基于机器学习的茶树DNA聚类算法

1

作者 杨小平 倪萍 +4 位作者 诸葛天秋 罗跃新 郭春雨 庞月兰 吴雨婷 《广西大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2024年第2期386-399,共14页

为了研究茶树基因序列的聚类问题,设计一种基于累计方差贡献率进行改进的核主成分分析(KPCA)与k均值(k-means)++聚类算法相结合的降维聚类算法(KPCA-k-means++)。将基因库数据集筛选分组后,利用k-mers算法提取基因数据的数据特征,根据... 为了研究茶树基因序列的聚类问题,设计一种基于累计方差贡献率进行改进的核主成分分析(KPCA)与k均值(k-means)++聚类算法相结合的降维聚类算法(KPCA-k-means++)。将基因库数据集筛选分组后,利用k-mers算法提取基因数据的数据特征,根据累计方差贡献率的占比大于85%的标准确定降维主元个数对KPCA进行降维改进并采用k-means++算法对降维后数据聚类,通过CH(Calinski-Harabaze Index)指标和响应时间分析聚类结果。结果表明:在单独聚类、KPCA聚类、改进PCA聚类、改进KPCA聚类4种处理方式中,改进KPCA-k-means++算法在不同处理方式和不同样本数的对比下,CH指标均为最高,与未改进时相比平均高出33%。在响应时间方面,改进KPCA-k-means++算法与同样改进PCA-k-means++算法在不同聚类数和样本数的对比下响应时间均较短。改进KPCA-k-means++算法能够保证对于茶树的基因序列的聚类准确率和聚类速度,表现出极好的聚类稳定性。 展开更多

关键词 核主成分分析 累计方差贡献率 K均值聚类算法 基因聚类

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用主成分分析法选择纽荷尔脐橙品质的评价因素 被引量：68

2

作者 鲍江峰 夏仁学 +4 位作者 邓秀新 彭抒昂 刘永忠 马湘涛 张红艳 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期663-666,共4页

分析了中国 2 4个产地纽荷尔脐橙成熟果实的单果重、果形指数、可溶性固形物含量、可滴定酸含量、Vc含量、果皮厚度、出汁率、果皮亮度值、果皮红色度、果皮黄色度等 10个品质指标。主成分分析结果表明 ,6个主成分的累计贡献率达到 92 .... 分析了中国 2 4个产地纽荷尔脐橙成熟果实的单果重、果形指数、可溶性固形物含量、可滴定酸含量、Vc含量、果皮厚度、出汁率、果皮亮度值、果皮红色度、果皮黄色度等 10个品质指标。主成分分析结果表明 ,6个主成分的累计贡献率达到 92 .16 % ,系统聚类结果显示可溶性固形物 (或果皮红色度 )、可滴定酸、Vc、出汁率、果皮亮度值 (或果皮黄色度 )、单果重 (或果形指数或果皮厚度 )共 6个品质指标可以反映纽荷尔脐橙品质的绝大部分信息 ,从而简化了果实品质的评价因素 ,为制订评价纽荷尔脐橙品质指标提供了理论依据。 展开更多

关键词 纽荷尔脐橙 品质评价 主成分分析 系统聚类分析 累计贡献率

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薄皮甜瓜表型性状的主成分分析 被引量：25

3

作者 胡建斌 马肖静 李琼 《江西农业学报》 CAS 2010年第12期30-33,共4页

对不同来源的34份薄皮甜瓜品种的19个表型性状进行了主成分分析。结果表明,果实形态和品质相关性状变异系数较大,是薄皮甜瓜表型变异的主要来源,其中果形指数变异系数最大,达80.13%。19个表型性状可归为6个主成分,即果形因子、植株生长... 对不同来源的34份薄皮甜瓜品种的19个表型性状进行了主成分分析。结果表明,果实形态和品质相关性状变异系数较大,是薄皮甜瓜表型变异的主要来源,其中果形指数变异系数最大,达80.13%。19个表型性状可归为6个主成分,即果形因子、植株生长因子、品质因子、熟性因子、单果重因子和种子形态因子,其累计贡献率为80.832%。根据主成分值对供试材料的主要性状进行综合评价,王海、十道梨、金巴齿、甜梨王、花脆瓜等10个品种综合表现优良。 展开更多

