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烤烟品种中川208和CV87根际细菌群落分析
1
作者
耿锐梅
赵清海
+9 位作者
曹长代
李峰
王大海
贺鹏霖
刘洋
李军民
徐蕊
宋志美
胡海洲
张玉
《浙江农业学报》
北大核心
2025年第7期1512-1520,共9页
根际微生物易受到植物生长时期和基因型的影响。为探究不同烤烟品种根际细菌菌群的差异及其相互作用,以烤烟品种中川208和CV87为对象,基于16S rRNA测序技术获得根际细菌菌群序列,利用多样性分析、组成型分析等方法,对不同生长时期两个...
根际微生物易受到植物生长时期和基因型的影响。为探究不同烤烟品种根际细菌菌群的差异及其相互作用,以烤烟品种中川208和CV87为对象,基于16S rRNA测序技术获得根际细菌菌群序列,利用多样性分析、组成型分析等方法,对不同生长时期两个品种的烟草根际细菌菌群进行详细比较与分析。研究发现,基因型和生育期影响根际细菌的群落结构和细菌间的相互关系。中川208的根际细菌群落多样性在初花期最高,而CV87是在成熟期最高。中川208和CV87的根际细菌物种间分别有435和282个edge(即相关性数据),说明中川208根际细菌的类群及其物种间的互作较CV87更加丰富和复杂。在中川208的团棵期、旺长期,固氮弧菌属(Azoarcus)的丰度较高,有助于中川208更有效地获取氮素。在CV87的根际细菌中,Ramlibacter在这两个生长期也显示出较高的丰度,可激活CV87植株的抗氧化系统,增强植株对病害的抵抗力。研究结果可为深入理解烟草根际微生物的组成和进一步深入揭示烟草根际微生物的互作机制提供基础数据和理论参考。
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关键词
烤烟
根际微生物
多样性
分析
组成型分析
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职称材料
水稻典型品种日本晴和IR24根系微生物组的解析
被引量：
10
2
作者
胡雅丽
戴睿
+5 位作者
刘永鑫
张婧赢
胡斌
储成才
袁怀波
白洋
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期506-518,共13页
植物的各项生命活动与其根系微生物组密不可分,且根系微生物组的组成易受到植物生长环境和基因型的影响。为进一步探究中国北方地区种植的不同品种水稻根系微生物组的差异及其相互作用机制,本研究以种植于北京昌平和上庄农场的水稻典型...
植物的各项生命活动与其根系微生物组密不可分,且根系微生物组的组成易受到植物生长环境和基因型的影响。为进一步探究中国北方地区种植的不同品种水稻根系微生物组的差异及其相互作用机制,本研究以种植于北京昌平和上庄农场的水稻典型品种日本晴(Nipponbare)和IR24为研究对象,基于16S rRNA基因扩增子测序技术获得根系微生物组序列,利用多样性分析、组成型分析、机器学习的随机森林和网络分析等方法,对旺盛生长期的两种不同品种的水稻根系微生物组进行详细比较。研究发现,种植地点和水稻基因型显著影响了水稻根系微生物组的群落结构,不同基因型导致了根系微生物组在物种分类组成上以及细菌间相互关系的差异,而且根系微生物组能作为生物标记跨地点区分宿主的基因型。本研究结果为深入理解我国北方种植的水稻根系微生物组的组成规律以及从根系微生物与植物互作的角度对品种进行改良提供了数据和理论基础。
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关键词
水稻根系生物组
多样性
分析
组成型分析
机器学习
网络
分析
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职称材料
题名
烤烟品种中川208和CV87根际细菌群落分析
1
作者
耿锐梅
赵清海
曹长代
李峰
王大海
贺鹏霖
刘洋
李军民
徐蕊
宋志美
胡海洲
张玉
机构
中国农业科学院烟草研究所
山东日照烟草有限公司
山东潍坊烟草有限公司
山东临沂烟草有限公司
青岛中烟种子有限责任公司
出处
《浙江农业学报》
北大核心
2025年第7期1512-1520,共9页
基金
中国烟草总公司“揭榜挂帅”项目(110202103014)
中国烟草总公司山东省公司重点项目(202207)
+1 种基金
