基于细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ序列的DNA微条形码技术鉴别11种生鲜肉制品掺假的研究 被引量：3

1

作者 励炯 吴琼 +2 位作者 扈明洁 金朦娜 邱红钰 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期52-59,共8页

建立并优化了基于细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome C oxidase subunitⅠ,COⅠ)序列的DNA微条形码(DNA mini-barcoding)技术,以检测生鲜肉制品中11种常见肉类的掺假情况。样品经真空冷冻干燥处理、提取DNA后,采用通用引物进行聚合酶链... 建立并优化了基于细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome C oxidase subunitⅠ,COⅠ)序列的DNA微条形码(DNA mini-barcoding)技术,以检测生鲜肉制品中11种常见肉类的掺假情况。样品经真空冷冻干燥处理、提取DNA后,采用通用引物进行聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增,目标条带扩增产物经切胶、回收、纯化后,进行克隆测序,并将测序结果提交到GenBank数据库(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)中进行Blast比对,筛选出适合猪肉、牛肉、羊肉、鸡肉、鸭肉、鸽子肉、马肉、驴肉、鹅肉、兔肉、鼠肉等11种肉类扩增的通用引物COⅠ-A,并对PCR扩增条件进行优化,建立18个掺假模型,以对低经济价值肉类的最低掺入比例进行考察验证。结果表明:11种肉类的PCR扩增效率均为100%。在这18个掺假模型中,牛肉和羊肉中掺入6种低经济价值肉类(猪肉、鸡肉、鸭肉、马肉、驴肉、鼠肉)的最低检出比例均为5%,而在鹅肉、鸽子肉和兔肉中其最低检出比例为10%。本方法前处理简单,灵敏度高,重现性好,可作为高经济价值生鲜肉制品中掺假低经济价值肉类的有效检测方法。 展开更多

关键词 DNA微条形码 肉制品 细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ序列 掺假

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细胞色素P450酶1A2和2C19基因多态性与难治性抑郁症的关联分析 被引量：11

2

作者 陈静 陆峥 +3 位作者 江三多 蔡军 钱伊萍 李霞 《上海精神医学》 2005年第2期95-98,共4页

目的探讨细胞色素P450酶(cytochromeP450enzymes,CYP)1A2、2C19基因多态性与难治性抑郁症的关联。方法应用聚合酶链反应(PCR)扩增技术及限制性片段长度多态性(RFLP)测定79例难治性抑郁症患者及107名正常对照者CYP1A2C163A、CYP2C19G681... 目的探讨细胞色素P450酶(cytochromeP450enzymes,CYP)1A2、2C19基因多态性与难治性抑郁症的关联。方法应用聚合酶链反应(PCR)扩增技术及限制性片段长度多态性(RFLP)测定79例难治性抑郁症患者及107名正常对照者CYP1A2C163A、CYP2C19G681A基因多态性。结果两组间基因型及等位基因分布差异无显著性(χ2=3.605,P>0.05;χ2=3.154,P>0.05)。难治性抑郁症患者对照组间基因型及等位基因分布差异无显著性(χ2=0.853,P>0.05;χ2=0.568,P>0.05)。79名患者中46名接受氟西汀合并小剂量利培酮(0.5～2.0mg/d)治疗,将其分为治疗有效组和无效组,两组间CYP1A2C163A(χ2=0.785,P>0.05;χ2=7.142,P>0.05)CYP2C19G681A(χ2=3.008,P>0.05;χ2=2.722,P>0.05)基因型及等位基因分布差异均无显著性。根据CYP2C19G681A基因多态性将患者分为无突变组(G/G型)和突变组(G/A型和A/A型),两组患者CYP1A2C163A基因型及等位基因分布差异无显著性(χ2=0.252,P>0.05;χ2=0.682,P>0.05)。结论CYP1A2C163A和CYP2C19G681A基因多态性与难治性抑郁症无显著关联,不是影响利培酮对氟西汀增效作用的主要因素。 展开更多

关键词 细胞色素P450酶 难治性抑郁症 基因多态性 关联分析 聚合酶链反应(PcR) cYP2c19 限制性片段长度多态性 P〉0.05 cYP1A2 抑郁症患者 分布差异 等位基因 显著性 基因型 正常对照 扩增技术 方法应用 增效作用 利培酮 氟西汀

