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利用线粒体DNA控制区部分序列分析不同地理群体大泷六线鱼遗传多样性 被引量:12
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作者 李莹 王伟 +1 位作者 孟凡平 李占东 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期40-46,共7页
利用PCR技术扩增了6个野生地理群体大泷六线鱼(Hexagrammos otakii)线粒体DNA控制区的部分序列,共获得352bp碱基序列,31尾个体定义了22种单倍型。中性检验Fu′s Fs值为-0.14881(P<0.01)。分子变异分析(AMOVA)结果显示:遗传分化指数Fs... 利用PCR技术扩增了6个野生地理群体大泷六线鱼(Hexagrammos otakii)线粒体DNA控制区的部分序列,共获得352bp碱基序列,31尾个体定义了22种单倍型。中性检验Fu′s Fs值为-0.14881(P<0.01)。分子变异分析(AMOVA)结果显示:遗传分化指数Fst=0.7398(P<0.01),73.98%的变异来自群体间,26.02%的变异来自群体内。根据不同个体间的遗传距离构建了NJ和MP系统树,两种方法获得了相似的进化树。其中青岛群体与旅顺群体的一部分个体单独成支,其它群体聚为1支。研究结果表明,大泷六线鱼群体遗传多样性较为丰富,群体间发生了较大的遗传分化,证明线粒体DNA控制区基因可用于大泷六线鱼群体内及群体间遗传多样性的分析。 展开更多
关键词 大泷六线鱼(Hexagrammos otakii) 野生地理群体 线粒体dna控制区部分序列 遗传多样性
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人癌细胞线粒体DNA控制区序列特征分析 被引量:14
2
作者 胡义德 钱桂生 +2 位作者 李淑平 陈维中 毛宝龄 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1999年第4期1-5,共5页
为了探讨癌细胞 mt D N A 控制区序列的变化特征, 采用 P C R 产物限制性片段长度多态性( P C R- R F L P) 分析与直接测序相结合的方法, 对比分析6 株人癌细胞系、6 例癌患者及4 例健康成人白细胞mt D N ... 为了探讨癌细胞 mt D N A 控制区序列的变化特征, 采用 P C R 产物限制性片段长度多态性( P C R- R F L P) 分析与直接测序相结合的方法, 对比分析6 株人癌细胞系、6 例癌患者及4 例健康成人白细胞mt D N A 控制区序列。发现第16519 位 T→ C、16 534 位 A→ G、46 位 T→ G 和49 位 A→ C 突变,在癌细胞系和癌患者白细胞mt D N A 中分别占50 % (3/6) 和333 % (2/6) , 健康成人白细胞mt D N A 中未见此类型突变; 第16 278 位 C→ T 突变, 在癌细胞系 mt D N A 中占50 % (3/6) , 显著高于正常人群mt D N A 中此位点的多态性变异。表明癌细胞和癌患者白细胞 mt D N A 重链复制起点及其 相邻 D 环区的特征性突变可能与细胞癌变/ 或癌的易感性有关。 展开更多
关键词 人癌细胞系 线粒体dna 控制区 核苷酸序列 突变
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中国近海黑鲷线粒体DNA控制区序列多态性分析 被引量:9
3
作者 龚金波 苏天凤 +2 位作者 夏军红 龚世园 江世贵 《南方水产》 2006年第4期24-30,共7页
