因(ARSB、B9D2和UVSSA)差异有统计学意义(P<0.01)。通过GEO数据库数据验证,ARSB在重度BPD中显著低表达(P<0.001),时间序列分析发现ARSB基因在重度BPD新生儿中表达模式与无/轻度BPD新生儿差异有统计学意义(P<0.01)。结论ARSB基因为RDS并发BPD的风险基因。
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关键词
支气管肺发育不良
呼吸窘迫综合征
罕见变异关联分析
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题名
新生儿呼吸窘迫综合征并发支气管肺发育不良风险基因巢式病例对照研究
被引量：
5
1
作者
陈辉耀
董欣然
杨琳
卢宇蓝
胡黎园
蒋思远
钱莉玲
周文浩
机构
复旦大学生物医学研究院
复旦大学附属儿科医院分子医学中心
复旦大学附属儿科医院内分泌科
复旦大学附属儿科医院新生儿科
复旦大学附属儿科医院呼吸科
出处
《中国循证儿科杂志》
CSCD
北大核心
2022年第2期128-133,共6页
基金
上海市科技重大专项:2017SHZDZX01
科技部国家重点研发计划:2020YFC2006402。
文摘
背景既往已有许多针对支气管肺发育不良(BPD)风险基因的研究,但不同研究遗传表型差异大,无法作为呼吸窘迫综合征(RDS)并发BPD的遗传风险基因。目的筛选RDS并发BPD的遗传风险因素,明确其对RDS患儿预后的影响。设计巢式病例对照研究。方法以2016年1月1日至2021年8月1日在复旦大学附属儿科医院住院治疗、临床确诊RDS的患儿为队列人群,以是否并发BPD分为BPD组和非BPD组。采用倾向性评分策略平衡2组胎龄,采用罕见变异关联性分析和功能富集分析,探索罕见变异基因富集的生物学过程,并筛选在BPD组中存在显著较多有害变异的候选风险基因。从GEO数据库检索RDS并发BPD高度相关基因表达数据,行基因表达模式的时间序列分析,验证本文高变异负荷基因的表达特征。主要结局指标RDS并发BPD风险基因。结果倾向性评分匹配后BPD组111例,非BPD组157例,2组的胎龄差异无统计学意义。基于2742个背景基因显著富集的1558个生物学过程(P<0.01),蛋白质截断变异最显著富集的基因集与蛋白激酶活性有关(P=0.011),BPD组中携带蛋白质截断变异的基因总数最多的是阳离子跨膜转运相关基因(P=0.027)。错义/非同义变异最显著富集的基因集与生长发育的调节有关(P=0.001)。BPD组中有26个基因的错义/非同义罕见变异负荷显著高于非BPD组(P<0.05),其中3个基因(ARSB、B9D2和UVSSA)差异有统计学意义(P<0.01)。通过GEO数据库数据验证,ARSB在重度BPD中显著低表达(P<0.001),时间序列分析发现ARSB基因在重度BPD新生儿中表达模式与无/轻度BPD新生儿差异有统计学意义(P<0.01)。结论ARSB基因为RDS并发BPD的风险基因。
关键词
支气管肺发育不良
呼吸窘迫综合征
罕见变异关联分析
Keywords
Bronchopulmonary dysplasia
Respiratory distress syndrome
Rare-variant association analysis
分类号
R722.1 [医药卫生—儿科]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
新生儿呼吸窘迫综合征并发支气管肺发育不良风险基因巢式病例对照研究
陈辉耀
董欣然
杨琳
卢宇蓝
胡黎园
蒋思远
钱莉玲
周文浩
《中国循证儿科杂志》
CSCD
北大核心
2022
5
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