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转录因子结合位点生物信息学研究进展
被引量：
29
1
作者
侯琳
钱敏平
+1 位作者
朱云平
邓明华
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期365-373,共9页
转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA序列,它们与转录因子相互作用调控基因的转录过程。确定TFBS是理解转录调控机制,建立转录调控网络的关键问题。随着高通量实验技术的发展,结合ChIP-chi...
转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA序列,它们与转录因子相互作用调控基因的转录过程。确定TFBS是理解转录调控机制,建立转录调控网络的关键问题。随着高通量实验技术的发展,结合ChIP-chip实验以及多个基因组的序列信息来预测TFBS已成为新的研究热点。本文简要概述了用于TFBS定位的实验技术,TFBS信息相关的数据库,重点评述了描述TFBS的模型以及预测TFBS的多种软件。TFBS的生物信息学研究的发展,将与相关领域相互促进,有助于进一步揭示转录调控机制。
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关键词
转录因子结合位点
生物信息学
ChIP—chip
位置权重矩阵
系统发育足迹分析法
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职称材料
题名
转录因子结合位点生物信息学研究进展
被引量：
29
1
作者
侯琳
钱敏平
朱云平
邓明华
机构
北京大学数学科学学院
军事医学科学院放射与辐射医学研究所
北京大学理论生物学中心
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期365-373,共9页
基金
国家自然科学基金项目(编号:30570425)
国家重点基础研究发展计划项目(编号:2003CB715903)
+1 种基金
国家高技术研究发展计划项目(编号:2006AA02Z331
2008AA02Z306)资助
文摘
转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA序列,它们与转录因子相互作用调控基因的转录过程。确定TFBS是理解转录调控机制,建立转录调控网络的关键问题。随着高通量实验技术的发展,结合ChIP-chip实验以及多个基因组的序列信息来预测TFBS已成为新的研究热点。本文简要概述了用于TFBS定位的实验技术,TFBS信息相关的数据库,重点评述了描述TFBS的模型以及预测TFBS的多种软件。TFBS的生物信息学研究的发展,将与相关领域相互促进,有助于进一步揭示转录调控机制。
关键词
转录因子结合位点
生物信息学
ChIP—chip
位置权重矩阵
系统发育足迹分析法
Keywords
transcription factor binding site （TFBS）
bioinformatics
ChiP-chip
position weight matrix
phylogenetic footprinting
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
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被引量
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1
转录因子结合位点生物信息学研究进展
侯琳
钱敏平
朱云平
邓明华
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009
29
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