采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序的方法,测定了广西北海、广东深圳和山东青岛3个地理群体共72尾黑鲷(Acanthopagrusschlegeli)线粒体Dloop第一高变区5′端547~549bp序列,以探讨黑鲷种群的遗传变异。分析结果表明:72条序列T、C、A、G... 采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序的方法,测定了广西北海、广东深圳和山东青岛3个地理群体共72尾黑鲷(Acanthopagrusschlegeli)线粒体Dloop第一高变区5′端547~549bp序列,以探讨黑鲷种群的遗传变异。分析结果表明:72条序列T、C、A、G4种核苷酸的平均含量分别为30.8%、21.8%、36.3%、11.0%。共检测到55个变异位点,其中转换位点32个,颠换位点19个,缺失/颠换位点1个,插入/颠换位点3个。72个个体具有51种单倍型(haplotype),单倍型比率为70.8%,黑鲷线粒体Dloop控制区表现出较为丰富的核苷酸多态性。对其所有单倍型依据序列距离使用NJ法构建的亲缘关系树并无明显的系谱分支,没有显示出明显的地理分布族群,说明黑鲷线粒体DNA控制区第一高变区序列无法用于黑鲷种群的鉴别。 展开更多
关键词 黑鲷 dna序列 线粒体控制区 多态性
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长薄鳅(Leptobotia elongata)线粒体DNA控制区遗传多样性研究 被引量:14
4
作者 赵刚 周剑 +4 位作者 杜军 刘光迅 陈先均 朱健 李建林 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2010年第3期930-937,共8页
对采自泸州(长江干流)、南溪(长江干流)、柏溪(金沙江段)、攀枝花(雅砻江段)、重庆(嘉陵江段)4个流域的45尾长薄鳅(Leptobotia elongata)的线粒体DNA控制区部分序列(798 bp)进行了扩增,共检测出19个单倍型,未发现群体间... 对采自泸州(长江干流)、南溪(长江干流)、柏溪(金沙江段)、攀枝花(雅砻江段)、重庆(嘉陵江段)4个流域的45尾长薄鳅(Leptobotia elongata)的线粒体DNA控制区部分序列(798 bp)进行了扩增,共检测出19个单倍型,未发现群体间有共享的单倍型,5群体单倍型多样性在0.833~1.000之间,显示不同流域的长薄鳅群体单倍型类型较为丰富。分析了D-Loop的碱基组成、变异情况和核苷酸序列差异,计算了核苷酸多样性(π)、单倍型多样性(h)、FST值和基因流数值(Nm),构建了长薄鳅不同单倍型分子系统树和中间网络图。5个群体内各序列核苷酸多样性指数(π)在0.276%~0.905%之间;群体间遗传距离范围为0.0028~0.0092,结果显示长薄鳅自然群体存在较丰富的线粒体控制区序列多态性(h=0.916,π=0.00450),Tajima’s D统计(?2.09890)和Fu’sFs统计(?7.56940)分析都显示各种群之间差异显著(P〈0.05),但FST值(FST〈0.05)的分析结果显示重庆、柏溪、南溪、攀枝花和泸洲种群间没有明显的遗传分化,暗示了柏溪和攀枝花种群历史上,可能发生过群体扩张和种群瓶颈,而泸州、南溪和重庆种群一直是平衡种群。Nm值计算结果显示各地理种群间无明显基因交流,暗示了长薄鳅虽然在各条不同的河流里洄游产卵,但并未因此而产生独立分化的群体。所有群体中,泸洲和攀枝花种群的遗传多样性比重庆、柏溪和南溪种群丰富。进行长薄鳅人工繁殖时,可以将遗传多样性较丰富地区的个体补充到人工繁殖中来,以提高长薄鳅的遗传素质,为人工增殖放流提供遗传多样性更丰富的个体。 展开更多
关键词 长薄鳅 线粒体dna 控制区序列 种群遗传结构 遗传多样性
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基于线粒体COⅠ基因和控制区序列的辽宁沿海弯棘斜棘鳂群体遗传多样性和遗传结构分析 被引量:2
5
作者 李玉龙 刘修泽 +3 位作者 于旭光 李轶平 付杰 董婧 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期581-588,共8页
