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基于高通量测序研究番红花不同生长期根际土壤中真菌群落结构及多样性
被引量：
2
1
作者
邱远金
赵亚琴
+4 位作者
张际昭
樊丛照
阿依别克·热合木都拉
王果平
朱军
《中国现代中药》
CAS
2023年第3期574-581,共8页
目的:以新疆番红花Crocus sativus L.不同生长期的根际土壤为材料,研究土壤真菌群落结构与多样性。方法:提取番红花不同生长期的根际土壤总DNA,应用Illumina NovaSeq 6000高通量测序平台进行测序分析。结果:对番红花3个生长期[生长初期(...
目的:以新疆番红花Crocus sativus L.不同生长期的根际土壤为材料,研究土壤真菌群落结构与多样性。方法:提取番红花不同生长期的根际土壤总DNA,应用Illumina NovaSeq 6000高通量测序平台进行测序分析。结果:对番红花3个生长期[生长初期(S1)、生长中期(S2)、生长后期(S3)]的3组样本进行高通量测序,共获得4252个操作分类单元(OTUs),包含9个真菌门,并对检测到的真菌属中相对丰度前20的真菌属进行了分析。结果发现,不同生长期番红花优势真菌群落共有门属分别是子囊菌门(Ascomycota)、被孢霉门(Mortierellomycota)、链格孢属(Alternaria)、球腔菌属(Mycosphaerella)和爪甲白癣菌属(Arthrographis)。3个生长期的真菌组成有所不同,S1和S2生长期特有的属分别是平脐蠕孢属(Bipolaris)和谷菌根菌属(Archaeorhizomyces),S3有2个特有的属和1个特有的门,分别是棘壳孢属(Setophoma)、枝孢属(Cladosporium)和油壶菌门(Olpidiomycota)。Alpha和Beta多样性分析结果表明,不同生长期番红花根际土壤真菌群落赵氏指数(Chao1)、香农指数(Shannon)和观察到的种类数(Sobs)差异有统计学意义,样本中真菌物种组成存在一定差异。结论:利用高通量测序技术可快速、全面地获得土壤真菌组成信息。番红花不同生长时期根际土壤中真菌群落结构与多样性存在差异,菌群多样性随番红花的生长呈现不断上升的趋势;在番红花不同的生长期尤其是S1土壤样本中均检测到相对丰度较高的有害菌链格孢菌属和被孢霉门。为进一步揭示新疆番红花S1易发生种球腐烂病害,以及根际真菌的多样性与番红花球茎内生真菌、病原菌相互作用机制研究提供新思路。
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关键词
高通量测序
番红花
根际土壤
真菌群落
结构与多样性
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职称材料
施用多抗霉素后烟叶叶际微生态变化规律
2
作者
冯瑞超
汪汉成
+4 位作者
邱雪柏
蔡刘体
陆宁
许灵杰
章松柏
《农药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期88-100,共13页
多抗霉素常用于防控烟草叶斑类病害,为探究其施用后烟叶叶际微生态的变化规律,采用Illumina高通量测序技术分析了其施用后不同时期叶际微生物的菌群结构与多样性,利用Biolog-ECO技术解析了叶际微生物代谢功能。结果表明:多抗霉素施用前...
多抗霉素常用于防控烟草叶斑类病害,为探究其施用后烟叶叶际微生态的变化规律,采用Illumina高通量测序技术分析了其施用后不同时期叶际微生物的菌群结构与多样性,利用Biolog-ECO技术解析了叶际微生物代谢功能。结果表明:多抗霉素施用前,健康与感病烟叶叶际真菌均主要分布于子囊菌门(64.20%、94.05%)和担子菌门(6.77%、2.40%);细菌均主要分布于变形菌门(7.16%、38.81%)和厚壁菌门(16.00%、0.78%);健康烟叶叶际真菌和细菌的多样性指数显著高于感病烟叶;健康烟叶叶际微生物代谢活性强于感病烟叶。多抗霉素施用后,感病烟叶中链格孢属、Boeremia、泛菌属、假单胞菌属的相对丰度均先降低后增加,而枝孢霉属、附球菌属、亚隔孢壳属、Symmetrospora、Stagonosporopsis、鞘氨醇单胞属等的相对丰度均先增加后降低;健康烟叶中链格孢属、附球菌属、Symmetrospora、Stagonosporopsis、鞘氨醇单胞属的相对丰度均先增加后降低,而枝孢霉属、Boeremia、泛菌属、假单胞菌属的相对丰度总体均呈下降趋势。感病烟叶叶际真菌和细菌多样性总体呈上升趋势,而健康烟叶的真菌多样性呈上升趋势、细菌多样性呈下降趋势。在代谢功能方面,多抗霉素施用后,感病与健康烟叶叶际微生物对31种碳源代谢均受到不同程度抑制,代谢活性随施药时间延长逐渐恢复。研究结果揭示了多抗霉素施用后烟叶叶际微生物菌群结构和多样性的变化规律,可为杀菌剂防控植物病害的微生态机制的研究提供参考。多抗霉素对健康烟叶菌群结构和微生物代谢的影响均高于感病烟叶,建议该药剂在生产上作为一种预防保护剂施用效果最佳。
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关键词
多抗霉素
烟草赤星病
叶际微生物
群落
结构与多样性
代谢功能
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职称材料
题名
基于高通量测序研究番红花不同生长期根际土壤中真菌群落结构及多样性
被引量：
2
1
作者
邱远金
赵亚琴
张际昭
樊丛照
阿依别克·热合木都拉
王果平
朱军
机构
新疆维吾尔自治区中药民族药研究所/国家中医药管理局新疆中药民族药资源重点研究室
道地药材国家重点实验室
出处
《中国现代中药》
CAS
2023年第3期574-581,共8页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2019D01A82)
中央本级重大增减支项目(2060302)。
文摘
