牦牛线粒体DNA细胞色素b基因序列测定及其起源、分类地位研究 被引量：28

1

作者 李齐发 李隐侠 +6 位作者 赵兴波 刘振山 张庆波 宋大伟 屈旭光 李宁 谢庄 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1118-1123,共6页

牦牛在牛亚科中的分类地位仍存在较大的分歧。根据普通牛线粒体基因组序列设计引物对家牦牛基因组进行PCR扩增和克隆测序，获得了家牦牛细胞色素6（Cytochromeb）基因的全长序列，并以羊亚科绵羊（Ovisaries）为外类群，对牛亚科代表性... 牦牛在牛亚科中的分类地位仍存在较大的分歧。根据普通牛线粒体基因组序列设计引物对家牦牛基因组进行PCR扩增和克隆测序，获得了家牦牛细胞色素6（Cytochromeb）基因的全长序列，并以羊亚科绵羊（Ovisaries）为外类群，对牛亚科代表性物种进行了系统发育分析。结果显示：牛亚科不同物种间线粒体细胞色素b基因的转换／颠换比值为4．9，突变未达到饱和状态；牦牛与牛属间的序列差异百分比为8．0％～8．6％，大于牦牛与美洲野牛间的序列差异百分比；系统发育分析发现家牦牛与野牦牛首先聚为一类，再与美洲野牛聚为一类；说明牦牛与美洲牦牛属间的遗传相似性较高，而与牛属间的遗传相似性较低，结果支持现在的家牦牛和野牦牛都是同一祖先原始牦牛的后代，推测两者分化时间大约为0．55百万年前；支持将牦牛划分为牛亚科牦牛属的观点，牦牛属包括家牦牛和野牦牛两个种。 展开更多

关键词 牛亚科 牦牛 线粒体 细胞色素b基因 起源 分类地位

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于线粒体细胞色素b基因片段序列变异探讨3种鲳属鱼类系统进化 被引量：11

2

作者 马春艳 赵峰 +3 位作者 孟彦羽 施兆鸿 庄平 赵云龙 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2009年第5期20-26,共7页

对鲳属3种鱼类共19个个体的细胞色素b(Cytb)基因进行PCR扩增,经比对校正得到1123bp的基因片段,共检测到141个变异位点,总变异为12.56%,5个简约信息位点,未出现插入和(或)缺失,序列中转换(Transition)明显多于颠换(Transversion)。鲳属3... 对鲳属3种鱼类共19个个体的细胞色素b(Cytb)基因进行PCR扩增,经比对校正得到1123bp的基因片段,共检测到141个变异位点,总变异为12.56%,5个简约信息位点,未出现插入和(或)缺失,序列中转换(Transition)明显多于颠换(Transversion)。鲳属3种鱼类19个序列共检测到11种单倍型,其T、C、A和G平均含量分别为29.1%、30.5%、27.4%和13.0%。(A+T)%为56.5%,大于(G+C)43.5%。结合来自GenBank中的鲳科的中间低鳍鲳Peprilus medius和星斑真鲳Stromateus stellatus的相应同源序列,并以长鲳科的刺鲳Psenopsis anomala作为外群,构建系统进化树。结果显示,翎鲳和中国鲳亲缘关系较近,二者与银鲳亲缘关系较远,同为鲳科的鱼类聚类后再与作为外群的刺鲳相聚。系统进化树显示,银鲳为3种鲳属鱼类中较早分化出的种,刺鲳位于进化树的基部,是较鲳属鱼类更为原始的类群,与形态分析结果一致。 展开更多

关键词 线粒体DNA 细胞色素b 鲳属 系统进化

在线阅读 下载PDF 职称材料

4个绵羊品种线粒体细胞色素b基因的序列差异和系统进化研究 被引量：27

3

作者 张传生 耿立英 +2 位作者 万海伟 李吉涛 杜立新 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期313-317,共5页

