4个绵羊品种线粒体细胞色素b基因的序列差异和系统进化研究 被引量：27

1

作者 张传生 耿立英 +2 位作者 万海伟 李吉涛 杜立新 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期313-317,共5页

测定了小尾寒羊、大尾寒羊、洼地绵羊、滩羊和鲁北白山羊5个品种羊415bp线粒体DNA细胞色素b基因片段,其中44个位点检出变异。分析其碱基组成和变异情况,并以鲁北白山羊为外群,用UPGMA和NJ法构建了一系列分子系统树,得到相同的拓扑结构,... 测定了小尾寒羊、大尾寒羊、洼地绵羊、滩羊和鲁北白山羊5个品种羊415bp线粒体DNA细胞色素b基因片段,其中44个位点检出变异。分析其碱基组成和变异情况,并以鲁北白山羊为外群,用UPGMA和NJ法构建了一系列分子系统树,得到相同的拓扑结构,在分子水平从母系遗传的角度澄清4个绵羊品种的起源分化关系。结果显示:在4个绵羊品种之间,洼地绵羊与滩羊关系最近与小尾寒羊亲缘关系最远。绵羊品种内的平均差异为0185%,线粒体DNA多态性相对贫乏,推测4个品种绵羊具有共同的母系祖先。 展开更多

关键词 线粒体细胞色素b基因 绵羊品种 系统进化 序列差异 线粒体DNA多态性 鲁北白山羊 小尾寒羊 洼地绵羊 分子系统树 UPGMA 大尾寒羊 基因片段 碱基组成 拓扑结构 起源分化 母系遗传 分子水平 亲缘关系 平均差 滩羊 变异 种羊

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东海原甲藻线粒体细胞色素b(Cytb)基因的定量检测 被引量：8

2

作者 赵丽媛 于志刚 +1 位作者 甄毓 米铁柱 《中国海洋大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期448-452,共5页

建立了检测东海原甲藻线粒体细胞色素b(Cytb)基因mRNA含量的实时荧光定量PCR方法。以甲藻Cytb基因的简并引物扩增得到984 bp长的东海原甲藻Cytb基因片段,经克隆、测序,制备并纯化质粒。以光度法测定质粒浓度并作为标准品。对上述基因片... 建立了检测东海原甲藻线粒体细胞色素b(Cytb)基因mRNA含量的实时荧光定量PCR方法。以甲藻Cytb基因的简并引物扩增得到984 bp长的东海原甲藻Cytb基因片段,经克隆、测序,制备并纯化质粒。以光度法测定质粒浓度并作为标准品。对上述基因片段,利用PRIMER EXPRESS 3.0设计引物,以梯度稀释的质粒标准品进行定量PCR反应,以SYBR Green I为荧光染料,制作标准曲线,得到基因拷贝数X与Ct值的关系为:Ct=-3.50 lgX+39.35(相关系数r为0.999)。通过对不同生长时期的东海原甲藻样品的Cytb基因mRNA含量检测,发现该基因的表达量较稳定,平均值为(45.4±4.7)拷贝/细胞,受生长状态影响不大,可作为实时荧光定量PCR的内参基因。 展开更多

关键词 线粒体细胞色素b基因 东海原甲藻 实时荧光定量PCR 内参基因

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基于线粒体细胞色素b基因的细颈囊尾蚴种群遗传多样性研究 被引量：3

3

作者 郝桂英 杨光友 +3 位作者 古小彬 阳爱国 杨应东 王淑贤 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期119-125,共7页