目的:以新疆番红花Crocus sativus L.不同生长期的根际土壤为材料,研究土壤真菌群落结构与多样性。方法:提取番红花不同生长期的根际土壤总DNA,应用Illumina NovaSeq 6000高通量测序平台进行测序分析。结果:对番红花3个生长期[生长初期(S1)、生长中期(S2)、生长后期(S3)]的3组样本进行高通量测序,共获得4252个操作分类单元(OTUs),包含9个真菌门,并对检测到的真菌属中相对丰度前20的真菌属进行了分析。结果发现,不同生长期番红花优势真菌群落共有门属分别是子囊菌门(Ascomycota)、被孢霉门(Mortierellomycota)、链格孢属(Alternaria)、球腔菌属(Mycosphaerella)和爪甲白癣菌属(Arthrographis)。3个生长期的真菌组成有所不同,S1和S2生长期特有的属分别是平脐蠕孢属(Bipolaris)和谷菌根菌属(Archaeorhizomyces),S3有2个特有的属和1个特有的门,分别是棘壳孢属(Setophoma)、枝孢属(Cladosporium)和油壶菌门(Olpidiomycota)。Alpha和Beta多样性分析结果表明,不同生长期番红花根际土壤真菌群落赵氏指数(Chao1)、香农指数(Shannon)和观察到的种类数(Sobs)差异有统计学意义,样本中真菌物种组成存在一定差异。结论:利用高通量测序技术可快速、全面地获得土壤真菌组成信息。番红花不同生长时期根际土壤中真菌群落结构与多样性存在差异,菌群多样性随番红花的生长呈现不断上升的趋势;在番红花不同的生长期尤其是S1土壤样本中均检测到相对丰度较高的有害菌链格孢菌属和被孢霉门。为进一步揭示新疆番红花S1易发生种球腐烂病害,以及根际真菌的多样性与番红花球茎内生真菌、病原菌相互作用机制研究提供新思路。
关键词
高通量测序
番红花
根际土壤
真菌群落
结构与多样性
Keywords
high-throughput sequencing
Crocus sativus L.
rhizosphere soil
fungal community
structure and diversity
分类号
R282 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
施用多抗霉素后烟叶叶际微生态变化规律
2
作者
冯瑞超
汪汉成
邱雪柏
蔡刘体
陆宁
许灵杰
章松柏
机构
贵州省烟草科学研究院
长江大学农学院
中国烟草总公司贵州省公司
出处
《农药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期88-100,共13页
基金
国家自然科学基金(31960550,32160522)
贵州省科技基金项目(黔科合基础-ZK[2021]重点036)
+2 种基金
中国烟草总公司科技项目(110202001035(LS-04),110202101048(LS-08),110202101045(LS-05))
中国烟草总公司贵州省公司(2021XM16)
贵州省“百层次”创新型人才(黔科合平台人才-GCC [2022]028-1)。
文摘
多抗霉素常用于防控烟草叶斑类病害,为探究其施用后烟叶叶际微生态的变化规律,采用Illumina高通量测序技术分析了其施用后不同时期叶际微生物的菌群结构与多样性,利用Biolog-ECO技术解析了叶际微生物代谢功能。结果表明:多抗霉素施用前,健康与感病烟叶叶际真菌均主要分布于子囊菌门(64.20%、94.05%)和担子菌门(6.77%、2.40%);细菌均主要分布于变形菌门(7.16%、38.81%)和厚壁菌门(16.00%、0.78%);健康烟叶叶际真菌和细菌的多样性指数显著高于感病烟叶;健康烟叶叶际微生物代谢活性强于感病烟叶。多抗霉素施用后,感病烟叶中链格孢属、Boeremia、泛菌属、假单胞菌属的相对丰度均先降低后增加,而枝孢霉属、附球菌属、亚隔孢壳属、Symmetrospora、Stagonosporopsis、鞘氨醇单胞属等的相对丰度均先增加后降低;健康烟叶中链格孢属、附球菌属、Symmetrospora、Stagonosporopsis、鞘氨醇单胞属的相对丰度均先增加后降低,而枝孢霉属、Boeremia、泛菌属、假单胞菌属的相对丰度总体均呈下降趋势。感病烟叶叶际真菌和细菌多样性总体呈上升趋势,而健康烟叶的真菌多样性呈上升趋势、细菌多样性呈下降趋势。在代谢功能方面,多抗霉素施用后,感病与健康烟叶叶际微生物对31种碳源代谢均受到不同程度抑制,代谢活性随施药时间延长逐渐恢复。研究结果揭示了多抗霉素施用后烟叶叶际微生物菌群结构和多样性的变化规律,可为杀菌剂防控植物病害的微生态机制的研究提供参考。多抗霉素对健康烟叶菌群结构和微生物代谢的影响均高于感病烟叶,建议该药剂在生产上作为一种预防保护剂施用效果最佳。
关键词
多抗霉素
烟草赤星病
叶际微生物
群落
结构与多样性
代谢功能
Keywords
polyoxin
tobacco brown spot
phyllosphere microorganisms
community structure and diversity
metabolic function
分类号
S482.2 [农业科学—农药学]
X172 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
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被引量
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1
基于高通量测序研究番红花不同生长期根际土壤中真菌群落结构及多样性
邱远金
赵亚琴
张际昭
樊丛照
阿依别克·热合木都拉
王果平
朱军
《中国现代中药》
CAS
2023
2
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职称材料
2
施用多抗霉素后烟叶叶际微生态变化规律
冯瑞超
汪汉成
邱雪柏
蔡刘体
陆宁
许灵杰
章松柏
《农药学学报》
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