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基于单细胞及普通转录组数据构建结直肠癌患者新型糖酵解相关预后风险模型
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作者 姚凯 夏静怡 +5 位作者 张硕 孙韵 马俊杰 朱博 任丽 张从利 《细胞与分子免疫学杂志》 北大核心 2025年第2期105-115,共11页
目的探究糖酵解基因对结直肠癌(CRC)患者的预后价值并构建新型糖酵解相关预后风险模型。方法从肿瘤基因组图谱数据库(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)收集CRC患者的单细胞、普通转录组数据;通过ssGSEA方法计算各样本糖酵解评分;利用Kapl... 目的探究糖酵解基因对结直肠癌(CRC)患者的预后价值并构建新型糖酵解相关预后风险模型。方法从肿瘤基因组图谱数据库(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)收集CRC患者的单细胞、普通转录组数据;通过ssGSEA方法计算各样本糖酵解评分;利用Kaplan-Meier方法绘制CRC患者糖酵解评分总生存率生存曲线;基于单细胞转录组数据,在糖酵解评分最高细胞类型中定义糖酵解相关亚群;通过基因富集、代谢活性分析和单因素Cox回归鉴定新定义亚群的生物学功能及对患者预后影响;基于影响预后最显著亚群的特征基因,构建并验证预后风险模型;采用基因集富集分析(GSEA)探讨高低风险组患者间生物学功能差异;使用R软件包评估高低风险组间免疫微环境和药物敏感性差异;借助Enrichr数据库预测预后风险基因的靶向药物。结果糖酵解评分在肿瘤组织中显著升高,且高糖酵解评分与CRC患者的不良预后相关。CRC组织中,糖酵解评分最高的细胞类型为上皮细胞,我们在这些细胞中定义了8个糖酵解相关的细胞亚群。这些亚群中,P4HA1+上皮细胞亚群与患者不良预后密切相关。基于该亚群特征基因,成功构建并验证了糖酵解相关预后风险模型。GSEA显示高低风险组之间存在显著生物学差异。免疫微环境分析表明,高风险组患者巨噬细胞和肿瘤相关成纤维细胞浸润较高,且伴有明显的免疫排斥和抑制;低风险组患者的B细胞和T细胞浸润较高。药物敏感性分析显示,高风险组患者对阿博利布等药物敏感,低风险组对顺铂等药物敏感。药物预测结果还表明,丙戊酸可能是预后风险基因的潜在靶向药物。结论CRC中高糖酵解状态影响患者预后。我们构建的新型糖酵解相关预后风险模型,在辅助CRC的诊疗方面具有潜在价值。 展开更多
关键词 直肠癌(crc) 糖酵解 单细胞分析 预后风险模型
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基于Wnt/β-catenin通路探究迷迭香酸对结直肠癌上皮-间质转化的抑制作用
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作者 周锋 沙德胜 +1 位作者 卢瑗瑗 陈维 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期726-733,共8页
目的探讨迷迭香酸(rosmarinic acid,RA)对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)SW480细胞恶性行为的影响及机制。方法通过收集2019年1月至2020年12月在如皋市人民医院接受手术治疗的初诊未经治疗的CRC患者的肿瘤组织以及正常人的结肠组织,... 目的探讨迷迭香酸(rosmarinic acid,RA)对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)SW480细胞恶性行为的影响及机制。方法通过收集2019年1月至2020年12月在如皋市人民医院接受手术治疗的初诊未经治疗的CRC患者的肿瘤组织以及正常人的结肠组织,用免疫组化和Western blotting方法检测β-catenin的表达,分析与临床分期、预后和免疫浸润的关系。CCK-8检测10、15、20μmol/L的RA对SW480细胞增殖的影响;流式细胞术检测细胞的凋亡情况;Transwell和划痕实验分别检测细胞的侵袭和迁移能力变化;Western blotting检测凋亡、上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)及Wnt/β-catenin通路的相关蛋白表达情况。CRC SW480细胞系悬液皮下接种制作移植瘤小鼠模型,150 mL/kg RA溶液灌胃,观察RA对移植瘤生长的影响,ELISA检测了血清炎症因子变化。