关键词 薄皮甜瓜 表型性状 主成分分析 Characters 形态因子 变异系数 累计贡献率 综合评价 综合表现 主要性状 主成分值 相关性状 甜瓜品种 生长因子 品质因子 果形指数 果实形态 不同来源 表型变异 重因子

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基于主成分分析的杂交稻芽种物理特性评价研究 被引量：11

4

作者 陈林涛 马旭 +3 位作者 曹秀龙 温志成 季传栋 李宏伟 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第16期334-342,共9页

杂交稻芽种物理特性研究评价与水稻机械化生产密切相关。为对杂交稻芽种物理特性进行系统研究及科学评价,该文以华南稻区常用的杂交稻芽种为试验样品,分别测定其含水率、千粒质量、滑动摩擦角、休止角α、休止角β、芽长、三轴算术平均... 杂交稻芽种物理特性研究评价与水稻机械化生产密切相关。为对杂交稻芽种物理特性进行系统研究及科学评价,该文以华南稻区常用的杂交稻芽种为试验样品,分别测定其含水率、千粒质量、滑动摩擦角、休止角α、休止角β、芽长、三轴算术平均粒径及硬度8个物理特性指标参数,并运用主成分分析法简化物理特性指标,构架科学的量化评价体系,得到每种样品的综合得分。结果表明,样品的各个物理特性指标参数差异明显,各物理特性指标之间存在不同程度的相关性。千粒质量与休止角α和休止角β呈显著正相关;三轴算术平均粒径与休止角α和休止角β呈显著正相关;休止角α与休止角β呈显著正相关;千粒质量与含水率、三轴算术平均粒径及滑动摩擦角呈正相关;含水率与芽长呈正相关;硬度与休止角α呈正相关;芽长与休止角α、休止角β和三轴算术平均粒径呈正相关。采用主成分分析法提取前3个主成分因子,累计贡献率达到80%以上,能够代表原来8个物理特性指标中的绝大部分信息,具有较好的代表性与客观性。结合试验结果初步确定9种杂交稻芽种样品物理特性的评价等级划分标准,对其做出了适当评价。采用聚类综合分析法对样品物理特性综合得分进行分析研究,9种杂交稻芽种被聚合为5类,各杂交稻芽种样品间物理特性有差异。本研究基于主成分分析法对杂交稻芽种物理特性进行评价,为杂交稻芽种物理特性的科学评价提供一种新思路,同时为水稻精密排种器作业参数的设计优化提供数据依据。 展开更多

关键词 农产品 物理特性 主成分分析 杂交稻芽种 相关性 累计贡献率

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基于PCA及属性距离和的孤立点检测算法 被引量：3

5

作者 张忠平 宋少英 宋晓辉 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2009年第17期139-141,243,共4页

提出了一种基于主分量分析和属性距离和的孤立点检测算法。该方法首先通过主分量分析方法从众多属性中提取出满足累计贡献率的主分量,同时利用PCA变换矩阵把原始数据集转换到由主分量组成的新的特征空间上,之后对转换后的数据集用属性... 提出了一种基于主分量分析和属性距离和的孤立点检测算法。该方法首先通过主分量分析方法从众多属性中提取出满足累计贡献率的主分量,同时利用PCA变换矩阵把原始数据集转换到由主分量组成的新的特征空间上,之后对转换后的数据集用属性距离和的方法对孤立点进行检测。实验结果证明了基于主分量分析和属性距离和的孤立点检测算法的有效性。 展开更多

