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贵州本地山羊线粒体转录因子B2基因5′调控区SNP筛查与生物信息学分析
1
作者
谢海强
刘若余
+1 位作者
龚俞
焦仁刚
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014年第2期183-188,共6页
试验旨在筛选线粒体转录因子B2(mitochondrial transcription factor B2,TFB2M)基因启动子区SNP,并研究其对启动子功能元件的影响。选择贵州本地优良品种黔北麻羊、贵州白山羊及贵州黑山羊3种山羊构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点。TF...
试验旨在筛选线粒体转录因子B2(mitochondrial transcription factor B2,TFB2M)基因启动子区SNP,并研究其对启动子功能元件的影响。选择贵州本地优良品种黔北麻羊、贵州白山羊及贵州黑山羊3种山羊构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点。TFB2 M基因5′调控区存在4个SNPs位点,分别为:G-601C、C-381A、C-286T和G-283T。生物信息学软件预测得到TFB2 M基因核心启动子区和CpG岛,SNP位点导致附近大量转录因子新位点产生和原来结合位点消失,但并不改变CpG岛大小。TFB2 M基因5′调控区存在4个对启动子功能元件有较大影响的SNPs位点。本研究结果为进一步确定TFB2 M基因启动子功能奠定基础。
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关键词
线粒体转录因子b2
基因
SNP
启动子
黔北麻羊
贵州白山羊
贵州黑山羊
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职称材料
贵州白山羊线粒体转录因子B2基因在组织中的表达
2
作者
崔治龙
崔真华
+2 位作者
肖旭东
罗卫星
孙岩岩
《贵州农业科学》
CAS
2015年第9期127-129,共3页
为探明线粒体转录因子B2(TFB2 M)基因在贵州白山羊组织中的表达规律,采用实时荧光定量PCR技术测定TFB2 M基因在贵州白山羊心、肝、脾、垂体和下丘脑组织中的表达量。结果表明:目的基因TFB2 M和内参基因β-actin的熔解曲线均呈单一峰形,...
为探明线粒体转录因子B2(TFB2 M)基因在贵州白山羊组织中的表达规律,采用实时荧光定量PCR技术测定TFB2 M基因在贵州白山羊心、肝、脾、垂体和下丘脑组织中的表达量。结果表明:目的基因TFB2 M和内参基因β-actin的熔解曲线均呈单一峰形,说明所选条件可准确定量TFB2 M基因在贵州白山羊各组织中的相对表达量。TFB2 M基因在贵州白山羊心、肝、脾、垂体和下丘脑组织中的相对表达量分别为1、0.5092、3.9228、1.9138和0.6744,表现为脾>垂体>心>下丘脑>肝。
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关键词
线粒体转录因子b2
Β-ACTIN
实时荧光定量PCR
贵州白山羊
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职称材料
小尾寒羊TFB2M基因遗传变异分析
3
作者
陈晓勇
王薇
+1 位作者
敦伟涛
赵兴波
《现代畜牧兽医》
2016年第2期15-20,共6页
试验旨在分析小尾寒羊线粒体基因转录因子B2(Mitochondrial Transcription Factors B2,TFB2M)基因遗传变异,采集小尾寒羊血液,采用直接测序方法,对该基因8个外显子、5’-UTR和3’-UTR多态位点进行分析。结果发现,编码区错义突变1个(G226...
试验旨在分析小尾寒羊线粒体基因转录因子B2(Mitochondrial Transcription Factors B2,TFB2M)基因遗传变异,采集小尾寒羊血液,采用直接测序方法,对该基因8个外显子、5’-UTR和3’-UTR多态位点进行分析。结果发现,编码区错义突变1个(G226A,GCC→ACC)导致76位苏氨酸变为丙氨酸,5’-UTR发现一处颠换(C58G);3’-UTR有三个突变位点(C98G、A206G和A429T)。生物学软件对启动子和5’-UTR转录因子预测结果显示共有54个转录因子结合位点,5’-UTR 58bp处没有结合位点,因此,该突变并没有改变结合位点。本研究为绵羊TFB2M基因变异及其功能研究奠定了分子生物学基础。
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关键词
线粒体转录因子b2
小尾寒羊
变异
转录
因子
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职称材料
线粒体转录复合物相关蛋白原核表达与纯化
被引量:
1
4
作者
刘光
杨瑞锋
+1 位作者
石秉炀
刘德培
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期638-643,共6页
目的获取人线粒体转录因子A(TFAM)、线粒体转录因子B1(TFB1M)、线粒体转录因子B2(TFB2M)基因片段,高效表达和纯化带有谷胱甘肽转移酶(GST)标签的GST-TFAM、GST-TFB1M、GST-TFB2M融合蛋白。方法设计引物扩增得到TFAM、TFB1M、TFB2M的cDN...
