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基于可变数目串联重复序列的痰液结核分枝杆菌检测方法建立及初步应用
被引量：
2
1
作者
苏敏
陈晋
+4 位作者
白冰
黄云秀
魏兰
刘旻雁
陈婷梅
《浙江大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期61-67,共7页
目的：结核分枝杆菌散在分布重复单位及可变数目串联重复序列（ MIRU-VNTR）是一项应用于结核分枝杆菌分子分型的技术，本研究基于该技术旨在建立一种直接应用临床痰液标本检测结核分枝杆菌的实验室方法。方法：根据扩增条件及临床检测...
目的：结核分枝杆菌散在分布重复单位及可变数目串联重复序列（ MIRU-VNTR）是一项应用于结核分枝杆菌分子分型的技术，本研究基于该技术旨在建立一种直接应用临床痰液标本检测结核分枝杆菌的实验室方法。方法：根据扩增条件及临床检测的实际需要，优化选择八个 MIRU-VNTR 位点（ MTUB21、MTUB04、QUB18、QUB26、QUB11b、MIRU31、MIRU10和MIRU26）作为检测靶标，收集130例肺结核患者和200例非肺结核患者（其他肺部疾病）的痰液样本，分别以传统的罗氏培养法和临床诊断的方法为标准，用MIRU-VNTR分析和荧光定量聚合酶链反应（ FQ-PCR ）对上述样本进行检测。结果：以罗氏培养法为标准时， MIRU-VNTR 的灵敏度为93.1％，特异度为97.7％；FQ-PCR 检测的灵敏度为94.0％，特异度为96.7％，MIRU-VNTR分析与FQ-PCR检测结果准确度差异无统计学意义（χ2＝0.352， P＝0.569）。以临床诊断为标准时， MIRU-VNTR分析的灵敏度为86.9％，特异度为100％；FQ-PCR 检测的灵敏度为87.7％，特异度为99.0％，两种方法检测结果准确度差异无统计学意义（χ2＝0.030， P＝0.862），且MIRU-VNTR分析中未发现假阳性结果。在MIRU-VNTR检测为阳性的结果中，98.2％（111／113）的样本分子编码互不相同，只有1.8％（2／113）分子编码一致（皆为54685538）。结论：应用临床痰液标本建立的基于MIRU-VNTR的结核分枝杆菌快速检测方法有着较好的应用价值。
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关键词
分枝杆菌
结核/
分离和提纯
结核
肺/诊断
痰液/微生物学
分枝杆菌
结核/遗传学
基因型
串联重复序列
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职称材料
中国人群中BTNL2基因多态性与结核病易感性研究
被引量：
2
2
作者
练媛媛
乐军
+2 位作者
韩敏
刘建芳
刘丽蓉
《中国防痨杂志》
CAS
2009年第4期199-205,共7页
目的探讨嗜乳脂样蛋白2（BTNL2）基因多态性与中国人群结核病发病的关系。方法在中国人群中进行病例对照研究，用SNaPshotSNP分型技术分析94例结核病样本（病例组）和95例健康对照者（对照组）的7个BTNL2基因单核苷酸多态性（SNP）位点...
目的探讨嗜乳脂样蛋白2（BTNL2）基因多态性与中国人群结核病发病的关系。方法在中国人群中进行病例对照研究，用SNaPshotSNP分型技术分析94例结核病样本（病例组）和95例健康对照者（对照组）的7个BTNL2基因单核苷酸多态性（SNP）位点（rs9405098、rs3763317、rs3763313、rs9268494、rs9268492、rs2076523、rs2076530），使用SHEsis软件进行数据处理，进行Hardy—Weinberg遗传平衡检验，计算各组等位基因频率和基因型频率，用x^2检验计算P值比较2组分布频率的差异，并计算各等位基因比值比（OR）及95％可信区间（CI）分析疾病与基因的关联强度，以及BTNL2基因多态性位点连锁不平衡系数（D＇值）和单倍体型频率。结果研究显示：（1）所研究的7个多态性位点与结核病的易感性均无显著关联。（2）BTNL2基因的C—A—T—G—C—G单倍体型和C—G—T—G—C—G单倍体型与中国人群结核病发生的易感性显著相关，P值分别为0．007和0．049，其OR值（95％CI）分别为0．39（0．19～0．79）和3．50（0．93～13．18）。结论（1）BTNL2基因多态性单个位点与中国人群结核病的易感性无显著相关。（2）BTNL2基因的单倍体型可能与中国人群结核病发生的易感性相关。
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关键词
结核
肺
/遗传学
疾病易感性
膜糖蛋白类
多态性
单核苷酸
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职称材料
题名
基于可变数目串联重复序列的痰液结核分枝杆菌检测方法建立及初步应用
被引量：
2
1
作者
苏敏
陈晋
白冰
黄云秀
魏兰
刘旻雁
陈婷梅
机构
重庆医科大学检验系教育部临床检验重点实验室
同济大学附属肺科医院检验科上海市结核病临床研究中心重点实验室
广西医科大学检验系
出处
