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口腔鳞状细胞癌预后相关的长链非编码RNA筛选及验证
1
作者 刘絮影 李锦存 +3 位作者 翟堃 胡晨 董文 马坚 《口腔医学研究》 北大核心 2025年第2期109-117,共9页
目的:基于口腔癌在线数据库鉴定与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA,构建ceRNA网络,分析其在OSCC发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(the cancer ge... 目的:基于口腔癌在线数据库鉴定与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA,构建ceRNA网络,分析其在OSCC发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas program,TCGA)和基因表达综合数据库(gene expression omnibus database,GEO)中筛选出TCGA-OSCC、GSE23558和GSE30784数据集,进行表达谱分析,筛选出差异表达lncRNA和mRNA,并进行生存分析、基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,确定其与OSCC预后的相关性。利用starBase、miRTarBase数据库预测关键lncRNA及mRNA的共同靶标miRNA,以此构建竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络。通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)检测这些关键lncRNA在OSCC细胞系和肿瘤组织中表达水平。结果:表达谱分析鉴定出23个差异表达lncRNA,其中有6个lncRNA与OSCC患者预后相关;mRNA的表达分析鉴定出282个差异表达mRNA,主要富集在三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)酶激活剂活性、核苷酸结合寡聚化域(nucletide-binding oligomerization domain,NOD)样受体等信号通路,其中10个差异表达的mRNA与OSCC预后相关。ceRNA网络构建了包括6个lncRNA、10个mRNA和靶向预测的26个miRNA分子网络。qRT-PCR结果显示包含LINC01980在内的5个lncRNA在OSCC细胞中高表达,而MIR99AHG低表达。在OSCC组织中,LINC01980表达水平明显升高,而MIR99AHG表达水平降低。结论:本研究筛选的LINC01980和MIR99AHG与OSCC进展和预后相关,可作为OSCC的生物学标志物进一步探讨。 展开更多
关键词 口腔鳞状细胞癌 长链非编码RNA 预后 LINC01980 MIR99AHG
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长链非编码RNA在继发性脊髓损伤中的作用及中医药干预的研究进展
2
作者 许多芳 张彦军 +3 位作者 郭铁峰 李家明 江朔轩 刘晏东 《西部中医药》 2025年第1期99-105,共7页
从长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)与脊髓损伤发生发展的相关性、lncRNA与脊髓损伤治疗的相关性及中医药对脊髓损伤-lncRNA的干预等方面阐述了lncRNA与脊髓损伤相关性及中药干预机制的研究进展,指出lncRNA在脊髓损伤中存在差... 从长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)与脊髓损伤发生发展的相关性、lncRNA与脊髓损伤治疗的相关性及中医药对脊髓损伤-lncRNA的干预等方面阐述了lncRNA与脊髓损伤相关性及中药干预机制的研究进展,指出lncRNA在脊髓损伤中存在差异性表达并在脊髓损伤的发展及治疗过程中有着重要的作用,可以通过调控lncRNA在脊髓损伤过程中的表达,为脊髓损伤找到潜在的治疗靶点,以期为脊髓损伤的防治提供新的参考方向。 展开更多
关键词 脊髓损伤 长链非编码RNA 中医药 研究进展
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大白菜长链非编码RNA研究进展
3
作者 王瑞华 韩敏 李媛媛 《广东农业科学》 2025年第1期124-134,共11页
长链非编码RNA(lncRNAs)是一种长度至少为200个核苷酸且缺乏显著编码能力的功能性非编码RNA分子,在植物的生长发育和胁迫应对过程中发挥重要调控作用。大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis)属于芸薹属蔬菜作物,是我国种植面积最大的... 长链非编码RNA(lncRNAs)是一种长度至少为200个核苷酸且缺乏显著编码能力的功能性非编码RNA分子,在植物的生长发育和胁迫应对过程中发挥重要调控作用。大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis)属于芸薹属蔬菜作物,是我国种植面积最大的蔬菜作物之一。大白菜杂交种具有明显的杂种优势,杂合状态下基因表达调控网络发生改变,激发新的调控机制,使得基因表达水平发生波动,引起各种生理生化反应的变化,进而导致性状改变、形成优势表型。lncRNAs作为非编码调控RNA,可以通过顺式作用和反式作用直接调控基因表达,或作为miRNAs前体或者靶标间接调控基因表达,导致基因差异性表达。因此,lncRNAs可能在大白菜杂种优势的形成中起重要调控作用。随着高通量测序技术的不断发展和芸薹属作物相关参考基因组数据的发表,大白菜lncRNAs的种类、数量和功能被不断探索。研究发现,大白菜中存在5种类型的lncRNAs:基因间、内含子、正义、反义和双向lncRNAs,其中基因间lncRNAs的数量最多。lncRNAs可调控大白菜的春化和花粉发育过程,还可调控大白菜应对生物和非生物胁迫,如霜霉病菌、尖孢镰刀菌和高温等。该文总结了植物lncRNAs的来源、分类和调控蛋白质编码基因表达的方式,以及大白菜中鉴定到的lncRNAs种类、数量及其生物学功能,为研究lncRNAs在大白菜的生长发育和遗传调控中的生物学功能提供重要参考。 展开更多
