汉坦病毒系统发生分析及其基因分型的研究 被引量：8

1

作者 张永振 屈勇刚 +2 位作者 杨东明 李莹 Zhen F.Fu 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期193-197,201,共6页

目的寻找适于汉坦病毒进行系统发生分析的系统发生树构建方法及其基因片段。选用GenBank中部分有代表性的汉坦病毒株,用M、S、M+S全序列,以及G1、G2的2003-2302、2741-2950核苷酸片段分别以邻位相连法(NJ)和最大简约法(MP)构建系统发生... 目的寻找适于汉坦病毒进行系统发生分析的系统发生树构建方法及其基因片段。选用GenBank中部分有代表性的汉坦病毒株,用M、S、M+S全序列,以及G1、G2的2003-2302、2741-2950核苷酸片段分别以邻位相连法(NJ)和最大简约法(MP)构建系统发生树。用M+S、M、G1、以及G2的2003-2302片段以NJ法构建的系统发生树将所选25株病毒分为5个分支,分别对应于HTN、SEO、DOB、PUU血清型及引起HPS的Sin Nombre血清族。但用G2区的2741-2950片段构建的系统发生树将DOB型与HTN型分为一支。以MP法用M、M+S及G1片段构建的发生树,结果与NJ法相同,但用S与G2的2003-2302、2741-2950片段构建的系统发生树则不能将所有的病毒株分在相应的血清型。因此,汉坦病毒的基因分型及系统发生分析时,NJ法优于MP法;用M片段的G1核苷酸序列可以替代M与S片段全序列进行基因分型及系统发生分析。 展开更多

关键词 汉坦病毒 系统发生分析 基因分型 邻位相连法 最大简约法

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系统发生分析程序MrBayes 3.1使用方法介绍 被引量：11

2

作者 王勇 陈克平 姚勤 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第33期16665-16669,共5页

在介绍MrBayes3.1程序基本特点以及Nexus文件准备的基础上,选取普通DNA序列、普通蛋白质序列、含编码区域的DNA序列、mRNA序列以及混合型数据文件为例分别介绍了MrBayes3.1程序的基本使用方法,为初学者正确使用该程序提供了操作指南,同... 在介绍MrBayes3.1程序基本特点以及Nexus文件准备的基础上,选取普通DNA序列、普通蛋白质序列、含编码区域的DNA序列、mRNA序列以及混合型数据文件为例分别介绍了MrBayes3.1程序的基本使用方法,为初学者正确使用该程序提供了操作指南,同时为深入学习与掌握该程序的特殊用途打好基础。 展开更多

关键词 系统发生分析 贝叶斯推理法 MRBAYES 3.1 使用方法

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系统发生分析软件PAUP和TreePuzzle使用方法介绍 被引量：4

3

作者 王勇 陈克平 姚勤 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第2期818-821,829,共5页

系统发生分析被广泛应用于研究不同生物DNA、蛋白质序列的进化关系。PAUP和TreePuzzle是目前使用较多的系统发生分析软件,但其使用方法较为复杂,不易被初学者掌握。从序列信息模块、序列参数模块、运算命令模块3个方面介绍了PAUP软件的... 系统发生分析被广泛应用于研究不同生物DNA、蛋白质序列的进化关系。PAUP和TreePuzzle是目前使用较多的系统发生分析软件,但其使用方法较为复杂,不易被初学者掌握。从序列信息模块、序列参数模块、运算命令模块3个方面介绍了PAUP软件的使用方法,同时也对TreePuzzle软件的使用和进化树的编辑与注释方法做了简单介绍。 展开更多

关键词 系统发生分析 PAUP TreePuzzle

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半胱氨酸蛋白酶抑制剂的系统发生分析 被引量：4

4

作者 李凤梅 盖雪梅 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第10期4972-4974,共3页

[目的]对已知半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因编码蛋白的分子量、等电点、信号肽、结构域等进行分析。[方法]在NCBI中检索半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因,下载相应的氨基酸序列。采用SMART软件预测结构域,用SingalP程序查找信号肽,用TMHMM程序搜寻... [目的]对已知半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因编码蛋白的分子量、等电点、信号肽、结构域等进行分析。[方法]在NCBI中检索半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因,下载相应的氨基酸序列。采用SMART软件预测结构域,用SingalP程序查找信号肽,用TMHMM程序搜寻预测跨膜区。多序列比对采用CLUSTALW程序。运用MEGA3.1软件,采用Neighbor-joining法构建进化树。[结果]多序列比对结果表明半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因存在高度保守的QxVxG基序,意味着该基序可能对半胱氨酸蛋白酶抑制剂的抑制活性具有重要意义。系统进化分析可预示半胱氨酸蛋白酶抑制半胱氨酸蛋白酶活性在进化过程中可能也是保守的。[结论]该研究可为半胱氨酸蛋白酶抑制剂抑制半胱氨酸蛋白酶的功能研究方面提供理论参考。 展开更多

