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植物CMS线粒体相关开放阅读框(ORFs)研究进展 被引量:2
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作者 赵艳红 周瑞阳 +1 位作者 陈鹏 廖剑 《种子》 CSCD 北大核心 2011年第10期51-55,共5页
从DNA、RNA、蛋白质水平分别阐述了线粒体开放阅读框(ORFs)与胞质雄性不育(CMS)的关系,并对目前发掘与胞质雄性不育相关的线粒体基因的研究策略进行了探讨。
关键词 胞质雄性不育 线粒体 开放阅读
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RT-PCR联合一步法扩增G蛋白α亚基基因的开放阅读框
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作者 彭艳华 黄永秀 齐义鹏 《武汉植物学研究》 CSCD 1996年第2期97-100,共4页
报道逆转录-多聚酶链式反应(RT-PCR)联合一步程序,扩增大于1kb的拟南芥菜G蛋白α亚基基因的开放阅读框。该程序中,当RNA模板和引物变性,并在同一管中加入PCR缓冲液、4种dNTP底物、逆转录酶和TaqDNA聚... 报道逆转录-多聚酶链式反应(RT-PCR)联合一步程序,扩增大于1kb的拟南芥菜G蛋白α亚基基因的开放阅读框。该程序中,当RNA模板和引物变性,并在同一管中加入PCR缓冲液、4种dNTP底物、逆转录酶和TaqDNA聚合酶之后,就不需其它手工操作步骤,因而可同时进行大批量样品的操作。实验结果证明AMV(鸟类骨髓性白血病病毒)逆转录酶对TaqDNA聚合酶的活性没有抑制作用。这种RT-PCR联合一步法可从0.5μg的总RNA中快速地扩增长于1.0kb的cDNA片段。 展开更多
关键词 拟南芥菜 RT-PCR 开放阅读 G蛋白 Α亚基基因
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鸡PPARγ基因转录本3上游开放阅读框转录后的调控作用 被引量:1
3
作者 褚衍凯 靳艳飞 +5 位作者 邢天宇 马广伟 崔婷婷 闫晓红 李辉 王宁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期657-667,共11页
过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator-activated receptor gamma,PPARγ)是脂肪生成的关键调控因子。本实验室前期研究发现,与人和鼠等哺乳动物PPARγ基因的转录本不同,鸡PPARγ基因的多个转录本5′UTR区存在上游开... 过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator-activated receptor gamma,PPARγ)是脂肪生成的关键调控因子。本实验室前期研究发现,与人和鼠等哺乳动物PPARγ基因的转录本不同,鸡PPARγ基因的多个转录本5′UTR区存在上游开放阅读框(upstream open reading frames,u ORFs)。为了揭示该u ORF转录后的调控作用,本研究构建了鸡PPARγ基因转录本3(c PPARγ3)野生型5′UTR报告基因载体psi CHECK2-c PPARγ3-5′UTR-WT和u ORF突变(u ATG突变为终止密码子TGA)的5′UTR报告基因载体psi CHECK2-c PPARγ3-5′UTR-Mut。将这两个报告基因载体分别转染永生化鸡前脂肪细胞(immortalized chicken pre-adipocytes,ICPA)和鸡胚成纤维细胞DF1,检测海肾荧光素酶报告基因h Rluc活性及其m RNA表达。荧光素酶报告基因检测结果显示,在ICPA细胞中,psi CHECK2-c PPARγ3-5′UTR-Mut的h Rluc报告基因活性极显著高于psi CHECK2-c PPARγ3-5′UTR-WT(P<0.01);在DF1细胞中,psi CHECK2-c PPARγ3-5′UTR-Mut的h Rluc报告基因活性高于psi CHECK2-c PPARγ3-5′UTR-WT,但差异不显著(P>0.05)。