关键词 大白菜 长链非编码RNA 基因表达调控 分子机制 生物学功能 杂种优势
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长链非编码RNA核富集转录本1在口腔颌面疾病中的研究进展
4
作者 百亥提亚·吐尔洪 多力昆·吾甫尔 《中国医药科学》 2025年第3期40-43,共4页
核富集转录本1(NEAT1)属于长链非编码RNA(LncRNA)。LncRNA在真核细胞中扮演着多重角色,并在哺乳动物细胞中表达广泛。LncRNA NEAT1可以通过参与核旁斑的形成、调节信号通路等多种方式来调节基因的表达。因此,它在炎症反应、免疫反应、... 核富集转录本1(NEAT1)属于长链非编码RNA(LncRNA)。LncRNA在真核细胞中扮演着多重角色,并在哺乳动物细胞中表达广泛。LncRNA NEAT1可以通过参与核旁斑的形成、调节信号通路等多种方式来调节基因的表达。因此,它在炎症反应、免疫反应、细胞的增殖和分化等生理和病理过程中起到关键作用,并与多种疾病的发生和发展有着紧密的联系。本文对LncRNA NEAT1的基本情况、其在口腔颌面疾病中的功能机制以及最新的研究进展进行全面的综述。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 核富集转录本1 口腔颌面部疾病 非综合征型唇腭裂
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长链非编码核糖核酸与冠心病的研究进展——从发病机制到诊断与治疗 被引量：6
5
作者 杨环莞 刘昱圻 陈韵岱 《中华老年多器官疾病杂志》 2021年第4期313-316,共4页
心血管疾病患病率高,死亡率亦居高不下,是目前世界范围内重大的公共卫生问题之一,其中冠心病心肌梗死仍是导致死亡的主要原因之一。随着微阵列及高通量测序技术的飞速发展,长链非编码核糖核酸(lncRNA)在心血管疾病发生发展中的作用被逐... 心血管疾病患病率高,死亡率亦居高不下,是目前世界范围内重大的公共卫生问题之一,其中冠心病心肌梗死仍是导致死亡的主要原因之一。随着微阵列及高通量测序技术的飞速发展,长链非编码核糖核酸(lncRNA)在心血管疾病发生发展中的作用被逐渐揭示。lncRNA通过表观遗传等作用形式在转录及转录后水平对基因表达进行调控。已有大量研究表明,lncRNA在动脉粥样硬化、急性心肌梗死等疾病中发挥重要调节作用。本文将对lncRNA的生物学作用模式,及其在冠心病发病、诊断及治疗等领域的研究进展做一综述。 展开更多
关键词 长链非编码核糖核酸 冠心病 发病机制 诊断 治疗
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长链非编码RNA在骨髓间充质干细胞成骨分化中的作用机制
6
作者 兰志杰 郭浩然 +2 位作者 柯义兵 秦庆庆 王勇平 《山东医药》 CAS 2024年第30期93-97,共5页
骨髓间充质干细胞(bone marrow-derived mesenchymal stem cell,BMSC)是一种具有多向分化潜能的细胞,其成骨分化是关系机体骨形成、维持骨代谢正常的重要环节。BMSC活力和成骨分化活性的下降是导致骨质疏松的重要原因。长链非编码RNA(lo... 骨髓间充质干细胞(bone marrow-derived mesenchymal stem cell,BMSC)是一种具有多向分化潜能的细胞,其成骨分化是关系机体骨形成、维持骨代谢正常的重要环节。BMSC活力和成骨分化活性的下降是导致骨质疏松的重要原因。长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)在BMSC成骨分化中起着重要作用。长链非编码核糖核酸(lncRNA)可能通过调控成骨分化特异性转录因子、Wnt/β-catenin信号通路、BMP/SMAD信号通路及转录调控因子,参与调控BMSC的成骨分化。LncRNA HOTTIP、LncRNA HAGLR及LncRNA Malat1等可通过激活Wnt/β-catenin信号通路,促进BMSC的成骨分化;LncRNA FGD5-AS1、LncRNA SNHG5及LncRNA MEG3等能通过抑制BMP/SMAD信号通路,调控Runx2、Osx等基因表达,促进BMSC的分化;LncRNA KCNQ1OT1、LncRNA SNHG14及LncRNA HIF1A-AS2等可通过与其他转录调控因子或染色质修饰酶相互作用,促进BMSC的分化。LncRNA HHAS1、LncRNA HOTAIR及LncRNA HOTAIRM1能调控成骨分化特异性转录因子,促进BMSC的成骨分化;LncRNA DNACR、LncRNA XIST能通过调控miRNA或直接作用于成骨分化相关基因,通过Wnt/β-catenin信号通路抑制BMSC成骨分化;LncRNA GAS5、LncRNA SNHG3及LncRNA CWF19L1等可通过抑制BMP/SMAD信号通路,抑制BMSC的成骨分化;LncRNA MIAT、LncRNA PCBP1-AS1等可通过直接或间接的抑制成骨特异性转录因子RUNX2和Osx的表达也能抑制BMSC成骨分化。 展开更多
关键词 长链非编码核糖核酸 骨髓间充质干细胞 成骨分化 骨质疏松症
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长链非编码RNA AFAP1-AS1靶向miR-195-5p对肝癌细胞生物学行为的影响