关键词 半胱氨酸蛋白酶抑制剂 多序列比对 系统发生分析

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中国江苏分离欧洲禽源H1N1猪流感病毒及系统发生分析

5

《中国猪业》 2012年第3期69-70,共2页

2010年1月首次在中国江苏的无症状猪身上分离出A（H1N1）pdm2009病毒，显示病毒在中国大陆感染人以后又回归感染猪。

关键词 猪流感病毒 中国大陆 系统发生分析 分离 江苏 禽源 欧洲 感染

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基于mtDNA中国地方鸡种系统发生数据库建立 被引量：2

6

作者 白云峰 栾德琴 +1 位作者 包文斌 陈国宏 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2010年第1期113-119,共7页

在.NET编程环境下,运用代理程序的方法从GenBank中获取中国地方鸡种数据,并将有关mtDNA的数据进行整理,引用Matlab生物信息学工具箱,以组件技术将其打包和发布,建成中国地方鸡种mtDNA数据库。实验人员可以应用系统发生分析组件、经过运... 在.NET编程环境下,运用代理程序的方法从GenBank中获取中国地方鸡种数据,并将有关mtDNA的数据进行整理,引用Matlab生物信息学工具箱,以组件技术将其打包和发布,建成中国地方鸡种mtDNA数据库。实验人员可以应用系统发生分析组件、经过运算得到中国地方鸡种进化树图结果。说明通过Matlab、SQL和.NET混合编程构建中国地方鸡种mtDNA数据库系统,实现了基于mtDNA的中国地方鸡种生物进化关系分析功能。 展开更多

关键词 中国地方鸡种 数据库 系统发生分析

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红花低分子量油体蛋白基因的克隆与系统进化分析 被引量：1

7

作者 候文静 王旺 +3 位作者 方锐 沃思宇 张捷 丁亦男 《南方农业》 2015年第3期1-2,共2页

目的:克隆红花低分子量油体蛋白基因L-Oleosin,并进行测序和序列比较分析。方法:参考已完成的红花转录组测序结果,设计特异性引物,从野生型红花种子中提取RNA,以RT-PCR方法扩增L-Oleosin全长基因,测序之后,进行不同物种同源基因间的系... 目的:克隆红花低分子量油体蛋白基因L-Oleosin,并进行测序和序列比较分析。方法:参考已完成的红花转录组测序结果,设计特异性引物,从野生型红花种子中提取RNA,以RT-PCR方法扩增L-Oleosin全长基因,测序之后,进行不同物种同源基因间的系统发生分析,应用Phylip软件绘制分子进化树。结果:克隆了红花低分子量油体蛋白基因,系统发生分析表明,L-Oleosin基因的变异很大,物种间差异明显。结论进行油体蛋白基因相关功能研究和建立油体蛋白表达系统等方面的研究应该以同种属植物或亲缘关系较近的植物之间应用为主,基因工程改造和功能验证应在本物种上进行,然后拓展至近缘物种。 展开更多

关键词 红花油体蛋白 基因克隆 系统发生分析

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分子系统发生学

8

作者 黄原 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1455-1455,共1页

内容简介：分子系统发生学是应用分子数据重建系统发生关系的学科。本书全面系统地论述了分子系统发生学的基础、原理、方法及应用。全书由18章组成，可以归纳为五大部分：第一部分包括第1～3章，分别介绍了系统发生和系统树的基本知识... 内容简介：分子系统发生学是应用分子数据重建系统发生关系的学科。本书全面系统地论述了分子系统发生学的基础、原理、方法及应用。全书由18章组成，可以归纳为五大部分：第一部分包括第1～3章，分别介绍了系统发生和系统树的基本知识；第二部分包括第4～7章，是分子系统发生分析的基础，其中第4章和第5章是分子系统发生学的信息学基础，第6章是数据集系统发生信号评估，第7章讨论了分子进化模型及模型选择原理与方法；第三部分中的第8～12章是各种系统发生分析方法，分别就目前主要的系统发生分析方法（距离矩阵法、简约法、最大似然法、贝叶斯推论法和系统发生网络法等）从原理、软件操作、应用及局限性等方面进行了详细的介绍。 展开更多

