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基于ITS-1基因的菜粉蝶地理种群遗传分化研究
被引量：
3
1
作者
毛增辉
郝家胜
+4 位作者
王晨
于芳
司曼曼
夏靖
朱朝东
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第10期1144-1152,共9页
为了探讨我国不同地区菜粉蝶种群之间的遗传分化情况,本研究运用克隆测序法,对我国16个地区79只菜粉蝶Pieris rapaerDNA的ITS-1基因序列进行测定并分析;同时,以东方菜粉蝶Pieris canidia为外群,重建了它们的系统发生树,初步探讨了它们...
为了探讨我国不同地区菜粉蝶种群之间的遗传分化情况,本研究运用克隆测序法,对我国16个地区79只菜粉蝶Pieris rapaerDNA的ITS-1基因序列进行测定并分析;同时,以东方菜粉蝶Pieris canidia为外群,重建了它们的系统发生树,初步探讨了它们的生物地理学分化格局。序列分析结果显示:所测菜粉蝶的ITS-1序列长度介于337～458bp之间。经序列比对后,在347个位点中共有281个保守位点,63个变异位点,16个简约信息位点和47个单突变位点;AMOVA软件分析其核苷酸多态性指数(nucleotide diversity)Pi为0.014,每位点Theta(per site)Eta为0.041,遗传分化指数(FST)为0.351(P<0.05);DnaSP软件共检测出48个单倍型(haplotype)序列,单倍型多样性(haplotype diversity)的频率为0.989。系统发生分析结果表明:现存的菜粉蝶各地理种群与其地理分布没有直接的对应关系根据系统发生树结果推测,该蝶种在我国的最早建群可能发生于辽宁、内蒙古及北京一带,其后,通过幼虫寄主植物的水陆运输以及成虫的迁飞向我国的不同地区扩散。
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关键词
菜粉蝶
地理
种群
遗传分化
系统地理发生
ITS-1序列
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职称材料
江淮流域9个家鸭品种的分子生物地理演化过程分析
被引量：
2
2
作者
张汤杰
李慧芳
+4 位作者
常洪
张晶鑫
汤青萍
高玉时
徐文娟
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期133-138,共6页
通过对江淮流域9个家鸭品种106个样本的线粒体D-loop区的序列分析,探讨了各品种体现在该特征的遗传多样性的现代分布格局及其地理演化过程。对检测出的31个单倍型的分析表明:长江中游地区的家鸭品种遗传多样性高于东部地区的家鸭品种。...
通过对江淮流域9个家鸭品种106个样本的线粒体D-loop区的序列分析,探讨了各品种体现在该特征的遗传多样性的现代分布格局及其地理演化过程。对检测出的31个单倍型的分析表明:长江中游地区的家鸭品种遗传多样性高于东部地区的家鸭品种。品种之间基因流同地理距离之间呈弱负相关。歧点分布分析和Tajima’s D值中性检验符合中性突变,提示江淮流域鸭在过去没有出现群体扩张,群体大小稳定。各单倍型在最大简约树中的分布和实际地理分布无显著关系,各地理单元的单倍型都相互散布在不同的分布群中,呈现一种混杂的分布格局。
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关键词
鸭
MTDNA控制区
基因流
分子
系统
发生
地理
学
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职称材料
6种帘蛤科贝类及4个地理种群文蛤线粒体COI基因片段序列分析
被引量：
35
3
作者
程汉良
夏德全
+4 位作者
吴婷婷
孟学平
吉红九
董志国
陈淑吟
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期109-116,共8页
对文蛤（Meretrix meretrix L.,1758）、青蛤（Cyclina sinensis G.,1791）、硬壳蛤（Mercenaria mercenaria L.,1758）、江户布目蛤（Protothaca jedoensis L.,1874）、薄片镜蛤（Dosinia corrugata R.,1850）和菲律宾蛤仔（Ruditapes ...