q RT-PCR检测h Rluc基因m RNA表达结果显示,与psi CHECK2-c PPARγ3-5′UTR-WT相比,在ICPA细胞中,psi CHECK2-c PPARγ3-5′UTR-Mut转染细胞的h Rluc基因的m RNA表达水平极显著降低(P<0.01);在DF1细胞中,psi CHECK2-c PPARγ3-5′UTR-Mut转染细胞后,h Rluc基因的m RNA表达水平也降低,但差异不显著(P>0.05)。为进一步分析该u ORF对鸡c PPARγ3的转录后调控作用,本研究又分别构建了野生型c PPARγ3真核表达载体pc DNA3.1-c PPARγ3-WT和u ORF突变的c PPARγ3真核表达载体pc DNA3.1-c PPARγ3-Mut。q RT-PCR检测c PPARγ3的m RNA表达水平,结果显示,在这两种细胞中,pc DNA3.1-c PPARγ3-Mut转染细胞的c PPARγ3 m RNA表达水平均显著低于pc DNA3.1-c PPARγ3-WT转染细胞(P<0.05),但Western blot结果显示,pc DNA3.1-c PPARγ3-Mut转染细胞的PPARγ蛋白表达水平极显著高于pc DNA3.1-c PPARγ3-WT转染细胞(P<0.01)。这些研究结果表明,5′UTR区的u ORF抑制鸡c PPARγ3的翻译。 展开更多
关键词 PPARΓ基因 上游开放阅读 翻译抑制
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鸡PPARγ基因转录本5的两个上游开放阅读框功能分析
4
作者 王宁 娄钰琦 +5 位作者 褚衍凯 黄佳新 徐海冬 罗昊玉 娄明 牟芳 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期70-78,共9页
前期研究发现,鸡PPARγ基因转录本5(c PPARγ5)的5’非翻译区(5’untranslated region,5’UTR)存在两个上游开放阅读框(uORF1和uORF2)。为揭示这两个uORFs在鸡PPARγ基因表达转录后调控作用,试验使用报告基因、定点突变、q RT-PCR和West... 前期研究发现,鸡PPARγ基因转录本5(c PPARγ5)的5’非翻译区(5’untranslated region,5’UTR)存在两个上游开放阅读框(uORF1和uORF2)。为揭示这两个uORFs在鸡PPARγ基因表达转录后调控作用,试验使用报告基因、定点突变、q RT-PCR和Western blot等技术,分析两个uORFs对报告基因活性及PPARγmRNA和蛋白表达的影响。结果表明,与野生型相比,uORF1和uORF2分别突变和同时突变均显著促进报告基因活性及PPARγm RNA和蛋白表达(P<0.05)。mRNA稳定性分析发现,两个uORFs突变对报告基因mRNA稳定性无显著影响。启动子活性分析发现,c PPARγ的5’UTR区具有启动子活性。研究结果表明,cPPARγ5的两个u ORFs抑制其翻译。 展开更多
关键词 PPARΓ基因 5’非翻译区 上游开放阅读 翻译抑制
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棉花CMS-D2和CMS-D8不育系线粒体全基因组比较分析
5
作者 葛李爽 冯娟娟 +8 位作者 张梦 郭立平 戚廷香 张学贤 李永旗 唐会妮 乔秀琴 邢朝柱 吴建勇 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期28-38,共11页
【目的】探究哈克尼西棉不育胞质(CMS-D2)和三裂棉不育胞质(CMS-D8)的不育系线粒体基因组之间的序列结构差异,为筛选鉴定不育相关基因奠定基础。【方法】根据D2A和D8A这2个不育系的线粒体基因组测序组装结果,使用Synteny and Rearrangem... 【目的】探究哈克尼西棉不育胞质(CMS-D2)和三裂棉不育胞质(CMS-D8)的不育系线粒体基因组之间的序列结构差异,为筛选鉴定不育相关基因奠定基础。【方法】根据D2A和D8A这2个不育系的线粒体基因组测序组装结果,使用Synteny and Rearrangement Identifier(Sy RI)软件鉴定结构变异,用Plotsr可视化分析包含共线性及非共线性区域的重组变异位点。