为探讨我国细颈囊尾蚴种群之间的遗传相似性及与其他带科带属绦虫的亲缘关系,用线粒体细胞色素b(Cyt b)基因全序列研究了分离自我国四川和云南2省7地区猪、山羊和绵羊共33个细颈囊尾蚴的遗传变异,并用MEGA 4.0程序NJ法和PAUP 4.0程序MP... 为探讨我国细颈囊尾蚴种群之间的遗传相似性及与其他带科带属绦虫的亲缘关系,用线粒体细胞色素b(Cyt b)基因全序列研究了分离自我国四川和云南2省7地区猪、山羊和绵羊共33个细颈囊尾蚴的遗传变异,并用MEGA 4.0程序NJ法和PAUP 4.0程序MP法绘制种系发育树。本研究结果显示:细颈囊尾蚴分离株的Cyt b基因全长为1 068bp,共检测到22个单倍型,单倍型间核苷酸相似性较高(97.3%～99.9%),其与带科带属其他5种绦虫的相似性均在82%以下。系统发育树显示,7个不同地域的细颈囊尾蚴聚为一支,分为3个亚群,且与地理区域、宿主没有直接的相关性,呈现混杂的分布格局,未形成明显的地理分支或宿主分支。研究结果表明:细颈囊尾蚴Cyt b基因存在一定的遗传差异,但种内相对保守,与其他带科绦虫种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记,并为细颈囊尾蚴的种群遗传学研究及其与其他带科绦虫病的鉴别诊断的建立奠定基础。 展开更多

关键词 细颈囊尾蚴 线粒体细胞色素b基因 遗传多样性 四川株 云南株

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基于线粒体细胞色素b基因对大耳姬鼠和龙姬鼠分类关系的探讨 被引量：1

4

作者 范振鑫 王璐萱 +1 位作者 张修月 刘少英 《四川动物》 CSCD 北大核心 2010年第6期878-881,共4页

大耳姬鼠Apodemus latronum的分类地位,尤其它和龙姬鼠A.draco的关系,还存在着争议。用PCR扩增了采集自5个不同地点的大耳姬鼠的线粒体细胞色素b(cytb)基因,并和GenBank已有的3条大耳姬鼠cytb序列一起分析其碱基组成和变异情况。采用邻... 大耳姬鼠Apodemus latronum的分类地位,尤其它和龙姬鼠A.draco的关系,还存在着争议。用PCR扩增了采集自5个不同地点的大耳姬鼠的线粒体细胞色素b(cytb)基因,并和GenBank已有的3条大耳姬鼠cytb序列一起分析其碱基组成和变异情况。采用邻接法(Neighbor-joining,NJ)、最大简约法(Maximum parsimony,MP)、最大似然法(Maximum likelihood,ML)和贝叶斯法(Bayesian inference,BI)构建了大耳姬鼠和龙姬鼠的系统发育树。4种方法构建的系统发育树拓扑结构一致,大耳姬鼠和龙姬鼠均各自形成单系,龙姬鼠先与台湾森鼠A.semotus聚在一起,再与大耳姬鼠形成姐妹群。此外,大耳姬鼠和龙姬鼠两者间的K2P平均遗传距离达到0.14。因此,认为大耳姬鼠是一个独立的种,而不是龙姬鼠的一个亚种。 展开更多

关键词 大耳姬鼠 龙姬鼠 线粒体细胞色素b 遗传距离 系统发育

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河川沙塘鳢线粒体细胞色素b(Cytb)基因序列分析 被引量：6

5

作者 谢楠 冯晓宇 +3 位作者 郭水荣 刘新轶 姚桂桂 王宇希 《现代农业科技》 2010年第19期288-290,共3页

采用特异性引物PCR扩增获得了河川沙塘鳢细胞色素b基因序列,并与塘鳢科其余22种细胞色素b基因序列进行比对,运用Mega 3.1软件通过NJ法构建了塘鳢科鱼类系统发育树。结果显示:2尾试验鱼构成1支;Eleotris、Hypseleotri 2个属构成1支;Odont... 采用特异性引物PCR扩增获得了河川沙塘鳢细胞色素b基因序列,并与塘鳢科其余22种细胞色素b基因序列进行比对,运用Mega 3.1软件通过NJ法构建了塘鳢科鱼类系统发育树。结果显示:2尾试验鱼构成1支;Eleotris、Hypseleotri 2个属构成1支;Odontobutis、Perccottus glehni 2个属构成1支;Bostrychus、Butis、Oxyeleotris、Ophiocara 4个属构成1支;Ptereleotris heteroptera单独构成1支。该研究结果可为深入探讨沙塘鳢属及塘鳢科鱼类的系统分类与重新整理提供依据。 展开更多

