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糖苷水解酶GH97家族成员PspAG97A的催化机制分析 被引量:2
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作者 张小敏 陈飞云 +2 位作者 张学成 何超 肖亚中 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期24-28,共5页
糖苷水解酶GH97家族是一个特殊的家族,同时拥有反转和保留两种催化类型成员,其两种催化类型如何分化目前还不清楚。对GH97家族成员PspAG97A的催化机制进行分析,通过高效液相色谱法检测水解产物异头物的构型,根据在不同酶反应时间所检测... 糖苷水解酶GH97家族是一个特殊的家族,同时拥有反转和保留两种催化类型成员,其两种催化类型如何分化目前还不清楚。对GH97家族成员PspAG97A的催化机制进行分析,通过高效液相色谱法检测水解产物异头物的构型,根据在不同酶反应时间所检测到的α-葡萄糖与β-葡萄糖的比例变化,证明PspAG97A执行反转催化机制。通过结构分析与定点突变等方法尝试对PspAG97A的催化类型进行改造,将PspAG97A与同一家族成员Bt GH97b(保留型)活性中心进行叠加比较,仿照保留类型的催化装置对相关位点G407、E377及E456进行单点突变和联合突变。结果显示突变酶活力相比野生型显著下降,并分析了相关位点的作用。研究加深了对PspAG97A催化机制的认识,为GH97家族两种催化类型进化关系的研究奠定基础。 展开更多
关键词 糖苷水解酶gh97家族 催化机制 定点突变
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烟草糖苷水解酶GH3基因家族鉴定与表达分析
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作者 张贞宇 罗正飞 +4 位作者 杨帅 顾江南 尹协 韦银龙 聂琼 《山东农业科学》 北大核心 2024年第4期9-19,共11页
糖苷水解酶GH3基因家族在植物的糖代谢和生长发育中起着重要作用,而烟草GH3基因家族目前尚未见相关鉴定和分析研究报道。本研究采用生物信息学方法在烟草基因组中鉴定GH3家族基因,并对其在不同组织中及逆境条件下的表达模式进行了分析... 糖苷水解酶GH3基因家族在植物的糖代谢和生长发育中起着重要作用,而烟草GH3基因家族目前尚未见相关鉴定和分析研究报道。本研究采用生物信息学方法在烟草基因组中鉴定GH3家族基因,并对其在不同组织中及逆境条件下的表达模式进行了分析。结果表明,在普通烟草K326的基因组中共鉴定出35个GH3基因,其中23个被定位在14条染色体上,存在6对共线性基因;GH3家族蛋白均为热稳定性蛋白,其基因上游启动子区均包含多个激素和胁迫响应元件。转录组数据表明,GH3家族基因大多数在烟苗茎尖高表达,少部分在根和茎中高表达,表达量受光照时间影响;烟苗受到干旱胁迫后GH3家族成员都有不同程度的响应。挑选4个NtGH3基因进行qRT-PCR分析,结果表明,NtGH3-5、NtGH3-19、NtGH3-22、NtGH3-26可能参与响应低温以及ABA处理。这可为深入了解烟草GH3基因家族及其功能提供依据。 展开更多
关键词 烟草 gh3基因家族 糖苷水解酶 生物信息学分析 表达模式
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大麦条纹病菌GH17基因家族的鉴定及表达分析
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作者 任睿斌 司二静 +7 位作者 万广有 汪军成 姚立蓉 张宏 马小乐 李葆春 王化俊 孟亚雄 《生物技术通报》 北大核心 2025年第8期146-154,共9页
【目的】糖苷水解酶17(glycoside hydrolase 17, GH17)在植物、动物和真菌的多种生理及致病过程中发挥重要作用,对大麦条纹病菌PgGH17家族成员进行鉴定和分析,为后续深入研究GH17基因功能提供科学依据,同时为解析大麦条纹病菌的致病性... 【目的】糖苷水解酶17(glycoside hydrolase 17, GH17)在植物、动物和真菌的多种生理及致病过程中发挥重要作用,对大麦条纹病菌PgGH17家族成员进行鉴定和分析,为后续深入研究GH17基因功能提供科学依据,同时为解析大麦条纹病菌的致病性基因功能和探究寄主-病原互动机制奠定坚实的理论基础。【方法】以大麦条纹病菌为研究对象,通过生物信息学方法,对基因家族进行鉴定及分析,经实时荧光定量PCR(RT-qPCR)监测大麦条纹病菌感染过程中各基因不同时间点的表达变化。【结果】PgGH17基因家族含有6个成员,氨基酸序列长度为305-648 aa,均为亲水性蛋白,等电点为5.06-8.66,脂肪指数为65.43-82.00,信号肽长度为0-22 aa,且大多定位在细胞外基质,只有1个基因具有跨膜结构。内含子数为1-3个,进化分析表明,该基因家族成员可聚成7个亚族。RT-q PCR结果表明,除PgGH17-3外,其他PgGH17基因在侵染过程中的表达水平基本呈现先上升后下降的趋势。【结论】从大麦条纹病菌中鉴定出6个GH17家族成员,除GH17-3外,其他GH17基因在侵染过程中表达均增强,说明其参与了病原菌的致病性。 展开更多
