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题名山羊EDNRA基因编码区克隆与组织表达规律分析
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作者
王梦
周靖宣
占思远
王林杰
李利
张红平
仲涛
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机构
四川农业大学动物科技学院/畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室
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出处
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2019年第6期852-859,共8页
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基金
国家重点研发计划项目(2018YFD0502002)
国家自然科学基金地区科学基金项目(31860623)
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文摘
【目的】旨在探究EDNRA基因在山羊心脏、肝、脾、肺、肾、大脑、网膜脂肪组织中的表达情况。【方法】采用克隆、测序的方法得到山羊EDNRA基因CDS全长的碱基序列,用生物信息学软件进行序列分析、亲水性/疏水性分析、潜在的信号肽位点分析、亚细胞定位分析、蛋白质的二级结构和三级结构预测及系统进化树分析,最后采用实时荧光定量PCR(qPCR)测定EDNRA基因在山羊心脏、肝、脾、肺、肾、大脑、网膜脂肪组织中mRNA的表达量。【结果】成功克隆了EDNRA的CDS序列,得到山羊EDNRA基因包含一个1 284 bp的最长开放阅读框。该序列编码427个氨基酸,含信号肽序列(第1到第20位氨基酸)以及7型跨膜受体同系物结构域。基因编码产物具有疏水性,属分泌蛋白,有35个磷酸化修饰位点。二级结构主要为α-螺旋。系统进化树分析表明,山羊EDNRA基因和绵羊、牛以及野牛的亲缘关系较近。qPCR结果表明,山羊EDNRA基因在心脏中的表达量最高,在肝、脾、肾、大脑、网膜组织中的表达量较低,而在肺中表达最少。【结论】EDNRA可能在心脏行使功能过程中发挥重要作用。
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关键词
EDNRA基因
CDS区序列分析
蛋白结构预测
组织表达规律
山羊
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Keywords
EDNRA gene
CDS sequence analysis
protein structure prediction
patterns of tissue expression
goat
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分类号
S811.5
[农业科学—畜牧学]
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题名高低脂肉鸡中与腹脂沉积相关基因的差异表达
被引量:1
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作者
王琪
田晨映
张细权
罗庆斌
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机构
华南农业大学动物科学学院
广东省农业动物基因组学和分子育种重点实验室
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出处
《中国家禽》
北大核心
2019年第7期6-10,共5页
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基金
广州市科技计划项目(201804020088
201810564454)
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文摘
试验以腹脂率(腹脂率=腹脂重/活重×100%)为标准选择两尾个体,分为高脂组(H)和低脂组(L),每组各6只,利用qRT-PCR的方法分析了与腹脂沉积相关的基因在鸡不同组织中的mRNA表达量。结果表明:LPIN1、ABHD5、ADORA1、ACBD5在肉鸡腹脂中高脂组的表达量低于低脂组,而DHCR24、SQLE在肉鸡腹脂中高脂组的表达量高于低脂组,且均差异显著,结果提示这些基因可能是影响肉鸡腹脂沉积的潜在分子标记。
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关键词
肉鸡
脂肪沉积
脂肪代谢
组织表达规律
分子标记
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Keywords
broiler
fat deposition
fat metabolism
tissue expression pattern
molecular marker
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分类号
S831.2
[农业科学—畜牧学]
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