关键词 河川沙塘鳢 线粒体细胞色素b基因 系统发育

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马头山羊线粒体细胞色素b基因遗传多样性研究

6

作者 邓书湛 刘若余 吴芸 《贵州畜牧兽医》 2009年第1期10-12,共3页

测定了马头山羊品种16个个体的细胞色素b基因全序列(1 140 bp),比较分析了群体中细胞色素b基因的碱基组成和序列间碱基的变异情况。结果显示:在该品种(群体)中细胞色素b基因序列中8个变异位点上观察到23次T-C间碱基转换,有11次T-G间碱... 测定了马头山羊品种16个个体的细胞色素b基因全序列(1 140 bp),比较分析了群体中细胞色素b基因的碱基组成和序列间碱基的变异情况。结果显示:在该品种(群体)中细胞色素b基因序列中8个变异位点上观察到23次T-C间碱基转换,有11次T-G间碱基颠换发生在密码子第2位点,为非同义突变;观察到6种单倍型,单倍型多样度为0.808,核苷酸多样度为0.002 43。以绵羊为外群构建系统发生树(NJ tree)。结果显示:马头山羊有两个母系起源,其中支系A占75%(12/16),支系B占25%(4/16)。 展开更多

关键词 山羊 线粒体细胞色素b基因 遗传多样性

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绒螯蟹线粒体细胞色素b基因的RFLP分析 被引量：6

7

作者 马成学 戴伟 +2 位作者 王茜 李晓东 王晓梅 《天津师范大学学报（自然科学版）》 CAS 2006年第3期23-27,共5页

对中国大陆4个水系的8个地理种群绒螯蟹样本的线粒体细胞色素b基因片段进行了PCR扩增,并应用6种限制性内切酶对该PCR产物进行RFLP分析.在应用的6种内切酶中,HinfⅠ,RsaⅠ和Eco RⅤ酶切该PCR片段后,在某些地区绒螯蟹之间表现出限制性片... 对中国大陆4个水系的8个地理种群绒螯蟹样本的线粒体细胞色素b基因片段进行了PCR扩增,并应用6种限制性内切酶对该PCR产物进行RFLP分析.在应用的6种内切酶中,HinfⅠ,RsaⅠ和Eco RⅤ酶切该PCR片段后,在某些地区绒螯蟹之间表现出限制性片段长度多态性,为多态性的内切酶,但在本研究中尚未发现种群特异的RFLP标记.应用3种多态性的限制性内切酶对8个地理种群的绒鳌蟹个体样本的线粒体细胞色素b基因片段进行RFLP分析,共检测到5种复合限制性酶切类型,即AAA型、BBB型、ABA型、BAB型、ACA型.依据群体间的净遗传距离绘制的UPGMA分子系统树显示,合浦绒螯蟹形成了独立的一支. 展开更多

关键词 绒螯蟹 线粒体细胞色素b基因片段 PCR—RFLP

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基于线粒体DNA细胞色素b基因部分序列的新疆裸重唇鱼遗传多样性分析 被引量：4

8

作者 郭飏 胡文革 +4 位作者 莫超 武菲 王翠华 马得草 何园 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期528-532,共5页

