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华支睾吸虫翻译控制肿瘤蛋白(TCTP)基因的鉴定及其编码区序列克隆
被引量：
6
1
作者
何东苟
余新炳
+4 位作者
吴忠道
徐劲
吴德
胡旭初
陈守义
《中国人兽共患病杂志》
CSCD
北大核心
2004年第2期117-121,共5页
目的 通过cDNA文库筛选识别华支睾吸虫新基因 ,并将所发现的华支睾吸虫翻译控制肿瘤蛋白 (csTCTP)编码区克隆到原核表达质粒PGEX - 4T - 1和真核表达质粒 pcDNA3上 ,为进一步研究其功能奠定基础。 方法 将插入于 pBlue script质粒上的...
目的 通过cDNA文库筛选识别华支睾吸虫新基因 ,并将所发现的华支睾吸虫翻译控制肿瘤蛋白 (csTCTP)编码区克隆到原核表达质粒PGEX - 4T - 1和真核表达质粒 pcDNA3上 ,为进一步研究其功能奠定基础。 方法 将插入于 pBlue script质粒上的cDNA进行随机测序 ,在NCBI和ExPasy网站上进行序列分析 ,识别华支睾吸虫新基因 ,并应用Motifsan、Scan prosite等程序对其进行结构域分析。根据PGEX - 4T - 1和pcDNA3上的克隆位点及所发现的csTCTPcDNA编码序列设计引物 ,进行PCR扩增 ,扩增产物回收纯化后克隆到原核表达载体PGEX4T - 1和真核表达载体 pcDNA3上。构建的PGEX4T- 1-csTCTP、pcDNA3-csTCTP重组表达质粒经PCR、双酶切及测序证实。 结果 发现华支睾吸虫新基因———csTCTP ,完整阅读框含 5 10个碱基 ,编码 16 9个氨基酸 ,理论分子量为 19 4 5 96Kd。序列分析表明 ,csTCTP编码氨基酸序列与其它物种有较高的同源性 ,Motifscan及Scanprosite程序发现推导的氨基酸序列具有TCTP保守的完整功能域以及两个典型的TCTP完整标签。所构建的重组原核和真核表达质粒经PCR、双酶切及测序证实与目标基因相符。结论 发现华支睾吸虫翻译控制肿瘤蛋白基因 ,并成功构建原核和真核重组表达质粒。
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关键词
华支睾吸虫
翻译控制肿瘤蛋白
TCTP
基因
鉴定
编码
区
序列
克隆
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职称材料
牦牛DRA基因克隆测序及生物信息学分析
2
作者
张丽
王媛媛
+1 位作者
王瑞
刘丽霞
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第7期1564-1570,共7页
为全面解析牦牛MHCⅡ类基因结构与功能,采用分子克隆测序技术对大通牦牛DRA基因编码区进行等位基因频率估算并进行生物信息学分析。结果显示:大通牦牛DRA基因编码区含有762 bp的开放阅读框,共编码253个氨基酸;共有3个SNPs(g.2376C>T...