以D8A线粒体基因组注释结果为参考,用D2A线粒体基因组注释的开放阅读框(open reading frame,ORF)编码的氨基酸序列进行tblastn比对,筛选出D2A线粒体基因组中特有的ORF,并进行聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)验证、相对表达量分析和生物信息学分析。【结果】D2A和D8A这2个不育系线粒体基因组之间存在2个部分重叠且相邻的倒易位区域。在D2A中发现17个特异的ORF,PCR验证了D2A中存在的6个特异ORF(orf114e、orf121b-1、orf121b-2、orf138b-2、orf186a-2和orf317a-2)。3~4 mm花蕾中orf121b-1和orf121b-2的相对表达量较高。orf114e、orf186a-2和orf317a-2具有典型的跨膜结构域和嵌合基因结构,符合不育基因的部分特征。【结论】D2A和D8A线粒体基因组间存在2个相邻的倒易位区域。D2A中存在6个特异的ORF,其中orf114e、orf186a-2和orf317a-2可能与棉花CMS-D2孢子体败育有关。 展开更多
关键词 棉花 细胞质雄性不育 线粒体基因 孢子体不育 配子体不育 开放阅读
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植物细胞质雄性不育与线粒体 被引量:2
6
作者 雷刚 方荣 +3 位作者 周坤华 黄月琴 袁欣捷 陈学军 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期1617-1626,共10页
细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterility,CMS)是由于核基因组与细胞质基因组之间不协调互作导致的一种雄性器官异常而雌器官可以接受外来花粉正常结实的自然现象。在生产上,CMS是植物杂交制种的有力工具和杂种优势利用的重要途径。... 细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterility,CMS)是由于核基因组与细胞质基因组之间不协调互作导致的一种雄性器官异常而雌器官可以接受外来花粉正常结实的自然现象。在生产上,CMS是植物杂交制种的有力工具和杂种优势利用的重要途径。对CMS分子机制的解析是其有效利用的基础,一直以来都是研究的热点,然而其机制研究却相对滞后。该文从线粒体嵌合基因(orfs)形成、特征及分类,基因转录后修饰(RNA编辑)的特点及与CMS的关系,基因翻译产物特征、分类及其与CMS的关系等3个方面综述了近年来植物胞质雄性不育的机制研究进展,以期为进一步深入解析其分子机制提供理论参考。 展开更多
关键词 胞质雄性不育 线粒体嵌合基因/开放阅读框 RNA编辑 能量赤字 毒性蛋白 程序性细胞死亡
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怀地黄基因片段及其中转座酶基因的克隆与序列分析 被引量:5
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作者 周延清 姚换灵 +4 位作者 段红英 周春娥 张永华 陈艳梅 张喻 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第1期106-109,共4页
根据已知裂叶牵牛花PNZIP启动子碱基序列的相关信息设计引物,采用PCR方法,从怀地黄基因组中扩增出5个基因片段,回收和克隆出其中一个1 096bp的基因片段。经过NCBI对比分析,发现它是一个类似转座子的相关蛋白基因序列,含有一个完整的开... 根据已知裂叶牵牛花PNZIP启动子碱基序列的相关信息设计引物,采用PCR方法,从怀地黄基因组中扩增出5个基因片段,回收和克隆出其中一个1 096bp的基因片段。经过NCBI对比分析,发现它是一个类似转座子的相关蛋白基因序列,含有一个完整的开放阅读框,大小为450bp,编码由150个氨基酸组成的转座酶。然后,基于该开放阅读框的碱基序列,设计另一对引物,用PCR方法,从中扩增出该完整开放阅读框的序列片段。 展开更多
关键词 怀地黄 转座酶基因 基因克隆 开放阅读 序列分析
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雌核发育银鲫四种孵化酶基因全长cDNA的克隆及其特征分析 被引量:10