为对新疆不同水系(开都河、玛纳斯河、喀什河、巩乃斯河)4个野生新疆裸重唇鱼Gymnodiptychus dybowskii群体的遗传多样性与种群遗传结构进行研究,提取了新疆裸重唇鱼线粒体DNA Cytb基因的部分序列,并利用生物学软件对获取的基因进行分... 为对新疆不同水系(开都河、玛纳斯河、喀什河、巩乃斯河)4个野生新疆裸重唇鱼Gymnodiptychus dybowskii群体的遗传多样性与种群遗传结构进行研究,提取了新疆裸重唇鱼线粒体DNA Cytb基因的部分序列,并利用生物学软件对获取的基因进行分析。结果表明:在74个样品中共检测到9个单倍型,变异位点15个,在开都河(21尾)、巩乃斯河(27尾)、喀什河(2尾)、玛纳斯河(24尾)的样品中,分别检测到1、11、5、1个变异位点;新疆裸重唇鱼群体平均单倍型多样性(Hd)和平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.810和0.005 9;群体间遗传分化系数(FST)分析显示,玛纳斯河群体与其他3个群体间存在较大的分化(FST>0.15),而其他群体间分化程度较低(0.05<FST<0.15);基因流Nm值显示,巩乃斯河群体与喀什河群体间存在极大的基因交流;分子系统树和单倍型网络图分析表明,新疆喀什河群体与其他群体间单倍型关系较远,而其他群体间单倍型关系较近。研究表明,新疆裸重唇鱼4个群体鱼类种质资源均遭受极大破坏,应加强渔业管理措施,设立专门的机构,保护新疆裸重唇鱼及其他土著鱼类资源。 展开更多

关键词 新疆裸重唇鱼 线粒体DNA细胞色素b 遗传多样性

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石爬(鱼兆)属2种鱼线粒体DNA细胞色素b基因序列的比较研究

9

作者 杨成 晁燕 +3 位作者 申志新 祁得林 唐文家 王国杰 《水产科学》 CAS 北大核心 2010年第1期23-26,共4页

对采于青海省玛柯河的6尾黄石爬(鱼兆)和四川省都江堰的1尾青石爬(鱼兆)线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)基因进行了PCR扩增并进行序列测定。结果表明,黄石爬(鱼兆)6个个体均属同一单倍型。在Cyt b基因全长1140 bp中,2种鱼类存在29个变异位点(... 对采于青海省玛柯河的6尾黄石爬(鱼兆)和四川省都江堰的1尾青石爬(鱼兆)线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)基因进行了PCR扩增并进行序列测定。结果表明,黄石爬(鱼兆)6个个体均属同一单倍型。在Cyt b基因全长1140 bp中,2种鱼类存在29个变异位点(2.54%),其中23个(79.3%)突变位点为转换,6个(20.7%)突变位点为颠换。2种鱼类序列差异偏低,提示分化较晚,致使物种间在Cyt b基因上未能积累丰富的碱基变异。黄石爬(鱼兆)遗传多样度较低,可能与其栖息环境的改变有关。 展开更多

关键词 黄石爬(鱼兆) 青石爬(鱼兆) 线粒体DNA细胞色素b基因 序列特征 系统发育

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家鹅品种细胞色素b基因序列分析及其系统发育关系 被引量：6

10

作者 王继文 刘安芳 +1 位作者 陈艳荣 瞿浩 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期741-746,共6页

测定了15个中国家鹅和2个欧洲家鹅品种44个个体线粒体细胞色素b基因全序列(1143 bp),并结合GenBank中的野生种白额雁序列比较分析表明,检测到31个可变位点和4种单倍型,没有发现缺失或插入,核苷酸多样度和单倍型多样度分别为0.00648和0.... 测定了15个中国家鹅和2个欧洲家鹅品种44个个体线粒体细胞色素b基因全序列(1143 bp),并结合GenBank中的野生种白额雁序列比较分析表明,检测到31个可变位点和4种单倍型,没有发现缺失或插入,核苷酸多样度和单倍型多样度分别为0.00648和0.45,密码子第三位点G碱基的含量较低(14.2%),A、T和C的含量极相似,第一二位点的偏倚度(0.057和0.223)低于第三位点(0.492),转换数明显高于颠换数(Ts/Tv=9.5～19),密码子第三位点的转换数最高.系统发育分析结果支持中国家鹅的两个不同起源学说. 展开更多

