文摘以西藏自治区林芝市色季拉山4个采样点手掌参(Gymnadenia conopsea)为材料,利用高通量测序技术对其16S rRNA进行测序,以探索不同环境因子对手掌参内生细菌群落多样性的影响。结果表明,从所有手掌参样品中共获得715920条有效序列,聚类为2365个OTUs,隶属于5门38科62属。优势菌门为变形菌门(Proteobacteria),优势菌属为假单胞菌属(Pseudomonas)、甲基杆菌属(Methylobacterium)和鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)。多样性分析表明所有样品中林海观景台(LH)采样点手掌参茎样品(LHS)内生细菌群落丰富度最高,雷达站(LD)采样点手掌参果荚样品(LDF)内生细菌群落丰富度最低;废弃木材厂(FM)采样点手掌参茎样品(FMS)内生细菌群落多样性最丰富,该采样点手掌参的茎、叶和果荚细菌群落多样性指数均高于其他3个采样点。四种组织样品中,茎、叶和根中内生细菌群落丰富度均高于果荚,果荚中内生细菌群落多样性和丰富度均随海拔升高而降低,雷达站(LD)采样点手掌参果荚样品(LDF)中内生细菌群落丰富度和多样性均最低。不同生境下相同组织内生细菌群落多样性具有显著差异性,相同生境下不同组织内生细菌群落多样性也存在一定差异。主坐标分析(Principal Coordinates Analysis,PCoA)表明内生细菌的群落组成受到环境因素和组织类型的影响,同时冗余分析(redundancy analysis,RDA)和相关性热图均表明全磷(TP)、全钾(TK)、pH和海拔为主要影响因子,与内生细菌群落组成存在显著相关性。PICRSt功能预测分析表明手掌参内生细菌主要富集在新陈代谢(Metabolism)、环境信息处理(Environmental information processing)、遗传信息处理(Genetic information processing)三个一级代谢通路,大多代谢通路随着海拔高度升高呈下降趋势。本研究采用高通量测序技术分析环境因子和组织差异对手掌参内生细菌的多样性和群落结构的影响,旨在丰富和完善野生手掌参内生细菌资源,为今后有益内生细菌的资源开发及手掌参野生资源保护提供参考。
