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敲低造血前B细胞白血病转录因子相互作用蛋白对胰腺癌细胞增殖、周期和凋亡的影响被引量：4: 1; 作者赵一鸣杨刚 +2 位作者由磊胡亚赵玉沛《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期7-15,共9页; 目的探讨造血前B细胞白血病转录因子相互作用蛋白(HPIP)对胰腺癌细胞增殖、周期及凋亡的影响。方法采用免疫组织化学染色方法检测胰腺癌组织及对应癌旁组织中HPIP的表达水平,小干扰RNA瞬时转染的方法敲低胰腺癌细胞中HPIP的表达水平,细... 展开更多; 关键词胰腺癌造血前B细胞白血病转录因子相互作用蛋白细胞周期细胞增殖细胞凋亡; 在线阅读下载PDF 职称材料

DeepCKI:一个基于变分图自编码器预测细胞-细胞因子相互作用的生物信息学模型被引量：2: 2; 作者朱渊何瑞瑞 +2 位作者刘源朱华庆李栋《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1033-1042,共10页; 细胞因子(cytokine)是一类由免疫细胞和某些非免疫细胞合成和分泌的信号分子,在免疫系统中通过结合相应受体调节细胞生长、分化和调控免疫应答。目前研究多侧重于通过实验方法检测细胞因子和受体的相互作用来研究细胞间的通讯网络,但存... 展开更多; 关键词细胞-细胞因子相互作用变分图自编码器 DeepCKI; 在线阅读下载PDF 职称材料

禽致病性大肠杆菌hcp2a基因对雏鸡脾脏细胞因子-细胞因子受体相互作用通路的影响: 3; 作者何琪孙晨晨 +6 位作者侯曼曼肖福泉龚柳菲黄燕段少仪祁克宗宋祥军《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第1期151-156,共6页; 探究禽致病性大肠杆菌(APEC)hcp2a基因缺失对雏鸡脾脏转录组的影响,为深入研究禽致病性大肠杆菌的致病机理奠定理论基础。将7日龄雏鸡随机分成2组,用APEC野生株(AE17)及其hcp2a基因缺失株(AE17△hcp2a)分别感染雏鸡,采集脾脏组织制作苏... 展开更多; 关键词禽致病性大肠杆菌 hcp2a基因脾脏雏鸡细胞因子-细胞因子受体相互作用通路; 在线阅读下载PDF 职称材料

IL-35在类风湿关节炎中的研究进展被引量：4: 4; 作者姜申易鲁静《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1714-1717,共4页; 类风湿关节炎（Rheumatoid arthritis,RA）是一种以慢性关节滑膜炎症为主的自身免疫性疾病,目前病因及发病机制尚未完全明确。RA滑膜细胞及滑膜组织中浸润的单核/巨噬细胞、淋巴细胞等产生大量细胞因子作用于多种细胞并相互调节,促进了R... 展开更多; 关键词类风湿关节炎 IL-35 关节滑膜炎症自身免疫性疾病细胞因子作用滑膜组织滑膜细胞 INTERLEUKIN 病毒诱导巨噬细胞; 在线阅读下载PDF 职称材料

癫痫持续状态大鼠海马Bim与Caspase-3的表达被引量：3: 5; 作者肖品品耿直《神经解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期477-481,共5页; 目的:探讨在匹罗卡品致痫的癫痫持续状态(Status epilepticus,SE)大鼠模型中,Bcl-2-相互作用细胞死亡介导因子(Bim)与Caspase-3在大鼠海马组织中的表达。方法:雄性成年Sprague-Dawley(SD)大鼠,应用匹罗卡品产生SE 60 min后终止发作,24 ... 展开更多; 关键词癫痫持续状态 Bcl-2相互作用细胞死亡介导因子(Bim) CASPASE-3 细胞凋亡; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名敲低造血前B细胞白血病转录因子相互作用蛋白对胰腺癌细胞增殖、周期和凋亡的影响被引量：4: 1; 作者赵一鸣杨刚由磊胡亚赵玉沛; 机构中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院基本外科; 出处《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期7-15,共9页; 基金中国医学科学院中央级公益性科研院所基本科研业务费(2018PT32014)~~; 文摘目的探讨造血前B细胞白血病转录因子相互作用蛋白(HPIP)对胰腺癌细胞增殖、周期及凋亡的影响。方法采用免疫组织化学染色方法检测胰腺癌组织及对应癌旁组织中HPIP的表达水平,小干扰RNA瞬时转染的方法敲低胰腺癌细胞中HPIP的表达水平,细胞计数试剂盒-8实验、克隆形成实验、流式细胞术检测敲低HPIP对细胞增殖、周期及凋亡的影响,免疫印迹法检测敲低HPIP对于cyclin D1、caspase 7和cleaved caspase 7表达水平的影响。结果胰腺癌组织中HPIP的表达明显高于癌旁组织(Z=-2.060,P=0.039)。