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鳗鲡目鱼类线粒体蛋白质编码基因易位及系统演化关系分析
被引量：
4
1
作者
申欣
田美
+2 位作者
孟学平
程汉良
阎斌伦
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期73-81,共9页
鳗鲡目鱼类线粒体基因组的基因组成较为保守,在58个线粒体基因组中,仅有3个物种存在基因数量的差异。在19个鳗鲡目鱼类线粒体基因组中存在主编码基因的重排。主编码基因的变异位点分析结果支持nad5、nad4和nad2基因作为cox1和lrRNA基因...
鳗鲡目鱼类线粒体基因组的基因组成较为保守,在58个线粒体基因组中,仅有3个物种存在基因数量的差异。在19个鳗鲡目鱼类线粒体基因组中存在主编码基因的重排。主编码基因的变异位点分析结果支持nad5、nad4和nad2基因作为cox1和lrRNA基因辅助的分子标记。鳗鲡科Anguillidae的20个种(亚种)聚在一起,强烈支持鳗鲡科为单系群(BPP=100)。鳗鲡科下属的3个类群(大洋洲类群、大西洋类群和印度洋-太平洋类群)也同时得到有力的验证(BPP均为100)。线鳗科Nemichthyidae和锯齿鳗科Serrivomeridae亲缘关系最近,二者聚类后,与鳗鲡科Anguillidae构成姊妹群(BPP=100)。在囊喉鱼亚目Saccopharyngoidei中,宽咽鱼科Eurypharyngidae与囊鳃鳗科Saccopharyngidae聚类(BPP=100),同时,单颌鳗科Monognathidae与月尾鳗科Cyematidae聚类(BPP=100),4个科聚在一支,支持囊喉鱼亚目为单系群(BPP=100)。在囊喉鱼亚目线粒体基因组中,3个物种(吞鳗Eurypharynx pelecanoides、拉文囊鳃鳗Saccopharynx lavenbergi和杰氏单颌鳗Monognathus jesperseni)存在主编码基因的重排。16种鳗鲡(细美体鳗Ariosoma shiroanago、短吻颈鳗Derichthys serpentinus、凯氏短尾康吉鳗Coloconger cadenati、鸭颈鳗Nessorhamphus ingolfianus、龟草鳗Thalassenchelys sp.、粗犁齿海鳗Cynoponticus ferox、百吉海鳗Muraenesox bagio、巨斑花蛇鳗Myrichthys maculosus、大吻沙蛇鳗Ophisurus macrorhynchos、几内亚副康吉鳗Paraconger notialis、哈氏异康吉鳗Heteroconger hassi、小头鸭嘴鳗Nettastoma parviceps、弱头鳗Leptocephalus sp.、斑点长犁齿鳗Hoplunnis punctata、尖吻小鸭嘴鳗Facciolella oxyrhyncha和星康吉鳗Conger myriaster),与鳗鲡目线粒体主编码基因的原始排列相比,共享nad6基因的易位。同时,基于线粒体基因组13个蛋白质编码基因构建的系统演化树,强烈支持这16个物种聚为一支(BPP=100)。然而,由此而带来的海鳗科Muraenesocidae、拟鯙科Chlopsidae和糯鳗科Congridae是否为单系群的问题,值得今后深入探究。
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关键词
鳗鲡
蛋白质编码基因
基因易位
系统演化关系
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职称材料
中国桃亚属植物系统发育及演化关系分析
被引量：
2
2
作者
邱蓉
程中平
王章利
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2011年第6期221-227,共7页
为了弄清桃亚属中国分布植物的系统发育及演化关系,对这些种类的植物学性状以及核ITS序列和叶绿体psbA-trnH序列进行比对分析,植物学性状和ITS序列分析分别采用SPSS和MEGA构建系统树,psbA-trnH序列分析采用Network构建进化网络。结果表...
为了弄清桃亚属中国分布植物的系统发育及演化关系,对这些种类的植物学性状以及核ITS序列和叶绿体psbA-trnH序列进行比对分析,植物学性状和ITS序列分析分别采用SPSS和MEGA构建系统树,psbA-trnH序列分析采用Network构建进化网络。结果表明:新疆桃确为普通桃的一个亚种;陕甘山桃不是山桃的变种,而是一个独立的种;桃亚属植物的演化关系为光核桃→甘肃桃,甘肃桃通过其中一支演化为山桃→陕甘山桃,另一支演化为普通桃和新疆桃。
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关键词
桃亚属
植物学性状
ITS
PSBA-TRNH
系统
发育及
演化
关系
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职称材料
沙蜥属系统学研究综述
3
作者
熊晔
张晋东
+1 位作者
戴建洪
王跃招
《四川动物》
CSCD
北大核心
2005年第3期421-427,共7页
沙蜥属隶属于鬣蜥科,是欧亚大陆荒漠和稀疏草原常见的蜥蜴。该属特征变异较大,存在许多争议。本文从其分类史、系统演化关系、生物地理学研究三个方面进行总结,并指出沙蜥属卵生类群的系统关系还比较混乱,生物地理历史过程有待进一步研究。
关键词
沙蜥属
分类学
系统演化关系
生物地理学
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职称材料
题名
鳗鲡目鱼类线粒体蛋白质编码基因易位及系统演化关系分析
被引量：
4
1
作者
申欣
田美
孟学平
程汉良
阎斌伦
机构
淮海工学院海洋学院
中国科学院北京生命科学研究院
出处
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期73-81,共9页
基金
国家自然科学基金(40906067)
香江学者计划(XJ2012056)
+3 种基金
中国博士后科学基金(2012M510054,2012T50218)
中央财政支持地方高校发展专项资金(CXTD04)
江苏省“青蓝工程”人才基金资助项目(苏教师[2010]27号)
江苏高校优势学科建设工程资助项目
文摘