结果正常结肠组织中β-catenin的表达很低,而CRC组织中β-catenin的表达明显增高。在CRC患者β-catenin高表达组中,肿瘤大于5 cm的患者数显著高于低表达组,而患者总生存期却显著小于低表达组(P<0.05)。各浓度RA组细胞增殖显著抑制,且呈浓度依赖性降低(P<0.05)。移植瘤小鼠模型中,RA处理组凋亡蛋白Bax和Bad表达较对照组显著增加,抗凋亡蛋白Bcl-2表达显著减少(P<0.05)。同时可见SW480细胞的侵袭和迁移能力显著被抑制(P<0.05),E-cadherin蛋白表达显著增加,Snail、N-cadherin和Vimentin表达显著减少(P<0.05),而且Axin和GSK-3β表达增加,β-catenin表达减少(P<0.05)。结论RA可能通过干预Wnt/β-catenin通路介导的EMT抑制SW480的生物学活性。 展开更多
关键词 迷迭香酸(RA) 直肠癌(crc) WNT/Β-CATENIN通路 上皮-间质转化(EMT)
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结直肠癌的共识分子分型及其临床应用展望 被引量:1
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作者 靳天乐 刘雨泉 +2 位作者 王润石 侯妮 李杰 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期525-534,共10页
结直肠癌(CRC)具有高度异质性。传统TNM分期不能很好地区分CRC异质性,已不能满足治疗需求。整合患者临床特征、癌组织分子遗传学变化、转录组和蛋白质组变化以及免疫基质等特征,共识分子分型(CMS)是迄今为止对CRC异质性的最佳描述。本... 结直肠癌(CRC)具有高度异质性。传统TNM分期不能很好地区分CRC异质性,已不能满足治疗需求。整合患者临床特征、癌组织分子遗传学变化、转录组和蛋白质组变化以及免疫基质等特征,共识分子分型(CMS)是迄今为止对CRC异质性的最佳描述。本文从三类CRC癌组织分子遗传学改变(染色体不稳定、微卫星不稳定和CpG岛甲基化表型)出发,系统阐述不同CMS分型CRC患者的临床特点、治疗方向和预后评估以及与免疫治疗和肠道微生物群组改变的联系。随着测序技术和前瞻性精准医学临床试验的持续探索,以CMS分型为基础的“多分子—多药物”治疗模式必将成为未来精准医学与个体化医疗的核心。 展开更多
关键词 直肠癌(crc) 异质性 共识分子分型(CMS) 临床应用
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槲皮素提高人结直肠癌细胞SW480和SW620对顺铂的敏感性 被引量:4
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作者 周锋 沙德胜 +1 位作者 卢瑗瑗 陈维 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期902-908,共7页
目的本研究旨在探究槲皮素对顺铂耐药人结直肠癌(colorectal cancer,CRC)细胞SW480和SW620的抑制作用及其可能的机制。方法培养SW480和SW620细胞的顺铂耐药亚型,并用MTT法测定槲皮素对细胞增殖和化疗敏感性的影响。流式细胞术用于检测... 目的本研究旨在探究槲皮素对顺铂耐药人结直肠癌(colorectal cancer,CRC)细胞SW480和SW620的抑制作用及其可能的机制。方法培养SW480和SW620细胞的顺铂耐药亚型,并用MTT法测定槲皮素对细胞增殖和化疗敏感性的影响。流式细胞术用于检测细胞凋亡,蛋白质印迹法用于检测相关蛋白质的表达。结果MTT实验显示,80μmol/L和160μmol/L浓度的槲皮素显著抑制了SW480和SW620细胞的增殖。流式细胞术结果表明,顺铂联合槲皮素组的细胞凋亡率明显高于其他3组。蛋白质印迹法结果显示,顺铂联合槲皮素组的裂解型半胱天冬酶-3(cleaved-caspase-3)和半胱天冬酶-9(caspase-9)表达显著增加。化疗药物敏感性检测结果表明,耐药细胞的IC_(50)升高,而在槲皮素给药后显著下降(P均<0.05)。结论本研究明确了槲皮素能够提高人CRC细胞对顺铂的敏感性。这种效应可能与其影响细胞增殖、凋亡和自噬等方面的作用机制有关。 展开更多
关键词 槲皮素 SW480细胞 SW620细胞 直肠癌(crc) 顺铂
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小RNA(miRNA)在结直肠癌(CRC)中的潜在临床应用价值 被引量:6