关键词 系统发生学 分子 系统发生分析 最大似然法 贝叶斯推论 数据重建 内容简介 模型选择

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从线粒体16S rDNA部分序列探讨厚蟹属的系统学位置 被引量：11

9

作者 孙红英 周开亚 +1 位作者 景开颜 汪芳 《南京师大学报（自然科学版）》 CAS CSCD 2002年第1期15-19,共5页

测定了天津厚蟹线粒体 16SrDNA部分序列 .基于天津厚蟹和方蟹科另外 13种蟹类线粒体 16SrDNA部分序列构建的NJ树 ,表明前者和弓蟹亚科 7个属形成单系群 ,自引导值达到 94% ,支持将厚蟹属从相手蟹亚科移至弓蟹亚科 .

关键词 线粒体 16S rDNA部分序列 厚蟹属 系统学位置 方蟹科 序列测定 遗传距离 系统发生分析

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葡萄MAPKK基因家族的识别与分析 被引量：3

10

作者 张演义 吕福堂 +1 位作者 张全军 房经贵 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第4期1791-1797,共7页

丝裂原活化蛋白激酶(MAPKK)是编码丝氨酸/苏氨酸特异的蛋白激酶,MAPKK基因家族对植物生长发育细胞周期调控和生物与非生物胁迫响应重要作用。已在一些物种中对这个基因家族进行了识别与分析,并对其如何参与胁迫条件下信号传导进行了探... 丝裂原活化蛋白激酶(MAPKK)是编码丝氨酸/苏氨酸特异的蛋白激酶,MAPKK基因家族对植物生长发育细胞周期调控和生物与非生物胁迫响应重要作用。已在一些物种中对这个基因家族进行了识别与分析,并对其如何参与胁迫条件下信号传导进行了探讨。在这项研究中,共识别出了葡萄基因组中5条MAPKK基因,并将其基因分别定位在第9、11、11、14和17条染色体上。对5条MAPKK基因序列内含子、外显子等结构信息进行了初步的比较分析。结果表明,它们可能存在功能上的分化。系统发生分析表明,葡萄和拟南芥的MAPKK基因亲缘关系近于其和水稻之间的亲缘关系;结合拟南芥MAPKK基因分组信息,将XP_002273313.1、XP_002280877.1、XP_002283491.1归为A组,而将XP_002274862.1和XP_002283080.1分别归位B组和D组。本研究结果为进行后续葡萄MAPKK基因和葡萄果实膨大相关方面的研究提供了有价值的参考。 展开更多

关键词 葡萄 MAPKK基因家族 识别 信号传导 系统发生分析

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热带爪蟾bHLH转录因子鉴定与进化分析 被引量：1

11

作者 刘武艺 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期59-71,共13页

爪蟾是重要的生物医学模式动物。文章根据NCBI公布的热带爪蟾(Xenopus tropicalis)基因组数据,利用生物信息学方法提取和鉴定了爪蟾全基因组范围的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)基因信息,应用系统发生方法进行分类并做基因本体论(Gene Ontolog... 爪蟾是重要的生物医学模式动物。文章根据NCBI公布的热带爪蟾(Xenopus tropicalis)基因组数据,利用生物信息学方法提取和鉴定了爪蟾全基因组范围的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)基因信息,应用系统发生方法进行分类并做基因本体论(Gene Ontology,GO)功能富集分布分析,以期从整体上探讨爪蟾bHLH转录因子基因家族的分类及功能。结果表明,在热带爪蟾基因组数据库中发现了70个bHLH转录因子,其中69个可以分别归到6大组(A^F)的34个亚家族中,另一个为"孤儿因子"(Orphan)基因。GO富集分布统计发现有51个显著富集分布的GO注释语句,其中转录调控活性、转录调控、DNA结合、RNA代谢过程调控、DNA依赖的转录调控、转录和转录因子活性等出现频率很高,表明这些GO术语是爪蟾bHLH基因最常见的功能;许多bHLH转录因子在一些重要的发育或生理过程中发挥调控作用,如肌肉组织和器官(横纹肌、骨骼肌、眼部和咽部肌肉)的分化和发育、消化系统发育、咽部和感觉器官的发育、碱基和核苷及核酸的代谢调控、生物合成过程调控、DNA结合和蛋白质异聚化活性等。另外,还有一些重要信号通路(Signaling pathway)的GO术语显著地富集。文章还对Hes转录因子家族做了进化分析。这些结果为热带爪蟾bHLH基因的进一步研究打下了很好的基础。 展开更多