8
作者 刘军 石耀华 +1 位作者 尹隽 桂建芳 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2003年第7期38-45,共8页
用抑制性差减杂交结合SMARTcDNA合成和RACE PCR技术 ,克隆得到雌核发育银鲫 (Carassiusauratusgibelio) 4种孵化酶基因的全长cDNA。 4种孵化酶基因分别被命名为GHE1、GHE2、GHE3、GHE4。序列分析表明 ,4种孵化酶基因cDNA的开放阅读框均... 用抑制性差减杂交结合SMARTcDNA合成和RACE PCR技术 ,克隆得到雌核发育银鲫 (Carassiusauratusgibelio) 4种孵化酶基因的全长cDNA。 4种孵化酶基因分别被命名为GHE1、GHE2、GHE3、GHE4。序列分析表明 ,4种孵化酶基因cDNA的开放阅读框均为 795bp ,都编码 2 6 5个氨基酸。它们推断的编码氨基酸序列同源性在 79 6~95 1 %之间。种系分析表明 ,GHE1、GHE2、GHE3、GHE4的进化地位位于日本鳗鲡(Anguillajaponica)孵化酶和青 (Oryziaslatipes)孵化酶之间。不同发育时期胚胎的RT PCR分析表明 ,银鲫GHE1、GHE2、GHE3、GHE4 4种孵化酶基因从尾芽期到幼苗期都检测到表达 ,且GHE3和GHE4在神经胚期也检测到表达。各种组织的RT PCR表明 。 展开更多
关键词 银鲫 雌核 孵化酶基因 抑制性差减杂交 SMARTcDNA RACE-PCR 克隆 开放阅读 氨基酸序列同源性
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基因表达式编程ORF过滤算子的设计和实现 被引量:4
9
作者 段磊 唐常杰 +2 位作者 刘胤田 左劼 吴江 《四川大学学报(工程科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第6期102-106,共5页
基因表达式编程(GEP)的个体代表了问题的候选解。在缺乏先验知识的情况下,个体长度的设定是个"两难"问题,过长或过短都会降低GEP的效率。对此,分析了个体长度对GEP求解效率的影响;设计了开放阅读框(ORF)过滤算子根据最优个体... 基因表达式编程(GEP)的个体代表了问题的候选解。在缺乏先验知识的情况下,个体长度的设定是个"两难"问题,过长或过短都会降低GEP的效率。对此,分析了个体长度对GEP求解效率的影响;设计了开放阅读框(ORF)过滤算子根据最优个体的进化历程动态调节个体的有效编码区域;验证了ORF过滤算子的有效性,实验结果表明,在同样的进化代数内,引入ORF过滤算子,GEP能进化出更高适应度的最优解且减少平均运行时间17.0%。 展开更多
关键词 基因表达式编程 开放阅读 个体
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植物CMS不育基因的研究进展 被引量:2
10
作者 杨慧丽 杨露 +3 位作者 张怀胜 林亚楠 李冰 薛亚东 《广东农业科学》 CAS 2018年第10期9-16,共8页
植物细胞质雄性不育是指植物的生殖器官不能产生雄配子,而雌器官发育正常,可接受外来花粉正常结实的一种生物学现象。细胞质雄性不育是由核基因和线粒体基因互作共同起作用,影响了植物花药的绒毡层和正在进行减数分裂的细胞,从而导致植... 植物细胞质雄性不育是指植物的生殖器官不能产生雄配子,而雌器官发育正常,可接受外来花粉正常结实的一种生物学现象。细胞质雄性不育是由核基因和线粒体基因互作共同起作用,影响了植物花药的绒毡层和正在进行减数分裂的细胞,从而导致植物体花粉产生败育。在生产上细胞质雄性不育对于作物杂种优势的利用、杂交种的制种都有重要意义。雄性不育现象无论是在遗传方向还是分子水平上一直以来都是科学家们研究的热点,深入研究细胞质雄性不育的机制有利于更有效地在生产上加以利用。对近年来植物细胞质雄性不育中发现的细胞质雄性不育基因的来源及分类、细胞质雄性不育与杂种优的相互关系、细胞质雄性不育的机理及目前发现的细胞质雄性不育基因进行概述,并探讨了植物细胞质雄性不育研究的发展前景。 展开更多
关键词 细胞质雄性不育 杂种优势 线粒体基因 细胞核基因 开放阅读(ORF) 基因重组
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荔枝DA1同源基因的克隆及生物信息学分析 被引量:1