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作者 韦君(综述) 樊晓明(审校) 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期531-536,共6页
小RNA(microRNA,miRNA)是一类长约18~25个核苷酸序列的内源性非编码单链小RNA,通过与靶基因序列特异性相互作用,在转录后水平调节基因表达,从而调控细胞增殖、分化与凋亡等过程。结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是最常见的恶性肿瘤之... 小RNA(microRNA,miRNA)是一类长约18~25个核苷酸序列的内源性非编码单链小RNA,通过与靶基因序列特异性相互作用,在转录后水平调节基因表达,从而调控细胞增殖、分化与凋亡等过程。结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是最常见的恶性肿瘤之一,我国CRC发病率呈逐年上升趋势,且发病年龄亦有年轻化趋势。越来越多的研究表明,特异性miRNA表达异常与CRC的发生、发展密切相关。近几年来,miRNA在CRC的诊断、靶向治疗及预后评估等方面的研究已成为热点。 展开更多
关键词 小RNA(miRNA) 直肠癌(crc) 诊断 治疗 预后
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双硫死亡相关基因对结直肠癌预后和药物敏感性的预测价值 被引量:1
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作者 孙双一 贺新新 +3 位作者 陈雯桐 吕彬 葛梦潇 郭雨濛 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期473-483,共11页
目的通过生物信息学方法建立基于双硫死亡相关基因表达量预测结直肠癌(colorectal cancer,CRC)预后和药物敏感性的评分模型,并结合CRC患者来源类器官(CRC patient-derived organoids,CRC-PDOs)验证。方法利用NMF(non-negative Matrix Fa... 目的通过生物信息学方法建立基于双硫死亡相关基因表达量预测结直肠癌(colorectal cancer,CRC)预后和药物敏感性的评分模型,并结合CRC患者来源类器官(CRC patient-derived organoids,CRC-PDOs)验证。方法利用NMF(non-negative Matrix Factorization)算法、Cox和LASSO回归分析明确对CRC预后有预测价值的双硫死亡相关基因,构建双硫死亡相关风险评分公式,结合GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析不同集群之间的差异基因及富集通路。通过GDSC数据库预测不同分组CRC患者对化疗药物的敏感性,并利用CRC-PDOs进行验证。结果NMF算法结果显示基于双硫死亡相关基因可建立CRC患者分群,COX回归分析显示LRPPRC和SLC7A11是能够预测CRC患者预后的潜在基因(P=0.047、0.033),CRC患者肿瘤中的SLC7A11低表达或LRPPRC高表达与总生存率(overall survival,OS)显著相关(P=0.004、0.003)。基于LASSO回归分析,双硫死亡风险评分公式为:Risk score=LRPPRC×(-0.6705)+SLC7A11×0.3112,且能将GSE161158数据集分群为高风险和低风险组。双硫死亡高低危群集间有125个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),结合GO和KEGG结果,高危群集患者的上调基因主要富集于免疫调节,如白细胞趋化性、粒细胞迁移和Toll样受体结合。低风险集群的特征是与硫化物代谢和运输相关的途径,如硫化物跨膜转运蛋白活性。基于GDSC数据库,双硫死亡相关的双基因表达水平可预测化疗药物敏感性,化疗药物(伊立替康)对于CRC-PDOs的生长抑制结果提示患者的结直肠癌组织中SLC7A11和LRPPRC的相对表达量与其类器官映射疗效呈线性相关(P=0.007、0.040)。结论根据生物信息学分析和CRC-PDOs实验结果,双硫死亡相关评分能够预测结直肠癌患者预后和药物敏感性,具有潜在的临床应用前景。 展开更多
关键词 双硫死亡 直肠癌(crc) 生物信息学分析 化疗药物 敏感性 患者来源类器官(PDOs)
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CXCL8通过增加M2型巨噬细胞浸润及抑制CD8^(+)T细胞浸润促进结直肠癌免疫抑制微环境的形成 被引量:1