为全面解析牦牛MHCⅡ类基因结构与功能,采用分子克隆测序技术对大通牦牛DRA基因编码区进行等位基因频率估算并进行生物信息学分析。结果显示:大通牦牛DRA基因编码区含有762 bp的开放阅读框,共编码253个氨基酸;共有3个SNPs(g.2376C>T、g.2851C>G、g.3016C>A),其中第2、3外显子分别存在1个C→T的同义突变和C→A的错义突变(L→M),这两个突变均降低了大通牦牛DRA基因mRNA二级结构的稳定性;g.3016C>A突变前后编码蛋白质的分子量、原子总数、脂肪系数、不稳定系数、总平均亲水性方面存在差异;生物信息学的方法分析显示,BoLA-DRA基因是MHC基因家族中高度保守的基因。该研究结果可以为大通牦牛DRA基因结构与功能的研究奠定基础。
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关键词
DRA基因
编码区克隆
突变位点
生物信息学
大通牦牛
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职称材料
题名
华支睾吸虫翻译控制肿瘤蛋白(TCTP)基因的鉴定及其编码区序列克隆
被引量：
6
1
作者
何东苟
余新炳
吴忠道
徐劲
吴德
胡旭初
陈守义
机构
中山大学中山医学院病原生物学部
出处
《中国人兽共患病杂志》
CSCD
北大核心
2004年第2期117-121,共5页
基金
广东省自然科学基金首批科研团队项目
2 11工程重点建设基金
卫生部博士点建设基金
文摘
目的 通过cDNA文库筛选识别华支睾吸虫新基因 ,并将所发现的华支睾吸虫翻译控制肿瘤蛋白 (csTCTP)编码区克隆到原核表达质粒PGEX - 4T - 1和真核表达质粒 pcDNA3上 ,为进一步研究其功能奠定基础。 方法 将插入于 pBlue script质粒上的cDNA进行随机测序 ,在NCBI和ExPasy网站上进行序列分析 ,识别华支睾吸虫新基因 ,并应用Motifsan、Scan prosite等程序对其进行结构域分析。根据PGEX - 4T - 1和pcDNA3上的克隆位点及所发现的csTCTPcDNA编码序列设计引物 ,进行PCR扩增 ,扩增产物回收纯化后克隆到原核表达载体PGEX4T - 1和真核表达载体 pcDNA3上。构建的PGEX4T- 1-csTCTP、pcDNA3-csTCTP重组表达质粒经PCR、双酶切及测序证实。 结果 发现华支睾吸虫新基因———csTCTP ,完整阅读框含 5 10个碱基 ,编码 16 9个氨基酸 ,理论分子量为 19 4 5 96Kd。序列分析表明 ,csTCTP编码氨基酸序列与其它物种有较高的同源性 ,Motifscan及Scanprosite程序发现推导的氨基酸序列具有TCTP保守的完整功能域以及两个典型的TCTP完整标签。所构建的重组原核和真核表达质粒经PCR、双酶切及测序证实与目标基因相符。结论 发现华支睾吸虫翻译控制肿瘤蛋白基因 ,并成功构建原核和真核重组表达质粒。
关键词
华支睾吸虫
翻译控制肿瘤蛋白
TCTP
基因
鉴定
编码
区
序列
克隆
Keywords
translationally controlled tumor protein
Clonorchiasis Sinensis
clone
分类号
R383.22 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
牦牛DRA基因克隆测序及生物信息学分析
2
作者
张丽
王媛媛
王瑞
刘丽霞
机构
西北民族大学生命科学与工程学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第7期1564-1570,共7页
基金
西北民族大学中央高校基本科研业务费资金资助项目(31920200074,31920210061)
西北民族大学研究生科研创新项目(Yxm2021074)。
文摘
为全面解析牦牛MHCⅡ类基因结构与功能,采用分子克隆测序技术对大通牦牛DRA基因编码区进行等位基因频率估算并进行生物信息学分析。结果显示:大通牦牛DRA基因编码区含有762 bp的开放阅读框,共编码253个氨基酸;共有3个SNPs(g.2376C>T、g.2851C>G、g.3016C>A),其中第2、3外显子分别存在1个C→T的同义突变和C→A的错义突变(L→M),这两个突变均降低了大通牦牛DRA基因mRNA二级结构的稳定性;g.3016C>A突变前后编码蛋白质的分子量、原子总数、脂肪系数、不稳定系数、总平均亲水性方面存在差异;生物信息学的方法分析显示,BoLA-DRA基因是MHC基因家族中高度保守的基因。该研究结果可以为大通牦牛DRA基因结构与功能的研究奠定基础。
关键词
DRA基因
编码区克隆
突变位点
生物信息学
大通牦牛
Keywords
DRA gene
coding region cloning
mutation site
bioinformatics
Datong yak
分类号
S823.85 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
华支睾吸虫翻译控制肿瘤蛋白(TCTP)基因的鉴定及其编码区序列克隆
何东苟
余新炳
吴忠道
徐劲
吴德
胡旭初
陈守义
《中国人兽共患病杂志》
CSCD
北大核心
2004
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
牦牛DRA基因克隆测序及生物信息学分析
张丽
王媛媛
王瑞
刘丽霞
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2023
0
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