关键词 爪蟾 系统发生分析 转录因子 基因本体论

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宁波野生鼠类携带的沙粒病毒检测和种系进化分析

12

作者 胡群 马思杰 +2 位作者 邹春颖 童淑梅 梅勇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期235-239,共5页

目的对宁波地区野生鼠类携带的沙粒病毒进行检测并分析病毒基因序列特征。方法设计沙粒病毒L、S基因的简并引物,采用RT-PCR方法对宁波口岸捕获的鼠类样品进行沙粒病毒检测,分离病毒,对PCR产物进行测序及系统发生分析。结果共检测73份鼠... 目的对宁波地区野生鼠类携带的沙粒病毒进行检测并分析病毒基因序列特征。方法设计沙粒病毒L、S基因的简并引物,采用RT-PCR方法对宁波口岸捕获的鼠类样品进行沙粒病毒检测,分离病毒,对PCR产物进行测序及系统发生分析。结果共检测73份鼠类样品,其中12份褐家鼠经检测为阳性,分离获得沙粒病毒株DX1401,该病毒株S片段扩增片段大小为413bp,L片段扩增大小1 204bp。S片段的系统发生分析显示DX1401与Mobala病毒株ACAR3080位于同一分支,与Mobala病毒株ACAR3080遗传距离最为接近,值为0.467;L片段的系统发生分析显示DX1401与Lassa病毒株Josiah、NL、Z148、Bamba-R114、Soromba-R、Nig08-A37、Nig08-A47,Mobala病毒株ACAR3080,Morogoro病毒株13017/2004,Mopeia病毒株Mozambique、AN 21366-BNI位于同一组,与Mobala病毒株ACAR 3080遗传距离最为接近,值为6.953。结论本研究证实了宁波地区野生鼠类中存在沙粒病毒流行。 展开更多

关键词 鼠类 沙粒病毒 检测 系统发生分析

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大鲵Tafazzin基因及其全长cDNA的克隆及序列分析

13

作者 田海峰 孟彦 +1 位作者 曾令兵 肖汉兵 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2013年第B07期3-7,共5页

实验采用兼并性PCR和末端快速扩增（RACE）的方法，得到了1432bp的大鲵AndriasdavidanusTAZ基因全长cDNA序列。该序列包括87bp的5’末端非翻译区（UTR），534bp的3’UTR及789bp的开放阅读框（ORF），NCBI数据库接收号KFll2047，编码263... 实验采用兼并性PCR和末端快速扩增（RACE）的方法，得到了1432bp的大鲵AndriasdavidanusTAZ基因全长cDNA序列。该序列包括87bp的5’末端非翻译区（UTR），534bp的3’UTR及789bp的开放阅读框（ORF），NCBI数据库接收号KFll2047，编码263个氨基酸，预测其蛋白质分子量约为30．55KD，等电点约为8．87。通过搜索NCBI的nr数据库获取同源序列进行氨基酸相似性比对，并构建TAZ氨基酸序列的系统进化树，结果表明，大鲵TAZ与斑马鱼（Daniorerio）、爪蟾（Xenopustropicalis）、人（Homosapiens）等的TAZ蛋白同源性在68％～80％之间，在系统树上也与爪蟾关系最近，处于鱼类与爬行动物、鸟类及哺乳动物之间，反应了大鲵在进化上的过渡状态。 展开更多