测定了小尾寒羊、大尾寒羊、洼地绵羊、滩羊和鲁北白山羊5个品种羊415bp线粒体DNA细胞色素b基因片段,其中44个位点检出变异。分析其碱基组成和变异情况,并以鲁北白山羊为外群,用UPGMA和NJ法构建了一系列分子系统树,得到相同的拓扑结构,... 测定了小尾寒羊、大尾寒羊、洼地绵羊、滩羊和鲁北白山羊5个品种羊415bp线粒体DNA细胞色素b基因片段,其中44个位点检出变异。分析其碱基组成和变异情况,并以鲁北白山羊为外群,用UPGMA和NJ法构建了一系列分子系统树,得到相同的拓扑结构,在分子水平从母系遗传的角度澄清4个绵羊品种的起源分化关系。结果显示:在4个绵羊品种之间,洼地绵羊与滩羊关系最近与小尾寒羊亲缘关系最远。绵羊品种内的平均差异为0185%,线粒体DNA多态性相对贫乏,推测4个品种绵羊具有共同的母系祖先。 展开更多

关键词 线粒体细胞色素b基因 绵羊品种 系统进化 序列差异 线粒体DNA多态性 鲁北白山羊 小尾寒羊 洼地绵羊 分子系统树 UPGMA 大尾寒羊 基因片段 碱基组成 拓扑结构 起源分化 母系遗传 分子水平 亲缘关系 平均差 滩羊 变异 种羊

在线阅读 下载PDF 职称材料

驼背鲈线粒体细胞色素b基因的序列分析 被引量：4

4

作者 区又君 李加儿 +1 位作者 吴勇 刘楚吾 《南方水产》 CAS 2008年第5期51-54,共4页

采用PCR-DNA测序技术,对驼背鲈线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因全序列进行分析。获得长度为1141bp的Cytb基因片段,序列碱基组成平均是T为29.1%,C为32.3%,A为23.2%,G为14.0%,A+T的碱基百分比总体上略大于C+G,平均值分别是52.3%和46.3%。与... 采用PCR-DNA测序技术,对驼背鲈线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因全序列进行分析。获得长度为1141bp的Cytb基因片段,序列碱基组成平均是T为29.1%,C为32.3%,A为23.2%,G为14.0%,A+T的碱基百分比总体上略大于C+G,平均值分别是52.3%和46.3%。与其它鱼类相同基因片段碱基序列含量相似。在由核苷酸推导的氨基酸中,亮氨酸(Leu)所占的比例最高,为16.03%。 展开更多

关键词 驼背鲈 细胞色素b(Cyt b) 序列

在线阅读 下载PDF 职称材料

三峡库区3种银鱼线粒体DNA细胞色素b基因序列多态性分析 被引量：13

5

作者 罗宏伟 段辛斌 +2 位作者 王珂 唐锡良 陈大庆 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2009年第6期16-21,共6页

对三峡库区大银鱼（Protosalanxchinensis）、太湖新银鱼（Neosalanxtaihuensis）和短吻间银鱼（Hemisalanxbrachyrostralis）共78尾个体的Cytb基因全序列（1141bp）进行了分析。结果显示，序列有16个变异位点，总变异率为1．4％，其中1... 对三峡库区大银鱼（Protosalanxchinensis）、太湖新银鱼（Neosalanxtaihuensis）和短吻间银鱼（Hemisalanxbrachyrostralis）共78尾个体的Cytb基因全序列（1141bp）进行了分析。结果显示，序列有16个变异位点，总变异率为1．4％，其中13个为简约位点。大银鱼的32尾样本有6个单倍型，太湖新银鱼32尾样本有5个单倍型，短吻间银鱼14尾样本中有3个单倍型。大银鱼、太湖新银鱼和短吻间银鱼的单倍型多样性指数（h）分别为0．804±0．032，0．671±0．061，0．385±0．149；核苷酸多样性指数（π）分别为0．00146±0．00009，0．00228±0．00024，0．00067±0．00026。3种银鱼群体的遗传距离在0．12461—0．23796之间，净遗传距离在0．12274～0．24418之间。基于Cytb基因序列，利用Kimura-2模型构建的NJ树表明：大银鱼与太湖新银鱼种群的亲缘关系最近．两者与短吻间银鱼种群的亲缘关系较远。研究结果表明，三峡库区3种银鱼的遗传多样性低。 展开更多