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作者 邵莹 兰燕 +2 位作者 宋冰 孙嘉颖 杨涛 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期880-886,共7页
目的探讨CXC趋化因子配体8(CXCL8)对结直肠癌(CRC)微环境的免疫调节作用。方法使用过表达CXCL8的鼠源CRC细胞株CT26细胞建立BALB/c小鼠皮下移植瘤模型,监测肿瘤生长情况,成瘤三周后剥离肿瘤组织并取出小鼠脾脏,一方面制备肿瘤单细胞悬液... 目的探讨CXC趋化因子配体8(CXCL8)对结直肠癌(CRC)微环境的免疫调节作用。方法使用过表达CXCL8的鼠源CRC细胞株CT26细胞建立BALB/c小鼠皮下移植瘤模型,监测肿瘤生长情况,成瘤三周后剥离肿瘤组织并取出小鼠脾脏,一方面制备肿瘤单细胞悬液,流式细胞术检测肿瘤微环境中M2型巨噬细胞及CD8^(+)T细胞的浸润情况;另一方面制备脾脏单细胞悬液,分选脾脏CD8^(+)T细胞,在体外将T细胞与过表达CXCL8的CT26细胞共培养,细胞毒性实验检测T细胞杀伤能力。结果过表达CXCL8促进小鼠CRC移植瘤生长;过表达CXCL8的CRC组织中M2型巨噬细胞浸润增加、CD8^(+)T细胞浸润减少;过表达CXCL8的小鼠CRC细胞并不影响CD8^(+)T细胞体外杀伤能力。结论CXCL8过表达CRC细胞通过增加M2型巨噬细胞浸润及抑制CD8^(+)T细胞浸润促进CRC免疫抑制微环境的形成。 展开更多
关键词 CXC趋化因子配体8(CXCL8) M2型巨噬细胞 CD8^(+)T细胞 直肠癌(crc)
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生物信息学技术分析人结直肠癌中蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA)表达与患者预后及免疫浸润的关系
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作者 梁小洁 程照翔 +2 位作者 尚维伟 陈信浩 李俊 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期591-604,共14页
目的通过分析蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA)在结直肠癌(CRC)中表达水平与患者预后及免疫浸润的关系,进一步了解CRC发生和进展中的相关机制。方法基于基因芯片数据库Oncomine和肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析在CRC组织和正常组织中... 目的通过分析蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA)在结直肠癌(CRC)中表达水平与患者预后及免疫浸润的关系,进一步了解CRC发生和进展中的相关机制。方法基于基因芯片数据库Oncomine和肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析在CRC组织和正常组织中PPP2CA表达水平的差异性;基于阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析门户(UALCAN)和基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析PPP2CA的表达水平对CRC患者预后的影响;基于LinkedOmics平台构建PPP2CA的共表达网络并进行基因本体论(GO)富集分析和京东基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析;基于TIMER和GEPIA数据库分析PPP2CA与免疫浸润之间的相关性。基于c-BioPortal平台分析结肠腺癌(COAD)中PPP2CA的基因突变情况。结果与正常结直肠组织相比,在CRC组织中PPP2CA表达下调。高表达水平的PPP2CA预示着更好的总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)。在COAD中,PPP2CA的表达水平与包括CD8^(+)T细胞、中性粒细胞和树突状细胞在内的免疫浸润细胞呈正相关。而某些免疫细胞标志物,包括B细胞的CD19和CD38、M1巨噬细胞的一氧化氮合酶2(NOS2)、M2巨噬细胞的精氨酸酶1(Arg1)和甘露糖受体C1(MRC1)、肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的人类白细胞抗原G(HLA-G)和CD80、单核细胞的CD14和IgG Fc段受体Ⅲa(FCGR3A),却显示出不同的PPP2CA相关免疫浸润模式:即PPP2CA表达水平与COAD和直肠腺癌(READ)中的B细胞、巨噬细胞、单核细胞、TAM、1型辅助T(Th1)细胞、Th2细胞、调节性T细胞、衰竭T细胞和中性粒细胞均显著相关。结论PPP2CA在CRC组织表达水平下调,并且与免疫浸润密切相关。 展开更多