对文蛤（Meretrix meretrix L.,1758）、青蛤（Cyclina sinensis G.,1791）、硬壳蛤（Mercenaria mercenaria L.,1758）、江户布目蛤（Protothaca jedoensis L.,1874）、薄片镜蛤（Dosinia corrugata R.,1850）和菲律宾蛤仔（Ruditapes philippinarum A.,1850）6种帘蛤科贝类和4个地理种群文蛤（大连、连云港、湛江、防城港）的细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ）基因片段的核苷酸序列进行了分析,以探讨这一序列在种质鉴定、种群遗传结构和分子系统发生研究中的应用价值.测序结果表明,所有物种扩增片段长度均为709 bp,序列A＋T含量（62.2%-67.6%）明显高于GC含量.物种间共有变异位点311个,其中简约信息位点202个;文蛤4个地理种群间共有变异位点46个,其中简约信息位点2个.此区段共编码235个氨基酸,种间共有氨基酸变异位点85个;文蛤种群间只有1个氨基酸变异位点.以COⅠ基因片段序列为标记,用大竹蛏（Solen grandis）作外群,构建了帘蛤科贝类的系统发生树,其拓扑结构显示4个地理种群文蛤首先聚为1个单元,然后与青蛤聚在一起,最后所有帘蛤科物种聚为一枝,与外群相区别,其结果与传统形态分类基本一致,说明COⅠ基因适合作为该科贝类种群遗传结构和系统发生研究的分子标记.
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关键词
帘蛤科
线粒体DNA
细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ
系统
发生
学
系统
发生
生物
地理
学
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职称材料
题名
基于ITS-1基因的菜粉蝶地理种群遗传分化研究
被引量：
3
1
作者
毛增辉
郝家胜
王晨
于芳
司曼曼
夏靖
朱朝东
机构
安徽师范大学生命科学学院分子进化与生物多样性研究室
安徽师范大学附属中学
中国科学院动物研究所动物进化与系统学院级重点实验室
广西师范大学生命科学学院
首都师范大学生命科学学院
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第10期1144-1152,共9页
基金
安徽省优秀青年科技基金(08040106811)
安徽省"重要生物资源保护与利用"重点实验室及中青年学术与技术带头人专项基金(590620)
+1 种基金
北京市自然科学基金委重点项目(6081002)
中国科学院动物研究所动物进化与系统学院级院重点实验室开放课题(O529YX5105)
文摘
为了探讨我国不同地区菜粉蝶种群之间的遗传分化情况,本研究运用克隆测序法,对我国16个地区79只菜粉蝶Pieris rapaerDNA的ITS-1基因序列进行测定并分析;同时,以东方菜粉蝶Pieris canidia为外群,重建了它们的系统发生树,初步探讨了它们的生物地理学分化格局。序列分析结果显示:所测菜粉蝶的ITS-1序列长度介于337～458bp之间。经序列比对后,在347个位点中共有281个保守位点,63个变异位点,16个简约信息位点和47个单突变位点;AMOVA软件分析其核苷酸多态性指数(nucleotide diversity)Pi为0.014,每位点Theta(per site)Eta为0.041,遗传分化指数(FST)为0.351(P<0.05);DnaSP软件共检测出48个单倍型(haplotype)序列,单倍型多样性(haplotype diversity)的频率为0.989。系统发生分析结果表明:现存的菜粉蝶各地理种群与其地理分布没有直接的对应关系根据系统发生树结果推测,该蝶种在我国的最早建群可能发生于辽宁、内蒙古及北京一带,其后,通过幼虫寄主植物的水陆运输以及成虫的迁飞向我国的不同地区扩散。
关键词
菜粉蝶
地理
种群
遗传分化
系统地理发生
ITS-1序列
Keywords
Pieris rapae
geographical population
genetic diversity
phylogeography
ITS-1 sequences
分类号
Q968 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
江淮流域9个家鸭品种的分子生物地理演化过程分析
被引量：
2
2
作者
张汤杰
李慧芳
常洪
张晶鑫
汤青萍
高玉时
徐文娟
机构
扬州大学兽医学院
中国农业科学院家禽研究所
扬州大学动物科学与技术学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期133-138,共6页
基金