目的获取人线粒体转录因子A(TFAM)、线粒体转录因子B1(TFB1M)、线粒体转录因子B2(TFB2M)基因片段,高效表达和纯化带有谷胱甘肽转移酶(GST)标签的GST-TFAM、GST-TFB1M、GST-TFB2M融合蛋白。方法设计引物扩增得到TFAM、TFB1M、TFB2M的cDNA片段,通过引入的酶切位点克隆至表达载体pET42a,构建重组表达载体,并导入E.coliBL21宿主菌中,异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达重组的GST融合蛋白,谷胱甘肽琼脂糖珠纯化表达产物,十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)进行分析鉴定。结果获得pET42a-TFAM、pET42a-TFB1M、pET42a-TFB2M表达质粒,测序结果与GenBank的基因序列一致。SDS-PAGE分析结果显示,重组GST-TFAM、GST-TFB1M、GST-TFB2M融合蛋白分别在相对分子质量56 000、67 000、69 000处出现特异性蛋白条带,经GST亲和层析纯化后,得到高纯度的融合蛋白。结论成功构建了基因重组体pET42a-TFAM、pET42a-TFB1M、pET42a-TFB2M,制备了GST-TFAM、GST-TFB1M、GST-TFB2M融合蛋白。
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关键词
线粒体
转录
因子
A
线粒体
转录
因子
b
1
线粒体转录因子b2
融合蛋白
纯化
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职称材料
题名
贵州本地山羊线粒体转录因子B2基因5′调控区SNP筛查与生物信息学分析
1
作者
谢海强
刘若余
龚俞
焦仁刚
机构
贵州大学动物科学学院、高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室、贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室
贵州省畜牧技术推广站
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014年第2期183-188,共6页
基金
贵州省重大科技专项计划项目(黔科合重大专项字[2011]6009号)
文摘
试验旨在筛选线粒体转录因子B2(mitochondrial transcription factor B2,TFB2M)基因启动子区SNP,并研究其对启动子功能元件的影响。选择贵州本地优良品种黔北麻羊、贵州白山羊及贵州黑山羊3种山羊构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点。TFB2 M基因5′调控区存在4个SNPs位点,分别为:G-601C、C-381A、C-286T和G-283T。生物信息学软件预测得到TFB2 M基因核心启动子区和CpG岛,SNP位点导致附近大量转录因子新位点产生和原来结合位点消失,但并不改变CpG岛大小。TFB2 M基因5′调控区存在4个对启动子功能元件有较大影响的SNPs位点。本研究结果为进一步确定TFB2 M基因启动子功能奠定基础。
关键词
线粒体转录因子b2
基因
SNP
启动子
黔北麻羊
贵州白山羊
贵州黑山羊
Keywords
TF
b
2
M gene
SNP
promoter
Qian
b
ei Ma goat
Guizhou White goat
Guizhou
b
lack goat
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
贵州白山羊线粒体转录因子B2基因在组织中的表达
2
作者
崔治龙
崔真华
肖旭东
罗卫星
孙岩岩
机构
贵州省沿河土家族自治县草地生态畜牧业发展中心
贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室
出处
《贵州农业科学》
CAS
2015年第9期127-129,共3页
基金
贵州省科技厅-铜仁市科技合作计划项目"高床漏缝式羊舍及舍饲养羊综合配套技术"(2013002)
贵州省农业科技攻关项目"贵州白山羊品系繁育及其杂交配套系关键技术研究与示范"[黔科合NY字(2012)3006]
文摘
为探明线粒体转录因子B2(TFB2 M)基因在贵州白山羊组织中的表达规律,采用实时荧光定量PCR技术测定TFB2 M基因在贵州白山羊心、肝、脾、垂体和下丘脑组织中的表达量。结果表明:目的基因TFB2 M和内参基因β-actin的熔解曲线均呈单一峰形,说明所选条件可准确定量TFB2 M基因在贵州白山羊各组织中的相对表达量。TFB2 M基因在贵州白山羊心、肝、脾、垂体和下丘脑组织中的相对表达量分别为1、0.5092、3.9228、1.9138和0.6744,表现为脾>垂体>心>下丘脑>肝。
关键词
线粒体转录因子b2
Β-ACTIN
实时荧光定量PCR
贵州白山羊
Keywords
TF
b
2
M
β-actin
real-time fluorescence quantitative PCR
Guizhou White Goat
分类号
S827 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