关键词 孤立点 主分量分析 累计贡献率 属性距离和

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早籼杂交稻新组合选育的综合分析方法 被引量：1

6

作者 方良俊 尹青女 张建中 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期5-8,共4页

对23个早籼杂交稻新组合的14个籽粒性状进行因子分析.选取了5个公因子,其方差累计贡献率为85 99%;通过5个公因子作为综合指标的聚类分析,其结果可分为6类;并以23个组合的5个公因子选择指数,求得每个杂交组合的综合选择指数,结果表明,根... 对23个早籼杂交稻新组合的14个籽粒性状进行因子分析.选取了5个公因子,其方差累计贡献率为85 99%;通过5个公因子作为综合指标的聚类分析,其结果可分为6类;并以23个组合的5个公因子选择指数,求得每个杂交组合的综合选择指数,结果表明,根据综合选择指数的大小,不但可作为决选杂交组合的依据,而且可衡量决选的杂交组合达到理想组合的程度. 展开更多

关键词 早籼杂交稻 新组合选育 籽粒性状 方差累计贡献率 聚类分析 杂交组合

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采用模糊RBF神经网络的直升机旋翼不平衡故障诊断 被引量：9

7

作者 廖文峰 高亚东 《南京航空航天大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第2期285-289,共5页

提出一种利用模糊径向基函数(Radial basis function,RBF)神经网络进行直升机旋翼不平衡故障诊断的方法,建立了用于直升机旋翼不平衡故障识别的模糊诊断模型。基于直升机旋翼不平衡故障模拟实验,对采集于旋翼配重不平衡、桨距不平衡、... 提出一种利用模糊径向基函数(Radial basis function,RBF)神经网络进行直升机旋翼不平衡故障诊断的方法,建立了用于直升机旋翼不平衡故障识别的模糊诊断模型。基于直升机旋翼不平衡故障模拟实验,对采集于旋翼配重不平衡、桨距不平衡、后缘调整不平衡和正常状态下的试验台体振动信号进行功率谱分析,并采用主分量分析(Principal component analysis,PCA)的方法进行故障特征提取。采用模糊RBF神经网络诊断模型对旋翼不平衡故障进行了故障分类识别,同时分析了不同主分量累计贡献率和模糊子空间对故障分类精度的影响,并与RBF神经网络的诊断模型、支持向量机(Support vector machine,SVM)诊断模型进行了故障识别效果对比。结果表明,模糊聚类RBF神经网络的诊断方法对旋翼不平衡故障具有更好的识别能力。 展开更多

关键词 直升机旋翼 故障诊断 模糊RBF神经网络 累计贡献率

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主成分-费歇尔判别模型在煤与瓦斯突出等级预测中的应用 被引量：7

8

作者 陈恋 袁梅 +4 位作者 高强 许石青 陈文 李鑫灵 隆能增 《工矿自动化》 北大核心 2020年第3期55-62,共8页

针对现有煤与瓦斯突出预测方法存在计算过程较复杂、预测主观性强、预测精度较低等问题,构建了主成分-费歇尔判别模型,并将其应用于某煤矿的煤与瓦斯突出等级预测。从瓦斯因素、煤体结构及地质构造方面分析得出了影响该矿煤与瓦斯突出... 针对现有煤与瓦斯突出预测方法存在计算过程较复杂、预测主观性强、预测精度较低等问题,构建了主成分-费歇尔判别模型,并将其应用于某煤矿的煤与瓦斯突出等级预测。从瓦斯因素、煤体结构及地质构造方面分析得出了影响该矿煤与瓦斯突出的因素包括瓦斯压力、瓦斯含量及瓦斯放散初速度等指标。以影响该矿煤与瓦斯突出的23组实测数据为基础,首先利用主成分分析模型对影响该矿的煤与瓦斯突出因素进行降维,提取与指标相关度较高的5个主成分,然后将5个主成分输入费歇尔判别模型,并根据判别函数对样本进行煤与瓦斯突出等级预测。应用结果表明:主成分-费歇尔判别模型具有较高的可信性,能对煤与瓦斯突出等级进行准确预测,训练样本的正确率为100%,待测样本的预测结果也与该矿煤与瓦斯突出的实际情况相符,误判率为0,为准确预测煤与瓦斯突出提供了一种新方法。 展开更多