国家科技基础条件平台资助(2005DKA21101)
文摘
通过对江淮流域9个家鸭品种106个样本的线粒体D-loop区的序列分析,探讨了各品种体现在该特征的遗传多样性的现代分布格局及其地理演化过程。对检测出的31个单倍型的分析表明:长江中游地区的家鸭品种遗传多样性高于东部地区的家鸭品种。品种之间基因流同地理距离之间呈弱负相关。歧点分布分析和Tajima’s D值中性检验符合中性突变,提示江淮流域鸭在过去没有出现群体扩张,群体大小稳定。各单倍型在最大简约树中的分布和实际地理分布无显著关系,各地理单元的单倍型都相互散布在不同的分布群中,呈现一种混杂的分布格局。
关键词
鸭
MTDNA控制区
基因流
分子
系统
发生
地理
学
Keywords
duck
mtDNA control region
gene flow
molecular phylogeography
分类号
S819 [农业科学—畜牧学]
S813.9 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
6种帘蛤科贝类及4个地理种群文蛤线粒体COI基因片段序列分析
被引量：
35
3
作者
程汉良
夏德全
吴婷婷
孟学平
吉红九
董志国
陈淑吟
机构
淮海工学院江苏省海洋生物技术重点建设实验室
中国水产科学研究院淡水渔业研究中心
南京农业大学无锡渔业学院
江苏省海洋水产研究所
出处
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期109-116,共8页
基金
"十五"国家科技攻关计划专题项目(2004BA526B0403)
淮海工学院自然科学基金项目(Z2004034)
+1 种基金
江苏省海洋生物技术重点实验开放基金项目(2006HS001)
淮海工学院引进人才科研启动基金项目(KK03035)资助
文摘
对文蛤（Meretrix meretrix L.,1758）、青蛤（Cyclina sinensis G.,1791）、硬壳蛤（Mercenaria mercenaria L.,1758）、江户布目蛤（Protothaca jedoensis L.,1874）、薄片镜蛤（Dosinia corrugata R.,1850）和菲律宾蛤仔（Ruditapes philippinarum A.,1850）6种帘蛤科贝类和4个地理种群文蛤（大连、连云港、湛江、防城港）的细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ）基因片段的核苷酸序列进行了分析,以探讨这一序列在种质鉴定、种群遗传结构和分子系统发生研究中的应用价值.测序结果表明,所有物种扩增片段长度均为709 bp,序列A＋T含量（62.2%-67.6%）明显高于GC含量.物种间共有变异位点311个,其中简约信息位点202个;文蛤4个地理种群间共有变异位点46个,其中简约信息位点2个.此区段共编码235个氨基酸,种间共有氨基酸变异位点85个;文蛤种群间只有1个氨基酸变异位点.以COⅠ基因片段序列为标记,用大竹蛏（Solen grandis）作外群,构建了帘蛤科贝类的系统发生树,其拓扑结构显示4个地理种群文蛤首先聚为1个单元,然后与青蛤聚在一起,最后所有帘蛤科物种聚为一枝,与外群相区别,其结果与传统形态分类基本一致,说明COⅠ基因适合作为该科贝类种群遗传结构和系统发生研究的分子标记.
关键词
帘蛤科
线粒体DNA
细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ
系统
发生
学
系统
发生
生物
地理
学
Keywords
Veneridae
mitochondrial DNA
cytochrome c oxidase subunit Ⅰ
phylogeny
phylogeography
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于ITS-1基因的菜粉蝶地理种群遗传分化研究
毛增辉
郝家胜
王晨
于芳
司曼曼
夏靖
朱朝东
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
江淮流域9个家鸭品种的分子生物地理演化过程分析
张汤杰
李慧芳
常洪
张晶鑫
汤青萍
高玉时
徐文娟
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
6种帘蛤科贝类及4个地理种群文蛤线粒体COI基因片段序列分析
程汉良
夏德全
吴婷婷
孟学平
吉红九
董志国
陈淑吟
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
35
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职称材料
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