青岛中烟种子有限责任公司研发项目(ycskY202212102-c1)
中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-TRIC01)。
文摘
根际微生物易受到植物生长时期和基因型的影响。为探究不同烤烟品种根际细菌菌群的差异及其相互作用,以烤烟品种中川208和CV87为对象,基于16S rRNA测序技术获得根际细菌菌群序列,利用多样性分析、组成型分析等方法,对不同生长时期两个品种的烟草根际细菌菌群进行详细比较与分析。研究发现,基因型和生育期影响根际细菌的群落结构和细菌间的相互关系。中川208的根际细菌群落多样性在初花期最高,而CV87是在成熟期最高。中川208和CV87的根际细菌物种间分别有435和282个edge(即相关性数据),说明中川208根际细菌的类群及其物种间的互作较CV87更加丰富和复杂。在中川208的团棵期、旺长期,固氮弧菌属(Azoarcus)的丰度较高,有助于中川208更有效地获取氮素。在CV87的根际细菌中,Ramlibacter在这两个生长期也显示出较高的丰度,可激活CV87植株的抗氧化系统,增强植株对病害的抵抗力。研究结果可为深入理解烟草根际微生物的组成和进一步深入揭示烟草根际微生物的互作机制提供基础数据和理论参考。
关键词
烤烟
根际微生物
多样性
分析
组成型分析
Keywords
flue-cured tobacco
rhizosphere microbiome
diversity analysis
taxonomic composition
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
水稻典型品种日本晴和IR24根系微生物组的解析
被引量：
10
2
作者
胡雅丽
戴睿
刘永鑫
张婧赢
胡斌
储成才
袁怀波
白洋
机构
合肥工业大学
中国科学院遗传与发育生物学研究所
中国科学院大学
中国科学院遗传与发育生物学研究所
中国科学院大学现代农学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期506-518,共13页
基金
中国科学院前沿科学重点研究项目(编号:QYZDB-SSW-SMC021)
国家自然科学基金面上项目(编号:31772400)资助。
文摘
植物的各项生命活动与其根系微生物组密不可分,且根系微生物组的组成易受到植物生长环境和基因型的影响。为进一步探究中国北方地区种植的不同品种水稻根系微生物组的差异及其相互作用机制,本研究以种植于北京昌平和上庄农场的水稻典型品种日本晴(Nipponbare)和IR24为研究对象,基于16S rRNA基因扩增子测序技术获得根系微生物组序列,利用多样性分析、组成型分析、机器学习的随机森林和网络分析等方法,对旺盛生长期的两种不同品种的水稻根系微生物组进行详细比较。研究发现,种植地点和水稻基因型显著影响了水稻根系微生物组的群落结构,不同基因型导致了根系微生物组在物种分类组成上以及细菌间相互关系的差异,而且根系微生物组能作为生物标记跨地点区分宿主的基因型。本研究结果为深入理解我国北方种植的水稻根系微生物组的组成规律以及从根系微生物与植物互作的角度对品种进行改良提供了数据和理论基础。
关键词
水稻根系生物组
多样性
分析
组成型分析
机器学习
网络
分析
Keywords
rice root microbiota
diversity analysis
taxonomic composition
machine learning
network analysis
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
烤烟品种中川208和CV87根际细菌群落分析
耿锐梅
赵清海
曹长代
李峰
王大海
贺鹏霖
刘洋
李军民
徐蕊
宋志美
胡海洲
张玉
《浙江农业学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
水稻典型品种日本晴和IR24根系微生物组的解析
胡雅丽
戴睿
刘永鑫
张婧赢
胡斌
储成才
袁怀波
白洋
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020
10
在线阅读
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职称材料
已选择
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