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水稻根尖质膜蛋白质组学研究方法的建立
被引量:
7
1
作者
齐耀程
王宁
+2 位作者
程彦伟
徐朗莱
张炜
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期111-117,共7页
以徐稻3号水稻苗期幼嫩根尖为材料,利用葡聚糖/聚乙二醇两相分配法纯化得到纯度达90%的质膜组分,使用优化的双向电泳水化液溶解质膜蛋白,通过等电聚焦/十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶双向电泳(IEF/SDS-PAGE)分离和基质辅助激...
以徐稻3号水稻苗期幼嫩根尖为材料,利用葡聚糖/聚乙二醇两相分配法纯化得到纯度达90%的质膜组分,使用优化的双向电泳水化液溶解质膜蛋白,通过等电聚焦/十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶双向电泳(IEF/SDS-PAGE)分离和基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱(MAI-DI—TOF/TOF)分析,鉴定了31个水稻质膜相关蛋白。结果表明IEF/SDSPAGE双向电泳适合分离亲水性相对较高的膜附着蛋白。进一步利用高盐和温和去污剂对纯化的质膜进行洗涤,以降低质膜组分的复杂程度,通过SDS-PAGE单向电泳分离和液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)分析,鉴定了8个质膜蛋白。经洗涤后的质膜组分复杂度显著降低,SDS-PAGE中的蛋白条带只包含1~2种蛋白,且主要为疏水性较强的穿膜蛋白,说明多种生物化学分离方法及不同质谱分析的综合运用,是解决生物膜蛋白质组学难点的有效途径。
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关键词
水稻
质膜
蛋白质组学
等电聚焦/十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶双向电泳
基质辅助激光解吸电离
串联
飞行时间
质谱
纳升电喷雾串联质谱
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职称材料
肝移植并免疫抑制剂联合用药后人血清差异蛋白质的鉴定
2
作者
李彦
刘锋
+4 位作者
王鸿丽
梁艳
刘煜
杨松成
何昆
《质谱学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期29-32,共4页
建立了基于质谱技术的应用免疫抑制剂肝移植后人血清中差异表达蛋白质的分析方法。肝移植前后的人血清用双向凝胶电泳分离,硝酸银染色,选取的差异蛋白质斑点用表面活性剂Rapigest SF变性和胰蛋白酶进行胶内酶解后,采用纳升超高效液相色...
建立了基于质谱技术的应用免疫抑制剂肝移植后人血清中差异表达蛋白质的分析方法。肝移植前后的人血清用双向凝胶电泳分离,硝酸银染色,选取的差异蛋白质斑点用表面活性剂Rapigest SF变性和胰蛋白酶进行胶内酶解后,采用纳升超高效液相色谱-电喷雾串联质谱(nanoUPLC-ESI-MS/MS)进行鉴定。本实验明确鉴定了9个显著差异表达的蛋白质斑点,对应8个不同的蛋白质,所发现的差异蛋白质多与免疫调节和肝病有关,可为深入研究肝移植术后免疫抑制剂抗排斥作用的分子机理提供线索。
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关键词
肝移植
血清
免疫抑制剂
纳
升
超高效液相色谱-
电喷
雾
串联
质谱
(nanoUPLC-ESI-MS/MS)
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职称材料
题名
水稻根尖质膜蛋白质组学研究方法的建立
被引量:
7
1
作者
齐耀程
王宁
程彦伟
徐朗莱
张炜
机构
南京农业大学生命科学学院生物化学与分子生物学系/南京农业大学一GEHealthcareBiosciences蛋白质组学合作示范实验室
出处
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期111-117,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(30400030)
江苏省基础研究计划创新人才基金资助项目(BK2004416)
文摘
以徐稻3号水稻苗期幼嫩根尖为材料,利用葡聚糖/聚乙二醇两相分配法纯化得到纯度达90%的质膜组分,使用优化的双向电泳水化液溶解质膜蛋白,通过等电聚焦/十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶双向电泳(IEF/SDS-PAGE)分离和基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱(MAI-DI—TOF/TOF)分析,鉴定了31个水稻质膜相关蛋白。结果表明IEF/SDSPAGE双向电泳适合分离亲水性相对较高的膜附着蛋白。进一步利用高盐和温和去污剂对纯化的质膜进行洗涤,以降低质膜组分的复杂程度,通过SDS-PAGE单向电泳分离和液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)分析,鉴定了8个质膜蛋白。经洗涤后的质膜组分复杂度显著降低,SDS-PAGE中的蛋白条带只包含1~2种蛋白,且主要为疏水性较强的穿膜蛋白,说明多种生物化学分离方法及不同质谱分析的综合运用,是解决生物膜蛋白质组学难点的有效途径。
关键词
水稻
质膜
蛋白质组学
等电聚焦/十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶双向电泳
基质辅助激光解吸电离
串联
飞行时间
质谱
纳升电喷雾串联质谱
Keywords
Oryza saliva
plasma membrane
proteomics
isoelectric focusing/sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis
matrix assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry
nanoelectrospray ionization tandem mass spectrometry
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
肝移植并免疫抑制剂联合用药后人血清差异蛋白质的鉴定
2
作者
李彦
刘锋
王鸿丽
梁艳
刘煜
杨松成
何昆
机构
武警总医院药剂科
国家生物医学分析中心
武警总医院肝脏移植研究所
出处
《质谱学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期29-32,共4页
基金
武警总医院二类课题(wz2011019)资助
文摘
建立了基于质谱技术的应用免疫抑制剂肝移植后人血清中差异表达蛋白质的分析方法。肝移植前后的人血清用双向凝胶电泳分离,硝酸银染色,选取的差异蛋白质斑点用表面活性剂Rapigest SF变性和胰蛋白酶进行胶内酶解后,采用纳升超高效液相色谱-电喷雾串联质谱(nanoUPLC-ESI-MS/MS)进行鉴定。本实验明确鉴定了9个显著差异表达的蛋白质斑点,对应8个不同的蛋白质,所发现的差异蛋白质多与免疫调节和肝病有关,可为深入研究肝移植术后免疫抑制剂抗排斥作用的分子机理提供线索。
关键词
肝移植
血清
免疫抑制剂
纳
升
超高效液相色谱-
电喷
雾
串联
质谱
(nanoUPLC-ESI-MS/MS)
Keywords
liver transplantation
serum
immunosuppressive agent
nanoUPLC-ESI- MS/MS
分类号
O657.63 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻根尖质膜蛋白质组学研究方法的建立
齐耀程
王宁
程彦伟
徐朗莱
张炜
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008
7
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职称材料
2
肝移植并免疫抑制剂联合用药后人血清差异蛋白质的鉴定
李彦
刘锋
王鸿丽
梁艳
刘煜
杨松成
何昆
《质谱学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
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