关键词 蛋白磷酸酶2A催化亚基α基因(PPP2CA) 直肠癌(crc) 免疫浸润 预后
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基于Wnt/β-catenin通路探讨葛根芩连汤对结直肠肿瘤生长的影响和机制 被引量:1
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作者 蔡蓉 王上 +3 位作者 肖柳 周燕萍 胡作为 李云海 《科学技术与工程》 北大核心 2025年第8期3142-3151,共10页
基于Wnt/β-catenin通路探究葛根芩连汤(Gegen Qinlian Decoction,GQD)对结直肠癌的抗肿瘤作用及对胞质分裂的蛋白质调节因子1(protein regulator of cytokinesis 1,PRC1)核易位的影响。采用BALB/c裸鼠皮下接种CT26结直肠癌细胞株制备... 基于Wnt/β-catenin通路探究葛根芩连汤(Gegen Qinlian Decoction,GQD)对结直肠癌的抗肿瘤作用及对胞质分裂的蛋白质调节因子1(protein regulator of cytokinesis 1,PRC1)核易位的影响。采用BALB/c裸鼠皮下接种CT26结直肠癌细胞株制备结直肠肿瘤体内模型,分别按低(L-GQD)、中(M-GQD)及高(H-GQD)剂量连续灌药干预25 d,模型组(Control)作为空白对照,并记录裸鼠皮下肿瘤生长变化,于末次给药后取出肿瘤后观察。苏木精-伊红染色(hematoxylin-eosin staining,HE)、免疫组化(immunohistochemistry,IHC)和原位末端转移酶标记技术(terminal deoxynucleotidyl transferase-mediated dUTP nick end labeling,TUNEL)检测肿瘤的增殖和凋亡情况,并通过qRT-PCR和蛋白质免疫印迹分析(western blot,WB)检测Wnt/β-catenin信号及其下游因子的表达变化;此外,WB检测GQD对PRC1的磷酸化水平其亚细胞定位的影响。结果表明:相较于Control组,GQD以剂量依赖方式抑制体内结直肠肿瘤的生长并提高其凋亡水平;IHC结果显示GQD下调了增殖相关蛋白细胞周期蛋白D1(Cyclind1)、增殖标志物Ki-67(Ki67)和血小板-内皮细胞黏附分子(CD31)的表达(P<0.05),同时促进了凋亡相关蛋白胱天蛋白酶3(Caspase 3)和胱天蛋白酶9(Caspase 9)的表达(P<0.05);进一步发现GQD可抑制Wnt/β-catenin信号的激活,推测可能与降低PRC1磷酸化水平并增加其核保留比例有关。GQD可显著抑制结直肠肿瘤的增殖并促进其凋亡,GQD还可抑制Wnt/β-catenin信号通路的激活,且可能与介导PRC1的核易位有关。 展开更多
关键词 葛根芩连汤(GQD) 直肠癌(crc) Wnt/β-catenin信号 蛋白质调节因子1(PRC1)
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IL-33及白细胞介素1受体样分子1(IL-1RL1)在结直肠癌组织中高表达及预后分析 被引量:7
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作者 赵学勤 王东明 +1 位作者 朴纪颖 段旭峰 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期447-451,共5页