《浙江大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期61-67,共7页
基金
国家自然科学基金
文摘
目的：结核分枝杆菌散在分布重复单位及可变数目串联重复序列（ MIRU-VNTR）是一项应用于结核分枝杆菌分子分型的技术，本研究基于该技术旨在建立一种直接应用临床痰液标本检测结核分枝杆菌的实验室方法。方法：根据扩增条件及临床检测的实际需要，优化选择八个 MIRU-VNTR 位点（ MTUB21、MTUB04、QUB18、QUB26、QUB11b、MIRU31、MIRU10和MIRU26）作为检测靶标，收集130例肺结核患者和200例非肺结核患者（其他肺部疾病）的痰液样本，分别以传统的罗氏培养法和临床诊断的方法为标准，用MIRU-VNTR分析和荧光定量聚合酶链反应（ FQ-PCR ）对上述样本进行检测。结果：以罗氏培养法为标准时， MIRU-VNTR 的灵敏度为93.1％，特异度为97.7％；FQ-PCR 检测的灵敏度为94.0％，特异度为96.7％，MIRU-VNTR分析与FQ-PCR检测结果准确度差异无统计学意义（χ2＝0.352， P＝0.569）。以临床诊断为标准时， MIRU-VNTR分析的灵敏度为86.9％，特异度为100％；FQ-PCR 检测的灵敏度为87.7％，特异度为99.0％，两种方法检测结果准确度差异无统计学意义（χ2＝0.030， P＝0.862），且MIRU-VNTR分析中未发现假阳性结果。在MIRU-VNTR检测为阳性的结果中，98.2％（111／113）的样本分子编码互不相同，只有1.8％（2／113）分子编码一致（皆为54685538）。结论：应用临床痰液标本建立的基于MIRU-VNTR的结核分枝杆菌快速检测方法有着较好的应用价值。
关键词
分枝杆菌
结核/
分离和提纯
结核
肺/诊断
痰液/微生物学
分枝杆菌
结核/遗传学
基因型
串联重复序列
Keywords
Mycobacterium tuberculosis/isolation ＆amp
purification
Tuberculosis,pulmonary/diagnosis
Sputum/microbiology
Mycobacterium tuberculosis/genetics
Genotype
Tandem repeat sequences
分类号
R52 [医药卫生—内科学]
R446.5 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
中国人群中BTNL2基因多态性与结核病易感性研究
被引量：
2
2
作者
练媛媛
乐军
韩敏
刘建芳
刘丽蓉
机构
同济大学附属上海市肺科医院检验科
出处
《中国防痨杂志》
CAS
2009年第4期199-205,共7页
文摘
目的探讨嗜乳脂样蛋白2（BTNL2）基因多态性与中国人群结核病发病的关系。方法在中国人群中进行病例对照研究，用SNaPshotSNP分型技术分析94例结核病样本（病例组）和95例健康对照者（对照组）的7个BTNL2基因单核苷酸多态性（SNP）位点（rs9405098、rs3763317、rs3763313、rs9268494、rs9268492、rs2076523、rs2076530），使用SHEsis软件进行数据处理，进行Hardy—Weinberg遗传平衡检验，计算各组等位基因频率和基因型频率，用x^2检验计算P值比较2组分布频率的差异，并计算各等位基因比值比（OR）及95％可信区间（CI）分析疾病与基因的关联强度，以及BTNL2基因多态性位点连锁不平衡系数（D＇值）和单倍体型频率。结果研究显示：（1）所研究的7个多态性位点与结核病的易感性均无显著关联。（2）BTNL2基因的C—A—T—G—C—G单倍体型和C—G—T—G—C—G单倍体型与中国人群结核病发生的易感性显著相关，P值分别为0．007和0．049，其OR值（95％CI）分别为0．39（0．19～0．79）和3．50（0．93～13．18）。结论（1）BTNL2基因多态性单个位点与中国人群结核病的易感性无显著相关。（2）BTNL2基因的单倍体型可能与中国人群结核病发生的易感性相关。
关键词
结核
肺
/遗传学
疾病易感性
膜糖蛋白类
多态性
单核苷酸
Keywords
tuberculosis, pulmonary/genetics
disease susceptibility
membrane glycoproteins
polymorphism, single nucleotide
分类号
R52 [医药卫生—内科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于可变数目串联重复序列的痰液结核分枝杆菌检测方法建立及初步应用
苏敏
陈晋
白冰
黄云秀
魏兰
刘旻雁
陈婷梅
《浙江大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
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职称材料
2
中国人群中BTNL2基因多态性与结核病易感性研究
练媛媛
乐军
韩敏
刘建芳
刘丽蓉
《中国防痨杂志》
CAS
2009
2
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