关键词 家鹅 线粒体细胞色素b 序列变异 系统发育

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鲂属鱼类细胞色素b片段序列分析 被引量：13

11

作者 谢楠 刘新轶 +1 位作者 冯晓宇 郭水荣 《现代农业科技》 2012年第1期290-292,共3页

采用特异性引物PCR扩增获得了鲂属4种鱼类及长春鳊的Cyt b片段序列,并运用MEGA 3.1软件进行了序列分析,通过NJ法、UPGMA法构建了系统发育树。结果表明:鲂属4种鱼类与长春鳊分别聚类为2支,但鲂属4种鱼类的聚类在2个系统发育树中存在差异... 采用特异性引物PCR扩增获得了鲂属4种鱼类及长春鳊的Cyt b片段序列,并运用MEGA 3.1软件进行了序列分析,通过NJ法、UPGMA法构建了系统发育树。结果表明:鲂属4种鱼类与长春鳊分别聚类为2支,但鲂属4种鱼类的聚类在2个系统发育树中存在差异;三角鲂与厚颌鲂的聚类不明确。该研究结果可为深入探讨鲂属鱼类的系统分类与重新整理提供依据。 展开更多

关键词 鲂属鱼类 线粒体细胞色素b序列 系统发育

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鳜类系统发育的线粒体Cytb基因全序列分析 被引量：8

12

作者 章群 任岗 +1 位作者 钱开诚 陈泉梅 《生态科学》 CSCD 2006年第5期430-432,436,共4页

测定了鳜、大眼鳜、斑鳜、暗鳜、波纹鳜、长体鳜、中国少鳞鳜等7种鳜类12个个体的线粒体细胞色素b基因全序列。结合GenBank中的同源序列,共分析了9种鳜类的系统发育关系。序列分析表明,鳜属鱼类属内种间的遗传距离(0.015～0.093)明显小... 测定了鳜、大眼鳜、斑鳜、暗鳜、波纹鳜、长体鳜、中国少鳞鳜等7种鳜类12个个体的线粒体细胞色素b基因全序列。结合GenBank中的同源序列,共分析了9种鳜类的系统发育关系。序列分析表明,鳜属鱼类属内种间的遗传距离(0.015～0.093)明显小于少鳞鳜属鱼类属内种间的遗传距离(0.152～0.178)。在分子系统发育树上,长体鳜与鳜属的鳜、大眼鳜、斑鳜、波纹鳜、暗鳜聚合成一分支,少鳞鳜属的种类聚成另一分支;支持将长体鳜归入鳜属,鳜类分为鳜属和少鳞鳜属等二个属的分类处理。在鳜属鱼类中,鳜和大眼鳜亲缘关系十分密切;斑鳜与波纹鳜亲缘较近;长体鳜与鳜属其它5个种的亲缘关系较远。在少鳞鳜属鱼类中,中国少鳞鳜和日本少鳞鳜的亲缘关系较远,韩国少鳞鳜的系统位置较不明确。鳜类的单系性及其鳜类的系统位置仍有待进一步研究。 展开更多

关键词 鳜类 线粒体细胞色素b基因 序列分析 系统发育

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基于线粒体Cytb基因序列探讨花斑鳅三亚种的分类地位 被引量：1