关键词 大银鱼(Protosalanx chinensis) 太湖新银鱼(Neosalanx taihuensis) 短吻间银鱼(Hemisalanx brachyrostralis) 线粒体DNA 细胞色素b基因 遗传多样性 三峡库区

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于线粒体DNA细胞色素b基因部分序列的新疆裸重唇鱼遗传多样性分析 被引量：4

6

作者 郭飏 胡文革 +4 位作者 莫超 武菲 王翠华 马得草 何园 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期528-532,共5页

为对新疆不同水系(开都河、玛纳斯河、喀什河、巩乃斯河)4个野生新疆裸重唇鱼Gymnodiptychus dybowskii群体的遗传多样性与种群遗传结构进行研究,提取了新疆裸重唇鱼线粒体DNA Cytb基因的部分序列,并利用生物学软件对获取的基因进行分... 为对新疆不同水系(开都河、玛纳斯河、喀什河、巩乃斯河)4个野生新疆裸重唇鱼Gymnodiptychus dybowskii群体的遗传多样性与种群遗传结构进行研究,提取了新疆裸重唇鱼线粒体DNA Cytb基因的部分序列,并利用生物学软件对获取的基因进行分析。结果表明:在74个样品中共检测到9个单倍型,变异位点15个,在开都河(21尾)、巩乃斯河(27尾)、喀什河(2尾)、玛纳斯河(24尾)的样品中,分别检测到1、11、5、1个变异位点;新疆裸重唇鱼群体平均单倍型多样性(Hd)和平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.810和0.005 9;群体间遗传分化系数(FST)分析显示,玛纳斯河群体与其他3个群体间存在较大的分化(FST>0.15),而其他群体间分化程度较低(0.05<FST<0.15);基因流Nm值显示,巩乃斯河群体与喀什河群体间存在极大的基因交流;分子系统树和单倍型网络图分析表明,新疆喀什河群体与其他群体间单倍型关系较远,而其他群体间单倍型关系较近。研究表明,新疆裸重唇鱼4个群体鱼类种质资源均遭受极大破坏,应加强渔业管理措施,设立专门的机构,保护新疆裸重唇鱼及其他土著鱼类资源。 展开更多

关键词 新疆裸重唇鱼 线粒体DNA细胞色素b 遗传多样性

在线阅读 下载PDF 职称材料

二长棘犁齿鲷线粒体细胞色素b基因序列和分子系统发育分析 被引量：4

7

作者 张殿昌 邵燕卿 +1 位作者 苏天凤 江世贵 《南方水产》 2007年第2期1-7,共7页

利用PCR技术克隆了二长棘犁齿鲷(Parargyrops edita Tanaka)线粒体细胞色素b(Cyt b)基因,该基因的全长为1140bp,并将该基因与GenBank中犁齿鲷、金头赤鲷、真赤鲷、四长棘鲷、黄牙鲷、平鲷、黑棘鲷和灰鳍棘鲷的Cytb序列进行了比较,共检测... 利用PCR技术克隆了二长棘犁齿鲷(Parargyrops edita Tanaka)线粒体细胞色素b(Cyt b)基因,该基因的全长为1140bp,并将该基因与GenBank中犁齿鲷、金头赤鲷、真赤鲷、四长棘鲷、黄牙鲷、平鲷、黑棘鲷和灰鳍棘鲷的Cytb序列进行了比较,共检测到407个核苷酸变异位点,占总序列的35.7%。同时结果也显示,二长棘犁齿鲷与犁齿鲷亲缘关系最近,序列差异仅为1.5%,与传统分类一致,它们应同属于犁齿鲷属;与金头赤鲷和真赤鲷的遗传差异分别为8.3%和8.4%,也处于种间的分化水平,且以较高的置信度(100%)在分子系统发育树上聚为一支,是否应该将它们归为一个属还有待于深入研究。 展开更多