关键词 煤与瓦斯突出 主成分-费歇尔模型 等级预测 累计贡献率 聚类 判别

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一种基于信号-噪声模型的主元数目选择方法 被引量：1

9

作者 王刚 冯贵玉 胡德文 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2003年第6期11-12,72,共3页

主成分分析(PCA)是一种基于二阶统计的数据分析方法。在简要介绍PCA的基本理论后,重点分析了主元数目的选择问题。在基于累计贡献率的传统方法基础上,考虑实际中噪声对信号的影响,提出一种基于信号-噪声模型的主元数目选择新方法。实验... 主成分分析(PCA)是一种基于二阶统计的数据分析方法。在简要介绍PCA的基本理论后,重点分析了主元数目的选择问题。在基于累计贡献率的传统方法基础上,考虑实际中噪声对信号的影响,提出一种基于信号-噪声模型的主元数目选择新方法。实验证明,在一定的条件下,新方法比传统的累计贡献率方法更有效。 展开更多

关键词 信号-噪声模型 主元数目选择方法 主成分分析 累计贡献率 数据分析方法 信号处理

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基于改进EMD方法的系统误差分离方法研究 被引量：12

10

作者 姚刚 赵建军 +1 位作者 姚跃亭 任喜 《振动与冲击》 EI CSCD 北大核心 2014年第14期176-180,共5页

针对测量中系统误差存在复杂的变化规律,将改进的经验模态分解(EMD)方法用于系统误差分离过程,突破传统分离方法限制。采用基于波形相似度的端点延拓方法有效抑制端点效应;基于累计方差贡献率的分解停止准则,合理确定停止时机。仿真与... 针对测量中系统误差存在复杂的变化规律,将改进的经验模态分解(EMD)方法用于系统误差分离过程,突破传统分离方法限制。采用基于波形相似度的端点延拓方法有效抑制端点效应;基于累计方差贡献率的分解停止准则,合理确定停止时机。仿真与实例分析结果表明,改进的经验模态分解方法在系统误差分离中效果较好。 展开更多

关键词 经验模态分解(EMD) 系统误差分离 端点效应 波形相似度 累计方差贡献率

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中国出口商品结构的主成分分析 被引量：1

11

作者 蒋茂军 《经济与管理》 2005年第10期36-38,共3页

对外贸易对经济增长的推动作用是很大的,作为对外贸易的基础,出口对经济增长的推动作用更加明显。按产品附加值大小可以将出口商品划分为十类,对按结构划分的中国出口产品进行主成分分析,可以发现中国出口数据的规律性。通过对数据分析... 对外贸易对经济增长的推动作用是很大的,作为对外贸易的基础,出口对经济增长的推动作用更加明显。按产品附加值大小可以将出口商品划分为十类,对按结构划分的中国出口产品进行主成分分析,可以发现中国出口数据的规律性。通过对数据分析,说明中国应扩大出口,进一步优化出口商品结构,以促进中国经济的快速发展。 展开更多

关键词 商品结构 附加值 主成分分析 累计贡献率

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多层合采气藏分层储量动用特征及判定方法 被引量：13

12

作者 徐轩 朱华银 +2 位作者 徐婷 郭辉 闫永强 《特种油气藏》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期111-114,156,共4页