7
作者 李俊徽 叶尔麦克·阿哈提 顾朋 《山东医药》 CAS 2024年第19期40-44,共5页
目的探讨长链非编码核糖核酸(lncRNA)AFAP1-AS1及微小核糖核酸-195-5p(miR-195-5p)对肝细胞癌(HCC)细胞生物学行为的影响。方法常规培养人HCC细胞系(HepG2、Hep3B、SMMC-7721、Bel7402、SK-hep1细胞)和正常人肝细胞(HL-7702细胞),用实... 目的探讨长链非编码核糖核酸(lncRNA)AFAP1-AS1及微小核糖核酸-195-5p(miR-195-5p)对肝细胞癌(HCC)细胞生物学行为的影响。方法常规培养人HCC细胞系(HepG2、Hep3B、SMMC-7721、Bel7402、SK-hep1细胞)和正常人肝细胞(HL-7702细胞),用实时荧光定量PCR法检测AFAP1-AS1、miR-195-5p并筛选实验细胞。将对数生长期实验细胞随机分为si-AFAP1-AS1组、si-NC组,miR-195-5pmimics组、mimics-NC组,miR-195-5pinhibitor+si-NC组、miR-195-5p inhibitor+si-AFAP1-AS1组、inhibitor-NC+si-AFAP1-AS1组、inhibitor-NC+si-NC组,用Lipofectamine 2000试剂将相应质粒按照分组转染入细胞。用CCK-8实验、菌落形成实验检测细胞增殖能力,用流式细胞术检测细胞凋亡及细胞周期,用Transwell实验检测细胞迁移及侵袭能力,用双荧光素酶报告基因实验验证AFAP1-AS1与miR-195-5p的靶向关系。结果HCC细胞中AFAP1-AS1表达高于正常人肝细胞(P均<0.05),HCC细胞中miR-195-5p表达低于正常人肝细胞(P均<0.05)。由于SK-hep1细胞中AFAP1-AS1表达最高、miR-195-5p表达最低,因此,后续研究均采用SK-hep1细胞进行实验。与si-NC组比较,si-AFAP1-AS1组中AFAP1-AS1表达低、细胞增殖能力低、迁移和侵袭细胞少、G0/G1期细胞比例高、细胞凋亡率高(P均<0.05)。通过Starbase v3.0在线数据库预测发现,AFAP1-AS1与miR-195-5p有互补的结合位点。双荧光素酶报告基因实验结果显示,miR-NC组、miR-195-5p组共转染WT-AFAP1-AS1后相对荧光素酶活性比较差异有统计学意义(P<0.05),共转染MUT-AFAP1-AS1后相对荧光素酶活性比较差异无统计学意义(P>0.05)。与inhibitor-NC+si-NC组比较,si-NC+miR-195-5p inhibitor组细胞增殖能力高、迁移和侵袭细胞多、G_(0)/G_(1)期细胞比例低、细胞凋亡率低(P均<0.05),而si-AFAP1-AS1+miR-195-5p inhibitor组上述细胞生物学行为则相反。结论lncRNA AFAP1-AS1可能通过竞争性结合miR-195-5p参与调控HCC细胞增殖、迁移、侵袭、凋亡等生物学行为。 展开更多
关键词 肝细胞癌 非长链编码核糖核酸 肌动蛋白丝相关蛋白1-反义核糖核酸1 微小核糖核酸-195-5p 细胞生物学行为
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长链非编码RNA MSTRG.14200对猪骨骼肌卫星细胞分化及肌纤维转化的影响 被引量：1
8
作者 杨玉铭 赵鑫铭 +6 位作者 谭宝华 肖丽窈 芦格言 翟立君 黄奕扬 洪林君 顾婷 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期453-461,共9页
[目的]探究长链非编码RNA(lncRNA)MSTRG.14200对猪骨骼肌卫星细胞(PSCs)成肌分化及不同类型肌纤维转化的影响。[方法]选择3头6月龄杜洛克猪,屠宰后采集心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、背最长肌、腿肌、比目鱼肌和趾长伸肌组织,利用... [目的]探究长链非编码RNA(lncRNA)MSTRG.14200对猪骨骼肌卫星细胞(PSCs)成肌分化及不同类型肌纤维转化的影响。[方法]选择3头6月龄杜洛克猪,屠宰后采集心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、背最长肌、腿肌、比目鱼肌和趾长伸肌组织,利用实时荧光定量PCR检测MSTRG.14200在不同组织中的表达情况。构建MSTRG.14200过表达载体pcDNA3.1-14200并转染PSCs细胞,诱导分化3 d后收集细胞。通过实时荧光定量PCR和Western blotting分别检测肌球蛋白重链(MyHC)、肌细胞生成素(MyoG)和肌分化因子(MyoD)、MyHCⅠ、MyHCⅡa、MyHCⅡb和MyHCⅡx mRNA和蛋白表达情况;利用免疫荧光法检测MyHC、MyHCⅠ和MyHCⅡb阳性细胞比率。[结果]MSTRG.14200在杜洛克猪不同组织中均有表达,且在背最长肌中表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01),在趾长伸肌和比目鱼肌中的表达量存在显著差异(P<0.05)。过表达MSTRG.14200后,细胞分化相关基因MyoD和MyHC的mRNA水平极显著升高(P<0.01),MyoD、MyoG和MyHC蛋白水平显著或极显著升高(P<0.05;P<0.01),MyHC阳性细胞比率极显著升高(P<0.01);肌纤维类型转化相关基因MyHCⅠ的mRNA和蛋白表达量及阳性细胞比例率均显著或极显著降低(P<0.05;P<0.01),MyHCⅡb基因mRNA和蛋白表达量以及阳性细胞比率均显著升高(P<0.05)。[结论]MSTRG.14200具有促进猪骨骼肌成肌分化以及促进慢肌纤维向快肌纤维转化的作用。研究结果为探究猪骨骼肌纤维类型转化的分子机制提供理论基础。 展开更多