关键词 二长棘犁齿鲷 线粒体 细胞色素b 分子系统树

在线阅读 下载PDF 职称材料

河川沙塘鳢线粒体细胞色素b(Cytb)基因序列分析 被引量：6

8

作者 谢楠 冯晓宇 +3 位作者 郭水荣 刘新轶 姚桂桂 王宇希 《现代农业科技》 2010年第19期288-290,共3页

采用特异性引物PCR扩增获得了河川沙塘鳢细胞色素b基因序列,并与塘鳢科其余22种细胞色素b基因序列进行比对,运用Mega 3.1软件通过NJ法构建了塘鳢科鱼类系统发育树。结果显示:2尾试验鱼构成1支;Eleotris、Hypseleotri 2个属构成1支;Odont... 采用特异性引物PCR扩增获得了河川沙塘鳢细胞色素b基因序列,并与塘鳢科其余22种细胞色素b基因序列进行比对,运用Mega 3.1软件通过NJ法构建了塘鳢科鱼类系统发育树。结果显示:2尾试验鱼构成1支;Eleotris、Hypseleotri 2个属构成1支;Odontobutis、Perccottus glehni 2个属构成1支;Bostrychus、Butis、Oxyeleotris、Ophiocara 4个属构成1支;Ptereleotris heteroptera单独构成1支。该研究结果可为深入探讨沙塘鳢属及塘鳢科鱼类的系统分类与重新整理提供依据。 展开更多

关键词 河川沙塘鳢 线粒体细胞色素b基因 系统发育

在线阅读 下载PDF 职称材料

小眼高原鳅线粒体DNA细胞色素b基因序列分析 被引量：4

9

作者 李太平 李均祥 《青海畜牧兽医杂志》 2003年第3期10-11,共2页

对小眼高原鳅线粒体DNA细胞色素b基因进行了PCR扩增、克隆及其序列测定 ,得到全序列长度为 114 0bp ,其T、C、A、G含量分别为 3 62 ( 3 1 8% )、2 91( 2 5 5 % )、3 0 1( 2 6 4% )、186( 16 3 ) ,GC含量 41 8%。分子质量为 3 49782。

关键词 小眼高原鳅 线粒体DNA 细胞色素b基因 序列分析 PCR

在线阅读 下载PDF 职称材料

山羊线粒体DNA细胞色素b基因序列分析 被引量：4

10

作者 耿荣庆 《草食家畜》 2006年第2期32-34,共3页

采用PCR直接测序法,对一个山羊群体线粒体DNA细胞色素b基因全序列进行测定。结果表明,山羊线粒体细胞色素b基因全长为1140bp,A、G、T和C碱基的平均含量分别为31.9%、13.1%、26.8%和28.2%,其中A+T含量为58.7%,G+C含量为41.3%,A+T含量明... 采用PCR直接测序法,对一个山羊群体线粒体DNA细胞色素b基因全序列进行测定。结果表明,山羊线粒体细胞色素b基因全长为1140bp,A、G、T和C碱基的平均含量分别为31.9%、13.1%、26.8%和28.2%,其中A+T含量为58.7%,G+C含量为41.3%,A+T含量明显高于G+C含量;密码子碱基的使用也存在一定差异。该研究为解决我国地方山羊品种起源系统中存在的分歧提供有益的探索。 展开更多