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细胞色素C氧化酶缺乏的可逆性线粒体肌病1例

3

作者 唐向国 庄家用 《儿科药学杂志》 CAS 2021年第8期30-33,共4页

目的:了解细胞色素C氧化酶缺乏的可逆性线粒体肌病临床特征及基因突变特点。方法:回顾分析1例婴儿细胞色素C氧化酶缺乏的可逆性线粒体肌病的临床资料及基因检测结果。结果:本例患儿系婴儿起病,生长发育落后,入院时呼吸衰竭,需气管插管... 目的:了解细胞色素C氧化酶缺乏的可逆性线粒体肌病临床特征及基因突变特点。方法:回顾分析1例婴儿细胞色素C氧化酶缺乏的可逆性线粒体肌病的临床资料及基因检测结果。结果:本例患儿系婴儿起病,生长发育落后,入院时呼吸衰竭,需气管插管下呼吸机辅助呼吸,神经系统查体未见异常,动脉血气分析pH 7.212、血乳酸6.3 mmol/L、二氧化碳分压73.8 mm Hg、肌酸激酶1193 U/L、肌酸激酶同工酶155 U/L及乳酸脱氢酶560 U/L。头颅磁共振成像(MRI)示脑白质髓鞘化进程落后。入院后抗感染及辅助治疗效果不佳,持续高乳酸血症、肌酶水平异常升高。经辅酶Q_(10)、左卡尼丁治疗,临床症状明显改善。基因检测示线粒体基因组存在m.14674 T>C突变,来源于母亲。结论:婴幼儿持续呼吸衰竭、血乳酸水平高需警惕线粒体肌病,基因检测有助于及时诊断,细胞色素C氧化酶缺乏的可逆性线粒体肌病临床表现无特异性,早期诊治预后良好。 展开更多

关键词 线粒体肌病 细胞色素c氧化酶 可逆性 线粒体基因组

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小鼠隐藏管状线虫线粒体cox1基因的扩增及序列分析 被引量：5

4

作者 李鑫 陈晓梅 +4 位作者 范文颖 邓均有 宋慧群 朱兴全 林瑞庆 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2009年第12期57-59,共3页

对从试验小鼠体内分离的蛲虫样品PMZ1-5的线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基（cox1）的部分基因（pcox1）进行PCR扩增、测序及序列分析,并与网上相关序列进行比对分析,研究其线粒体pcox1基因遗传变异情况。结果表明,获得pcox1有效序列373 ... 对从试验小鼠体内分离的蛲虫样品PMZ1-5的线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基（cox1）的部分基因（pcox1）进行PCR扩增、测序及序列分析,并与网上相关序列进行比对分析,研究其线粒体pcox1基因遗传变异情况。结果表明,获得pcox1有效序列373 bp,经序列比对分析,发现5个蛲虫样品之间的变异很小,只有1个碱基的差异,序列相似性为99.73%～100%,BLAST分析结果表明为隐藏管状线虫,与同属的Syphacia montana序列差异性为5.24%～5.68%。结果表明,隐藏管状线虫的pcox1序列种内变异很小,种间差异明显,本结果为进一步研究蛲虫的群体遗传学奠定了基础。 展开更多

关键词 蛲虫 线粒体DNA 细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1) PcR

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山羊脑多头蚴形态学与cox1基因鉴定 被引量：6

5

作者 段博芳 程文杰 +6 位作者 杨勇 赵珍 吕艳 姜关树 吕艳彩 杨建发 张文东 《动物医学进展》 北大核心 2021年第9期42-46,共5页

为鉴定山羊脑多头蚴,通过对虫体进行形态学观察并采用PCR扩增虫体线粒体细胞色素C氧化酶亚基1(cox1)基因,将有效序列进行NCBI-Blast在线比对,利用MEGA6.0构建遗传系统进化树。结果显示,山羊脑多头蚴cox1序列长度为446 bp,与多头带绦虫... 为鉴定山羊脑多头蚴,通过对虫体进行形态学观察并采用PCR扩增虫体线粒体细胞色素C氧化酶亚基1(cox1)基因,将有效序列进行NCBI-Blast在线比对,利用MEGA6.0构建遗传系统进化树。结果显示,山羊脑多头蚴cox1序列长度为446 bp,与多头带绦虫同源性达100%,系统进化分析显示分离株与多头带绦虫位于同一分支。结合形态学观察结果表明,山羊所感染的多头蚴属于多头带绦虫幼虫——脑多头蚴,cox1基因可作为鉴定多头带绦虫的有效分子标记,研究结果为山羊脑多头蚴的分子诊断提供参考依据。 展开更多

关键词 山羊 脑多头蚴 形态学 线粒体细胞色素c氧化酶亚基1基因 鉴定

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昆明汉族人群VKORC1、CYP2C9基因多态性对华法林稳态剂量的影响及预测剂量模型的建立 被引量：7