为研究辽宁沿海弯棘斜棘逐(Repomucenus curvicornis)自然群体的遗传多样性及遗传结构,采用PCR扩增获得辽宁沿海弯棘斜棘逐辽东湾群体(n=22)及黄海北部群体(n=18)线粒体的COⅠ及控制区(CR)部分DNA序列片段,进行序列比较及遗传多样性分... 为研究辽宁沿海弯棘斜棘逐(Repomucenus curvicornis)自然群体的遗传多样性及遗传结构,采用PCR扩增获得辽宁沿海弯棘斜棘逐辽东湾群体(n=22)及黄海北部群体(n=18)线粒体的COⅠ及控制区(CR)部分DNA序列片段,进行序列比较及遗传多样性分析。获得弯棘斜棘逐COⅠ基因片段624 bp,其A、T、C、G平均含量分别为24.09%、31.04%、25.28%和19.59%;CR片段460 bp,其A、T、C、G平均含量分别为32.96%、32.80%、14.86%和19.38%。基于COⅠ基因和CR序列得到的两群体变异位点数、平均核苷酸差异数、单倍型多样性指数以及核苷酸多样性指数分别为:38、4.67、0.96±0.02和0.0075±0.0042;26、3.35、0.97±0.02和0.0073±0.0043。序列分析结果均显示,辽东湾群体的遗传多样性低于黄海北部群体。分子方差(AMOVA)分析结果显示,基于COⅠ基因片段辽东湾与黄海北部群体间无明显遗传分化(F_(st)=0.0091,P=0.25)而基于CR序列两群体间具有较小但接近显著的遗传分化(F_(st)=0.0264,P=0.09)。研究表明,线粒体CR序列与COⅠ基因均可作为检测弯棘斜棘逐群体遗传多样性的有效分子标记,但CR序列遗传分化的敏感度要高于COⅠ基因,更适合作为弯棘斜棘逐群体遗传研究的分子标记。 展开更多
关键词 弯棘斜棘逐 线粒体dna COⅠ基因 控制区序列 遗传多样性 遗传分化
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云南猕猴mtDNA控制区全序列测定
6
作者 禹文海 黄芬 +6 位作者 杨凤梅 鲁帅尧 赵远 沈冬 王俊斌 陈丽雄 和占龙 《中国比较医学杂志》 CAS 2011年第12期42-45,共4页
目的测定云南猕猴线粒体DNA控制区全序列,对其进行鉴定及进化分析。方法利用PCR技术扩增猕猴线粒体DNA控制区全序列,结合GenBank中下载的猕猴参考序列(AY612638),采用多个生物学软件对序列碱基组成、同源性、转换/颠换比等遗传信息进行... 目的测定云南猕猴线粒体DNA控制区全序列,对其进行鉴定及进化分析。方法利用PCR技术扩增猕猴线粒体DNA控制区全序列,结合GenBank中下载的猕猴参考序列(AY612638),采用多个生物学软件对序列碱基组成、同源性、转换/颠换比等遗传信息进行分析,并基于邻接法(NJ)和最小进化法(ME)构建系统进化树。结果云南猕猴线粒体DNA控制区全长为(1 084~1 089)bp,A、T、G和C四种碱基平均含量分别为29.9%、26.9%、12.3%和30.9%,A+T含量(56.8%)高于G+C含量(43.2%)。所分析序列间的同源性为91.5%~99.5%,平均核苷酸变异率为4.5%,变异类型包括转换、颠换、插入和缺失4种形式,转换/颠换比值平均为26.1。进化树显示云南猕猴存在两个平行进化的姐妹分支。结论本研究获得了云南猕猴mtDNA控制区全序列,为猕猴进化关系研究及mtDNA控制区功能研究奠定基础。 展开更多
关键词 猕猴 线粒体dna 控制区 序列
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线粒体控制区在鱼类种内遗传分化中的意义 被引量:30
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作者 谢振宇 杜继曾 +2 位作者 陈学群 WANG Yu-Xiang Brent W Murray 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期362-368,共7页
线粒体DNA(mtDNA)作为分子标记已被广泛应用于各物种系统发生的研究。mtDNA控制区序列(D-loop)以其较高的突变积累对于研究物种种内的遗传分化具有重要价值。鱼类是脊椎动物中最原始但在种属数量上又最占优势的类群,其物种繁多,分布广泛... 线粒体DNA(mtDNA)作为分子标记已被广泛应用于各物种系统发生的研究。mtDNA控制区序列(D-loop)以其较高的突变积累对于研究物种种内的遗传分化具有重要价值。鱼类是脊椎动物中最原始但在种属数量上又最占优势的类群,其物种繁多,分布广泛,起源复杂,研究其系统发生历来是令人饶有兴趣的课题。D-loop在研究鱼类种内遗传分化中具有多方面的重要意义。近年来,已有越来越多的研究工作将D-loop作为分子标记来探讨各种鱼类的种内遗传分化,并且获得了许多有启发性的结果。青海湖是我国内陆最大的咸水湖,湖中主要鱼类为青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii),D-loop分析初步结果显示青海湖及其周围河流中的裸鲤似乎没有新的种内遗传分化现象。 展开更多