11
作者 王弋 董晨 +2 位作者 魏永赞 郑雪文 李伟才 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第11期2509-2513,共5页
【目的】克隆荔枝种子大小调控基因DA1,对其进行生物信息学分析。为深入研究荔枝LcDA1基因的功能提供理论参考。【方法】利用生物信息学软件对荔枝DA1同源基因及其编码蛋白进行预测和分析。以荔枝种子cDNA为材料,采用RT-PCR扩增3个LcDA... 【目的】克隆荔枝种子大小调控基因DA1,对其进行生物信息学分析。为深入研究荔枝LcDA1基因的功能提供理论参考。【方法】利用生物信息学软件对荔枝DA1同源基因及其编码蛋白进行预测和分析。以荔枝种子cDNA为材料,采用RT-PCR扩增3个LcDA1基因全长。【结果】根据转录组数据获得3个DA1同源基因,分别命名为LcDA1-1、LcDA1-2和LcDA1-3。开放阅读框(ORF)分别为1479,1419和1104 bp,分别编码492,472和367个氨基酸。氨基酸序列分析结果显示3个蛋白均含有典型的UIM和LIM结构域。【结论】荔枝LcDA1蛋白具有典型的DA1保守结构域,可能在荔枝种子发育中具有重要作用。 展开更多
关键词 荔枝 DA1基因 结构域 开放阅读
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乳草长蝽Ubx基因克隆及多转录本分析 被引量:1
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作者 田晓轩 谢强 卜文俊 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期390-396,共7页
针对非完全变态类昆虫发育关键基因的研究相对匮乏,尤其缺少Hox基因家族的基因结构和序列信息。为了研究Hox基因家族成员之一的Ubx基因在非完全变态类昆虫中的结构特点,本实验选取乳草长蝽Oncopeltus fasciatus(Dallas,1852)为代表,应用... 针对非完全变态类昆虫发育关键基因的研究相对匮乏,尤其缺少Hox基因家族的基因结构和序列信息。为了研究Hox基因家族成员之一的Ubx基因在非完全变态类昆虫中的结构特点,本实验选取乳草长蝽Oncopeltus fasciatus(Dallas,1852)为代表,应用RACE和RT-PCR技术,对其Ubx基因的全长开放阅读框进行克隆。结果显示:乳草长蝽Ubx基因(Of-Ubx)开放阅读框全长888bp,推测的完整蛋白含有295个氨基酸。Southern blot证实Ubx基因以单拷贝形式存在且含有内含子。在Of-Ubx的YPWM基序和同源异型结构域之间存在选择性剪接位点,可产生3种不同转录本。分析以上实验结果,发现乳草长蝽与黑腹果蝇Drosophila melanogaster(Meigen,1830)的Ubx基因拥有相似的剪接位置、剪接体组合和边界序列,提示它们很可能具有相似的剪接机理。这是Ubx基因的多转录本现象在昆虫纲中果蝇属以外类群中的首次详尽报道。 展开更多
关键词 乳草长蝽 Ubx基因 克隆 开放阅读 多转录本
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农业害虫铅灰齿爪鳃金龟气味受体基因Or83b的克隆及序列分析 被引量:3
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作者 陈全森 姜晓静 +3 位作者 鞠倩 赵志强 曲明静 朱新产 《江西农业学报》 CAS 2010年第11期1-4,共4页
采用简并引物反转录多聚酶链式反应(RT-PCR)和cDNA末端快速扩增(RACE)技术,从农业害虫铅灰齿爪鳃金龟中分离和克隆了一类非常保守的嗅觉受体蛋白基因(命名为Hp-Or83b)全序列。Hp-Or83b全长共1822 bp,5’-UTR为168 bp,3’-UTR为220 bp,... 采用简并引物反转录多聚酶链式反应(RT-PCR)和cDNA末端快速扩增(RACE)技术,从农业害虫铅灰齿爪鳃金龟中分离和克隆了一类非常保守的嗅觉受体蛋白基因(命名为Hp-Or83b)全序列。Hp-Or83b全长共1822 bp,5’-UTR为168 bp,3’-UTR为220 bp,开放阅读框全长1434 bp,编码478个氨基酸,预测分子量为54.24 kDa,等电点为7.46。通过同源性比较,发现Hp-Or83b氨基酸序列与已知的其它昆虫的Or83b具有较高的同源性。因此推断所获得的cDNA序列为农业害虫铅灰齿爪鳃金龟气味受体基因Or83b的cDNA序列。 展开更多