6

作者 肖成 胡莹 +3 位作者 王玉明 徐梦云 李婉澜 柳杰 《山东医药》 CAS 2018年第10期21-24,共4页

目的观察昆明地区汉族人群维生素K环氧化物还原酶复合体1(VKORC1)和细胞色素P4502C9(CYP2C9)基因多态性对华法林稳态剂量的影响,并建立预测剂量模型。方法选择162例采取华法林抗凝治疗的下肢深静脉血栓患者,采用扩增阻滞突变体系-聚合... 目的观察昆明地区汉族人群维生素K环氧化物还原酶复合体1(VKORC1)和细胞色素P4502C9(CYP2C9)基因多态性对华法林稳态剂量的影响,并建立预测剂量模型。方法选择162例采取华法林抗凝治疗的下肢深静脉血栓患者,采用扩增阻滞突变体系-聚合酶链式反应技术(ARMS-PCR)检测患者血液中VKORC1、CYP2C9基因多态性;收集患者性别、年龄、身高、体质量、BMI、国际化标准比值(INR)、VKORC1和CYP2C9基因型,采用Pearson相关分析筛选与华法林稳态剂量相关的因素;综合华法林稳态剂量的相关因素进行多元逐步回归分析,得到预测剂量模型。另外选取20例下肢深静脉血栓患者,观察运用预测剂量模型推荐的华法林用量后出血性事件的发生情况。结果 162例患者中,CYP2C9 AA、AC基因型分别为151、11例,其中AC型华法林稳态剂量低于AA型;VKORC1的AA、AG、GG型分别为138、22、2例,其中AA型华法林稳态剂量低于AG型和GG型。患者年龄、体质量、VKORC1和CYP2C9基因多态性与华法林稳态剂量相关(P均<0.05)。预测剂量模型:华法林用量=3.401-0.027×年龄+0.015×体质量-0.312×CYP2C9+0.979×(VKORC1-X1)+0.64×(VKORC1-X2)。运用预测剂量模型推荐华法林用量的20例患者,在随访期间无出血事件发生。结论昆明地区汉族人群存在VKORC1和CYP2C9基因多态性,VKORC1和CYP2C9基因多态性对华法林稳态剂量具有一定的影响;成功构建了华法林预测剂量模型,该模型可较为准确地指导华法林用药。 展开更多

关键词 华法林 维生素K环氧化物还原酶复合体1 细胞色素P4502c9 基因多态性 下肢深静脉血栓 预测剂量模型 昆明市 汉族

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金属硫蛋白2A基因沉默对乳腺癌细胞Cpy6B2表达的影响 被引量：1

7

作者 魏西军 王清路 +1 位作者 李俏俏 江小华 《山东医药》 CAS 北大核心 2015年第14期19-21,共3页

目的探讨金属硫蛋白2A(MT2A)基因沉默对乳腺癌细胞呼吸链中细胞色素C氧化酶6B2亚基(Cpy6B2)表达的影响。方法乳腺癌野生细胞株MCF-7(以下简称MCF-7)分为空白对照组和MT2A干扰组,每组各12复孔。空白对照组不转染任何遗传物质,MT2A干扰组... 目的探讨金属硫蛋白2A(MT2A)基因沉默对乳腺癌细胞呼吸链中细胞色素C氧化酶6B2亚基(Cpy6B2)表达的影响。方法乳腺癌野生细胞株MCF-7(以下简称MCF-7)分为空白对照组和MT2A干扰组,每组各12复孔。空白对照组不转染任何遗传物质,MT2A干扰组转染shRNA-MT2A载体,采用半定量PCR法检测两组MT2A mRNA的表达水平,MT2A干扰组成功获得MT2A基因沉默,采用实时定量PCR法分析两组Cpy6B2的表达水平。结果 MT2A干扰组中Cpy6B2的表达水平升高,与空白对照组相比,P<0.05。结论 MT2A基因可抑制人乳腺癌细胞Cpy6B2的表达。 展开更多

关键词 金属硫蛋白 乳腺癌细胞 细胞色素c氧化酶6B2亚基

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伯恩山犬的眼线虫形态学鉴定与cox1基因分析 被引量：1

8

作者 程文杰 李朝 +4 位作者 董仙兰 杨建发 邹丰才 李永华 李红霞 《动物医学进展》 北大核心 2020年第10期43-47,共5页

为鉴定伯恩山犬感染的眼线虫种属关系,采用PCR扩增虫体线粒体细胞色素C氧化酶第1亚基(cox1)基因。将有效序列进行NCBI-BLAST在线比对,利用MEGA6.0构建遗传系统进化树。结果显示,伯恩山犬眼线虫cox1序列长度为446 bp,与结膜吸吮线虫同源... 为鉴定伯恩山犬感染的眼线虫种属关系,采用PCR扩增虫体线粒体细胞色素C氧化酶第1亚基(cox1)基因。将有效序列进行NCBI-BLAST在线比对,利用MEGA6.0构建遗传系统进化树。结果显示,伯恩山犬眼线虫cox1序列长度为446 bp,与结膜吸吮线虫同源性达99%,系统进化分析显示二者位于同一分支,由此确定,伯恩山犬感染的线虫为结膜吸吮线虫。 展开更多