关键词 猪 长链非编码RNA(lncRNA) MSTRG.14200 成肌分化 肌纤维转化
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长链非编码RNA RNF157-AS1对肺腺癌细胞恶性生物学行为的影响
9
作者 姚羽 林敏杰 +1 位作者 金文芳 吕艳玲 《医学研究与战创伤救治》 CAS 北大核心 2024年第9期904-908,共5页
目的通过细胞实验探究长链非编码RNA RNF157-AS1对肺腺癌细胞恶性生物学行为的影响。方法利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测RNF157-AS1在肺腺癌细胞株(H1299、A549、PC9和Calu3)和正常肺上皮细胞(HBE)中的表达;构建小干扰RNA转染至肺腺... 目的通过细胞实验探究长链非编码RNA RNF157-AS1对肺腺癌细胞恶性生物学行为的影响。方法利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测RNF157-AS1在肺腺癌细胞株(H1299、A549、PC9和Calu3)和正常肺上皮细胞(HBE)中的表达;构建小干扰RNA转染至肺腺癌细胞中敲降RNF157-AS1的表达,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证干扰效率;在筛选的两种肺腺癌细胞株中成功干扰RNF157-AS1后,分为对照组(NC组)及实验组(si1组,si2组),分别利用CCK8实验、Transwell迁移实验和Matrigel侵袭实验探究RNF157-AS1对肺腺癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。结果相较于HBE,RNF157-AS1在4种肺腺癌细胞株中的表达显著上调(均P<0.01),将其中表达量最高H1299和PC9细胞株为后续试验细胞株;经qRT-PCR证实,2种小干扰RNA均能有效敲降RNF157-AS1的表达,干扰效率在70%以上(均P<0.01);CCK8实验表明,与对照组相比,干扰RNF157-AS1的表达后,细胞的增殖能力明显下降(均P<0.01);Transwell实验表明,与对照组相比,干扰RNF157-AS1的表达后,细胞的迁移能力明显下降(P<0.01);Matrigel实验表明,与对照组相比,干扰RNF157-AS1后,细胞的侵袭能力明显下降(均P<0.01)。结论RNF157-AS1在肺腺癌细胞中高表达,并且影响肺腺癌细胞的增殖、迁移、侵袭能力。 展开更多
关键词 肺腺癌 长链非编码RNA RNF157-AS1 迁移 侵袭
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长链非编码RNA MALAT1对槟榔碱诱导的颊黏膜成纤维细胞活化能力影响的研究
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作者 李熠洁 邵溢朵 +3 位作者 蔡芸舟 吴光栋 孙天翱 王月红 《口腔医学研究》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期622-628,共7页
目的:本研究旨在明确长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA) MALAT1对槟榔碱诱导的颊黏膜成纤维细胞(buccal mucosal fibroblasts, BMFs)活化能力影响的作用,为寻找新的口腔黏膜下纤维化(oral submucous fibrosis, OSF)治疗途径提... 目的:本研究旨在明确长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA) MALAT1对槟榔碱诱导的颊黏膜成纤维细胞(buccal mucosal fibroblasts, BMFs)活化能力影响的作用,为寻找新的口腔黏膜下纤维化(oral submucous fibrosis, OSF)治疗途径提供理论基础。方法:体外培养BMFs,采用不同浓度槟榔碱刺激BMFs,在细胞水平上构建OSF疾病模型。采用细胞计数试剂盒(cell counting kit-8,CCK-8)法检测细胞活力;Transwell法和胶原凝胶收缩法检测BMFs活化;实时荧光定量聚合酶链反应(quantitative real-time PCR, qRT-PCR)检测BMFs中平滑肌肌动蛋白-α(α-smooth muscle actin, α-SMA)和lncRNA MALAT1的表达情况;siRNA-MALAT1瞬时转染到BMFs中,评估槟榔碱刺激下BMFs迁移和收缩能力的变化。结果:10μg/mL槟榔碱是体外构建OSF疾病模型的最佳浓度,此时细胞内α-SMA和lncRNA MALAT1表达升高。Transwell实验和胶原凝胶收缩实验提示敲低lncRNA MALAT能抑制槟榔碱诱导的BMFs收缩和迁移。结论:lncRNA MALAT1对槟榔碱诱导的BMFs激活,细胞收缩和迁移有重要作用。 展开更多
关键词 长链非编码RNA MALAT1 口腔黏膜下纤维化 槟榔碱 成纤维细胞
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长链非编码RNA在食管鳞状细胞癌中调控转录、翻译及翻译后修饰的相关机制研究进展
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作者 宗煜煜 陈琳徽 +1 位作者 罗鹏飞 江拥军 《消化肿瘤杂志（电子版）》 2024年第2期238-243,共6页