关键词 农业害虫 铅灰 金龟 气味 受体基因 克隆 序列分析 Receptor Sequence Analysis 反转录多聚酶链式反应 CDNA序列 同源性比较 末端快速扩增 氨基酸序列 开放阅读 嗅觉受体 简并引物 蛋白基因 全序列 分子量
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基于宏基因组长片段的基因预测算法基准 被引量:1
14
作者 李瑞琳 尚秋明 +4 位作者 韩鑫胤 张裕 祝海栋 LI Weizhong 牛北方 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2019年第A01期143-149,共7页
目前,围绕宏基因组的模拟读长(reads)或片段、全基因组等不同类型的输入数据,新的基因预测算法、软件与工具层出不穷,但存在三方面的问题:一、基于模拟reads或片段得出的结果无法准确反映真实基因的预测效果,而基于全基因组得出的结果... 目前,围绕宏基因组的模拟读长(reads)或片段、全基因组等不同类型的输入数据,新的基因预测算法、软件与工具层出不穷,但存在三方面的问题:一、基于模拟reads或片段得出的结果无法准确反映真实基因的预测效果,而基于全基因组得出的结果不能实现未知物种的预测;二、模拟reads或片段大多小于真实基因的总长度,软件很难预测出完整的基因,甚至丢失部分真实基因;三、长片段基因预测的基准衡量研究较少,大大限制了基因预测在不同领域的应用。针对以上问题,提出基于真实数据长片段基因预测的基准衡量方法。首先,对两个包含20种细菌株的真实序列数据集进行过滤及组装处理;其次,利用组装后得到的长片段支架(scaffolds)作为输入,对6种软件进行基准性能评估;最后,基于评估结果进行错误率上限分析。实验结果表明,在覆盖度较高的数据集上,Prodigal、GeneMarkS-2、MetaGeneAnnotator和FragGeneScan这4种软件错误率接近且最低,在3.5%~22.8%变化;在低覆盖度的数据集上,GeneMarkS-2错误率最低,在27.1%~54.7%变化。 展开更多
关键词 基因 基因预测 开放阅读 组装 基准衡量
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真鲷转铁蛋白基因的克隆与表达特征分析 被引量:7
15
作者 蔡忠华 宋林生 +1 位作者 高春萍 吴龙涛 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期105-110,共6页
采用同源克隆的方法,根据相近物种转铁蛋白(Transferrin, TF)基因的序列设计简并引物,在经感染真鲷的cDNA上进行PCR扩增,获得了真鲷TF的全基因编码序列(GeneBank Accession No.AY335444).该序列由2444bp核苷酸组成,含31 bp 5′非编码区... 采用同源克隆的方法,根据相近物种转铁蛋白(Transferrin, TF)基因的序列设计简并引物,在经感染真鲷的cDNA上进行PCR扩增,获得了真鲷TF的全基因编码序列(GeneBank Accession No.AY335444).该序列由2444bp核苷酸组成,含31 bp 5′非编码区和340 bp 3′非编码区以及2073 bp的开放阅读框,可编码691个氨基酸,预测分子量约为74.3kD,等电点为5.63.同源性分析表明,真鲷TF与鱼类TF的相似性很高,约为65%~75%;与哺乳类转铁蛋白和乳铁蛋白的相似性约40%~50%;与脊索动物海鞘和无脊椎动物昆虫也有一定的相似性.进化分析表明,该基因是转铁蛋白而不是乳铁蛋白.真鲷TF与其它动物TF结构相似,是由两叶相似的结构域构成的单一肽链;该基因有一信号肽序列,缺乏糖基化位点,在它的两个结构域上,分别有三个TF家族的标签序列及一个MHC分子标签序列;与哺乳类相比,参与蛋白二硫键形成的半胱氨酸以及铁离子结合位点高度保守.RT-PCR结果显示,真鲷TF在肝脏成组成型表达,但在其它组织中的表达可受病原调控,表现为经病原刺激后转铁蛋白基因的组织分布显著增多. 展开更多