关键词 线粒体细胞色素c氧化酶第1亚基基因 结膜吸吮线虫 鉴定 伯恩山犬

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CYP2C9和VKORC1基因多态性与华法林个体化用药的临床研究 被引量：5

9

作者 陈晖 马蕾 《中国实用医药》 2015年第12期3-5,共3页

目的：探讨细胞色素P450同工酶2C9（CYP2C9）及维生素K环氧化物还原酶复合体亚单位1（VKORC1）基因多态性对华法林个体化用药的影响。方法110例临床初次和维持口服华法林抗凝治疗的患者，记录患者的年龄、性别、身高、体重和服用华法林5... 目的：探讨细胞色素P450同工酶2C9（CYP2C9）及维生素K环氧化物还原酶复合体亚单位1（VKORC1）基因多态性对华法林个体化用药的影响。方法110例临床初次和维持口服华法林抗凝治疗的患者，记录患者的年龄、性别、身高、体重和服用华法林5-7 d后每次国际标准化比值（INR）的测定值， INR达到目标值时华法林的总用量以及华法林的日均用量。同时检测CYP2C9＊1、＊2、＊3位点和VKORC1-1639 AA、AG、GG位点基因型。结果对于初次口服华法林的患者， CYP2C9＊2或＊3基因型患者在抗凝治疗初期易发生INR值超过治疗窗（INR〉3.0）；而VKORC1-1639 AG或GG基因型患者INR达标时间明显延长，并且INR达标时所服用的华法林总剂量和日均剂量均高于AA基因型患者。结论 CYP2C9和VKORC1基因检测对于指导患者华法林的个体化用药具有一定的临床意义。 展开更多

关键词 华法林 个体化用药 基因多态性 细胞色素P450同工酶2c9 维生素K环氧化物还原酶复合体亚单位1

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CYP2C19、ABCB1、PON1基因多态性与氯吡格雷抵抗的关系研究 被引量：1

10

作者 张姗姗 刘立雄 +1 位作者 张志新 江晓敏 《中国社区医师》 2023年第25期50-52,共3页

目的:探讨细胞色素P4502C19(CYP2C19)、三磷酸腺苷结合盒转运体(ABCB1)、对氧磷酶-1(PON1)基因多态性与氯吡格雷抵抗的关系。方法:选取2019年10月—2022年10月广州医科大学附属第二医院收治的急性缺血性脑卒中接受经皮冠状动脉介入治疗(... 目的:探讨细胞色素P4502C19(CYP2C19)、三磷酸腺苷结合盒转运体(ABCB1)、对氧磷酶-1(PON1)基因多态性与氯吡格雷抵抗的关系。方法:选取2019年10月—2022年10月广州医科大学附属第二医院收治的急性缺血性脑卒中接受经皮冠状动脉介入治疗(PCI)术后服用氯吡格雷且出现抵抗现象的患者90例作为研究对象,均测定CYP2C19(rs4244285,rs4986893),ABCB1(rs1045642)和PON1(rs662)基因型。统计单核苷酸多态性(SNP)基因型,比较不同CYP2C19基因型别与ABCB1、PON1的关系。结果:CYP2C19基因的*1、*2、*3基因突变率分别为22.22%(20/90)、14.44%(13/90)、7.78%(7/90),其中氯吡格雷抵抗患者的CYP2C19*1/*1野生型样本21例(23.33%);突变型样本69例(76.67%),包括CYP2C19*1/*2or*3突变型杂合子和CYP2C19*2/*2or*3突变型纯合子。ABCB1基因C3435T多态性,基因突变率为54.44%(49/90);PON1基因Q192R为AG多态性,基因突变率为51.11%(46/90)。CYP2C19野生型和突变型的ABCB1基因型CC、CT、TT以及PON1基因型GG、GA、AA比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:氯吡格雷抵抗不仅与CYP2C19单基因因素有关,同时也受其他多基因相互作用共同导致,而ABCB1基因C3435T多态性、PON1基因Q192R多态性与氯吡格雷抵抗无明显关系。 展开更多

关键词 细胞色素P4502c19 三磷酸腺苷结合盒转运体 对氧磷酶-1 基因多态性 氯吡格雷

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基于形态学和线粒体COI基因分子标记的安西自然保护区普氏野马马胃蝇幼虫鉴定分析

