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题名基于线粒体COI序列的中国沿海蓝点马鲛遗传多样性
被引量：18
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作者
曹艳
章群
宫亚运
吕金磊
杨喜书
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机构
暨南大学生态系
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出处
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2015年第6期485-493,共9页
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基金
国家自然科学基金(41071034)
中央高校基本科研业务费专项资金(21613105)
欧盟Erasmus Mundus TECHNO I博士后交流项目
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文摘
为了解中国沿海蓝点马鲛(Scomberomorus niphonius)的遗传背景以更好地保护和开发利用种质资源,对分布于渤海、黄海、东海和南海海域的6个群体76 ind蓝点马鲛线粒体COI基因712 bp序列进行了测定,并结合Gen Bank中下载的9条南海蓝点马鲛序列,分析其遗传多样性、种群结构和历史动态。共检测到21个变异位点,17个单倍型,总体呈现高单倍型多样性(Hd=0.702±0.044)和低核苷酸多样性(π=0.002 8±0.000 2)的特点,其中渤海、黄海和东海海域的蓝点马鲛群体遗传多样性指数相对较高(Hd:0.695~0.816,π:0.002 7~0.003 3),而南海群体明显偏低(Hd=0.442±0.145,π=0.001 7±0.000 6),推测是由于黄海和东海是中心分布区,而南海是边缘分布区的缘故。AMOVA分析结果显示,群体间(-6.27%^-1.52%)不存在变异,群体内个体间(101.52%~106.56%)的变异是变异的主要来源;群体间遗传分化系数Fst值为-0.138~0.040(P>0.05),遗传距离N_m值为-81.145^-4.134、11.876~146.559,均大于4或小于0,表明群体间不存在遗传分化,不同海域群体间基因交流频繁,这可能与蓝点马鲛分布范围广、具长距离迁移能力、产卵和越冬时均可发生洄游以及鱼卵具漂浮性且为多次性产卵类型等原因有关。聚类分析的邻接树与单倍型网络图上出现的2个分支均在更新世晚期发生过种群快速扩张事件,但蓝点马鲛总体在数据上未呈现出种群扩张现象,可能是2个分支的叠加造成整体核苷酸不配对分析图呈现多峰分布。
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关键词
蓝点马鲛
线粒体coi序列
遗传多样性
中国沿海
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Keywords
Scomberomorus niphonius
mitochondrial coi gene
genetic diversity
coastal waters of China
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分类号
Q349
[生物学—遗传学]
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题名中国南海康氏马鲛线粒体COI序列遗传变异分析
被引量：6
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作者
曹艳
章群
宫亚运
吕金磊
杨喜书
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机构
暨南大学生态系
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出处
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期53-60,共8页
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基金
国家自然科学基金项目(41071034)
中央高校基本科研业务费专项资金项目(21613105)
欧盟Erasmus Mundus TECHNO I博士后交流项目
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文摘
在测定的采自广东饶平、阳江和广西东兴海域的62尾康氏马鲛（Scomberomorus commerson）线粒体COI基因711 bp序列中,共检测到26个变异位点,18个单倍型,总体呈现出高单倍型多样性（Hd=0.808±0.040）和低核苷酸多样性（π=0.004 0±0.000 6）的特点。邻接树上出现了3个分支,分支间Fst为0.811-0.833且P〈0.001,Nm为0.1-0.117;AMOVA分析显示分支间遗传变异占82.61%。表明3个分支间分化程度高,推测分歧时间为（89-22.67）万年前中更新世时期,可能原因是受到更新世冰期和间冰期交替的影响。但分支内与分支间都有不同地理来源的个体,没有出现明显的地理聚群;不同地理群体间Fst为-0.027-0.066,Nm均大于4或小于0;群体内个体间变异为96.34%。均表明群体间基因交流频繁,遗传分化程度并不高。3个分支中Clade A分支经历过种群快速扩张事件,可能是末次冰期期间康氏马鲛进入外海并受洋流及生存空间改变的影响。
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关键词
康氏马鲛
线粒体coi序列
遗传变异
种群结构
中国南海
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Keywords
Scomberomorus commerson
mitochondrial coi gene
genetic diversity
population structure
the South China Sea
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分类号
Q347
[生物学—遗传学]
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