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杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析 被引量:3
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作者 彭沙沙 童再康 +3 位作者 黄华宏 周厚君 时剑 林二培 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期1-6,共6页
纤维素合成酶类似蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相类似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区。利用其他物种中的CesA基因的保守序列设计简并引物,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)结合cDNA末端快速扩增技术(RACE)... 纤维素合成酶类似蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相类似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区。利用其他物种中的CesA基因的保守序列设计简并引物,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)结合cDNA末端快速扩增技术(RACE)成功地从杉木Cunninghamia lanceolata中扩增出一个含有完整阅读框架的cDNA序列,长度为4 150 bp,开放阅读框架为3 396 bp,编码1 132个氨基酸并含有保守的D,D,D,QXXRW天冬氨酸残基序列。应用美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库对获得的基因进行序列分析比对,发现它属于CslD基因家族,命名为ClCslD1基因。多重序列比对结果分析表明,该蛋白与来自颤杨Populus tremuloides,水稻Oryza sativa,拟南芥Arabidopsis thaliana等的同源基因相似性高达71%以上。利用生物软件对其进行生物学分析,为进一步研究其在植物纤化中的功能奠定基础。 展开更多
关键词 林木育种学 杉木 纤维素合成酶类似蛋白 克隆 表达
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烟草纤维素合成酶1(CESA1)蛋白结构比较 被引量:1
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作者 刘晓柱 李银凤 +1 位作者 赵燕 张学文 《作物研究》 2019年第4期284-291,共8页
纤维素合成酶1(cellulose synthase 1,CESA1)可催化合成纤维素,参与植物细胞壁的生物合成过程.烟草品种WS38的CESA1基因尚未被克隆,烟草属间的CESA1结构特征差异未知.本研究通过RT-PCR方法克隆了烟草WS38 CESA1基因的cDNA;依据其推导的... 纤维素合成酶1(cellulose synthase 1,CESA1)可催化合成纤维素,参与植物细胞壁的生物合成过程.烟草品种WS38的CESA1基因尚未被克隆,烟草属间的CESA1结构特征差异未知.本研究通过RT-PCR方法克隆了烟草WS38 CESA1基因的cDNA;依据其推导的编码氨基酸序列,利用生物信息学方法比较了3个烟草间的CESA1蛋白结构特征.结果表明,烟草WS38 CESA1基因cDNA全长3276 bp,编码1091个氨基酸,与烟草SR1以及花烟草(Nicotiana alata)CESA1序列同源性超过98%.3个烟草的CESA1一级结构、二级结构以及三级结构比较相似,但也存在一定的差异.其中烟草WS38和SR1之间的差异性较WS38与花烟草(Nicotiana alata)之间的小;3个烟草CESA1典型结构特征均相同,N端都具有1个锌指结构,均具有8个跨膜结构域,磷酸化位点修饰均相同,均具有蛋白激酶活性.此外,3个烟草的CESA1均定位在细胞质膜上,它们的蛋白亲缘关系相近,功能应较为一致. 展开更多
关键词 烟草 纤维素合成酶1 蛋白结构
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生长素结合蛋白与纤维素合成酶在同一细胞中的标记与定位