关键词 山羊 线粒体DNA 细胞色素b基因

在线阅读 下载PDF 职称材料

鲂属鱼类细胞色素b片段序列分析 被引量：13

11

作者 谢楠 刘新轶 +1 位作者 冯晓宇 郭水荣 《现代农业科技》 2012年第1期290-292,共3页

采用特异性引物PCR扩增获得了鲂属4种鱼类及长春鳊的Cyt b片段序列,并运用MEGA 3.1软件进行了序列分析,通过NJ法、UPGMA法构建了系统发育树。结果表明:鲂属4种鱼类与长春鳊分别聚类为2支,但鲂属4种鱼类的聚类在2个系统发育树中存在差异... 采用特异性引物PCR扩增获得了鲂属4种鱼类及长春鳊的Cyt b片段序列,并运用MEGA 3.1软件进行了序列分析,通过NJ法、UPGMA法构建了系统发育树。结果表明:鲂属4种鱼类与长春鳊分别聚类为2支,但鲂属4种鱼类的聚类在2个系统发育树中存在差异;三角鲂与厚颌鲂的聚类不明确。该研究结果可为深入探讨鲂属鱼类的系统分类与重新整理提供依据。 展开更多

关键词 鲂属鱼类 线粒体细胞色素b序列 系统发育

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于线粒体细胞色素b基因的细颈囊尾蚴种群遗传多样性研究 被引量：3

12

作者 郝桂英 杨光友 +3 位作者 古小彬 阳爱国 杨应东 王淑贤 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期119-125,共7页

为探讨我国细颈囊尾蚴种群之间的遗传相似性及与其他带科带属绦虫的亲缘关系,用线粒体细胞色素b(Cyt b)基因全序列研究了分离自我国四川和云南2省7地区猪、山羊和绵羊共33个细颈囊尾蚴的遗传变异,并用MEGA 4.0程序NJ法和PAUP 4.0程序MP... 为探讨我国细颈囊尾蚴种群之间的遗传相似性及与其他带科带属绦虫的亲缘关系,用线粒体细胞色素b(Cyt b)基因全序列研究了分离自我国四川和云南2省7地区猪、山羊和绵羊共33个细颈囊尾蚴的遗传变异,并用MEGA 4.0程序NJ法和PAUP 4.0程序MP法绘制种系发育树。本研究结果显示:细颈囊尾蚴分离株的Cyt b基因全长为1 068bp,共检测到22个单倍型,单倍型间核苷酸相似性较高(97.3%～99.9%),其与带科带属其他5种绦虫的相似性均在82%以下。系统发育树显示,7个不同地域的细颈囊尾蚴聚为一支,分为3个亚群,且与地理区域、宿主没有直接的相关性,呈现混杂的分布格局,未形成明显的地理分支或宿主分支。研究结果表明:细颈囊尾蚴Cyt b基因存在一定的遗传差异,但种内相对保守,与其他带科绦虫种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记,并为细颈囊尾蚴的种群遗传学研究及其与其他带科绦虫病的鉴别诊断的建立奠定基础。 展开更多

关键词 细颈囊尾蚴 线粒体细胞色素b基因 遗传多样性 四川株 云南株

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于细胞色素b基因序列的鲌亚科鱼类系统发育研究 被引量：4

13

作者 冯晓宇 谢楠 +2 位作者 冯建彬 许宝青 赵金良 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2009年第5期23-27,共5页

采用特异性引物PCR扩增获得了鲌亚科7属10种鱼类细胞色素b基因的全长序列,初步构建了鲌亚科鱼类的系统发育关系。NJ树和MP树一致表明,鲌亚科鱼类种内所有个体均单独聚群,支持率高;同一属内,除蒙古鲌(Culter mogolicus mongolicus)未能... 采用特异性引物PCR扩增获得了鲌亚科7属10种鱼类细胞色素b基因的全长序列,初步构建了鲌亚科鱼类的系统发育关系。NJ树和MP树一致表明,鲌亚科鱼类种内所有个体均单独聚群,支持率高;同一属内,除蒙古鲌(Culter mogolicus mongolicus)未能与同属的翘嘴鲌(Culter alburnus)、青梢鲌(Culter dabryi dabryi)单独聚为一支外,团头鲂(Megalobrama amblycephala)与三角鲂(Megalobrama terminal)、翘嘴鲌与青梢鲌均为姐妹种。NJ、MP树显示鲌亚科鱼类属间关系的支持率都较低,鲂属(Megalobrama)与鳊属(Parabramis)间、鲌属(Culter)与原鲌属(Cultrichthys)间、细鳊属(Rasborinus)与半属(Hemiculterella)、属(Hemiculter)间有较近的亲缘关系,在系统演化关系上,细鳊属、半属、依氏鱼属(Ishikauia)较为原始,鲌属与原鲌属、鲂属与鳊属互为姐妹群,为较特化群。 展开更多