关键词 线粒体dna控制区序列 鱼类 种内遗传分化 青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)
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辽宁沿海鲬mtDNA控制区结构和遗传多样性分析 被引量:4
8
作者 李玉龙 刘修泽 +6 位作者 吉光 于旭光 李轶平 付杰 王小林 郭栋 董婧 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期818-824,共7页
用PCR扩增直接测序的方法,获得辽宁沿海25尾鲬线粒体DNA控制区基因的876~878bp全序列。通过GenBank中已有的鲬属鱼类控制区同源序列比对及形态特征分析发现,辽宁沿海鲬实为褐斑鲬而非印度鲬。同时,利用高度变异的控制区序列,对辽宁沿海... 用PCR扩增直接测序的方法,获得辽宁沿海25尾鲬线粒体DNA控制区基因的876~878bp全序列。通过GenBank中已有的鲬属鱼类控制区同源序列比对及形态特征分析发现,辽宁沿海鲬实为褐斑鲬而非印度鲬。同时,利用高度变异的控制区序列,对辽宁沿海褐斑鲬进行序列多态性分析和遗传多样性分析。结果显示,25尾褐斑鲬间共有22个变异位点,辽宁沿海褐斑鲬群体的遗传多样性处于中等偏低水平,单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0.92±0.04和0.0026±0.0017。核苷酸不配对分析表明,辽宁沿海褐斑鲬群体在19 000~63 000年前经历了群体扩张。对比其他已报道鱼类控制区的结构识别序列,对鲬属鱼类控制区的结构进行分析,识别了终止序列区、中央保守区和保守序列区,并找到DNA复制终止相关的序列ETAS,中央保守区的保守序列CSB-F、CSB-E、CSB-D以及保守序列区的保守序列CSB1、CSB2、CSB3。这一结果可为将来全面了解鲬的种群分化研究及其物种资源保护提供基础资料。 展开更多
关键词 褐斑鲬 线粒体dna控制区序列 结构 遗传多样性
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三倍体湘云鲫线粒体DNA序列变异性分析(英文) 被引量:1
9
作者 郭新红 刘少军 +1 位作者 向兵 刘筠 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期855-862,共8页
对26尾三倍体湘云鲫的线粒体tRNA-Thr基因、tRNA-Pro基因和部分控制区的核苷酸序列进行了测定,获得26条长度为837—839 bp的同源基因序列,共发现65个多态性核苷酸变异位点,多态位点比例为0.077,定义了8种单元型。在湘云鲫8种单元型中确... 对26尾三倍体湘云鲫的线粒体tRNA-Thr基因、tRNA-Pro基因和部分控制区的核苷酸序列进行了测定,获得26条长度为837—839 bp的同源基因序列,共发现65个多态性核苷酸变异位点,多态位点比例为0.077,定义了8种单元型。在湘云鲫8种单元型中确认了DNA复制终止相关的序列TAS、中央保守区序列(CSB-F、CSB-E和CSB-D)和保守序列CSB1,8种单元型含有3—5个TAS序列。在65个变异位点中,大部分序列变异为转换,8种单元型之间的序列差异在0.1%—6.3%之间。该研究为三倍体湘云鲫的繁殖和遗传改良提供了一些有价值的信息。 展开更多
关键词 三倍体湘云鲫 线粒体dna 控制区 序列变异
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基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的高邮湖湖鲚(Coilia nasus)遗传多样性分析 被引量:15