关键词 蛋白基因 真鲷 特征分析 转铁蛋白 RT-PCR 非编码区 乳铁蛋白 PCR扩增 核苷酸组成 开放阅读 无脊椎动物 二硫键形成 组成型表达 相似性 同源克隆 简并引物 序列设计 cDNA 编码序列 脊索动物 结合位点 半胱氨酸 组织分布
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人KiSS-1基因克隆及其真核表达载体的构建 被引量:1
16
作者 王春晖 乔宠 戴显伟 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期218-219,共2页
目的:克隆转移抑制基因KiSS1的不含信号肽的表达序列,构建人KiSS1基因的真核表达载体。方法:从人正常胰腺组织中提取总RNA,经RT PCR得到KiSS1基因开放阅读框cDNA序列,并将其克隆到真核表达载体pcDNA3中,构建真核表达质粒pcDNA3/KiSS1。... 目的:克隆转移抑制基因KiSS1的不含信号肽的表达序列,构建人KiSS1基因的真核表达载体。方法:从人正常胰腺组织中提取总RNA,经RT PCR得到KiSS1基因开放阅读框cDNA序列,并将其克隆到真核表达载体pcDNA3中,构建真核表达质粒pcDNA3/KiSS1。结果:经PCR、酶切鉴定和基因序列测定,证实重组入载体pcDNA3的片段为目的基因开放阅读框的核苷酸序列。结论:重组质粒pcDNA3/KiSS1的成功构建,为该基因相应蛋白质的表达和其抗体的制备研究提供基础。 展开更多
关键词 真核表达载体 基因克隆 KISS-1基因 pcDNA3 开放阅读 转移抑制基因 正常胰腺组织 cDNA序列 RT-PCR 真核表达质粒 基因序列测定 核苷酸序列 表达序列 总RNA 酶切鉴定 目的基因 重组质粒 信号肽 蛋白质 栽体
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烟草基因组知识篇:3.基因组注释 被引量:1
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作者 刘贯山 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2010年第3期82-83,共2页
在完成序列的拼接后,得到的是很长的DNA序列、甚至可能是整个基因组的序列。这些序列中包含许多未知的基因,将基因从这些序列中找出来是基因组注释的主要内容。基因组DNA序列可分为两大部分:基因及其相关序列、基因间序列。以起始密码... 在完成序列的拼接后,得到的是很长的DNA序列、甚至可能是整个基因组的序列。这些序列中包含许多未知的基因,将基因从这些序列中找出来是基因组注释的主要内容。基因组DNA序列可分为两大部分:基因及其相关序列、基因间序列。以起始密码子开始、终止密码子结束、称之为开放阅读框(open readingframe,ORF)的序列为基因序列,它们可编码蛋白质和RNA(非编码RNA),所以又称为编码序列;基因相关序列包括拟(假)基因(pseudogene)、基因片段、内含子、非翻译区(untranslated region,UTR)等。基因间序列主要是一些重复序列,它们是所有基因组尤其是真核生物基因组共同的重要特征。 展开更多
关键词 基因组注释 DNA序列 知识 烟草 相关序列 起始密码子 终止密码子 开放阅读
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一个编码玉米转译起始因子新基因的克隆
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作者 胡建广 袁自强 +3 位作者 赵相山 钱晓茵 程宁辉 杨金水 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1998年第S1期120-120,共1页
一个编码玉米转译起始因子新基因的克隆胡建广袁自强赵相山钱晓茵程宁辉杨金水(复旦大学遗传学研究所,上海200433)杂交玉米在生长势、抗逆性与产量性状等方面表现明显的超亲优势,这涉及到杂种一代的亲本基因表达方式发生改变... 一个编码玉米转译起始因子新基因的克隆胡建广袁自强赵相山钱晓茵程宁辉杨金水(复旦大学遗传学研究所,上海200433)杂交玉米在生长势、抗逆性与产量性状等方面表现明显的超亲优势,这涉及到杂种一代的亲本基因表达方式发生改变。我们以玉米杂种一代增强表达的基因... 展开更多