目的研究IL-33在结直肠癌(CRC)组织中的表达,探讨IL-33与CRC手术患者预后的相关性以及IL-33对CRC细胞恶性表型的促进作用。方法利用免疫组织化学染色法检测CRC组织中IL-33及白细胞介素1受体样分子1(IL-1RL1)的表达,从TCGA数据库中选取... 目的研究IL-33在结直肠癌(CRC)组织中的表达,探讨IL-33与CRC手术患者预后的相关性以及IL-33对CRC细胞恶性表型的促进作用。方法利用免疫组织化学染色法检测CRC组织中IL-33及白细胞介素1受体样分子1(IL-1RL1)的表达,从TCGA数据库中选取经转录组测序分析的597例CRC患者,并利用Kaplan-Meier模型分析IL-33或IL-1RL1与CRC患者生存情况, Log-Rank检验比较生存曲线。采用Lovo人结肠癌细胞裸鼠皮下种植建立移植瘤模型,利用游标卡尺量取并计算IL-33处理组及对照组小鼠肿瘤体积,进而评估IL-33对CRC细胞生长的影响。结果与癌旁组织相比, IL-33、IL-1RL1在CRC组织高表达,且肿瘤组织高表达IL-33或IL-1RL1的患者预后显著优于低表达组患者。IL-33可显著抑制CRC细胞在小鼠体内的增殖。结论 CRC组织高表达IL-33或IL-1RL1的患者预后较好。 展开更多
关键词 直肠癌(crc) 白细胞介素33(IL-33) 白细胞介素1受体样分子1(IL-1RL1) 预后 肿瘤生长
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血细胞DNA甲基化在结直肠癌中的研究进展 被引量:3
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作者 温炽秀 戎祯祥 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2017年第23期4001-4004,共4页
结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的发病机制尚不明确,随着对基因水平的深入研究,发现在结直肠癌患者中,血细胞甲基化异常与结直肠癌的早期诊断、治疗疗效及预后评价等存在一定的相关性,且表观遗传学的改变比经典遗传以及生理生化的改... 结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的发病机制尚不明确,随着对基因水平的深入研究,发现在结直肠癌患者中,血细胞甲基化异常与结直肠癌的早期诊断、治疗疗效及预后评价等存在一定的相关性,且表观遗传学的改变比经典遗传以及生理生化的改变更早发生。本文对近期关于结直肠癌中血细胞DNA甲基化的研究进展进行综述,分析血细胞DNA甲基化检测在结直肠癌临床运用,为结直肠癌的早期诊断、治疗疗效及预后评价提供参考。 展开更多
关键词 血细胞 DNA甲基化 直肠癌(crc)
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长链非编码RNA在结直肠癌发生发展中的研究进展 被引量:6
12
作者 陈猛云(综述) 樊晓明(审校) 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期267-270,共4页
我国结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的发病率和死亡率均保持上升趋势,且多数患者发现时已属晚期。随着CRC的发病机制与分子通路的研究进展,其中长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)参与CRC发生。抑癌基因LncRNA-p21,致癌基因Ln... 我国结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的发病率和死亡率均保持上升趋势,且多数患者发现时已属晚期。随着CRC的发病机制与分子通路的研究进展,其中长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)参与CRC发生。抑癌基因LncRNA-p21,致癌基因LncRNA结直肠癌差异表达基因(LncRNA colorectal neoplasia differentially expressed,LncRNA-CRNDE)、LncRNA牛磺酸上调基因1(LncRNA taurine up-regulating gene 1,LncRNATUG1)、胃腺癌相关LncRNA(gastric adenocarcinoma related LncRNA,LncRNA-GAPLIC)等在CRC中异常表达,并通过多种途径调控CRC发生和发展。LncRNA对癌细胞的增殖、迁移、侵袭、凋亡进行调控,所以对CRC早期筛查、治疗及预后有重要意义。本文就上述4种LncRNA在CRC发生发展中的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 直肠癌(crc) 长链非编码RNA(LncRNA) LncRNA-p21 LncRNA-CRNDE LncRNATUG1 LncRNA-GAPLIC