11

作者 裴鹏祖 田瑞祥 +1 位作者 闫利平 张东 《甘肃林业科技》 2024年第2期53-57,共5页

马胃蝇Gasterophilus spp.是马科动物体内常见的一类寄生虫,目前全世界报道了9种马胃蝇。马胃蝇不同物种具有明显的地域分布特征,不同地区感染马胃蝇的物种组成结构差异明显。为了探究甘肃安西极旱荒漠国家级自然保护区内普氏野马Equus ... 马胃蝇Gasterophilus spp.是马科动物体内常见的一类寄生虫,目前全世界报道了9种马胃蝇。马胃蝇不同物种具有明显的地域分布特征,不同地区感染马胃蝇的物种组成结构差异明显。为了探究甘肃安西极旱荒漠国家级自然保护区内普氏野马Equus ferus感染马胃蝇幼虫的物种组成,2021年对保护区内的野马进行了驱虫保健,并解剖死亡个体,采获马胃蝇幼虫875只;利用体视解剖镜对特征明显的三龄幼虫进行了形态学观察及鉴别,根据三龄幼虫领部棘刺,以及各体节棘刺形态、口脊骨页部形态平滑、伪头小刺结构清晰等特征,明确了三龄幼虫均为黑腹胃蝇Gasterophilus pecorum;对于形态难以鉴定的一、二龄幼虫,采取了扩增其线粒体细胞色素氧化酶亚基(COI)基因并与GenBank数据库中马胃蝇属序列对比的分子鉴定方法,经过比对分析,确认一、二龄幼虫均与黑腹胃蝇序列聚为一支,且与黑腹胃蝇遗传距离最近。综上,确认甘肃安西极旱荒漠国家级自然保护区马胃蝇种类均为黑腹胃蝇。 展开更多

关键词 普氏野马 马胃蝇 线粒体细胞色素氧化酶亚基(cOI)基因 分子鉴定

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CYP2C9和VKORC1基因多态性指导临床华法林初始抗凝的研究 被引量：2

12

作者 张彦昂 《中国实用医药》 2016年第16期179-180,共2页

目的评价细胞色素P450酶2C9基因（CYP2C9）和维生素K环氧化物还原酶复合体亚单位1基因（VKORC1）多态性对郑州地区进行华法林初始抗凝疗效的影响。方法 200例初次服用华法林的患者,随机分成基因组和对照组,各100例。基因组根据CYP2C9和V... 目的评价细胞色素P450酶2C9基因（CYP2C9）和维生素K环氧化物还原酶复合体亚单位1基因（VKORC1）多态性对郑州地区进行华法林初始抗凝疗效的影响。方法 200例初次服用华法林的患者,随机分成基因组和对照组,各100例。基因组根据CYP2C9和VKORC1基因检测结果推荐剂量范围,从低推荐剂量开始服药,对照组按照常规方式给药。计算服用华法林后国际标准化比值（INR）达2~2.5时两组所需的时间及INR首次达标时华法林日平均剂量等指标。结果基因组INR首次达标时所需时间少于对照组（P〈0.05）。基因组VKORC1-1639AG或GG患者INR达标时华法林日平均剂量比AA型多（P〈0.05）。INR达标时华法林日平均剂量与基因检测推荐范围相近。结论 VKORC1和CYP2C9基因检测指导可以缩短INR达标时间,对华法林日均剂量的确定有一定作用,对指导初始抗凝个体化应用华法林有一定的临床意义。 展开更多

关键词 华法林 基因多态性 细胞色素P450酶2c9基因 维生素K环氧化物还原酶复合体亚单位1基因 初始抗凝

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CYP2C9和VKORC1基因多态性对华法林剂量的影响研究 被引量：2