关键词 大鲵(Andrias davidanus) TAFAZZIN 全长CDNA 系统发生分析

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鼠肠道病毒RT-PCR检测与基因序列分析

14

作者 胡群 马思杰 王军 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期416-419,共4页

目的对鼠类携带的肠道病毒进行检测并分析病毒基因序列特征。方法设计肠道病毒属一致-简并引物,采用RT-PCR方法对宁波口岸捕获的鼠类肠道内容物样品进行检测,对PCR产物进行测序,并将所测序列与国内外肠道病毒属病毒株序列进行核苷酸同... 目的对鼠类携带的肠道病毒进行检测并分析病毒基因序列特征。方法设计肠道病毒属一致-简并引物,采用RT-PCR方法对宁波口岸捕获的鼠类肠道内容物样品进行检测,对PCR产物进行测序,并将所测序列与国内外肠道病毒属病毒株序列进行核苷酸同源性分析和构建种系进化树。根据基因序列比对结果,采用鼻病毒通用引物进行验证。结果共检测165份鼠类样品,2份黄毛鼠样品经检测为阳性,扩增片段大小为378bp,标识为DXEV1601。片段的系统发生分析显示DXEV1601与人鼻病毒1B SC9813株位于同一进化分支,与23个不同肠道病毒属病毒流行株同源性相似度范围为50.3%～59.6%。经鼻病毒特异性引物扩增为阳性。结论宁波地区野生鼠类中存在鼻病毒感染。 展开更多

关键词 鼠类 肠道病毒属 一致-简并RT-PCR 系统发生分析

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犬副流感病毒CC-14株全基因组测序及分析 被引量：9

15

作者 高菽蔓 靳红亮 +2 位作者 张守峰 刘晔 扈荣良 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期802-804,共3页

为研究犬副流感病毒（CPIV）CC-14株全基因组序列特征，本研究参照猴病毒5型全基因组序列设计了覆盖CPIVCC-14株基因组全长的14对引物，对CPIVCC-14株进行RT—PCR分段扩增，扩增产物分别克隆于pMD18-T载体中，以通用引物进行序列测定、... 为研究犬副流感病毒（CPIV）CC-14株全基因组序列特征，本研究参照猴病毒5型全基因组序列设计了覆盖CPIVCC-14株基因组全长的14对引物，对CPIVCC-14株进行RT—PCR分段扩增，扩增产物分别克隆于pMD18-T载体中，以通用引物进行序列测定、拼接并分析。结果显示，CPIVCC-14株全基因组序列大小为15246nt（KP893891）。以高度保守的1530bpNP基因序列对现有的CPIV进行系统发生分析，同源比对结果显示，CPIV CC-14株与其他17株参考序列的核苷酸同源性为97．25％～99．80％，推导氨基酸同源性为98．62％～99．80％：系统发生分析显示，CC-14株与长春牛源PV5-BC14株同属一个分支。 展开更多

关键词 犬副流感病毒 全基因组 系统发生分析

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家蚕谷氨酸转运蛋白基因克隆及序列分析 被引量：1

16

作者 王晓莹 袁刚祥 +2 位作者 齐登伟 马艳 沈以红 《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期177-183,共7页

谷氨酸转运蛋白(EAAT)主要存在于神经、神经原及神经胶质细胞浆膜上,对胞外谷氨酸浓度进行调节,在维持细胞正常的生理状态、避免神经元过度兴奋方面起着重要的作用.利用鳞翅目粉纹夜蛾(Trichoplusia ni)和双翅目拟暗果蝇(Drosophila pse... 谷氨酸转运蛋白(EAAT)主要存在于神经、神经原及神经胶质细胞浆膜上,对胞外谷氨酸浓度进行调节,在维持细胞正常的生理状态、避免神经元过度兴奋方面起着重要的作用.利用鳞翅目粉纹夜蛾(Trichoplusia ni)和双翅目拟暗果蝇(Drosophila pseudoobscura)的谷氨酸转运蛋白序列为问询序列,在家蚕基因组数据库中进行同源检索,找到2个EAAT基因的同源基因(BmEAAT),并进行了克隆测序.两个BmEAAT基因均含8个外显子,编码蛋白均为膜蛋白,各有8个跨膜结构域.多物种的同源基因序列的系统发生分析结果表明:家蚕的两个EAAT拷贝至少在鳞翅目与双翅目分化前就已存在.基因芯片数据显示BmEAAT的两个拷贝在家蚕5龄3天的组织表达模式有明显差异,表明这两个基因的功能可能已经分化. 展开更多

关键词 家蚕 谷氨酸转运蛋白 系统发生分析

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甘蓝型油菜phytocyanin家族全基因组鉴定和表达分析 被引量：2

17

作者 张帅 林科运 +2 位作者 侯纯朴 方玉洁 王幼平 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期116-129,共14页

