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题名一种土壤微生物总DNA的高效提取方法
被引量:29
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作者
黄婷婷
曹慧
王兴祥
崔中利
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机构
南京农业大学农业部环境微生物工程重点开放实验室
中国科学院南京土壤研究所
中国科学院南京土壤研究所南京
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出处
《土壤》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第6期662-666,共5页
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基金
国家自然科学基金项目(40371069)
中国博士后科学基金项目(2003033495)
中国科学院创新项目( KZCX3-SW-417)资助。
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文摘
获得高浓度、大片段、多样性程度高的土壤微生物总DNA 是研究土壤微生物群落结构的分子生态学基础。本文采用间接法(菌体细胞回收法)提取红壤地区两种土壤类型的土壤微生物总DNA,定量计算其回收率,并与直接法(细胞原位裂解法)比较了提取效率和纯度。结果表明:红壤地区2种土壤每克干土的总DNA提取量,间接法约为0.34和0.53礸/g干土,直接法约为13.62和24.32礸/g干土;间接法的提取效率低于直接法,但所得DNA片段较大,且Sau 3AⅠ 酶切和16 S rDNA通用引物PCR扩增结果显示,间接法比直接法更能有效地去除土壤中的某些抑制剂,所得总DNA的纯度更高,有利于后续操作。
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关键词
土壤微生物
总DNA提取
细胞回收
粗DNA纯化
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Keywords
Soil microorganism, DNA extraction, Cell re covery method, Crude DNA purification
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分类号
S154
[农业科学—土壤学]
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