13

作者 陈咏霞 梁娜 +2 位作者 李秀 潘晓睿 武大勇 《天津师范大学学报（自然科学版）》 CAS 2015年第3期1-6,共6页

以线粒体DNA细胞色素b（Cytb）基因的全序列作为遗传标记,探讨花斑鳅3亚种（指名亚种Cobitis melanoleuca melanoleuca、北方鳅亚种C.m.granoei和格氏鳅亚种C.m.gladkovi）的分类地位.基于Kimura双参数法计算河北花斑鳅指名亚种个体间... 以线粒体DNA细胞色素b（Cytb）基因的全序列作为遗传标记,探讨花斑鳅3亚种（指名亚种Cobitis melanoleuca melanoleuca、北方鳅亚种C.m.granoei和格氏鳅亚种C.m.gladkovi）的分类地位.基于Kimura双参数法计算河北花斑鳅指名亚种个体间的遗传距离为0.2%~1.1%,俄罗斯花斑鳅指名亚种、北方鳅亚种和格氏鳅亚种之间的平均遗传距离为0.1%~1.5%,而河北花斑鳅指名亚种与俄罗斯花斑鳅3个亚种之间的平均遗传距离为1.7%~2.6%.分子系统树显示,花斑鳅分为两大分支：分支I为河北花斑鳅指名亚种8个单倍型类群,分支Ⅱ含俄罗斯花斑鳅指名亚种、北方鳅亚种和格氏鳅亚种以及辽宁北方鳅亚种.结合已有研究结果得出：花斑鳅指名亚种仅分布于中国,而俄罗斯也仅有北方鳅亚种1个物种,两者的分化时间约为2.50~3.09百万年. 展开更多

关键词 花斑鳅 线粒体细胞色素b基因 遗传标记 遗传距离 分类地位

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基于线粒体Cytb基因序列的洞庭湖河蚬遗传多样性分析 被引量：9

14

作者 王剑平 朱鹏飞 +2 位作者 王健 桂雨婷 李德亮 《水生态学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第5期89-94,共6页

研究洞庭湖不同地理群体河蚬的遗传多样性和遗传结构,为其资源合理开发和有效保护提供参考。在6个样点共采集河蚬126只,以线粒体细胞色素b基因部分序列为分子标记,分析扩增与测序后基因序列的单倍型及多样性、核苷酸多样性,计算群体间... 研究洞庭湖不同地理群体河蚬的遗传多样性和遗传结构,为其资源合理开发和有效保护提供参考。在6个样点共采集河蚬126只,以线粒体细胞色素b基因部分序列为分子标记,分析扩增与测序后基因序列的单倍型及多样性、核苷酸多样性,计算群体间遗传分化指数等。获得长531bp的序列片段,共检出5种单倍型,变异位点10个;平均单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.559和0.006。6个河蚬群体间的遗传距离为0.006-0.007;遗传分化指数和AMOVA分析显示,河蚬群体间遗传分化低,遗传变异主要来自群体个体内。最大似然法构建的系统进化树中,单倍型DTH1和DTH5聚为一支,DTH2、DTH3、DTH4聚为另一支。中性检验结果显示洞庭湖河蚬群体相对稳定,没有经历过瓶颈效应和突然的群体萎缩等历史事件。洞庭湖6个河蚬群体间不存在显著的遗传差异,可将其作为一个整体进行管理和保护。 展开更多

关键词 河蚬 线粒体细胞色素b 遗传多样性 遗传结构 洞庭湖

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大规模人工增殖放流对青海湖裸鲤种群多样性的影响

15

作者 陈生学 刘思嘉 +7 位作者 田菲 祁洪芳 俞录贤 柴长凯 汪洋 江华敏 李晓环 赵凯 《水生态学杂志》 北大核心 2025年第3期102-110,共9页

分析大规模人工增殖放流对青海湖裸鲤种群的影响,为今后实施更加有效的保护措施提供科学依据。对2020—2022年间青海湖裸鲤增殖放流的幼鱼群体(FL)、野生群体(SS)、保种群体(BZ)3个群体以及增殖放流前的历史群体(LS)进行形态学测量、文... 分析大规模人工增殖放流对青海湖裸鲤种群的影响,为今后实施更加有效的保护措施提供科学依据。对2020—2022年间青海湖裸鲤增殖放流的幼鱼群体(FL)、野生群体(SS)、保种群体(BZ)3个群体以及增殖放流前的历史群体(LS)进行形态学测量、文献调研及线粒体基因测序,对形态特征、遗传多样性及种群结构进行比较分析。结果显示,形态特征上,青海湖裸鲤第一鳃弓外鳃耙数和体长体高比等形态特征SS与LS群体之间无显著差异(P>0.05);对3461个样本的细胞色素b基因(Cyt b)测序后共获得20个变异位点和23个单倍型,比较分析单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数在SS、FL、BZ与LS之间无显著差异(P>0.05);单倍型网络分析显示SS、FL、BZ与LS的遗传结构一致。研究结果表明,科学合理的人工增殖放流措施并没有影响青海湖裸鲤种群原有的遗传多样性和种群结构。 展开更多