敲低HPIP表达水平后,在24 h起MIA PaCa-2和BxPC-3细胞的生长受到抑制(P均<0.05);MIA PaCa-2(t=4.706,P=0.009)和BxPC-3细胞(t=9.514,P=0.000)形成的阳性克隆数明显减少;MIA PaCa-2(t=7.642,P=0.001)及BxPC-3细胞(t=2.714,P=0.051)中S期细胞比例明显降低,G0/G1期细胞比例明显增加(t=3.244,P=0.031;t=6.095,P=0.003);MIA PaCa-2(t=24.58,P=0.000;t=29.43,P=0.000)和BxPC-3细胞(t=36.45,P=0.000;t=43.52,P=0.000)中的晚期凋亡率和总凋亡率均明显上升;MIA PaCa-2(t=6.705,P=0.002)和BxPC-3细胞(t=6.238,P=0.003)的cyclin D1表达水平明显下降,caspase 7表达水平变化无统计学意义(t=0.711,P=0.516;t=0.027,P=0.979),cleaved caspase 7表达水平明显上升(t=3.991,P=0.016;t=6.536,P=0.002)。结论与癌旁组织相比,HPIP在胰腺癌中表达水平较高。敲低HPIP可导致胰腺癌细胞生长受到抑制,细胞周期由G0/G1期向S期转化受阻,并促进胰腺癌细胞凋亡。HPIP可能在胰腺癌中发挥癌基因作用。; 关键词胰腺癌造血前B细胞白血病转录因子相互作用蛋白细胞周期细胞增殖细胞凋亡; Keywords pancreatic cancer hematopoietic pre-B-cell leukemia transcription factor interacting protein cell cycle cell proliferation cell apoptosis; 分类号 R735.9 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名DeepCKI:一个基于变分图自编码器预测细胞-细胞因子相互作用的生物信息学模型被引量：2: 2; 作者朱渊何瑞瑞刘源朱华庆李栋; 机构安徽医科大学基础医学院河北大学生命科学学院军事医学研究院生命组学研究所; 出处《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1033-1042,共10页; 基金国家自然科学基金项目(No.32088101)资助。; 文摘细胞因子(cytokine)是一类由免疫细胞和某些非免疫细胞合成和分泌的信号分子,在免疫系统中通过结合相应受体调节细胞生长、分化和调控免疫应答。目前研究多侧重于通过实验方法检测细胞因子和受体的相互作用来研究细胞间的通讯网络,但存在实验周期长、设备要求高和成本高等不足。因此,有必要通过计算方法来加快对细胞-细胞因子相互作用(cell-cytokine interactions,CKI)的系统研究。本文提出一种基于变分图自编码器(variational graph auto-encoder,VGAE)预测细胞-细胞因子相互作用的深度学习模型——DeepCKI。该模型可有效融合蛋白质相互作用网络和不同类型的蛋白质特征,充分挖掘网络拓扑结构和节点属性中的有效信息,实现对细胞-细胞因子相互作用的高效预测。与变分自编码和深度神经网络方法相比,采用图结构设计的DeepCKI表现出了最优的预测性能。DeepCKI模型对4种不同类型细胞-细胞因子相互作用的ROC曲线下面积均高于0.8,模型具有一定的鲁棒性和有效性。预测打分排名前100的细胞-细胞因子相互作用中,有36对已被最新发表文献验证,表明该模型具有发现新的细胞-细胞因子相互作用的能力。; 关键词细胞-细胞因子相互作用变分图自编码器 DeepCKI; Keywords cell-cytokine interactions(CKI) variational graph auto-encoder DeepCKI; 分类号 R392-3 [医药卫生—免疫学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名禽致病性大肠杆菌hcp2a基因对雏鸡脾脏细胞因子-细胞因子受体相互作用通路的影响: 3; 作者何琪孙晨晨侯曼曼肖福泉龚柳菲黄燕段少仪祁克宗宋祥军; 机构安徽农业大学动物科技学院; 出处《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第1期151-156,共6页; 基金 2020年省级大学生创新创业计划项目(S202010364022) 安徽省重点研究与开发计划项目(202104f06020010) 国家青年科学基金项目(31802161)。; 文摘探究禽致病性大肠杆菌(APEC)hcp2a基因缺失对雏鸡脾脏转录组的影响,为深入研究禽致病性大肠杆菌的致病机理奠定理论基础。将7日龄雏鸡随机分成2组,用APEC野生株(AE17)及其hcp2a基因缺失株(AE17△hcp2a)分别感染雏鸡,采集脾脏组织制作苏木精-伊红(HE)染色切片,通过转录组学测序筛选hcp2a基因缺失株感染后的差异表达基因,利用实时荧光定量PCR方法对测序结果进行验证,对差异表达基因进行GO、KEGG分析。AE17和AE17△hcp2a均能引起雏鸡脾脏的病理变化,转录组学测序结果发现,AE17△hcp2a感染雏鸡脾脏中筛选到512个差异表达基因,其中221个基因上调表达,291个基因下调表达。选择部分差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证,差异表达基因mRNA转录水平的变化趋势与测序结果一致。