小尾寒羊TFB2M基因遗传变异分析
3
作者
陈晓勇
王薇
敦伟涛
赵兴波
机构
中国农业大学动物科技学院
河北省畜牧兽医研究所
出处
《现代畜牧兽医》
2016年第2期15-20,共6页
基金
转基因生物新品种培育重大专项(2014ZX08009-002)
河北省科技支撑计划项目(No.14226315D)和(No.15226308D)
文摘
试验旨在分析小尾寒羊线粒体基因转录因子B2(Mitochondrial Transcription Factors B2,TFB2M)基因遗传变异,采集小尾寒羊血液,采用直接测序方法,对该基因8个外显子、5’-UTR和3’-UTR多态位点进行分析。结果发现,编码区错义突变1个(G226A,GCC→ACC)导致76位苏氨酸变为丙氨酸,5’-UTR发现一处颠换(C58G);3’-UTR有三个突变位点(C98G、A206G和A429T)。生物学软件对启动子和5’-UTR转录因子预测结果显示共有54个转录因子结合位点,5’-UTR 58bp处没有结合位点,因此,该突变并没有改变结合位点。本研究为绵羊TFB2M基因变异及其功能研究奠定了分子生物学基础。
关键词
线粒体转录因子b2
小尾寒羊
变异
转录
因子
Keywords
TF
b
2
M
Small-tailed Han sheep
Variation
Transcription factor
分类号
S826.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
线粒体转录复合物相关蛋白原核表达与纯化
被引量:
1
4
作者
刘光
杨瑞锋
石秉炀
刘德培
机构
中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室
出处
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期638-643,共6页
基金
国家重点基础研究发展计划项目(973计划)(2011CB503902)
国家重点实验室专项经费(2060204)~~
文摘
目的获取人线粒体转录因子A(TFAM)、线粒体转录因子B1(TFB1M)、线粒体转录因子B2(TFB2M)基因片段,高效表达和纯化带有谷胱甘肽转移酶(GST)标签的GST-TFAM、GST-TFB1M、GST-TFB2M融合蛋白。方法设计引物扩增得到TFAM、TFB1M、TFB2M的cDNA片段,通过引入的酶切位点克隆至表达载体pET42a,构建重组表达载体,并导入E.coliBL21宿主菌中,异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达重组的GST融合蛋白,谷胱甘肽琼脂糖珠纯化表达产物,十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)进行分析鉴定。结果获得pET42a-TFAM、pET42a-TFB1M、pET42a-TFB2M表达质粒,测序结果与GenBank的基因序列一致。SDS-PAGE分析结果显示,重组GST-TFAM、GST-TFB1M、GST-TFB2M融合蛋白分别在相对分子质量56 000、67 000、69 000处出现特异性蛋白条带,经GST亲和层析纯化后,得到高纯度的融合蛋白。结论成功构建了基因重组体pET42a-TFAM、pET42a-TFB1M、pET42a-TFB2M,制备了GST-TFAM、GST-TFB1M、GST-TFB2M融合蛋白。
关键词
线粒体
转录
因子
A
线粒体
转录
因子
b
1
线粒体转录因子b2
融合蛋白
纯化
Keywords
mitochondrial transcription factor A
mitochondrial transcription factor
b
1
mitochondrial transcription factor
b
2
fusion protein
purification
分类号
Q782 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
贵州本地山羊线粒体转录因子B2基因5′调控区SNP筛查与生物信息学分析
谢海强
刘若余
龚俞
焦仁刚
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014
0
在线阅读
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职称材料
2
贵州白山羊线粒体转录因子B2基因在组织中的表达
崔治龙
崔真华
肖旭东
罗卫星
孙岩岩
《贵州农业科学》
CAS
2015
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
小尾寒羊TFB2M基因遗传变异分析
陈晓勇
王薇
敦伟涛
赵兴波
《现代畜牧兽医》
2016
0
在线阅读
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职称材料
4
线粒体转录复合物相关蛋白原核表达与纯化
刘光
杨瑞锋
石秉炀
刘德培
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
1
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