关键词 青海湖裸鲤 遗传多样性 大规模人工增殖放流 线粒体细胞色素b 形态特征

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齐口裂腹鱼基于Cyt b基因序列多态性研究 被引量：5

16

作者 晁燕 杨成 +3 位作者 申志新 唐文家 王国杰 祁得林 《水产科学》 CAS 北大核心 2010年第7期421-424,共4页

采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序方法获得了齐口裂腹鱼玛柯河和大渡河2个种群25个个体线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(Cyt b)基因的全序列(1140 bp),分析了种群遗传多样性和遗传结构。25个序列经比对后,发现12个(1.05%)多态性位点,共定义... 采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序方法获得了齐口裂腹鱼玛柯河和大渡河2个种群25个个体线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(Cyt b)基因的全序列(1140 bp),分析了种群遗传多样性和遗传结构。25个序列经比对后,发现12个(1.05%)多态性位点,共定义了8个单倍型,其中有一个单倍型(hp2)为2个种群所共享。遗传多样性分析结果表明,齐口裂腹鱼玛柯河种群的单倍型多样度(h=0.5606±0.1540)和核苷酸多样度(π=0.0007±0.0005)均明显偏低,这可能与近年来自然环境的恶化及人为活动的影响有关。系统发育分析和AMOVA分析结果综合表明,齐口裂腹鱼玛柯河种群与大渡河种群的基因交流受到一定程度的限制,自然种群出现明显的分化现象。 展开更多

关键词 齐口裂腹鱼 线粒体细胞色素b基因 遗传多样性 基因流

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川陕哲罗鲑Cyt b基因克隆及其在鲑亚科中的系统发育关系 被引量：6

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作者 祁得林 晁燕 +2 位作者 杨成 申志新 唐文家 《四川动物》 CSCD 北大核心 2009年第6期805-809,共5页

采用聚合酶链式反应克隆川陕哲罗鲑Hucho bleekeri线粒体细胞色素b基因(Cyt b),首次报道该基因的全长序列(1140bp,GenBank登录号FJ597623),并与鲑亚科中其他5属14个物种的Cyt b基因进行同源性比较,分析了碱基组成和变异情况,以白鲑亚科... 采用聚合酶链式反应克隆川陕哲罗鲑Hucho bleekeri线粒体细胞色素b基因(Cyt b),首次报道该基因的全长序列(1140bp,GenBank登录号FJ597623),并与鲑亚科中其他5属14个物种的Cyt b基因进行同源性比较,分析了碱基组成和变异情况,以白鲑亚科的白鲑Coregonus lavaretus作为外群构建了ML、NJ和MP系统发育树。遗传距离和分子系统学分析表明,川陕哲罗鲑与细鳞鲑属的细鳞鱼Brachymystax lenok之间的遗传距离相对较小(8.47%),在系统发育树上两者聚在一起,提示川陕哲罗鲑与细鳞鱼存在较近的亲缘关系,该结果与以往的形态学分类不相符。 展开更多

关键词 川陕哲罗鲑 线粒体细胞色素b基因 克隆 系统发育分析

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基于Cytb基因序列的拟硬刺高原鳅遗传多样性研究 被引量：9

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作者 杨成 申志新 +2 位作者 王国杰 晁燕 祁得林 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第25期15395-15396,共2页

