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一株产纤维素酶菌株的筛选、鉴定及全基因组分析
1
作者
车建美
郑雪芳
+3 位作者
王阶平
陈燕萍
陈冰星
刘波
《生物技术通报》
北大核心
2025年第3期294-307,共14页
【目的】筛选纤维素降解酶活性强的微生物菌株,用于青贮饲料的高效发酵。【方法】从已有菌种库中,利用羧甲基纤维素钠平板筛选产纤维素酶菌株,测定其纤维素酶活性;采用形态观察、生理生化及16S rRNA对菌株进行鉴定;测定该菌株的生长曲...
【目的】筛选纤维素降解酶活性强的微生物菌株,用于青贮饲料的高效发酵。【方法】从已有菌种库中,利用羧甲基纤维素钠平板筛选产纤维素酶菌株,测定其纤维素酶活性;采用形态观察、生理生化及16S rRNA对菌株进行鉴定;测定该菌株的生长曲线、生长温度及pH、耐盐性等,研究其生长特性;对该菌株的全基因组数据进行生物信息学分析,探究其产纤维素酶基因。【结果】根据透明圈和菌落直径比值D/d,从菌种库中筛选获得比值最大的菌株为FJAT-25102,其48 h时纤维素酶活性为221.81 U/mL,此外,该菌株具有产蛋白酶和淀粉酶能力。经形态特征、生理生化特征及系统发育分析,将菌株FJAT-25102鉴定为藤黄微球菌(Micrococcus luteus)。菌株FJAT-25102在培养2 h后进入生长起始期,在培养26 h时,OD600值达到最大。该菌株在20-50℃、pH 5-11及NaCl浓度为0%-5%时均能生长,具有一定的耐高温性和耐盐碱性。菌株FJAT-25102的基因组由1条环状染色体组成,大小约为2570649 bp,GC含量为72.98%。基因组包含2378个预测的蛋白质编码序列。菌株FJAT-25102中所有可能参与纤维素降解的基因和推定编码的酶包括可能的α-葡萄糖苷酶GH13、内切葡聚糖酶GH74和乙酰木聚糖酯酶CE1、CE7和CE3,其中在FJAT-25102的糖苷水解酶家族中GH13、GH74调控的酶在其降解纤维素的过程中可能起重要作用。菌株FJAT-25102处理的巨菌草青贮饲料的粗纤维、酸性洗涤纤维及中性洗涤纤维含量均显著降低。【结论】所筛选的藤黄微球菌FJAT-250102可为青贮饲料的发酵提供微生物菌株资源,其全基因组的测定及纤维素酶基因的探究可为后续该菌株产纤维素酶机理研究提供基础。
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关键词
纤维素
酶
藤黄微球菌
生长特性
全
基因
组
纤维素降解基因
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职称材料
中药渣堆肥微生物群落结构及纤维素降解酶基因表达量变化特征
被引量：
3
2
作者
杜婕
宋修超
马艳
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第2期352-360,共9页
本研究对不同堆制时期的中药渣堆肥样品进行Miseq高通量测序分析,并对8种纤维素降解酶基因进行荧光定量RT-PCR分析,以解析中药渣堆肥过程中微生物群落结构组成及纤维素降解酶基因表达丰度的变化特征。结果表明,在中药渣堆肥过程中,不同...