关键词 大麦条纹病菌 糖苷水解酶17(gh17) 基因家族 基因表达分析
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具有辅助降解纤维素功能的大斑刚毛座腔菌糖苷水解酶GH61的鉴定、异源表达及功能分析 被引量:3
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作者 马玉倩 孙东辉 +3 位作者 岳浩峰 辛佳瑜 刘宁 曹志艳 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期124-135,共12页
糖苷水解酶61家族(GH61)属于一类同时具有氧化作用和水解作用的纤维素降解酶类,既具有微弱的纤维素内切酶活性,也可通过氧化作用破坏纤维素晶体结构促进纤维素酶对木质纤维素的降解,在生物质资源的利用方面具有潜在的应用价值。对大斑... 糖苷水解酶61家族(GH61)属于一类同时具有氧化作用和水解作用的纤维素降解酶类,既具有微弱的纤维素内切酶活性,也可通过氧化作用破坏纤维素晶体结构促进纤维素酶对木质纤维素的降解,在生物质资源的利用方面具有潜在的应用价值。对大斑刚毛座腔菌Setosphaeria turcica的GH61家族基因进行鉴定及生物信息学分析,通过转录组数据分析及荧光定量PCR验证,筛选出受玉米秸秆木质纤维素底物诱导表达的GH61家族基因StGH61-11。将StGH61-11进行重组表达,使用2,6-二甲氧基苯酚氧化反应测定其酶活力并优化诱导条件,表征其酶学性质并检测其对纤维素酶水解木质纤维素的促进作用。结果表明,在S.turcica基因组中存在21个GH61家族基因,且S.turcica在玉米秸秆的诱导下滤纸酶活明显增加,对其进行转录组分析发现,在以玉米秸秆为碳源时GH61家族基因中有11个基因的表达量增加。将其中StGH61-11基因在大肠杆菌中诱导表达,最佳诱导条件为25℃、1 mmol/L IPTG诱导9 h,此时获得的蛋白比活力可达到(54.08±1.67)U/g。重组蛋白StGH61-11的最佳催化条件为温度50℃、pH 5,在最佳催化条件下可以显著提高纤维素酶水解玉米秸秆的活性,协同度最高可达2.5,糖化率最高可达46.5%。 展开更多
关键词 gh61糖苷水解酶家族 多糖单加氧酶 纤维素酶 AA9 大斑刚毛座腔菌 协同降解 异源表达
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棉花GH9家族的全基因组鉴定与分析 被引量:1
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作者 赵庆英 杨俊鸾 +1 位作者 李旭凯 杨致荣 《山西农业科学》 2018年第7期1065-1069,共5页
糖苷水解酶GH9基因家族在纤维素的生物合成、修饰以及器官脱落和果实成熟过程中发挥着重要的作用。利用生物信息学的方法对棉花GH9基因家族进行了分析,结果发现,棉花与同属于双子叶的拟南芥GH9基因家族亲缘关系最近;棉花、水稻、拟南芥... 糖苷水解酶GH9基因家族在纤维素的生物合成、修饰以及器官脱落和果实成熟过程中发挥着重要的作用。利用生物信息学的方法对棉花GH9基因家族进行了分析,结果发现,棉花与同属于双子叶的拟南芥GH9基因家族亲缘关系最近;棉花、水稻、拟南芥及杨树等物种的GH9跨膜结构域均具有一段保守的跨膜基序;GH9C具有保守的CBM_49纤维素结合结构域。通过对棉花GH9基因共表达分析发现,A亚类基因在叶片以及开花20 d后的纤维中表达量较高,B亚类基因在各个组织中均有表达,C亚类基因在叶片、茎、开花10 d后的纤维以及柱头中表达量较高。研究可为深入解析棉花GH9家族成员的功能及作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 棉花 糖苷水解酶 gh9家族 生物信息学
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