[目的]探究拟硬刺高原鳅种群的遗传多样性和分化程度。[方法]采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序方法获得拟硬刺高原鳅线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(Cytb)基因的全序列。[结果]拟硬刺高原鳅3个种群共58个个体均获得Cytb基因的全长序列(1 1... [目的]探究拟硬刺高原鳅种群的遗传多样性和分化程度。[方法]采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序方法获得拟硬刺高原鳅线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(Cytb)基因的全序列。[结果]拟硬刺高原鳅3个种群共58个个体均获得Cytb基因的全长序列(1 140 bp),共定义了20个单倍型,拟硬刺高原鳅宝库河种群遗传多样性低于黄河种群。[结论]拟硬刺高原鳅黄河种群和宝库河种群间存在显著的分化,建议在实践中将2种群分开管理和保护,以达到保护种群遗传多样性的目的。 展开更多

关键词 拟硬刺高原鳅 线粒体细胞色素b基因 遗传多样性

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利用mtDNA Cytb基因探讨黔东南小香羊系统地位 被引量：2

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作者 罗卫星 杨忠诚 刘若余 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2010年第2期575-578,共4页

黔东南小香羊和贵州白山羊之间的遗传关系一直存在争议,为此,对黔东南小香羊16个个体和贵州白山羊13个个体细胞色素b基因全序列进行了测定,通过遗传多样性和系统发育分析,探讨黔东南小香羊系统地位。结果表明:在2个贵州山羊群体中共观察... 黔东南小香羊和贵州白山羊之间的遗传关系一直存在争议,为此,对黔东南小香羊16个个体和贵州白山羊13个个体细胞色素b基因全序列进行了测定,通过遗传多样性和系统发育分析,探讨黔东南小香羊系统地位。结果表明:在2个贵州山羊群体中共观察到8种单倍型,2种单倍型共享,其中,贵州白山羊有7种单倍型,黔东南小香羊有3种单倍型;黔东南小香羊单倍型多样性(Hd)为0.625,核苷酸多样性(Pi)为0.00189,贵州白山羊的Hd和Pi分别为0.923和0.00324,贵州白山羊遗传多样性比黔东南小香羊丰富。结合从GenBank中检索获得的野生山羊、岩羊、绵羊细胞色素b基因序列构建分子系统发生树,结果显示,黔东南小香羊和贵州白山羊与胃石山羊亲缘关系最近,与我国野生岩羊亲缘关系较远。 展开更多

关键词 黔东南小香羊 线粒体细胞色素b基因(Cytb) 系统地位

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板角山羊mtDNA Cyt b基因变异特点及系统进化研究 被引量：1

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作者 邓书湛 刘若余 吴芸 《四川动物》 CSCD 北大核心 2009年第5期720-723,共4页

测定了板角山羊品种13个个体的细胞色素b基因全序列(1140bp),比较分析了群体中细胞色素b基因的碱基组成和序列间碱基的变异情况,结果显示:在该品种(群体)中细胞色素b基因序列中6个变异位点上观察到11次T-C间和2次A-G间的碱基转换,除了有... 测定了板角山羊品种13个个体的细胞色素b基因全序列(1140bp),比较分析了群体中细胞色素b基因的碱基组成和序列间碱基的变异情况,结果显示:在该品种(群体)中细胞色素b基因序列中6个变异位点上观察到11次T-C间和2次A-G间的碱基转换,除了有2次T-C间碱基转换发生在密码子第2位点为非同义突变以外,其余的11次碱基转换发生在密码子第3位点,均为同义突变;有1次T-G间碱基颠换发生在密码子第2位点,为非同义突变;观察到5种单倍型,单倍型多样度为0.8077。并以绵羊为外群,与山羊属其他种的同源区序列构建系统发生树。结果显示,在系统地位上板角山羊与胃石山羊有较近的亲缘关系。 展开更多

关键词 山羊 线粒体细胞色素b基因(Cyt b) 系统进化

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