针对多层气藏合采过程中分层产气量差异大、储量动用不均衡的问题,运用物理实验和数值模拟相结合的方法,系统、定量地研究了层间非均质性和压力系统差异对分层产气量和储量动用的影响,提出储量动用均衡性的界定方法,即分层累计产气量贡... 针对多层气藏合采过程中分层产气量差异大、储量动用不均衡的问题,运用物理实验和数值模拟相结合的方法,系统、定量地研究了层间非均质性和压力系统差异对分层产气量和储量动用的影响,提出储量动用均衡性的界定方法,即分层累计产气量贡献率比值小于3∶2为储量动用较均衡;分层累计产气量贡献率比值大于3∶2而小于3∶1为储量动用欠均衡;分层累计产气量贡献率比值大于3∶1储量动用不均衡。以此为依据,获得了多层气藏气井分层储量动用判定方法及判断图版。实例分析表明,利用此方法可在开发方案决策前对层间分层产气量贡献和储量动用均衡性进行评估,为气藏储量动用评价提供技术支持。 展开更多

关键词 多层合采 数值模拟 物理模拟 分层产气量 储量动用程度 分层累计产气量贡献率

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基于奇异值分解的角度域去噪方法 被引量：15

13

作者 李江 《石油物探》 EI CSCD 北大核心 2019年第3期427-432,443,共7页

受地层调谐效应和地震数据品质等因素的影响,角度域共成像点道集(angle domain common image gathers,ADCIGs)存在不同程度的波形拉伸和随机噪声干扰。为了提高ADCIGs及其叠加剖面的成像效果,提出了基于奇异值分解的角度域去噪方法。首... 受地层调谐效应和地震数据品质等因素的影响,角度域共成像点道集(angle domain common image gathers,ADCIGs)存在不同程度的波形拉伸和随机噪声干扰。为了提高ADCIGs及其叠加剖面的成像效果,提出了基于奇异值分解的角度域去噪方法。首先对叠前偏移输出的ADCIGs进行奇异值分解,然后对奇异值进行归一化修正,采用累计贡献率的方法确定降噪阶次,从而实现角度域内的信噪分离和噪声压制。在确定降噪阶次时,采用累计贡献率的方法可以直观地判断各奇异值分量对数据的贡献,便于快速选择降噪阶次。理论模型和实际数据的测试处理结果表明,基于奇异值分解的角度域去噪方法适用于具有水平同相轴的ADCIGs,它能有效分离角度域内的随机干扰,并且能压制高角度处的频率畸变,改善大角度数据的品质。对ADCIGs进行基于奇异值分解的角度域去噪,可进一步提高该叠前道集的精度,从而有效改善角度域叠加剖面的信噪比和分辨率,也为基于叠前道集的速度分析和叠前反演提供了更为准确的数据基础。 展开更多

关键词 角度域共成像点道集 奇异值分解 滤波 降噪阶次 累计贡献率 叠加成像

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省域经济与环境动态综合评价及耦合协调测度 被引量：11

14

作者 王瑛 缪勤 《湖南大学学报（社会科学版）》 CSSCI 北大核心 2021年第4期63-68,共6页

采用自相关分析和累计信息贡献率法,对经济发展和环境质量评价指标进行二次筛选,构建综合评价指标体系;基于熵值法、TOPSIS法和灰色关联度法,计算经济和环境系统历年单一评价值;采用支持度模型进行综合评价,得到经济与环境系统的动态综... 采用自相关分析和累计信息贡献率法,对经济发展和环境质量评价指标进行二次筛选,构建综合评价指标体系;基于熵值法、TOPSIS法和灰色关联度法,计算经济和环境系统历年单一评价值;采用支持度模型进行综合评价,得到经济与环境系统的动态综合评价值;引入耦合协调度模型,对30个省域2008-2017年的经济发展与环境质量的耦合协调发展进行评级,为各省域协调发展提供决策支持。 展开更多