食管癌是一种常见的消化道恶性肿瘤,发病率和死亡率均较高,且整体预后较差。食管癌病理类型主要有鳞状细胞癌和腺癌两种,西方国家以腺癌为主,我国与其相反,主要为食管鳞状细胞癌。由于早期症状不典型以及缺乏特异的肿瘤标志物,许多患者... 食管癌是一种常见的消化道恶性肿瘤,发病率和死亡率均较高,且整体预后较差。食管癌病理类型主要有鳞状细胞癌和腺癌两种,西方国家以腺癌为主,我国与其相反,主要为食管鳞状细胞癌。由于早期症状不典型以及缺乏特异的肿瘤标志物,许多患者在中晚期才确诊,治疗效果欠佳,导致5年生存率仍非常低。长链非编码RNA(longnon-coding RNA,LncRNA)与食管癌的发生发展密不可分,当务之急是需要深入探索LncRNA在食管癌中的作用,开发出更多的治疗靶点以提高其5年生存率。基于此,本文着重阐述了LncRNA在食管鳞状细胞癌中的作用机制,明确其如何调节食管鳞状细胞癌的发生发展,探讨它作为诊断和预后生物标志物的潜在临床价值,为临床治疗提供思路。 展开更多
关键词 食管鳞状细胞癌 长链非编码RNA 转录 翻译 生物标志物 作用机制
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长链非编码RNA小核仁核糖核酸宿主基因11在肿瘤中的研究进展
12
作者 张钧硕 万明会 +1 位作者 郭燕 仓顺东 《河南医学研究》 CAS 2022年第4期759-764,共6页
长链非编码RNA(lncRNA)是真核细胞中一种转录本超过200个核苷酸的RNA分子,几乎不具备编码蛋白质的能力,但可以调节其他基因的表达从而参与多种肿瘤的发生和发展。lncRNA小核仁核糖核酸宿主基因11(SNHG11)是一种近年来备受关注的lncRNA... 长链非编码RNA(lncRNA)是真核细胞中一种转录本超过200个核苷酸的RNA分子,几乎不具备编码蛋白质的能力,但可以调节其他基因的表达从而参与多种肿瘤的发生和发展。lncRNA小核仁核糖核酸宿主基因11(SNHG11)是一种近年来备受关注的lncRNA。随着研究的深入,已经报道并证实了lncRNASNHG11在多种恶性肿瘤中异常表达,包括消化系统肿瘤、呼吸系统肿瘤、神经系统肿瘤、泌尿系统肿瘤、生殖系统肿瘤,并在这些肿瘤中起着至关重要的作用。本文结合国内外最新报道,就lncRNASNHG11在肿瘤中的影响及其潜在机制进行简要综述。 展开更多
关键词 小核仁核糖核酸宿主基因11 长链非编码RNA 肿瘤 研究进展
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长链非编码RNA母源表达基因3减轻去卵巢大鼠心肌缺血再灌注损伤的作用及机制
13
作者 张海洋 冯静茹 +3 位作者 史贺 王紫监 程光慧 毕胜利 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2024年第12期1483-1488,共6页
目的研究长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)母源表达基因3(maternally expressed gene 3,MEG3)通过吸附微小RNA-21(microRNA-21,miR-21)减轻卵巢切除术(ovariectomy,OVX)大鼠心肌缺血再灌注(ischemia reperfusion,IR)损伤的作... 目的研究长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)母源表达基因3(maternally expressed gene 3,MEG3)通过吸附微小RNA-21(microRNA-21,miR-21)减轻卵巢切除术(ovariectomy,OVX)大鼠心肌缺血再灌注(ischemia reperfusion,IR)损伤的作用及机制。方法选择雌性SD大鼠108只,其中48只随机分为假手术组、OVX组、IR组、联合1组(OVX+IR),每组12只;其余60只OVX及心肌IR造模前尾静脉注射阴性对照、lncRNA MEG3、miR-21腺相关病毒,根据造模及腺相关病毒注射情况分为阴性假手术组、阴性模型组、lncRNA MEG3组、miR-21组、联合2组(lncRNA MEG3+miR-21),每组12只。检测心肌梗死面积、左心室射血分数(left ventricular ejection fraction,LVEF)、左心室短轴缩短率(left ventricular fractional shortening,LVFS)、血清乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)、肌酸激酶(creatine kinase,CK)、肌酸激酶同工酶(creatine kinase isoenzyme,CK-MB)、心肌细胞凋亡率及裂解型半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(cysteinyl aspartate specific proteinase-3,Caspase-3)表达。培养心肌H9c2细胞,采用双荧光素酶报告基因实验检测lncRNA MEG3靶向miR-21。结果与假手术组比较,OVX组、IR组和联合1组心肌lncRNA MEG3表达明显降低,miR-21表达明显升高(P<0.05);与OVX组及IR组比较,联合1组lncRNA MEG3表达明显降低,miR-21表达明显升高,差异有统计学意义(P<0.05)。与阴性模型组比较,lncRNA MEG3组心肌梗死面积、血清LDH、CK、CK-MB、心肌细胞凋亡率、裂解型Caspase-3表达明显降低,LVFS、LVEF明显升高(P<0.05);与lncRNA MEG3组比较,联合2组心肌梗死面积、血清LDH、CK、CK-MB、心肌凋亡率、裂解型Caspase-3表达明显升高,LVFS、LVEF明显降低[(43.58±3.32)%vs(50.37±4.29)%,(57.12±4.28)%vs(68.47±5.61)%,P<0.05]。结论过表达lncRNA MEG3通过吸附miR-21减轻OVX大鼠心肌IR损伤。 展开更多
关键词 心肌再灌注损伤 卵巢切除术 RNA 长链非编码 微小RNA-21
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胃癌组蛋白H3第4位赖氨酸的三甲基化修饰相关长链非编码RNA预后模型的构建与验证