10
作者 李大命 张彤晴 +4 位作者 关浩勇 唐晟凯 刘燕山 刘小维 潘建林 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2017年第6期3-8,共6页
本研究利用线粒体细胞色素b(Cytb)基因和控制区(D-loop)序列作为分子标记,调查了高邮湖湖鲚(Coilia nasus)种群遗传多样性。结果显示,Cytb基因和D-loop区序列碱基A+T含量均高于G+C含量,显示碱基组成具有偏倚性。38条Cytb基因序列检出26... 本研究利用线粒体细胞色素b(Cytb)基因和控制区(D-loop)序列作为分子标记,调查了高邮湖湖鲚(Coilia nasus)种群遗传多样性。结果显示,Cytb基因和D-loop区序列碱基A+T含量均高于G+C含量,显示碱基组成具有偏倚性。38条Cytb基因序列检出26个变异位点,定义13个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.716±0.078和0.002 70±0.000 57;40条D-loop区序列检出53个变异位点,定义21个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.906±0.034和0.006 27±0.000 99。13个Cytb基因单倍型之间的遗传距离在0.001~0.014之间,NJ系统进化树显示单倍型聚为1支;21个D-loop区单倍型之间的遗传距离在0.001~0.019之间,NJ系统进化树显示单倍型聚为2支。中性检测结果和歧点分布图均表明高邮湖湖鲚种群稳定,近期没有发生种群扩张。整体来看,高邮湖湖鲚种质资源遗传多样性水平较高,具有高单倍型多样性和低核苷酸多样性的特征。 展开更多
关键词 湖鲚(Coilia nasus) 遗传多样性 线粒体dna 细胞色素B基因 控制区序列
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基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的洪泽湖湖鲚遗传多样性分析 被引量:11
11
作者 李大命 张彤晴 +5 位作者 唐晟凯 关浩勇 刘燕山 穆欢 黄越峰 潘建林 《江苏农业科学》 2018年第20期36-39,共4页
利用线粒体细胞色素b(cytochrome b,简称Cytb)基因和控制区(D-loop)序列作为分子标记,调查洪泽湖湖鲚的遗传多样性。结果表明,Cytb基因和D-loop区序列碱基A+T含量均高于G+C含量,显示碱基组成具有偏倚性。40条Cytb基因序列检出14个变异位... 利用线粒体细胞色素b(cytochrome b,简称Cytb)基因和控制区(D-loop)序列作为分子标记,调查洪泽湖湖鲚的遗传多样性。结果表明,Cytb基因和D-loop区序列碱基A+T含量均高于G+C含量,显示碱基组成具有偏倚性。40条Cytb基因序列检出14个变异位点,定义13个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0. 762±0. 067、0. 0018 2±0. 000 28,平均碱基差异数为2. 073; 40条D-loop区序列检出54个变异位点,定义17个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0. 727±0. 078、0. 006 10±0. 001 00,平均碱基差异数为7. 378。13个Cytb基因单倍型之间的遗传距离在0. 001~0. 004之间,17个D-loop区单倍型之间的遗传距离在0. 001~0. 018之间,邻接法(neighbourjoining method,简称NJ)系统进化树显示单倍型聚为1支。Cytb基因和D-loop区序列中性检测Tajima's D和Fu's F_s结果产生的D和F_s值为负值,且Cytb基因的F_s值统计结果有极显著差异(P <0. 01)。同时,Cytb基因序列的岐点分布图呈现单峰型,均表明洪泽湖湖鲚近期经历了种群扩张。整体来看,洪泽湖湖鲚资源具有较高的遗传多样性,呈现出高单倍型多样性和低核苷酸多样性的特征。 展开更多
