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肿瘤细胞DNA样品基于二次谐波发生(SHG)的非线性光谱学成像
被引量：
1
1
作者
罗冬梅
邓小元
+3 位作者
卓双木
谭淑雯
庄正飞
金鹰
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期800-804,共5页
二次谐波的产生是一个二阶非线性光学过程,这个过程只发生在中心对称系数不为零的非中心对称区域。利用二次谐波显微技术可以对各种具有内源性信号的生物组织进行无损伤实时成像,如结缔组织的胶原纤维或肌细胞的肌动球蛋白。在生物化学...
二次谐波的产生是一个二阶非线性光学过程,这个过程只发生在中心对称系数不为零的非中心对称区域。利用二次谐波显微技术可以对各种具有内源性信号的生物组织进行无损伤实时成像,如结缔组织的胶原纤维或肌细胞的肌动球蛋白。在生物化学和结构生物学中,虽然DNA是由脱氧核糖核苷酸构成而蛋白质是由氨基酸残基组成,但是DNA和蛋白质大分子高级结构的形成机制是相似的。利用光谱学成像技术对不同DNA样品进行检测,获取DNA样品的SHG信号并进行高解析度成像。这些DNA样品包括基因组DNA溶液、细胞核提取物以及培养细胞的细胞核。实验结果表明在常规条件下可以获得基因组DNA溶液和细胞核提取物的SHG信号,但几乎观测不到来自培养细胞核区的SHG信号。通过在培养基中添加少量无水乙醇(体积比小于5%),可以在培养细胞的细胞核区域检测到SHG信号。推测在培养细胞中乙醇和DNA相互作用引起DNA分子构象发生变化,这些变化可能导致了DNA分子非线性光学性质的改变。
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关键词
二次谐波发生
基因组DNA
细胞核提取物
培养肿瘤
细胞
乙醇
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职称材料
关岭牛MyoDI基因启动子上转录因子结合位点的筛选
被引量：
4
2
作者
张雯
许厚强
+4 位作者
陈伟
陈祥
桓聪聪
夏丹
周迪
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第7期1259-1267,共9页
本研究旨在筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上的转录因子结合位点。根据GenBank已公布的牛MyoDI基因的启动子序列,设计特异性PCR引物,扩增贵州关岭牛MyoDI基因的启动子区,构建重组克隆载体pUCM-TMyoDI-pro,并对阳性质粒进行测序鉴定。再利...
本研究旨在筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上的转录因子结合位点。根据GenBank已公布的牛MyoDI基因的启动子序列,设计特异性PCR引物,扩增贵州关岭牛MyoDI基因的启动子区,构建重组克隆载体pUCM-TMyoDI-pro,并对阳性质粒进行测序鉴定。再利用筛选试验和生物信息学分析筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上的转录因子结合位点。结果,筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上含有的转录因子结合位点有SATB1、Xbp、MEF2、Pax-3、Pbx1、PPAR、TFⅡD、COUP-TF、Gfi-1、HNF-1、HOX4C、NRF2(ARE)、MEF1、RXR、SMUC、Snail、MyoD、VDR。结合在线软件分析和文献,最终筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上含有MyoD、TFIID、Pax3、MEF1、VDR和MEF2转录因子结合位点,这些转录因子对启动子活性起着重要的调控作用。结果显示,关岭牛MyoDI基因启动子上含有MyoD、TFIID、Pax3、MEF1、VDR和MEF2转录因子结合位点。
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关键词
MyoDI基因
转录因子结合位点
启动子
细胞核提取物
生
物
信息学分析
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职称材料
题名
肿瘤细胞DNA样品基于二次谐波发生(SHG)的非线性光谱学成像
被引量：
1
1
作者
罗冬梅
邓小元
卓双木
谭淑雯
庄正飞
金鹰
机构
华南师范大学生物光子学研究院
福建师范大学医学光电科学与技术重点实验室
出处
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期800-804,共5页
基金
国家自然科学基金专项项目/科学部主任基金项目(30940020)资助
文摘
二次谐波的产生是一个二阶非线性光学过程,这个过程只发生在中心对称系数不为零的非中心对称区域。利用二次谐波显微技术可以对各种具有内源性信号的生物组织进行无损伤实时成像,如结缔组织的胶原纤维或肌细胞的肌动球蛋白。在生物化学和结构生物学中,虽然DNA是由脱氧核糖核苷酸构成而蛋白质是由氨基酸残基组成,但是DNA和蛋白质大分子高级结构的形成机制是相似的。利用光谱学成像技术对不同DNA样品进行检测,获取DNA样品的SHG信号并进行高解析度成像。这些DNA样品包括基因组DNA溶液、细胞核提取物以及培养细胞的细胞核。实验结果表明在常规条件下可以获得基因组DNA溶液和细胞核提取物的SHG信号,但几乎观测不到来自培养细胞核区的SHG信号。通过在培养基中添加少量无水乙醇(体积比小于5%),可以在培养细胞的细胞核区域检测到SHG信号。推测在培养细胞中乙醇和DNA相互作用引起DNA分子构象发生变化,这些变化可能导致了DNA分子非线性光学性质的改变。
关键词
二次谐波发生
基因组DNA
细胞核提取物
培养肿瘤
细胞
乙醇
Keywords
Second harmonic generation
Genomic DNA
Extracted nuclei
Cultured tumor cell
Ethanol
分类号
O433 [机械工程—光学工程]
Q523 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
关岭牛MyoDI基因启动子上转录因子结合位点的筛选
被引量：
4
2
作者
张雯
许厚强
陈伟
陈祥
桓聪聪
夏丹
周迪
机构
贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室
贵州大学动物科学学院
贵州大学生命科学学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第7期1259-1267,共9页
基金
国家转基因生物新品种培育重大专项(2013ZX08009-004)
黔科合重大专项贵州畜禽种质资源保存
+2 种基金
创新与利用(字[2013]6008号)
贵州省科技厅农业攻关项目(黔科合NY字[2012]3008号)
贵州大学研究生创新基金(研农2014021)
文摘
本研究旨在筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上的转录因子结合位点。根据GenBank已公布的牛MyoDI基因的启动子序列,设计特异性PCR引物,扩增贵州关岭牛MyoDI基因的启动子区,构建重组克隆载体pUCM-TMyoDI-pro,并对阳性质粒进行测序鉴定。再利用筛选试验和生物信息学分析筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上的转录因子结合位点。结果,筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上含有的转录因子结合位点有SATB1、Xbp、MEF2、Pax-3、Pbx1、PPAR、TFⅡD、COUP-TF、Gfi-1、HNF-1、HOX4C、NRF2(ARE)、MEF1、RXR、SMUC、Snail、MyoD、VDR。结合在线软件分析和文献,最终筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上含有MyoD、TFIID、Pax3、MEF1、VDR和MEF2转录因子结合位点,这些转录因子对启动子活性起着重要的调控作用。结果显示,关岭牛MyoDI基因启动子上含有MyoD、TFIID、Pax3、MEF1、VDR和MEF2转录因子结合位点。
关键词
MyoDI基因
转录因子结合位点
启动子
细胞核提取物
生
物
信息学分析
Keywords
MyoDI gene
transcription factor binding sites
promoter
nuclear extracts
bioinformatics analysis
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
肿瘤细胞DNA样品基于二次谐波发生(SHG)的非线性光谱学成像
罗冬梅
邓小元
卓双木
谭淑雯
庄正飞
金鹰
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
关岭牛MyoDI基因启动子上转录因子结合位点的筛选
张雯
许厚强
陈伟
陈祥
桓聪聪
夏丹
周迪
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
4
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