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作者 胡震 祁玉忠 +3 位作者 赵绍基 王光熙 孙开宇 吴文辉 《消化肿瘤杂志（电子版）》 2024年第2期183-193,共11页
目的 探索胃癌组蛋白H3第4位赖氨酸的三甲基化(trimethylation of lysine 4 on histone H3,H3K4me3)修饰相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)特征,构建相关预后模型并预测胃癌免疫治疗疗效。方法 从癌症基因组图谱数据库下... 目的 探索胃癌组蛋白H3第4位赖氨酸的三甲基化(trimethylation of lysine 4 on histone H3,H3K4me3)修饰相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)特征,构建相关预后模型并预测胃癌免疫治疗疗效。方法 从癌症基因组图谱数据库下载胃癌相关转录组测序数据和对应的患者临床资料,通过构建H3K4me3相关调节因子基因与LncRNA的共表达网络识别H3K4me3修饰相关LncRNA,并将癌症基因组图谱数据库中370例符合筛选标准的胃癌患者样本(整体组)按1:1随机抽样划分为训练组(n=185)和验证组(n=185)。随后基于单因素Cox回归、Lasoo回归分析构建H3K4me3相关LncRNA预后风险评分模型并进行内部验证。Kaplan-Meier生存分析和受试者操作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC曲线)被用于验证模型的预测性能。通过单因素和多因素Cox回归分析评估风险评分等临床指标的预后预测价值。结合风险评分、年龄和肿瘤TNM分期构建预测胃癌患者总生存率的列线图模型,ROC曲线与校准图被用于评估列线图的预测准确性。借助共识聚类识别异质性聚类亚群并进行免疫治疗疗效预测。结果 基于共表达网络关系识别了14个具有预后价值的H3K4me3相关LncRNA并构建了相关风险模型及评价体系。根据训练组预后风险评分模型获得的中位风险评分将训练组、验证组和整体组胃癌患者划分为高、低风险,Kaplan-Meier生存曲线显示低风险患者的总体生存情况要优于高风险患者(P<0.05)。此外,该模型在训练组中预测胃癌患者1、3、5年总生存率的曲线下面积(area under curve,AUC)分别为0.708、0.730、0.770,在验证组中分别为0.690、0.648、0.713,而在整体组中分别为0.697、0.670、0.724。多因素Cox回归分析显示基于H3K4me3相关LncRNA构建的风险评分模型是预测胃癌患者预后的独立因素(P<0.001)。构建的列线图预测胃癌患者1、2、3年总生存率的AUC分别为0.727、0.780、0.717,且其校准曲线与理想曲线相接近。基于共识聚类算法进一步识别了2种具有异质性免疫特征的H3K4me3-LncRNA亚群,其中亚组Ⅱ具有更高的免疫细胞浸润水平和更强的免疫应答潜力,并对5-氟尿嘧啶、奥沙利铂等显示出更高的药物敏感性,而亚组Ⅰ则可能对磷脂酰肌醇3-激酶特异性抑制剂具有更高的敏感性。结论 本研究构建了一个H3K4me3-LncRNA风险评分模型以预测胃癌患者的预后,并揭示了其异质性微观特征及在预测免疫治疗疗效方面的潜在价值。 展开更多
关键词 胃癌 组蛋白H3第4位赖氨酸的三甲基化修饰 组蛋白修饰 长链非编码RNA 免疫治疗
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应用微阵列技术分析五子衍宗丸干预少弱精症小鼠睾丸组织的长链非编码RNA表达 被引量：1
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作者 邹迪新 鹿伟 +7 位作者 孟雪丹 张钟秀 王汉 段宇 代一航 路广琦 张岳阳 林瑞超 《环球中医药》 CAS 2024年第10期1937-1947,共11页
目的研究五子衍宗丸干预少弱精症相关的睾丸长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA),初步探讨该方调控lncRNA在其干预少弱精症中的潜在作用机制。方法采用白消安法建立少弱精症动物模型,使用五子衍宗丸干预14天后,应用小动物精子自... 目的研究五子衍宗丸干预少弱精症相关的睾丸长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA),初步探讨该方调控lncRNA在其干预少弱精症中的潜在作用机制。方法采用白消安法建立少弱精症动物模型,使用五子衍宗丸干预14天后,应用小动物精子自动检测仪测定附睾精子数量和活力及与雌鼠交配受孕率评估生育力。分别抽提正常组、模型组、药物组各6例睾丸组织的RNA,应用转录组测序技术分析并筛选五子衍宗丸调控的差异表达lncRNA,实时荧光定量(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术对差异表达lncRNA数据验证。通过生物信息学对获得的药物调控lncRNA结合前期报道该方调控mRNAs的实测值,进行关联分析,建立该方调控lncRNA靶向mRNAs的共表达网络,筛选网络lncRNA靶向的核心mRNAs,对核心mRNAs进行KEGG信号通路分析,构建该方调控lncRNA靶向信号通路网络,分析五子衍宗丸调控lncRNA干预少弱精症的信号通路。结果五子衍宗丸可显著提高少弱精症精子质量、雌鼠受孕率,并明显调控296条睾丸lncRNA,其中上调215条,下调81条,qRT-PCR验证lncRNA测序结果可靠。通过lncRNA-mRNAs的关联分析筛选到药物调控的核心lncRNA(102条)和mRNAs(81条),该方调控lncRNA靶向信号通路网络显示,在102条lncRNA中,有80条lncRNA靶向2条及以上信号通路,信号通路中有40条对应2条及以上lncRNA,这些lncRNA靶向的信号通路涉及到睾丸细胞的生长、分化、代谢、凋亡、信号传导等整个细胞周期过程,并且主要富集在范科尼贫血通路、细胞周期、剪接体、叉头状转录因子通路、p53通路、同源重组等通路上。结论本研究提供了五子衍宗丸干预少弱精症的睾丸lncRNA表达谱,这些lncRNA参与了药物修复睾丸生精损伤,提示其可能在药效中起到了重要作用,是五子衍宗丸潜在的干预靶点。 展开更多