13

作者 梁红梅 邬银伟 王艳群 《中国实用医药》 2019年第15期195-197,共3页

目的探究细胞色素氧化酶2C9(CYP2C9)基因和维生素K环氧化物还原酶复合物1基因(VKORC1)-1639 G/A多态性对华法林初始抗凝剂量的影响。方法 200例使用华法林患者,观察患者使用华法林5~7 d后凝血酶原时间(PT)和国际标准化比值(INR),记录患... 目的探究细胞色素氧化酶2C9(CYP2C9)基因和维生素K环氧化物还原酶复合物1基因(VKORC1)-1639 G/A多态性对华法林初始抗凝剂量的影响。方法 200例使用华法林患者,观察患者使用华法林5~7 d后凝血酶原时间(PT)和国际标准化比值(INR),记录患者服用华法林初次达标天数、总用量和平均每日用量,同时测定患者CYP2C9位点基因型(*1、*2、*3)和VKORC1-1639位点基因型(AA、AG、GG)。结果 CYP2C9*1、CYP2C9*2/*3 VKORC1-1639 AG/GG基因型患者初次达标天数分别为(14.47±1.52)、(9.77±0.91)d,总用量分别为(115.13±11.47)、(56.31±5.49)mg,平均每日用量分别为(5.22±0.53)、(4.36±0.44)mg, CYP2C9*1、CYP2C9*2/*3 VKORC1-1639 AA基因型患者初次达标天数分别为(9.24±0.94)、(5.37±0.52)d,总用量分别为(52.37±5.14)、(15.56±1.42)mg,平均每日用量分别为(3.02±0.35)、(3.21±0.36)mg;CYP2C9*1、CYP2C9*2/*3 VKORC1-1639 AG/GG基因型患者初次达标天数均长于CYP2C9*1、CYP2C9*2/*3 VKORC1-1639 AA基因型患者,总用量及平均每日用量均大于CYP2C9*1、CYP2C9*2/*3 VKORC1-1639 AA基因型患者,差异有统计学意义(P<0.05)。结论对于服用华法林的患者,对CYP2C9、VKORC1-1639基因多态性的测定具有重要指导价值,能帮助临床实施个体化用药,值得临床应用与推广。 展开更多

关键词 华法林 细胞色素氧化酶2c9基因 维生素K环氧化物还原酶复合物1基因 基因多态性

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洪泽湖大银鱼(Protosalanx hyalocranius)Cytb和COⅠ基因序列多态性分析 被引量：19

14

作者 李大命 李康 +6 位作者 张彤晴 唐晟凯 刘燕山 刘小维 穆欢 黄越峰 潘建林 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2017年第6期25-31,共7页

为揭示我国洪泽湖大银鱼(Protosalanx hyalocranius)遗传多样性现状,科学保护和合理利用大银鱼种质资源,采用线粒体细胞色素b基因(Cytb)和细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基基因(COⅠ)序列,分析了洪泽湖40尾大银鱼的遗传多样性。通过PCR扩增与序列... 为揭示我国洪泽湖大银鱼(Protosalanx hyalocranius)遗传多样性现状,科学保护和合理利用大银鱼种质资源,采用线粒体细胞色素b基因(Cytb)和细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基基因(COⅠ)序列,分析了洪泽湖40尾大银鱼的遗传多样性。通过PCR扩增与序列测定分别获得了长度为1141 bp和630 bp的Cytb和COⅠ基因序列。40条Cytb基因序列碱基A、T、G和C的平均含量分别为21.7%、29.3%、16.7%和32.3%,检出6个变异位点,定义7个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.775和0.00129,碱基平均差异数为1.469。40条COⅠ基因序列碱基A、T、G和C的平均含量分别为21.6%、26.0%、19.2%和33.2%,检出5个变异位点,定义6个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.700和0.00207,平均碱基差异数是1.303。Cytb及COⅠ基因单倍型之间的遗传距离较小,且NJ系统进化树聚为一支,说明大银鱼单倍型没有出现遗传分化。Fu’s F_s中性检验结果和碱基歧点分布图均表明,洪泽湖大银鱼近期经历了种群扩张事件。 展开更多

关键词 遗传多样性 细胞色素B基因 细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ基因 大银鱼 洪泽湖

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光肩星天牛mtDNACOⅠ基因遗传差异的研究 被引量：9

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作者 安榆林 杨晓军 +3 位作者 林晓佳 师丽敏 黄晓明 陈建东 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第5期77-83,共7页

应用PCR直接测序法对不同地理来源的24个光肩星天牛、4个不同地理来源的黄斑星天牛及8个近缘种样品和花柳曲窄吉丁共37个样品的线粒体mtDNACOⅠ基因中一段504bp的序列进行测序。序列分析结果表明:光肩星天牛与其近缘种、外缘种间存在明... 应用PCR直接测序法对不同地理来源的24个光肩星天牛、4个不同地理来源的黄斑星天牛及8个近缘种样品和花柳曲窄吉丁共37个样品的线粒体mtDNACOⅠ基因中一段504bp的序列进行测序。序列分析结果表明:光肩星天牛与其近缘种、外缘种间存在明显规律性差异;中国、美国、韩国等不同地理来源的光肩星天牛样品间存在一定的基因差异,并呈现出中国北方、中国南方、美国和韩国4个种群的特征,此研究结果不支持“美国的光肩星天牛是从中国传入的”的观点;光肩星天牛和黄斑星天牛样品间的差异较小,并未达到种级分类水平,应归为同1个种。 展开更多

