蛋白质是一种具有空间结构的物质。蛋白质结构预测的主要目标是从已有的大规模的蛋白质数据集中提取有效的信息,从而预测自然界中蛋白质的结构。目前蛋白质结构预测实验存在的一个问题是,缺少能够进一步反映出蛋白质空间结构特征的数据...蛋白质是一种具有空间结构的物质。蛋白质结构预测的主要目标是从已有的大规模的蛋白质数据集中提取有效的信息,从而预测自然界中蛋白质的结构。目前蛋白质结构预测实验存在的一个问题是,缺少能够进一步反映出蛋白质空间结构特征的数据集。当前主流的PDB蛋白质数据集虽然是经过实验测得,但没有利用到蛋白质的空间特征,而且存在掺杂核酸数据和部分数据不完整的问题。针对以上问题,从蛋白质的空间结构角度来研究蛋白质的预测。在原始PDB数据集的基础上,提出了河海图结构蛋白质数据集(Hohai Graphic Protein Data Bank,HohaiGPDB)。该数据集以图结构为基础,表达出了蛋白质的空间结构特征。基于传统Transformer网络模型对新的数据集进行了相关的蛋白质结构预测实验,在HohaiGPDB数据集上的预测准确率可以达到59.38%,证明了HohaiGPDB数据集的研究价值。HohaiGPDB数据集可以作为蛋白质相关研究的通用数据集。展开更多
This data set collects,compares and contrasts the capacities and structures of a series of hard carbon materials,and then searches for correlations between structure and electrochemical performance.The capacity data o...This data set collects,compares and contrasts the capacities and structures of a series of hard carbon materials,and then searches for correlations between structure and electrochemical performance.The capacity data of the hard carbons were obtained by charge/discharge tests and the materials were characterized by XRD,gas adsorption,true density tests and SAXS.In particular,the fitting of SAXS gave a series of structural parameters which showed good characterization.The related test details are given with the structural data of the hard carbons and the electrochemical performance of the sodium-ion batteries.展开更多
文摘蛋白质是一种具有空间结构的物质。蛋白质结构预测的主要目标是从已有的大规模的蛋白质数据集中提取有效的信息,从而预测自然界中蛋白质的结构。目前蛋白质结构预测实验存在的一个问题是,缺少能够进一步反映出蛋白质空间结构特征的数据集。当前主流的PDB蛋白质数据集虽然是经过实验测得,但没有利用到蛋白质的空间特征,而且存在掺杂核酸数据和部分数据不完整的问题。针对以上问题,从蛋白质的空间结构角度来研究蛋白质的预测。在原始PDB数据集的基础上,提出了河海图结构蛋白质数据集(Hohai Graphic Protein Data Bank,HohaiGPDB)。该数据集以图结构为基础,表达出了蛋白质的空间结构特征。基于传统Transformer网络模型对新的数据集进行了相关的蛋白质结构预测实验,在HohaiGPDB数据集上的预测准确率可以达到59.38%,证明了HohaiGPDB数据集的研究价值。HohaiGPDB数据集可以作为蛋白质相关研究的通用数据集。
基金supported by the National Natural Science Foundation of China(22379157)CAS Project for Young Scientists in Basic Research(YSBR-102)+2 种基金Institute of Coal Chemistry,Chinese Academy of Sciences(SCJC-XCL-2023-13,SCJCXCL-2023-10)Talent Projects for Outstanding Doctoral Students to Work in Shanxi Province(E3SWR4791Z)Fundamental Research Program of Shanxi Province(202403021222485).
文摘This data set collects,compares and contrasts the capacities and structures of a series of hard carbon materials,and then searches for correlations between structure and electrochemical performance.The capacity data of the hard carbons were obtained by charge/discharge tests and the materials were characterized by XRD,gas adsorption,true density tests and SAXS.In particular,the fitting of SAXS gave a series of structural parameters which showed good characterization.The related test details are given with the structural data of the hard carbons and the electrochemical performance of the sodium-ion batteries.