关键词 五子衍宗丸 长链非编码RNA 少弱精症 精子发生
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长链非编码RNA在炎症性肠病中的作用机制和临床应用研究进展 被引量：1
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作者 李雨 王颖逸 +4 位作者 张怡 苏婷 李萍 赵薇 杨旭丽 《山西医科大学学报》 CAS 2024年第8期1072-1081,共10页
炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)是一组病因尚不明确的肠道疾病,临床表现主要为腹痛、腹泻、黏液脓血便、腹部包块等,主要包括溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)和克罗恩病(Crohn disease,CD)两种类型,其发病机制与环境... 炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)是一组病因尚不明确的肠道疾病,临床表现主要为腹痛、腹泻、黏液脓血便、腹部包块等,主要包括溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)和克罗恩病(Crohn disease,CD)两种类型,其发病机制与环境因素、遗传因素、肠道微生态失衡、免疫失衡等因素有关[1]。中国疾病预防控制中心的数据显示,从2005-2014年间,我国的IBD患者总数约为35万,到2025年预计达到150万,其发病率呈逐年上升的趋势[2]。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 炎症性肠病 肠道黏膜屏障 线粒体氧化应激 肠道微生态平衡 溃疡性结肠炎 克罗恩病
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姜黄素调控长链非编码RNA AK125910的表达介导肝癌细胞凋亡 被引量：12
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作者 过忆 周留勇 +1 位作者 尤建良 薛博瑜 《南京中医药大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期254-257,301,共4页
目的 检测姜黄素诱导肝癌细胞凋亡中lncRNA表达谱的改变及关键lncRNA的筛选鉴定。方法 使用不同浓度姜黄素刺激肝癌细胞株HepG2不同时间后,提取总RNA进行lncRNA芯片杂交检测lncRNA表达谱的改变,筛选出差异表达lncRNA;并利用MTT法和TUNE... 目的 检测姜黄素诱导肝癌细胞凋亡中lncRNA表达谱的改变及关键lncRNA的筛选鉴定。方法 使用不同浓度姜黄素刺激肝癌细胞株HepG2不同时间后,提取总RNA进行lncRNA芯片杂交检测lncRNA表达谱的改变,筛选出差异表达lncRNA;并利用MTT法和TUNEL染色观察HepG2细胞的凋亡,Real-time PCR验证差异表达的lncRNA AK125910在其中的作用。结果 与对照组细胞相比,姜黄素处理后的肝癌细胞中有5 432条lncRNA表达出现改变,而其中变化倍数大于3的lncRNA有8条,表达差异化最显著的是lncRNA AK058003,上调7.62倍。在姜黄素诱导肝癌细胞凋亡中,lncRNA AK125910表达上调7.16倍,与芯片杂交结果基本一致。结论 姜黄素诱导肝癌细胞凋亡过程中lncRNA表达谱出现显著变化,其中差异性表达最显著的lncRNA AK125910可能参与了肝癌细胞的凋亡进程。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 姜黄素 AK125910 肝癌细胞 凋亡
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长链非编码RNA-N1LR在脑缺血再灌注血脑屏障损伤的作用机制研究 被引量：1
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作者 胡云 周礼鑫 +2 位作者 童理 李鑫泰 杨剑文 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2024年第2期217-220,共4页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)-N1LR在脑缺血再灌注损伤后血脑屏障的作用机制。方法原代小鼠脑微血管内皮细胞常规培养,经氧糖剥夺/复糖复氧(OGD/R)处理模拟脑缺血再灌注损伤,实验分对照组、OGD组、lncRNA-N1LR过表达组(OGD处理后转染... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)-N1LR在脑缺血再灌注损伤后血脑屏障的作用机制。方法原代小鼠脑微血管内皮细胞常规培养,经氧糖剥夺/复糖复氧(OGD/R)处理模拟脑缺血再灌注损伤,实验分对照组、OGD组、lncRNA-N1LR过表达组(OGD处理后转染质粒lncRNA-N1LR过表达)、lncRNA-N1LR沉默组(OGD处理后转染质粒lncRNA-N1LR沉默)。