关键词 光肩星天牛 线粒体DNA 细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ基因 遗传差异

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基于COⅠ和Cytb基因的浙江不同抗性水平二化螟种群的遗传结构分析 被引量：3

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作者 鲁艳辉 郭嘉雯 +3 位作者 田俊策 薛钊鸿 郑许松 吕仲贤 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第11期2462-2470,共9页

本研究利用线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)和细胞色素b(Cytb)基因的遗传学方法分析了浙江省8个不同抗性水平二化螟地理种群的遗传多样性及种群遗传结构。种群遗传多样性分析表明:PCR扩增测序分别获得长度为627 bp的COⅠ基因片段和长... 本研究利用线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)和细胞色素b(Cytb)基因的遗传学方法分析了浙江省8个不同抗性水平二化螟地理种群的遗传多样性及种群遗传结构。种群遗传多样性分析表明:PCR扩增测序分别获得长度为627 bp的COⅠ基因片段和长度为455 bp的Cytb基因片段。355条同源COⅠ序列监测出了68个多态性位点,其中单突变位点22个,简约突变位点46个,共定义了85个单倍型,每个群体的平均单倍型为18.25个,其中瑞安(RA)种群中单倍型最多,为27个单倍型。326条Cytb同源序列监测出了45个多态性位点,其中单突变位点19个,简约突变位点26个,共定义了64个单倍型,每个群体的平均单倍型为14.375个,其中乐清(YQ)种群中单倍型最多,为25个单倍型。此外,各群体中最高的单倍型多样度h分别为0.8963和0.9344,反映出二化螟群体较低的遗传多样性水平。种群遗传结构分析表明:二化螟不同地理种群间遗传变异大多数来自于群体内个体间,占80.30%(COⅠ基因)和78.16%(Cytb基因)。较少部分的遗传差异来自于组间,仅占19.43%(COⅠ基因)和21.22%(Cytb基因)。单倍型网络关系图未表现出显著的地理谱系结构,Mantel相关性检测显示,遗传距离与地理距离之间无显著相关性。单倍型邻接树也没有明显分支,未呈现出地域性差异。该研究结果为浙江省不同抗性水平二化螟种群间交流和二化螟的防控提供了基础资料。 展开更多

关键词 二化螟 细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ 细胞色素B 遗传多样性 遗传结构 抗性

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基于线粒体COXⅠ基因变异探讨国内外猪种的遗传多样性及系统进化研究 被引量：1

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作者 周秀敏 杨永江 +2 位作者 毕英杰 任卫合 张丽 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第8期1271-1280,共10页

基于mtDNA COXⅠ基因,探讨了6个猪种687个样本(大白猪、长白猪、杜洛克、藏猪、甘肃黑猪和八眉猪)的遗传多样性和各猪种间的亲缘关系。对各猪种样本mtDNACOXⅠ基因构建混合池,并利用直接测序技术获得6个猪种COXⅠ基因的序列,采用MEGA 6.... 基于mtDNA COXⅠ基因,探讨了6个猪种687个样本(大白猪、长白猪、杜洛克、藏猪、甘肃黑猪和八眉猪)的遗传多样性和各猪种间的亲缘关系。对各猪种样本mtDNACOXⅠ基因构建混合池,并利用直接测序技术获得6个猪种COXⅠ基因的序列,采用MEGA 6.0分析软件基于Kimurk双参数模型应用邻接法构建系统发生树。结果表明,6个猪种mtDNA COXⅠ基因序列共存在21个突变位点,其中8个突变为各群体特有。长白猪与杜洛克猪的多态性较丰富,含有13个相同位点的突变,核苷酸的转换数(si)和颠换数(sv)的比值(R)分别为12和15,序列替换远未达到饱和。而藏猪、黑猪和八眉猪的多态性较贫乏。系统进化树和遗传距离分析显示,6个猪种及野猪先聚为一支而后与同属为偶蹄目的牛、羊聚为一支,3个地方猪种间遗传距离较近。外来猪种引入中国后主要是用作父本以提高生产速度和瘦肉率等,对本地猪种未有母系贡献,线粒体COXⅠ基因可有效区别6个猪种的亲缘关系,在一定程度上为中国地方猪品种的有效保护和合理利用提供理论依据。 展开更多

关键词 猪 线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基 系统地理学

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2个地理种群大银鱼COⅠ基因序列变异与遗传分化 被引量：4

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作者 赵琳 张敏莹 +4 位作者 徐东坡 周彦锋 方弟安 段金荣 刘凯 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期285-289,共5页