关键词 鲌亚科鱼类 细胞色素b序列 系统发育

在线阅读 下载PDF 职称材料

2种虾虎鱼细胞色素b基因全序列克隆与分析 被引量：4

14

作者 陈雷 程远志 +1 位作者 王日昕 徐田军 《南方水产》 2010年第5期43-49,共7页

测定了矛尾刺虾虎鱼（Acanthogobius hasta）和红狼牙虾虎鱼（Odontamblyopus rubicundus）的线粒体细胞色素b（Cytb）基因全序列。2种虾虎鱼Cytb基因序列全长均为1141bp,通过序列比对,检测到266个变异位点,序列中碱基转换频率高于颠换... 测定了矛尾刺虾虎鱼（Acanthogobius hasta）和红狼牙虾虎鱼（Odontamblyopus rubicundus）的线粒体细胞色素b（Cytb）基因全序列。2种虾虎鱼Cytb基因序列全长均为1141bp,通过序列比对,检测到266个变异位点,序列中碱基转换频率高于颠换,碱基替换主要发生在密码子第3位。结合GenBank中的虾虎鱼科其他物种的细胞色素b基因全序列,利用Kimura-双参数模型分析遗传距离表明,10种虾虎鱼科鱼类的遗传差异在0.118~0.330之间,大头新虾虎鱼（Neogobius kessleri）与同属的裸喉新虾虎鱼（N.gymnotrachelus）遗传距离最小,为0.118;大头新虾虎鱼和矛尾刺虾虎鱼遗传距离最大,为0.330。以Cytb基因全序列构建的NJ进化树分析表明,10种虾虎鱼分为3个主要类群,红狼牙虾虎鱼和矛尾刺虾虎鱼聚为1支,且与其余8种虾虎鱼类遗传距离较远。 展开更多

关键词 虾虎鱼科 细胞色素b 序列分析 系统发生

在线阅读 下载PDF 职称材料

鲇细胞色素b基因序列差异及遗传多样性分析 被引量：6

15

作者 王庆容 李黛 《水生态学杂志》 北大核心 2009年第1期40-44,共5页

从4个种群的鲇（Silurus asotus）线粒体DNA（mitochondrial DNA，mtDNA）扩增出约500bp的细胞色素b基因，经ClustalX同源排序后得400bp序列。用PopGen32软件计算遗传距离和遗传一致度。17个个体间的遗传距离的变化范围为0～0．0211，... 从4个种群的鲇（Silurus asotus）线粒体DNA（mitochondrial DNA，mtDNA）扩增出约500bp的细胞色素b基因，经ClustalX同源排序后得400bp序列。用PopGen32软件计算遗传距离和遗传一致度。17个个体间的遗传距离的变化范围为0～0．0211，遗传一致度的变化范围为1～0．9791。结果显示，在长江上游的支流中，雅砻江种群在该基因片段上基本不存在变异，在被分析的4个个体中，其细胞色素b基因的序列完全一致；岷江种群和乌江种群在该基因片段上有一定的变异。沅江上游的涤阳河种群在该基因片段上基本不存在变异，在被分析的5个个体中，其细胞色素b基因的序列完全一致。但各个种群间在该基因片段上差异较大。在4个种群的鲇Cytb基因比较分析的基础上，构建了遗传关系聚类图，雅砻江、岷江、乌江、海阳河4个种群各聚为一支后，雅砻江和岷江2个种群再聚为一支，乌江和海阳河2个种群再聚为另一支。 展开更多