GO分析结果表明,差异表达基因富集在生物膜、生物膜的组成成分、氧化还原过程、免疫反应、水解酶活性等条目。KEGG分析结果表明,差异表达基因富集在细胞因子-细胞因子受体相互作用通路、细胞粘附分子(CAMs)通路等。禽致病性大肠杆菌hcp2a基因缺失后感染雏鸡,会影响其脾脏mRNA表达谱,差异表达基因主要富集在细胞因子-细胞因子受体相互作用通路等。; 关键词禽致病性大肠杆菌 hcp2a基因脾脏雏鸡细胞因子-细胞因子受体相互作用通路; Keywords avian pathogenic Escherichia coli hcp2a gene spleen chick cytokine-cytokine receptor interaction pathway; 分类号 S831 [农业科学—畜牧学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名IL-35在类风湿关节炎中的研究进展被引量：4: 4; 作者姜申易鲁静; 机构中国医科大学附属第一医院风湿免疫科; 出处《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1714-1717,共4页; 基金国家自然科学基金面上项目(81172867); 文摘类风湿关节炎（Rheumatoid arthritis,RA）是一种以慢性关节滑膜炎症为主的自身免疫性疾病,目前病因及发病机制尚未完全明确。RA滑膜细胞及滑膜组织中浸润的单核/巨噬细胞、淋巴细胞等产生大量细胞因子作用于多种细胞并相互调节,促进了RA的发生和发展。; 关键词类风湿关节炎 IL-35 关节滑膜炎症自身免疫性疾病细胞因子作用滑膜组织滑膜细胞 INTERLEUKIN 病毒诱导巨噬细胞; 分类号 R593.22 [医药卫生—内科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名癫痫持续状态大鼠海马Bim与Caspase-3的表达被引量：3: 5; 作者肖品品耿直; 机构苏州大学医学部上海交通大学附属第六人民医院神经内科; 出处《神经解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期477-481,共5页; 文摘目的:探讨在匹罗卡品致痫的癫痫持续状态(Status epilepticus,SE)大鼠模型中,Bcl-2-相互作用细胞死亡介导因子(Bim)与Caspase-3在大鼠海马组织中的表达。方法:雄性成年Sprague-Dawley(SD)大鼠,应用匹罗卡品产生SE 60 min后终止发作,24 h后取材,行HE染色及TUNEL染色,观察海马神经元的损伤及凋亡情况,Western Blot测定海马组织中Bim的表达,免疫组化检测Caspase-3的表达。采用Pearson相关分析法分析Bim与Caspase-3表达的相关性。结果:SE后24 h,海马组织HE染色见神经元数量减少,TUNEL染色阳性细胞数明显增加,Western Blot中Bim出现相对分子量26kD的条带,免疫组化染色可见大量Caspase-3阳性神经元。结论:大鼠SE后24 h,Bim与Caspase-3在海马组织神经元表达增加,且二者的表达呈正相关(r=0.901,P=0.001),海马神经元出现凋亡。; 关键词癫痫持续状态 Bcl-2相互作用细胞死亡介导因子(Bim) CASPASE-3 细胞凋亡; Keywords status epileptieus Bcl-2-interacting mediator of cell death （Bim） Caspase-3 apoptosis; 分类号 R742.1 [医药卫生—神经病学与精神病学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	敲低造血前B细胞白血病转录因子相互作用蛋白对胰腺癌细胞增殖、周期和凋亡的影响	赵一鸣杨刚由磊胡亚赵玉沛	《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心	2020	4	在线阅读下载PDF 职称材料
2	DeepCKI:一个基于变分图自编码器预测细胞-细胞因子相互作用的生物信息学模型	朱渊何瑞瑞刘源朱华庆李栋	《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心	2022	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	禽致病性大肠杆菌hcp2a基因对雏鸡脾脏细胞因子-细胞因子受体相互作用通路的影响	何琪孙晨晨侯曼曼肖福泉龚柳菲黄燕段少仪祁克宗宋祥军	《江苏农业学报》 CSCD 北大核心	2022	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	IL-35在类风湿关节炎中的研究进展	姜申易鲁静	《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2015	4	在线阅读下载PDF 职称材料
5	癫痫持续状态大鼠海马Bim与Caspase-3的表达	肖品品耿直	《神经解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2014	3	在线阅读下载PDF 职称材料