采用逆转录聚合酶链反应检测各组中lncRNA-N1LR mRNA、紧密连接蛋白5(claudin-5)及闭合蛋白(occludin)mRNA表达水平;异硫氰酸荧光素-葡聚糖(FITC-dextran)渗透法检测血脑屏障通透性;免疫蛋白印迹法检测claudin-5、occludin蛋白表达。结果与对照组比较,OGD组lncRNA-N1LR mRNA、occludin、claudin-5 mRNA表达水平下降(0.31±0.01 vs 1.00±0.10,0.42±0.03 vs 1.01±0.13,0.38±0.03 vs 1.00±0.15,P<0.05),血脑屏障FITC-dextran通透性明显升高(58.79±3.04 vs 8.87±0.63,P<0.01)。与OGD组比较,lncRNA-N1LR过表达组lncRNA-N1LR mRNA、occludin、claudin-5 mRNA表达水平升高(0.67±0.07 vs 0.31±0.01,0.92±0.02 vs 0.42±0.03,0.70±0.08 vs 0.38±0.03,P<0.05),血脑屏障FITC-dextran通透性降低(41.57±2.43 vs 58.79±3.04,P<0.05)。与OGD组比较,lncRNA-N1LR沉默组lncRNA-N1LR mRNA、occludin、claudin-5 mRNA表达水平降低(0.21±0.02 vs 0.31±0.01,0.31±0.03 vs 0.42±0.03,0.22±0.02 vs 0.38±0.03,P<0.05),血脑屏障FITC-dextran通透性升高(72.34±1.43 vs 58.79±3.04,P<0.05)。结论LncRNA-N1LR上调可能通过降低血脑屏障通透性发挥神经保护作用。 展开更多
关键词 RNA 未翻译 再灌注损伤 血脑屏障 神经保护 MICE 模型 动物 长链非编码RNA-N1LR
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长链非编码RNA CCAT2对肝癌细胞增殖和侵袭迁移能力的影响及其机制探讨 被引量：5
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作者 纪易斐 刘金霞 +4 位作者 江枫 刘肇修 管程齐 肖明兵 倪润洲 《山东医药》 CAS 北大核心 2017年第34期1-4,共4页
目的观察长链非编码RNA CCAT2(lncRNA CCAT2)对肝细胞癌(HCC)细胞增殖和侵袭迁移能力的影响,并探讨其机制。方法将对数生长期的HCC细胞Hep G2随机分为A、B、C组,采用Lipofectamine3000分别瞬时转染对照质粒、小干扰RNA质粒(si-CCAT2)... 目的观察长链非编码RNA CCAT2(lncRNA CCAT2)对肝细胞癌(HCC)细胞增殖和侵袭迁移能力的影响,并探讨其机制。方法将对数生长期的HCC细胞Hep G2随机分为A、B、C组,采用Lipofectamine3000分别瞬时转染对照质粒、小干扰RNA质粒(si-CCAT2)、si-CCAT2+多梳蛋白EZH2过表达质粒。采用Real-time PCR法检测细胞中的lncRNA CCAT2、EZH2 mRNA,Western blotting法检测细胞中的EZH2蛋白,MTT法观察培养24、48、72、96 h细胞增殖能力(OD490),细胞划痕及Transwell实验分别观察细胞的迁移、侵袭能力。结果与A组比较,B组细胞中lncRNA CCAT2和EZH2的mRNA和蛋白表达水平均下降(P均<0.05);与B组比较,C组胞中EZH2的mRNA和蛋白表达水平均增加(P均<0.05)。与A组同时点比较,B组细胞增殖的OD490值降低(P均<0.05);与B组同时点比较,C组细胞增殖的OD490值升高(P均<0.05)。与A组比较,B组细胞划痕愈合百分比、穿膜细胞数均下降(P均<0.05);与B组比较,C组细胞划痕愈合百分比、穿膜细胞数均增加(P均<0.05)。结论 lncRNA CCAT2可通过上调EZH2的表达促进HCC细胞的增殖、侵袭和迁移,进而促进HCC的发生发展。 展开更多
关键词 肝细胞癌 长链非编码RNA CCAT2 EZH2基因 细胞增殖 细胞侵袭 细胞迁移
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长链非编码RNA DANCR促滑膜间充质干细胞向软骨细胞分化作用的研究进展 被引量：6
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作者 杨超 张雷 +1 位作者 周利武 赵建宁 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2016年第8期892-896,共5页
长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度大于200 nt,不具有翻译成蛋白质能力的RNA。lncRNA DANCR是一种近年来在肝细胞癌中发现的特异性高表达的长链非编码RNA,具有高度调控细胞分化的作用。最新研究表明,lncRNA DA... 长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度大于200 nt,不具有翻译成蛋白质能力的RNA。lncRNA DANCR是一种近年来在肝细胞癌中发现的特异性高表达的长链非编码RNA,具有高度调控细胞分化的作用。最新研究表明,lncRNA DANCR在关节软骨损伤修复中也起着重要的调控作用,并有望成为促进滑膜间充质干细胞(synovium-derived mesenchymal stem cells,SMSCs)向软骨细胞增殖和分化的关键调控位点。文中就近年来DANCR促进SMSCs向软骨细胞增殖和分化过程中的作用及未来可能的研究热点进行综述。 展开更多
关键词 长链非编码RNA DANCR 滑膜间充质干细胞
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