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大豆TCP转录因子家族结构域分析及功能预测
被引量：
14
1
作者
刘洋
张慧
+5 位作者
辛大伟
王琳琳
张丽伟
刘春燕
陈庆山
胡国华
《大豆科学》
CSCD
北大核心
2012年第5期707-713,717,共8页
利用已知的拟南芥TCP基因和大豆基因组数据库,通过生物信息学方法,鉴定并获得了大豆TCP家族基因序列,基因定位信息。共鉴定大豆TCP基因54个,分布在大豆除14号染色体外的其他19条染色体上。对54个基因进行进化和聚类分析及功能结构域的分...
利用已知的拟南芥TCP基因和大豆基因组数据库,通过生物信息学方法,鉴定并获得了大豆TCP家族基因序列,基因定位信息。共鉴定大豆TCP基因54个,分布在大豆除14号染色体外的其他19条染色体上。对54个基因进行进化和聚类分析及功能结构域的分析,发现全部具有高度保守的TCP结构域。根据结构域差异和系统发育分析的结果,将大豆TCP转录因子家族分成2个TCP亚家族。以生物信息学手段和已有的其他物种的TCP基因进行了比较分析,大豆TCP基因占总数的3.5%,与拟南芥同源基因比较,序列长度存在相似性。对启动子元件分析显示,TCP基因含有大量与在子叶、根、茎处大量表达有关的元件及对分生组织有作用的元件。
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关键词
大豆
TCP转录因子
结构域分析
功能预测
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题名
大豆TCP转录因子家族结构域分析及功能预测
被引量：
14
1
作者
刘洋
张慧
辛大伟
王琳琳
张丽伟
刘春燕
陈庆山
胡国华
机构
东北农业大学农学院
黑龙江省农垦科研育种中心
出处
《大豆科学》
CSCD
北大核心
2012年第5期707-713,717,共8页
基金
抗除草剂转基因大豆新品种培育项目(2011ZX08004-001-06)
现代农业产业体系资助项目(CARS-04-02A)
黑龙江省普通高等学校新世纪优秀人才培养计划(1252-NCET-004)
文摘
利用已知的拟南芥TCP基因和大豆基因组数据库,通过生物信息学方法,鉴定并获得了大豆TCP家族基因序列,基因定位信息。共鉴定大豆TCP基因54个,分布在大豆除14号染色体外的其他19条染色体上。对54个基因进行进化和聚类分析及功能结构域的分析,发现全部具有高度保守的TCP结构域。根据结构域差异和系统发育分析的结果,将大豆TCP转录因子家族分成2个TCP亚家族。以生物信息学手段和已有的其他物种的TCP基因进行了比较分析,大豆TCP基因占总数的3.5%,与拟南芥同源基因比较,序列长度存在相似性。对启动子元件分析显示,TCP基因含有大量与在子叶、根、茎处大量表达有关的元件及对分生组织有作用的元件。
关键词
大豆
TCP转录因子
结构域分析
功能预测
Keywords
Soybean
TCP-domain
Structure domain analysis
Function prediction
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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被引量
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1
大豆TCP转录因子家族结构域分析及功能预测
刘洋
张慧
辛大伟
王琳琳
张丽伟
刘春燕
陈庆山
胡国华
《大豆科学》
CSCD
北大核心
2012
14
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