关键词 湖鲚 遗传多样性 线粒体dna CYTB基因 控制区序列
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动物线粒体DNA的特异结构及应用分子系统学分析的方法 被引量:11
12
作者 徐其放 陈嘉昌 +3 位作者 朱世杰 申煜 刘运忠 常弘 《中国比较医学杂志》 CAS 2005年第5期315-319,共5页
动物线粒体是一种存在真核生物细胞质中的细胞器,根据已经测序的动物线粒体DNA,它可编码13种蛋白质,2种rRNA,22种tRNA,和非编码区(D-Loop),已有报道发现了新的R-Loop结构,呈现母性遗传特点,且其平均进化速度是核基因组的10倍,尤其是D-L... 动物线粒体是一种存在真核生物细胞质中的细胞器,根据已经测序的动物线粒体DNA,它可编码13种蛋白质,2种rRNA,22种tRNA,和非编码区(D-Loop),已有报道发现了新的R-Loop结构,呈现母性遗传特点,且其平均进化速度是核基因组的10倍,尤其是D-Loop区.同时在线粒体DNA控制区中发现的重复序列在种间甚至种内存在着差异可作为动物特异的分子标记。根据线粒体的结构和遗传特点,借助生物信息学手段和丰富的数据库资源,对动物种间及种内群体进行分子系统学的研究,并确定分类地位,亲缘关系。 展开更多
关键词 线粒体 控制区序列 序列分析 dna 分子系统学 生物信息学
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mtDNA基因多态性分析在母系遗传鉴定中应用的研究
13
作者 居晓斌 苏恩本 +3 位作者 陈子庆 周惠英 丁小健 顾民 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1763-1764,共2页
目的:探讨线粒体DNA中的HV1、HV2基因的序列多态性,并讨论其在母系遗传鉴定中的应用价值。方法:针对线粒体HV1、HV2基因位点采用文献报道引物,PCR扩增后应用直接测序技术研究其等位基因分布及频率。结果:一代母系遗传中可能有1~2个点突... 目的:探讨线粒体DNA中的HV1、HV2基因的序列多态性,并讨论其在母系遗传鉴定中的应用价值。方法:针对线粒体HV1、HV2基因位点采用文献报道引物,PCR扩增后应用直接测序技术研究其等位基因分布及频率。结果:一代母系遗传中可能有1~2个点突变,而非母系遗传则突变点一定大于3个。结论:对于认定2个个体是否母子(女)关系或者是否有同一个母亲的案例具有很重要的意义。 展开更多
关键词 线粒体dna 控制区 序列长度多态性 母系亲权鉴定 测序
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同域分布二倍体和四倍体泥鳅群体的遗传结构 被引量:6
14
作者 周玲玲 张桂蓉 +4 位作者 魏开建 邹桂伟 王卫民 梁宏伟 冉玮 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期624-630,共7页
采用SRAP标记和线粒体DNA控制区测序方法对武汉和洞庭湖2个二倍体和四倍体泥鳅同域分布区4个泥鳅群体的遗传结构进行研究。SRAP分析结果表明,18对多态性引物组合在4个泥鳅群体中共检测到534个位点,每对引物组合检测的位点数为23~40个;... 采用SRAP标记和线粒体DNA控制区测序方法对武汉和洞庭湖2个二倍体和四倍体泥鳅同域分布区4个泥鳅群体的遗传结构进行研究。SRAP分析结果表明,18对多态性引物组合在4个泥鳅群体中共检测到534个位点,每对引物组合检测的位点数为23~40个;各群体的Nei's基因多样性(h)和Shannon's信息指数(I)平均值分别为0.205~0.218和0.324~0.341,4个群体间的h以及I差异不明显;基于Nei's无偏遗传距离构建的UPGMA树显示,洞庭湖二倍体和四倍体泥鳅群体亲缘关系最近,先聚为一支,再与武汉四倍体泥鳅聚为一支,而武汉二倍体泥鳅聚为单独一支。测定了4个泥鳅群体40个个体线粒体DNA控制区序列片段(932~935bp),发现47个变异位点,共计29种单倍型。洞庭湖四倍体和二倍体泥鳅群体的核苷酸多样性(π)分别为0.898%和0.872%,明显大于武汉四倍体(π=0.465%)和二倍体(π=0.675%)。在同域分布二倍体和四倍体泥鳅群体中,洞庭湖四倍体遗传多样性略大于洞庭湖二倍体,武汉二倍体则明显大于武汉四倍体。AMOVA分析表明,泥鳅群体的遗传变异主要来自群体内(62.68%),群体间的变异达到37.32%;群体间成对固定指数FST及Kimura 2-parameter遗传距离均显示,洞庭湖四倍体与二倍体泥鳅群体无明显分化,其余群体间均存在显著分化。控制区序列单倍型Bayesian系统树与SRAP分析所揭示的4个泥鳅群体的亲缘关系相似。 展开更多