关键词 转译起始因子 基因的克隆 杂种一代 玉米 编码 基因的表达调控 开放阅读 亲本基因 差异展示 普通烟草
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细胞质雄性不育表型及不育机制研究进展
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作者 王雪松 邹益 +2 位作者 王杰 聂丽云 武志强 《广西植物》 北大核心 2025年第3期483-499,共17页
植物线粒体基因组内特殊的开放阅读框(open reading frame,ORF)导致植物不产生雄配子或产生的雄配子无法正常受精,这种现象被称为细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterility,CMS)。CMS材料雄配子稳定败育的特性使其在杂交种商业化生产... 植物线粒体基因组内特殊的开放阅读框(open reading frame,ORF)导致植物不产生雄配子或产生的雄配子无法正常受精,这种现象被称为细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterility,CMS)。CMS材料雄配子稳定败育的特性使其在杂交种商业化生产中一直扮演着重要角色,有效降低了制种成本,提高了杂交种纯度。随着对CMS现象研究的深入,新的CMS材料通过各种手段被不断创制出来,相关的不育基因也逐渐被定位和克隆。该文首先概述了目前对CMS基因进化的研究和常用CMS材料及其相关CMS基因的挖掘情况,随后总结了CMS材料在物质能量代谢、激素水平等方面的表型特点。同时整合了当前对CMS分子机制的几种假说,并结合实验证据提出对CMS分子机制的观点。以期在总结当前细胞质雄性不育研究的基础上对未来更加深入的理论和实验研究提供参考。 展开更多
关键词 细胞质雄性不育 线粒体基因 活性氧(ROS) 开放阅读(ORF) CMS分子机制
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脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)vasa基因cDNA克隆及其在卵巢发育中的表达分析 被引量:3
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作者 徐文斐 刘萍 +2 位作者 李吉涛 李健 陈萍 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期136-144,574,共9页
VASA蛋白属于DEAD-box家族蛋白,是一种RNA解旋酶,在生殖细胞的分化中具有重要作用。本研究从脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)卵巢中克隆得到vasa基因cDNA全长(将其命名为Ec-vasa),Ec-vasa序列长度为2516bp,开放阅读框(ORF)长度为1800... VASA蛋白属于DEAD-box家族蛋白,是一种RNA解旋酶,在生殖细胞的分化中具有重要作用。本研究从脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)卵巢中克隆得到vasa基因cDNA全长(将其命名为Ec-vasa),Ec-vasa序列长度为2516bp,开放阅读框(ORF)长度为1800bp,编码600个氨基酸,具有DEAD-box家族蛋白的8个高度保守的结构域,与日本沼虾(Macrobrachium nipponense)的同源性最高(80%)。半定量RT-PCR结果显示,Ec-vasa在卵巢组织中特异表达,在肌肉、肝胰腺、心脏和鳃等组织中均未检测到表达。荧光定量结果显示,Ec-vasa在卵巢发育Ⅰ期具有较高表达量,随着卵巢的发育,表达量逐渐降低,在第Ⅳ期达到最低水平。结果表明,Ec-vasa基因可能在脊尾白虾卵巢的早期分化和卵子发生过程中起重要作用。 展开更多
关键词 脊尾白虾 卵巢发育 表达量 日本沼虾 开放阅读 基因片段 卵巢组织 克隆 生殖细胞 卵母细胞
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