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作者 陈宗星 刘晓柱 +2 位作者 黄妤 黄丽华 张学文 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期602-606,F0003,共6页
生长素通过其结合蛋白(ABP1)促进细胞纤维素合成并使细胞伸长生长。为探明ABP1与纤维素合成酶(CesA1)这2种蛋白质之间的相互关系,分别对这2种蛋白质进行了荧光标记,构建了绿色荧光蛋白(GFP)对ABP1融合标记以及青色荧光蛋白(CFP)对CesA1... 生长素通过其结合蛋白(ABP1)促进细胞纤维素合成并使细胞伸长生长。为探明ABP1与纤维素合成酶(CesA1)这2种蛋白质之间的相互关系,分别对这2种蛋白质进行了荧光标记,构建了绿色荧光蛋白(GFP)对ABP1融合标记以及青色荧光蛋白(CFP)对CesA1融合标记的2种载体。采用烟草叶片侵注法,将2种重组体转入烟草叶片同一细胞进行瞬时表达。扫描激光共聚焦显微成像观察到转基因瞬时表达的烟草铺列细胞的细胞膜上有强烈两色荧光信号,表明这2种蛋白集中在细胞膜上分布,其分布区域存在明显的重叠。在细胞的内膜系统中绿色荧光信号相对较强,青色荧光信号较弱,表明内膜系统中也分布着一定量的ABP1,而纤维素合成酶在内膜系统中不会集中分布。在叶片铺列细胞间嵌合交错区可以观察到青色荧光的高亮点,表明此处存在纤维素合成酶的高密度分布,也说明在此部位有更多的纤维素合成。 展开更多
关键词 生长素结合蛋白 纤维素合成酶 荧光标记 细胞定位
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纤维素合成酶及其在基因工程中的应用 被引量:5
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作者 黄青云 张党权 +1 位作者 谷振军 田华 《经济林研究》 2009年第2期131-136,共6页
纤维素是地球上最丰富的生物大分子和最重要的可再生资源,广泛存在于植物和部分细菌中。近年来,关于植物纤维素分子生物学的研究一直是国际相关研究的热点。从几种典型植物的纤维素合成酶基因入手,综述了植物纤维素合成酶的特性、纤维... 纤维素是地球上最丰富的生物大分子和最重要的可再生资源,广泛存在于植物和部分细菌中。近年来,关于植物纤维素分子生物学的研究一直是国际相关研究的热点。从几种典型植物的纤维素合成酶基因入手,综述了植物纤维素合成酶的特性、纤维素合成酶基因的克隆与序列特征及其蛋白结构特征。 展开更多
关键词 纤维素合成酶 纤维素合成酶相似蛋白 基因特性 蛋白结构 转基因 综述
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剑麻纤维素合成酶(CesA/Csl)基因家族成员鉴定及表达分析
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作者 柯智 张燕梅 +2 位作者 谌惠邦 周文钊 杨子平 《福建农林大学学报(自然科学版)》 2025年第5期577-588,共12页
【目的】系统鉴定剑麻(Agave hybrid NO.11648) CesA/Csl基因家族成员,分析其生物信息学特征及组织表达模式,为揭示该基因家族在剑麻纤维发育中的功能提供理论依据。【方法】采用同源比对与结构域分析相结合的方法筛选剑麻CesA/Csl基因... 【目的】系统鉴定剑麻(Agave hybrid NO.11648) CesA/Csl基因家族成员,分析其生物信息学特征及组织表达模式,为揭示该基因家族在剑麻纤维发育中的功能提供理论依据。【方法】采用同源比对与结构域分析相结合的方法筛选剑麻CesA/Csl基因家族成员,系统分析其理化性质、进化关系、基因和蛋白结构、保守结构域、染色体分布、共线性关系、顺式作用元件及组织表达模式。【结果】共鉴定出51个CesA/Csl成员,分为CesA和Csl两大类共5个亚族,蛋白主要定位于质膜。CesA亚族同时含有锌指(zinc finger)结构域和纤维素合成催化域(D…DxD/D…QxxRW),而Csl亚族仅保留催化域。该基因家族成员在17条染色体(含5条contig)上不均匀分布,检测到11对物种内重复基因。比较基因组分析显示,剑麻与拟南芥和水稻分别存在9对和25对同源基因。启动子分析揭示CesA/Csl基因家族启动子中富含多种激素及非生物胁迫响应的顺式作用元件。表达谱分析显示CesA/Csl基因家族存在明显的组织特异性表达,CesA-A2和CslG成员在叶片中表达水平较高。【结论】CesA-A2和CslG成员可能负责叶部纤维和半纤维的合成。 展开更多
关键词 剑麻 纤维素合成酶 纤维素合酶类蛋白 基因功能 表达模式
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