关键词 经济与环境 累计信息贡献率 支持度模型 动态综合评价 耦合协调模型

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基于故障检测的KPCA中核主元的选取方法 被引量：5

15

作者 郭金玉 张安宝 李元 《计算机应用与软件》 北大核心 2021年第9期60-66,85,共8页

在应用KPCA进行故障检测时,根据累计贡献率选取的核主元是数据建模的最佳选择,但不是故障检测的最佳选择。为了解决这个问题,提出一种基于故障检测的KPCA中核主元的选取方法。使用核主元对样本马氏距离的贡献来评估核主元对故障检测的... 在应用KPCA进行故障检测时,根据累计贡献率选取的核主元是数据建模的最佳选择,但不是故障检测的最佳选择。为了解决这个问题,提出一种基于故障检测的KPCA中核主元的选取方法。使用核主元对样本马氏距离的贡献来评估核主元对故障检测的重要性,即运用即时累计贡献率(JITCPC)准则来选取核主元。选定和未选择的核主元分别用于定义主要和次要T 2统计量,运用核密度估计方法计算出99%的控制限。将统计量与控制限比较进行故障检测。应用数值例子和半导体工业实例进行仿真研究,仿真结果说明JITCPC准则在基于KPCA的故障检测中的有效性和优越性。 展开更多

关键词 故障检测 马氏距离 KPCA 即时累计贡献率准则

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省际人口经济区划量化探析

16

作者 吕玉花 李军海 《西北人口》 1999年第3期53-54,共2页

关键词 经济区划 主成份 人口经济 人口比重 探析 累计贡献率 已婚妇女 欧氏距离 样本相关矩阵 综合指标

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应用主成份分析方法探讨广东省大学生身体形态、机能状况

17

作者 戎家增 《广州体育学院学报》 1984年第1期17-27,共11页

前言随着现代科学技术发展突飞猛进,边缘科学的创立,各门学科领域的互相渗透引用,它对某些单学科的重要作用巳为大家所公认。体育科学研究中应用数理统计的多因素分析方法,解决体育活动中多因素、多指标的研究也初步为大家所认识。不少... 前言随着现代科学技术发展突飞猛进,边缘科学的创立,各门学科领域的互相渗透引用,它对某些单学科的重要作用巳为大家所公认。体育科学研究中应用数理统计的多因素分析方法,解决体育活动中多因素、多指标的研究也初步为大家所认识。不少省市体育科学研究工作者都在探索,寻找适合于体育科学研究的数理统计方法,以解决体育活动中的复杂问题。本文正是基于这种思想,探讨用数理统计的多因素分析方法——主成份分析方法分析我省大学生身体形态、机能的主成份。 展开更多

关键词 身体形态 体育科学研究 广东省大学生 数理统计方法 体育活动 机能状况 累计贡献率 形态机能指标 立定跳远 肺活量

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基于CRCI-GRA模型的区域农业水土资源复合系统恢复力评价指标体系优选 被引量：6

18

作者 刘东 齐晓晨 朱伟峰 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期59-67,共9页

指标体系合理构建是评价区域农业水土资源复合系统恢复能力基础和关键。文章以黑龙江省农垦建三江管理局为例,依据Dale单个指标入选原则及TOSE空间维度模型从自然、生态环境、社会、经济、技术管理5个维度构建农业水土资源复合系统恢复... 指标体系合理构建是评价区域农业水土资源复合系统恢复能力基础和关键。文章以黑龙江省农垦建三江管理局为例,依据Dale单个指标入选原则及TOSE空间维度模型从自然、生态环境、社会、经济、技术管理5个维度构建农业水土资源复合系统恢复力评价指标体系框架,选择50个评价指标组成区域农业水土资源复合系统恢复力评价指标体系初选库。针对现有指标筛选研究适用性问题,利用指标相对离散系数及累计信息贡献率(CRCI)剔除对评价结果影响较弱的10个指标,运用剩余指标间灰色关联度(GRA)筛选信息重复5个指标完成最后优选。通过与信息可替代筛选指标方法比较,验证方法完备性与可靠性。 展开更多

关键词 评价指标体系 累计信息贡献率 灰色关联度 显著再相关

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