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质谱定量蛋白质组学技术筛选结直肠癌外周血单个核细胞差异表达蛋白 被引量:1
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作者 逄雪超 徐燕 纪丽云 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第2期216-223,共8页
结直肠癌(CRC)是一种常见的、发生及发展过程复杂的消化系统癌症,其复杂、多级的发生发展过程会影响机体免疫功能,引起免疫变化。外周血单个核细胞(PBMC)是机体免疫系统的重要组成部分,且便于获取,是研究机体免疫功能的理想材料。本研... 结直肠癌(CRC)是一种常见的、发生及发展过程复杂的消化系统癌症,其复杂、多级的发生发展过程会影响机体免疫功能,引起免疫变化。外周血单个核细胞(PBMC)是机体免疫系统的重要组成部分,且便于获取,是研究机体免疫功能的理想材料。本研究采用最新的数据非依赖采集(data independent acquision,DIA)质谱新方法结合Skyline软件对结直肠癌患者与良性肠病患者的PBMC蛋白进行定量比较,寻找差异表达蛋白,并对差异蛋白进行Reactome通路及GO分析。结果表明,共找到113个差异表达蛋白,其中,上调蛋白23个,下调蛋白90个,它们参与巨噬细胞、T细胞、树突细胞等多种外周免疫细胞的免疫活动。在这些差异蛋白中,上调蛋白Galectin-1及下调蛋白Dok-2和AHNAK1等蛋白与机体的免疫功能息息相关,有望成为外周血单个核细胞中的结直肠癌免疫标志物。 展开更多
关键词 直肠癌(crc) 数据非依赖采集(DIA) 质谱 蛋白质组学 外周血单个核细胞(PBMC)
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抑制自噬增强盐酸阿霉素诱导的人结直肠癌细胞凋亡 被引量:1
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作者 汤弘婷 吴道秋 +5 位作者 杨瀚林 杨娟 张艺 李梦醒 刘虹麟 李琴山 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期237-243,共7页
目的 探讨盐酸阿霉素(DOX)抑制结直肠癌HT29、 HCT15细胞增殖的可能机制。方法 HT29、 HCT15细胞采用(0、 0.08、 0.16、 0.32、 0.64、 1.28)μmol/L DOX处理24、 48、 72 h,CCK-8法检测细胞增殖活性确定DOX最佳处理浓度和处理时间。将... 目的 探讨盐酸阿霉素(DOX)抑制结直肠癌HT29、 HCT15细胞增殖的可能机制。方法 HT29、 HCT15细胞采用(0、 0.08、 0.16、 0.32、 0.64、 1.28)μmol/L DOX处理24、 48、 72 h,CCK-8法检测细胞增殖活性确定DOX最佳处理浓度和处理时间。将HT29、 HCT15细胞分别设为对照组(只加DMSO处理)和(0.16、 0.32、 0.64、 1.28)μmol/LDOX处理组,Western blot法检测抑制自噬对凋亡的影响时添加3-甲基腺嘌呤(3-MA)组、 3-MA联合DOX组。集落形成实验检测结直肠癌细胞的集落形成能力,Western blot法检测细胞B细胞淋巴瘤因子2(Bcl2)、 Bcl2相关X蛋白(BAX)、 beclin 1、微管相关蛋白1轻链3(LC3)的蛋白表达。结果 DOX抑制结直肠癌细胞的增殖和集落形成,促进细胞发生凋亡,呈浓度依赖性;DOX促进细胞发生自噬,beclin 1和LC3Ⅱ表达增加,呈浓度依赖性;抑制自噬后可增加DOX对结直肠癌细胞的促凋亡作用。结论 DOX抑制结直肠癌细胞增殖并促进其凋亡且抑制自噬有促凋亡作用。 展开更多
关键词 直肠癌(crc) 盐酸阿霉素(DOX) 细胞凋亡 自噬
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聚ADP核糖聚合酶在结直肠癌中作用的研究进展
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作者 李晶晶(综述) 孙琦 刘斌(审阅) 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1400-1404,共5页