本研究对不同堆制时期的中药渣堆肥样品进行Miseq高通量测序分析,并对8种纤维素降解酶基因进行荧光定量RT-PCR分析,以解析中药渣堆肥过程中微生物群落结构组成及纤维素降解酶基因表达丰度的变化特征。结果表明,在中药渣堆肥过程中,不同堆制时期的微生物群落结构组成不同,并且不同处理间的群落结构也存在差异。对样品中微生物群落进行主成分分析(PCoA),发现在中药渣堆肥过程中,不同处理的组间微生物群落结构存在较大差异,组内群落结构不断变化并逐渐趋于稳定。荧光定量RT-PCR检测结果显示,在中药渣堆肥过程中,纤维素降解酶基因的表达丰度也处于明显的变化中。说明,中药渣堆肥中微生物群落与纤维素降解酶是相互联系、相互影响的。
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关键词
中药渣堆肥
Miseq高通量测序
群落结构
纤维素
降解
酶
基因
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职称材料
题名
一株产纤维素酶菌株的筛选、鉴定及全基因组分析
1
作者
车建美
郑雪芳
王阶平
陈燕萍
陈冰星
刘波
机构
福建省农业科学院资源环境与土壤肥料研究所
出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第3期294-307,共14页
基金
中央引导地方科技发展专项(2022L3020)
农业高质量发展超越“5511”协同创新工程(XTCXGC2021019)。
文摘
【目的】筛选纤维素降解酶活性强的微生物菌株,用于青贮饲料的高效发酵。【方法】从已有菌种库中,利用羧甲基纤维素钠平板筛选产纤维素酶菌株,测定其纤维素酶活性;采用形态观察、生理生化及16S rRNA对菌株进行鉴定;测定该菌株的生长曲线、生长温度及pH、耐盐性等,研究其生长特性;对该菌株的全基因组数据进行生物信息学分析,探究其产纤维素酶基因。【结果】根据透明圈和菌落直径比值D/d,从菌种库中筛选获得比值最大的菌株为FJAT-25102,其48 h时纤维素酶活性为221.81 U/mL,此外,该菌株具有产蛋白酶和淀粉酶能力。经形态特征、生理生化特征及系统发育分析,将菌株FJAT-25102鉴定为藤黄微球菌(Micrococcus luteus)。菌株FJAT-25102在培养2 h后进入生长起始期,在培养26 h时,OD600值达到最大。该菌株在20-50℃、pH 5-11及NaCl浓度为0%-5%时均能生长,具有一定的耐高温性和耐盐碱性。菌株FJAT-25102的基因组由1条环状染色体组成,大小约为2570649 bp,GC含量为72.98%。基因组包含2378个预测的蛋白质编码序列。菌株FJAT-25102中所有可能参与纤维素降解的基因和推定编码的酶包括可能的α-葡萄糖苷酶GH13、内切葡聚糖酶GH74和乙酰木聚糖酯酶CE1、CE7和CE3,其中在FJAT-25102的糖苷水解酶家族中GH13、GH74调控的酶在其降解纤维素的过程中可能起重要作用。菌株FJAT-25102处理的巨菌草青贮饲料的粗纤维、酸性洗涤纤维及中性洗涤纤维含量均显著降低。【结论】所筛选的藤黄微球菌FJAT-250102可为青贮饲料的发酵提供微生物菌株资源,其全基因组的测定及纤维素酶基因的探究可为后续该菌株产纤维素酶机理研究提供基础。
关键词
纤维素
酶
藤黄微球菌
生长特性
全
基因
组
纤维素降解基因
Keywords
cellulase
Micrococcus luteus
growth characteristics
genome
cellulose degradation genes
分类号
S816.53 [农业科学—饲料科学]
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职称材料
题名
中药渣堆肥微生物群落结构及纤维素降解酶基因表达量变化特征
被引量：
3
2
作者
杜婕
宋修超
马艳
机构
江苏省农业科学院农业资源与环境研究所
农业农村部长江下游农业环境重点实验室
江苏大学环境与安全工程学院
江苏农林职业技术学院畜牧兽医学院
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第2期352-360,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFD0800200)
江苏省农业科技自主创新基金项目[CX(17)2025]
+1 种基金
中国博士后科学基金项目(2018M632255)
江苏农林职业技术学院青年支持项目(2020kj011)。
文摘
本研究对不同堆制时期的中药渣堆肥样品进行Miseq高通量测序分析,并对8种纤维素降解酶基因进行荧光定量RT-PCR分析,以解析中药渣堆肥过程中微生物群落结构组成及纤维素降解酶基因表达丰度的变化特征。结果表明,在中药渣堆肥过程中,不同堆制时期的微生物群落结构组成不同,并且不同处理间的群落结构也存在差异。对样品中微生物群落进行主成分分析(PCoA),发现在中药渣堆肥过程中,不同处理的组间微生物群落结构存在较大差异,组内群落结构不断变化并逐渐趋于稳定。荧光定量RT-PCR检测结果显示,在中药渣堆肥过程中,纤维素降解酶基因的表达丰度也处于明显的变化中。说明,中药渣堆肥中微生物群落与纤维素降解酶是相互联系、相互影响的。
关键词
中药渣堆肥
Miseq高通量测序
群落结构
纤维素
降解
酶
基因
Keywords
Chinese medicine residue compost
Miseq high-throughput sequencing
community structure
cellulose degrading enzyme genes
分类号
S141.4 [农业科学—肥料学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一株产纤维素酶菌株的筛选、鉴定及全基因组分析
车建美
郑雪芳
王阶平
陈燕萍
陈冰星
刘波
《生物技术通报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
中药渣堆肥微生物群落结构及纤维素降解酶基因表达量变化特征
杜婕
宋修超
马艳
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022
3
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职称材料
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