鳗鲡目鱼类线粒体基因组的基因组成较为保守,在58个线粒体基因组中,仅有3个物种存在基因数量的差异。在19个鳗鲡目鱼类线粒体基因组中存在主编码基因的重排。主编码基因的变异位点分析结果支持nad5、nad4和nad2基因作为cox1和lrRNA基因辅助的分子标记。鳗鲡科Anguillidae的20个种(亚种)聚在一起,强烈支持鳗鲡科为单系群(BPP=100)。鳗鲡科下属的3个类群(大洋洲类群、大西洋类群和印度洋-太平洋类群)也同时得到有力的验证(BPP均为100)。线鳗科Nemichthyidae和锯齿鳗科Serrivomeridae亲缘关系最近,二者聚类后,与鳗鲡科Anguillidae构成姊妹群(BPP=100)。在囊喉鱼亚目Saccopharyngoidei中,宽咽鱼科Eurypharyngidae与囊鳃鳗科Saccopharyngidae聚类(BPP=100),同时,单颌鳗科Monognathidae与月尾鳗科Cyematidae聚类(BPP=100),4个科聚在一支,支持囊喉鱼亚目为单系群(BPP=100)。在囊喉鱼亚目线粒体基因组中,3个物种(吞鳗Eurypharynx pelecanoides、拉文囊鳃鳗Saccopharynx lavenbergi和杰氏单颌鳗Monognathus jesperseni)存在主编码基因的重排。16种鳗鲡(细美体鳗Ariosoma shiroanago、短吻颈鳗Derichthys serpentinus、凯氏短尾康吉鳗Coloconger cadenati、鸭颈鳗Nessorhamphus ingolfianus、龟草鳗Thalassenchelys sp.、粗犁齿海鳗Cynoponticus ferox、百吉海鳗Muraenesox bagio、巨斑花蛇鳗Myrichthys maculosus、大吻沙蛇鳗Ophisurus macrorhynchos、几内亚副康吉鳗Paraconger notialis、哈氏异康吉鳗Heteroconger hassi、小头鸭嘴鳗Nettastoma parviceps、弱头鳗Leptocephalus sp.、斑点长犁齿鳗Hoplunnis punctata、尖吻小鸭嘴鳗Facciolella oxyrhyncha和星康吉鳗Conger myriaster),与鳗鲡目线粒体主编码基因的原始排列相比,共享nad6基因的易位。同时,基于线粒体基因组13个蛋白质编码基因构建的系统演化树,强烈支持这16个物种聚为一支(BPP=100)。然而,由此而带来的海鳗科Muraenesocidae、拟鯙科Chlopsidae和糯鳗科Congridae是否为单系群的问题,值得今后深入探究。
关键词
鳗鲡
蛋白质编码基因
基因易位
系统演化关系
Keywords
eel
protein-coding gene
gene translocation
phylogenetic relationship
分类号
Q959.469 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
中国桃亚属植物系统发育及演化关系分析
被引量：
2
2
作者
邱蓉
程中平
王章利
机构
中国科学院武汉植物园
中国科学院研究生院
中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2011年第6期221-227,共7页
基金
武汉市创新人才开发基金项目(2010016)
武汉市科技攻关项目(200920322141)
文摘
为了弄清桃亚属中国分布植物的系统发育及演化关系,对这些种类的植物学性状以及核ITS序列和叶绿体psbA-trnH序列进行比对分析,植物学性状和ITS序列分析分别采用SPSS和MEGA构建系统树,psbA-trnH序列分析采用Network构建进化网络。结果表明:新疆桃确为普通桃的一个亚种;陕甘山桃不是山桃的变种,而是一个独立的种;桃亚属植物的演化关系为光核桃→甘肃桃,甘肃桃通过其中一支演化为山桃→陕甘山桃,另一支演化为普通桃和新疆桃。
关键词
桃亚属
植物学性状
ITS
PSBA-TRNH
系统
发育及
演化
关系
Keywords
Subgenus Persica
Botanical characters
ITS
psbA-trnH
Phylogeny and evolutionary
分类号
Q662.03 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
沙蜥属系统学研究综述
3
作者
熊晔
张晋东
戴建洪
王跃招
机构
中国科学院成都生物研究所
出处
《四川动物》
CSCD
北大核心
2005年第3期421-427,共7页
基金
国家自然科学基金项目:30470252
30070090
中国科学院知识创新工程项目(KSCX2-1-09)
文摘
沙蜥属隶属于鬣蜥科,是欧亚大陆荒漠和稀疏草原常见的蜥蜴。该属特征变异较大,存在许多争议。本文从其分类史、系统演化关系、生物地理学研究三个方面进行总结,并指出沙蜥属卵生类群的系统关系还比较混乱,生物地理历史过程有待进一步研究。
关键词
沙蜥属
分类学
系统演化关系
生物地理学
Keywords
Phrymocephalus
taxonomy
phylogenetic relationships
biogecgraphy
分类号
Q959.62 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鳗鲡目鱼类线粒体蛋白质编码基因易位及系统演化关系分析
申欣
田美
孟学平
程汉良
阎斌伦
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
4
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下载PDF
职称材料
2
中国桃亚属植物系统发育及演化关系分析
邱蓉
程中平
王章利
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2011
2
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下载PDF
职称材料
3
沙蜥属系统学研究综述
熊晔
张晋东
戴建洪
王跃招
《四川动物》
CSCD
北大核心
2005
0
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职称材料
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