质体蓝素(phytocyanin,PC)是一类含铜电子转移蛋白,参与植物光合作用、生长发育以及对环境的适应等。为研究异源四倍体作物甘蓝型油菜的PC基因功能,对BnPC家族进行全基因组鉴定,共鉴定到173个成员。根据铜结合位点以及糖基化位点的差异... 质体蓝素(phytocyanin,PC)是一类含铜电子转移蛋白,参与植物光合作用、生长发育以及对环境的适应等。为研究异源四倍体作物甘蓝型油菜的PC基因功能,对BnPC家族进行全基因组鉴定,共鉴定到173个成员。根据铜结合位点以及糖基化位点的差异将该基因家族的蛋白划分为4个亚家族:类早期结瘤素蛋白(BnENODL)、类花青苷蛋白(BnUCL)、类漆树蓝蛋白(BnSCL)和类质体蓝素蛋白(BnPLCL)。蛋白质序列特征分析结果表明,133个BnPC含有N端信号肽,77个BnPC具有糖基磷脂酰肌醇锚定信号,87个BnPC具有阿拉伯半乳聚糖结构域,104个BnPC具有N-糖基化位点。共线性分析结果表明,基因组复制和片段重复在该家族的扩张中起着重要作用。表达谱分析结果表明,部分BnPC基因的表达具有组织/器官特异性,95个BnPC基因至少对旱、盐、冷和高温胁迫中的一种产生响应。 展开更多

关键词 甘蓝型油菜 质体蓝素 系统发生分析 表达分析

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两株H9N2亚型猪流感病毒全基因进化分析

18

作者 葛菲菲 刘健 +2 位作者 鞠厚斌 杨德全 周锦萍 《中国动物传染病学报》 CAS 2012年第4期13-18,共6页

用RT-PCR方法扩增了H9N2亚型猪流感病毒河南株(Swine/Henan/Y1/09)和H9N2亚型猪流感病毒上海株(Swine/Shanghai/Y1/09)的8个基因片段,进行测序分析。结果表明,这两株猪流感病毒HA基因长度均为1701 bp,编码566个氨基酸,HA切割位点序列均... 用RT-PCR方法扩增了H9N2亚型猪流感病毒河南株(Swine/Henan/Y1/09)和H9N2亚型猪流感病毒上海株(Swine/Shanghai/Y1/09)的8个基因片段,进行测序分析。结果表明,这两株猪流感病毒HA基因长度均为1701 bp,编码566个氨基酸,HA切割位点序列均为R-S-S-R-G,属非高致病性毒株;这两个毒株的HA蛋白均有8个潜在的糖基化位点。两个分离株的NA基因长度为1401 bp,编码467个氨基酸,这两个毒株均在茎区63、64、65位发生氨基酸缺失。两株猪流感病毒HA基因的同源性为96.6%,NA基因的同源性为98.6%。两株毒株的8个基因片段系统发生树分析表明它们均为重组体,与2008年上海地区健康鸡群中分离的H9N2亚型毒株(Ck/Shanghai/Y1/2008)8个基因片段均分别属于同一个基因群。 展开更多

关键词 H9N2亚型猪流感病毒 HA基因 NA基因 系统发生树分析

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复杂系统的逻辑结构判据问题

19

作者 王青芸 刘来福 孟大志 《北京师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期126-129,共4页

系统阐述了LAPP方法以及2004年以来的主要发展,并指出一些新的针对复杂系统的逻辑结构判据算法及相关问题的研究方向.

关键词 系统发生谱的逻辑分析 逻辑相关性 复杂网络

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江苏省蛇类新纪录——东亚腹链蛇

20

作者 叶琳 朱文启 +3 位作者 章铁睿 虞磊 高国富 包浩然 《野生动物学报》 北大核心 2024年第1期216-221,共6页

2022年7—9月,在江苏省宁镇山脉的南京汤山(32°3’59’’N,119°1’2’’E;海拔179 m)和句容市宝华山(32°7’40’’N,119°5’33’’E;海拔288 m)共采集到蛇类标本5号。通过形态学比对和分子系统学分析,确认标本均为... 2022年7—9月,在江苏省宁镇山脉的南京汤山(32°3’59’’N,119°1’2’’E;海拔179 m)和句容市宝华山(32°7’40’’N,119°5’33’’E;海拔288 m)共采集到蛇类标本5号。通过形态学比对和分子系统学分析,确认标本均为水游蛇科(Natricidae)东亚腹链蛇属(Hebius)东亚腹链蛇[H.vibakari(Boie,1826)],为江苏省蛇类分布新纪录,也是本种在长江以南地区的首次发现。 展开更多

关键词 东亚腹链蛇 新分布纪录 系统发生分析 江苏省 宁镇山脉

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