为探究大银鱼Protosalanx hyalocranius不同地理种群的遗传变异情况,采用PCR产物纯化测序方法,测定了太湖、洪泽湖两个种群共96尾大银鱼线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(cytochrome oxidaseⅠ,COⅠ)基因的部分序列。结果表明:在638 bp序列... 为探究大银鱼Protosalanx hyalocranius不同地理种群的遗传变异情况,采用PCR产物纯化测序方法,测定了太湖、洪泽湖两个种群共96尾大银鱼线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(cytochrome oxidaseⅠ,COⅠ)基因的部分序列。结果表明:在638 bp序列中共检测到6个变异位点,占核苷酸总数的0.94%;A、G、T、C平均含量依次为26.2%、34.0%、21.3%和18.5%,A+T含量(47.5%)低于G+C含量(52.5%);共发现7种单倍型,其中hap1、hap5和hap7为共享单倍型,hap6为洪泽湖种群特有,hap2、hap3和hap4为太湖种群特有,在7种单倍型中,hap1为明显的优势单倍体型,共54个个体(占总个体数的56.25%);平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.642和0.001 48,遗传多样性较低;AMOVA分析显示,种群内遗传变异为79.82%,种群间变异为20.18%,两种群间遗传分化系数(Fst)为0.201 79,表明两种群间遗传分化程度较高。本研究结果可为合理开发和利用大银鱼野生资源提供参考。 展开更多

关键词 大银鱼 地理种群 线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基(cOⅠ) 遗传分化

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基于COI基因分析长江下游典型水域翘嘴鲌的遗传多样性 被引量：6

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作者 张桂宁 方弟安 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2021年第6期29-35,共7页

为了解长江下游典型水域翘嘴鲌(Culter alburnus Basilewsky)群体遗传多样性现状,利用线粒体COI基因序列对淀山湖(DSH)、太湖(TH)、长漾湖(CYH)和长江水域江苏段(CJ)的4个翘嘴鲌群体进行了遗传多样性分析。结果显示,在816 bp的COI基因... 为了解长江下游典型水域翘嘴鲌(Culter alburnus Basilewsky)群体遗传多样性现状,利用线粒体COI基因序列对淀山湖(DSH)、太湖(TH)、长漾湖(CYH)和长江水域江苏段(CJ)的4个翘嘴鲌群体进行了遗传多样性分析。结果显示,在816 bp的COI基因序列中,碱基A、T、C和G的平均含量分别为26.3%、28.7%、26.8%和18.2%,表现出较明显的AT偏倚性;4个群体共检测到302个多态性位点,定义了43个单倍型;单倍型多样性指数(Hd)为0.639~0.912,表现为CJ>CYH>DSH>TH,核苷酸多样性指数(Pi)为0.0052~0.0874,表现为CJ>DSH>CYH>TH。群体间遗传分化系数Fst和遗传距离分析表明,TH群体与其它群体间均存在较高的遗传分化,且与其它群体间的遗传距离均较远。AMOVA分析结果表明,遗传变异主要来自群体内,群体间遗传分化未达到显著水平。中性检验结果显示DSH群体的Tajima′s D和FuLiF均为负值,表明DSH群体可能经历过群体爆发和扩张事件,可能与淀山湖的形成历史有关。研究表明,翘嘴鲌不同地理群体间的遗传分化程度不同,4个水域的翘嘴鲌群体遗传多样性均较丰富,每个群体都可单独作为一个保护单元,其中CJ群体的遗传多样性最高,表明长江江苏段翘嘴鲌种质资源状况较好。 展开更多

关键词 翘嘴鲌(culter alburnus Basilewsky) 线粒体DNA 细胞色素c氧化酶亚基I(cOI)基因 遗传多样性

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猥迭宫绦虫的线粒体cox1序列测定及种系发育关系分析 被引量：3

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作者 李伟平 崔健扬 《中国畜禽种业》 2012年第8期60-61,共2页

本研究应用聚合酶链反应(PCR)方法扩增出分离自广州的猬迭宫绦虫的线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(cox1)基因部分序列(pcox1),并进行序列分析。应用CLUSTALW2软件进行多重比对分析序列差异,应用MEGA4.0软件构建种系发育树,并与GenBank... 本研究应用聚合酶链反应(PCR)方法扩增出分离自广州的猬迭宫绦虫的线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(cox1)基因部分序列(pcox1),并进行序列分析。应用CLUSTALW2软件进行多重比对分析序列差异,应用MEGA4.0软件构建种系发育树,并与GenBank中收录的猬迭宫绦虫相应基因序列进行比对分析。结果表明所获得的pcox1序列长度一致,均为396bp,且与GenBank中收录的猥迭宫绦虫均构成同一亚群,为猬迭宫绦虫进一步的分类、鉴定和遗传变异研究奠定了基础。 展开更多

关键词 猥迭宫绦虫 细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1) 种系发育关系 序列分析

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