关键词 鲇 线粒体DNA 细胞色素b 遗传多样性

在线阅读 下载PDF 职称材料

普通小球藻细胞色素b559α亚基编码基因的克隆及序列分析 被引量：1

16

作者 尚常花 朱顺妮 +1 位作者 袁振宏 王忠铭 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第15期105-107,共3页

细胞色素b559是由α和β两个亚基组成的一种血红蛋白,是光系统Ⅱ的必需组分,可以保护光系统Ⅱ免受光抑制的危害。为了从分子水平深入了解细胞色素b559的功能,从普通小球藻(Chlorella vugaris)中克隆了编码细胞色素b559α亚基的基因序列... 细胞色素b559是由α和β两个亚基组成的一种血红蛋白,是光系统Ⅱ的必需组分,可以保护光系统Ⅱ免受光抑制的危害。为了从分子水平深入了解细胞色素b559的功能,从普通小球藻(Chlorella vugaris)中克隆了编码细胞色素b559α亚基的基因序列及其5′-侧翼序列。结果表明,DNA全长包括1个252 bp的开放读码框,442 bp的5′-侧翼序列和195 bp的3′-侧翼序列,5′-侧翼序列区域存在一系列预测的顺式作用元件。 展开更多

关键词 普通小球藻 细胞色素b559α亚基 克隆 序列分析

在线阅读 下载PDF 职称材料

线粒体细胞色素b基因在鱼唇制品物种鉴定中适用性的研究 被引量：2

17

作者 张霞 徐仁杰 +4 位作者 方丽 伍俊羽 郭泽时 何振宇 钟瑞敏 《食品安全质量检测学报》 CAS 北大核心 2022年第20期6528-6534,共7页

目的探讨线粒体细胞色素b基因(cytochrome b,Cyt b)作为DNA条形码在鱼唇制品物种鉴定中的适用性。方法对全国31个城市购买的252份鱼唇样品进行聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)测序,同源基因比较分析,构建系统发育树,鉴... 目的探讨线粒体细胞色素b基因(cytochrome b,Cyt b)作为DNA条形码在鱼唇制品物种鉴定中的适用性。方法对全国31个城市购买的252份鱼唇样品进行聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)测序,同源基因比较分析,构建系统发育树,鉴定制作鱼唇产品的鱼种,并对其进行濒危评价分析。结果成功鉴定250个样品,一致性物种基因序列相似性在99%以上,涉及8个鲨鱼物种,最多样品为大青鲨(Prionace glauca),占样品65.5%,其余还有镰形真鲨(Carcharhinus falciformis)、路氏双髻鲨(Sphyrna lewini)、锤头双髻鲨(Sphyrna zygaena)等7类鲨鱼物种。结论Cyt b可以作为对鲨鱼物种进行鉴定的一种DNA条形码,在对鲨鱼种鉴定时可以使用Cyt b基因及细胞色素氧化酶亚基I基因联合鉴定条形码,为深加工海产品物种鉴定提供更多的技术支撑。 展开更多

关键词 线粒体细胞色素b DNA条形码 鱼唇 物种鉴定

在线阅读 下载PDF 职称材料

平耳孔蜈蚣细胞色素b基因序列变异分析

18

作者 左宝平 宋大祥 +1 位作者 周开亚 孙红英 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第7期2883-2885,共3页