关键词 泥鳅 相关序列扩增多态性 线粒体dna控制区 倍性 遗传变异 单倍型
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大泷六线鱼6个野生群体遗传多样性的12S rRNA基因分析 被引量:6
15
作者 王伟 高伟峰 +2 位作者 张赛赛 董安然 姜欣彤 《水产学杂志》 CAS 2017年第5期7-12,共6页
本文利用PCR技术扩增了6个野生群体大泷六线鱼线粒体12S r RNA基因的部分序列。在获得的582bp碱基序列中,共检测到314个变异位点,占总位点数的53.95%。34尾个体共定义了16种单倍型,6个群体的单倍型多样性指数为0.40~1.00,核苷酸多样性... 本文利用PCR技术扩增了6个野生群体大泷六线鱼线粒体12S r RNA基因的部分序列。在获得的582bp碱基序列中,共检测到314个变异位点,占总位点数的53.95%。34尾个体共定义了16种单倍型,6个群体的单倍型多样性指数为0.40~1.00,核苷酸多样性指数为0.00071~0.10441。中性检验Fu's Fs值为1.19782(P<0.01)。分子变异分析表明:Fst=0.88326(P<0.01),群体间和群体内变异分别为88.33%和11.67%。不同个体间的遗传距离构建的NJ和MP系统树表明,东港和旅顺群体亲缘关系较近,构成一个分支,其他群体构成另一分支。 展开更多
关键词 大泷六线鱼 野生群体 线粒体dna 12S r RNA部分序列
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向家坝水电站阻隔背景下圆口铜鱼种群遗传结构分析 被引量:5
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作者 熊美华 闫书祥 +1 位作者 邵科 朱滨 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2014年第6期65-73,共9页
通过对向家坝坝上坝下不同地点和不同年龄的圆口铜鱼(Coreius guichenoti)样本的遗传结构进行计算和分析,从时空两个维度上评估向家坝水电站对圆口铜鱼种群所造成的影响。从10个采样点共获得254尾铜鱼,年龄分别在1-7龄,依据各年龄组... 通过对向家坝坝上坝下不同地点和不同年龄的圆口铜鱼(Coreius guichenoti)样本的遗传结构进行计算和分析,从时空两个维度上评估向家坝水电站对圆口铜鱼种群所造成的影响。从10个采样点共获得254尾铜鱼,年龄分别在1-7龄,依据各年龄组样本数,将其分为5个世代群体。用于分析的线粒体DNA控制区的片段序列为944 bp,在254个序列中,共检测出变异位点40个,单倍型62种,共享单倍型比例较高,为37.1%(23/62)。254个个体的平均单倍型多样性(Hd)和平均核苷酸多样性(π)分别为0.947 09和0.004 89,遗传多样性相对较丰富。10个地理群体间的分化指数(Fst值)、分子方差分析(AMOVA)和平均K 2-P遗传距离均表明10个圆口铜鱼地理群体间存在广泛的基因交流,未发生显著的群体遗传分化。5个世代群体的分子方差分析(AMOVA)结果显示,各世代群体间不存在显著的遗传差异。单倍型的NJ分子系统树和NETWORK网络图显示单倍型的聚类与地理分群没有相关性。结果表明,不同采样点的群体和不同世代群体间均未出现遗传分化,向家坝对圆口铜鱼种群所造成的影响在遗传结构上暂未显现出来。 展开更多
关键词 圆口铜鱼(Coreius guichenoti) 向家坝 线粒体dna 控制区序列 遗传结构
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