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题名两株H9N2亚型猪流感病毒全基因进化分析
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作者
葛菲菲
刘健
鞠厚斌
杨德全
周锦萍
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机构
上海市动物疫病预防控制中心
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出处
《中国动物传染病学报》
CAS
2012年第4期13-18,共6页
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基金
上海市科技兴农重点攻关项目[2009(5-2)]
上海市科委生物医药重大专项(09DZ1906602)
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文摘
用RT-PCR方法扩增了H9N2亚型猪流感病毒河南株(Swine/Henan/Y1/09)和H9N2亚型猪流感病毒上海株(Swine/Shanghai/Y1/09)的8个基因片段,进行测序分析。结果表明,这两株猪流感病毒HA基因长度均为1701 bp,编码566个氨基酸,HA切割位点序列均为R-S-S-R-G,属非高致病性毒株;这两个毒株的HA蛋白均有8个潜在的糖基化位点。两个分离株的NA基因长度为1401 bp,编码467个氨基酸,这两个毒株均在茎区63、64、65位发生氨基酸缺失。两株猪流感病毒HA基因的同源性为96.6%,NA基因的同源性为98.6%。两株毒株的8个基因片段系统发生树分析表明它们均为重组体,与2008年上海地区健康鸡群中分离的H9N2亚型毒株(Ck/Shanghai/Y1/2008)8个基因片段均分别属于同一个基因群。
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关键词
H9N2亚型猪流感病毒
HA基因
NA基因
系统发生树分析
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Keywords
H9N2 subtype Swine influenza virus
HA gene
NA gene
phylogenetic analysis
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分类号
S858.282.659.5
[农业科学—临床兽医学]
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