[目的]对中国平耳孔蜈蚣种群的地理变异进行初步探讨。[方法]中国平耳孔蜈蚣标本经95%乙醇浸制后进行总基因组提取、PCR扩增和测序,最后进行序列分析。[结果]共定义26个单元型,单元型之间的平均遗传距离为0.13。种群的遗传多样性波动范... [目的]对中国平耳孔蜈蚣种群的地理变异进行初步探讨。[方法]中国平耳孔蜈蚣标本经95%乙醇浸制后进行总基因组提取、PCR扩增和测序,最后进行序列分析。[结果]共定义26个单元型,单元型之间的平均遗传距离为0.13。种群的遗传多样性波动范围较大,系统发生树中各样地平耳孔蜈蚣的单元型呈现一种混杂的分布格局。[结论]根据节肢动物分子钟,推断现代平耳孔蜈蚣遗传分布格局均比较古老,早在第三纪中期就已经形成,可见更新世冰期对平耳孔蜈蚣种群没有影响。 展开更多

关键词 基因序列变异分析 细胞色素b 平耳孔蜈蚣

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的高邮湖湖鲚(Coilia nasus)遗传多样性分析 被引量：15

19

作者 李大命 张彤晴 +4 位作者 关浩勇 唐晟凯 刘燕山 刘小维 潘建林 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2017年第6期3-8,共6页

本研究利用线粒体细胞色素b(Cytb)基因和控制区(D-loop)序列作为分子标记,调查了高邮湖湖鲚(Coilia nasus)种群遗传多样性。结果显示,Cytb基因和D-loop区序列碱基A+T含量均高于G+C含量,显示碱基组成具有偏倚性。38条Cytb基因序列检出26... 本研究利用线粒体细胞色素b(Cytb)基因和控制区(D-loop)序列作为分子标记,调查了高邮湖湖鲚(Coilia nasus)种群遗传多样性。结果显示,Cytb基因和D-loop区序列碱基A+T含量均高于G+C含量,显示碱基组成具有偏倚性。38条Cytb基因序列检出26个变异位点,定义13个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.716±0.078和0.002 70±0.000 57;40条D-loop区序列检出53个变异位点,定义21个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.906±0.034和0.006 27±0.000 99。13个Cytb基因单倍型之间的遗传距离在0.001~0.014之间,NJ系统进化树显示单倍型聚为1支;21个D-loop区单倍型之间的遗传距离在0.001~0.019之间,NJ系统进化树显示单倍型聚为2支。中性检测结果和歧点分布图均表明高邮湖湖鲚种群稳定,近期没有发生种群扩张。整体来看,高邮湖湖鲚种质资源遗传多样性水平较高,具有高单倍型多样性和低核苷酸多样性的特征。 展开更多

关键词 湖鲚(Coilia nasus) 遗传多样性 线粒体DNA 细胞色素b基因 控制区序列

在线阅读 下载PDF 职称材料

我国主要地方绵羊品种mtDNA细胞色素b基因PCR-RFLP研究 被引量：11

20

作者 巩元芳 李祥龙 刘铮铸 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期649-653,共5页

应用PCRRFLP方法,对我国9个地方绵羊品种和3个引入品种共计120个个体的线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(cytb)基因进行了分析。结果表明,12种限制性内切酶在所研究的个体中共检测到22个酶切位点,15种限制性态型,其中StuⅠ、EcoRⅠ和MboⅡ表... 应用PCRRFLP方法,对我国9个地方绵羊品种和3个引入品种共计120个个体的线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(cytb)基因进行了分析。结果表明,12种限制性内切酶在所研究的个体中共检测到22个酶切位点,15种限制性态型,其中StuⅠ、EcoRⅠ和MboⅡ表现出多态,15种限制性态型归结为4种基因单倍型,即单倍型Ⅰ、单倍型Ⅱ、单倍型Ⅲ和单倍型Ⅳ。单倍型Ⅰ为受试绵羊品种的基本单倍型。线粒体DNA细胞色素b基因遗传多态度为0.0142%,说明我国地方绵羊品种线粒体DNA多态度贫乏。 展开更多

关键词 地方绵羊品种 线粒体DNA 细胞色素b基因 PCR-RFLP

在线阅读 下载PDF 职称材料