近年来DNA修复途径成为癌症治疗的热门靶点,聚ADP核糖聚合酶[poly(ADP)-ribosepolymerase,PARP]作为DNA修复的关键酶得到了广泛研究,目前上市的PARP抑制剂(PARP inhibitor,PARPi)药物,在乳腺及卵巢等肿瘤中取得了革命性的突破。结直肠癌... 近年来DNA修复途径成为癌症治疗的热门靶点,聚ADP核糖聚合酶[poly(ADP)-ribosepolymerase,PARP]作为DNA修复的关键酶得到了广泛研究,目前上市的PARP抑制剂(PARP inhibitor,PARPi)药物,在乳腺及卵巢等肿瘤中取得了革命性的突破。结直肠癌(CRC)具有异质性,其发生与发展是一个多途径、多基因参与及多步骤的过程,其发病率与病死率在中国逐年上升。研究发现,PARP1与CRC的发生、发展及治疗密切相关,本文从PARP1的分子结构及生物学功能、PARPi的作用机制、PARP1在CRC组织中的表达情况、PARP1与结直肠癌干细胞的关系、PARPi与CRC治疗的关系等5个方面对PARPi在CRC中作用的研究进展作一系统综述,为临床治疗CRC寻找新的治疗策略。 展开更多
关键词 聚ADP核糖聚合酶(PARP) 直肠癌(crc) PARP抑制剂(PARPi) 合成致死 放疗与化疗
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TNF-α通过激活PI3K/AKT通路促进SW620^Lgr5+结肠癌干细胞增殖 被引量:9
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作者 戴璐 赵晓鹏 +6 位作者 马璐 李昕 左娣 李元杰 魏波 隋御 徐方 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期33-41,共9页
目的探讨炎症环境下磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B (PI3K/AKT)通路对SW620^Lgr5+结肠癌干细胞(CSC)增殖的影响。方法以人结肠癌SW620、 SW480、 HT29、 HCT116细胞为材料, Western blot法检测四株细胞中干细胞标志物富含亮氨酸重复序列的G... 目的探讨炎症环境下磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B (PI3K/AKT)通路对SW620^Lgr5+结肠癌干细胞(CSC)增殖的影响。方法以人结肠癌SW620、 SW480、 HT29、 HCT116细胞为材料, Western blot法检测四株细胞中干细胞标志物富含亮氨酸重复序列的G蛋白偶联受体5(Lgr5)的表达水平;选用Lgr5表达量最高的SW620细胞,采用荧光激活细胞分选技术(FACS)分析Lgr5^+细胞的比例;无血清悬浮培养得到结肠癌球细胞, FACS分选获得结肠癌Lgr5^+ CSC,集落形成实验、 5-氟尿嘧啶(5-FU)耐药实验鉴定分选得到的结肠癌Lgr5^+CSC生物学特征的变化;肿瘤坏死因子α(TNF-α)处理Lgr5^+ CSC建立炎症模型, CCK-8法筛选TNF-α的最适作用浓度及最佳作用时间;采用PI3K/AKT通路抑制剂MK2206处理Lgr5^+ CSC,分为空白对照组、 MK2206组、 TNF-α组、 MK2206联合TNF-α组;集落形成实验检测细胞增殖情况,异硫氰酸荧光素标记的膜联素Ⅴ/碘化丙啶(AnnexinⅤ-FITC/PI)双标记结合流式细胞术检测细胞凋亡情况;Western blot法检测AKT、磷酸化的AKT(p-AKT)、糖原合酶激酶3β(GSK-3β)、磷酸化的GSK-3β(p-GSK-3β)蛋白水平。结果 SW620细胞中Lgr5的蛋白表达量显著高于其他细胞系;FACS分析得到SW620细胞中Lgr5^+细胞比例为6.9%,无血清培养基悬浮培养后,分选得到SW620^Lgr5+ CSC的比例为34.5%;与SW620细胞相比, SW620^Lgr5+ CSC的增殖能力与耐药性显著提高;1 ng/mL TNF-α作用24 h时,SW620^Lgr5+ CSC具有最高的细胞活力;与对照组相比, TNF-α显著增加SW620^Lgr5+ CSC的集落形成能力,但MK2206显著性降低SW620^Lgr5+ CSC的集落形成能力,增加SW620^Lgr5+ CSC的凋亡率;同时MK2206显著降低TNF-α诱导的SW620^Lgr5+ CSC的集落形成能力,增加其凋亡比例。TNF-α处理增加SW620^Lgr5+ CSC中AKT和GSK-3β的磷酸化水平,但MK2206可抑制TNF-α诱导的AKT和GSK-3β的磷酸化水平。结论 TNF-α通过激活PI3K/AKT信号通路促进SW620^Lgr5+ CSC增殖。 展开更多
关键词 直肠癌(crc) 癌症干细胞(CSC) TNF-Α PI3K/AKT信号通路 细胞增殖
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