目的:运用网络药理学方法探讨丹参-红花药对治疗糖尿病周围神经病变(diabetic peripheral neuropathy,DPN)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and anal...目的:运用网络药理学方法探讨丹参-红花药对治疗糖尿病周围神经病变(diabetic peripheral neuropathy,DPN)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索丹参和红花的活性成分及对应靶点,借助UniProt数据库对靶点进行规范化;通过人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、Disgenet、药物靶标数据库(therapeutic targetdatabase,TTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)获取DPN的相关靶点,并利用R语言筛选药物与疾病的交集靶点;通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白-蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络分析,并通过Bioconductor平台对交集靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;通过Cytoscape软件构建丹参-红花药对治疗DPN的“活性成分-疾病靶点”可视化调控网络及PPI调控网络,借助CytoNCA插件筛选并提取出核心调控网络得到的核心活性成分及作用靶点。结果:获得丹参-红花药对73个活性成分,对应215个作用靶点,其中与疾病的交集靶点96个;筛选出槲皮素、山柰酚、木犀草素、丹参酮ⅡA等16个核心活性成分,核心作用靶点包括AKT1、IL-1β等20个;GO功能富集分析涉及2497个条目,主要影响转录因子活性、酶活性、受体活性及生物化学过程调控等过程,KEGG通路富集分析得到158条,涉及到糖尿病并发症中的AGE-RAGE、IL-17、TNF等信号通路。结论:丹参-红花药对通过槲皮素、山柰酚、木犀草素、丹参酮ⅡA等活性成分干预AGE-RAGE等信号通路,并作用于AKT1等靶点,从而发挥治疗DPN的作用。展开更多
文摘目的:运用网络药理学方法探讨丹参-红花药对治疗糖尿病周围神经病变(diabetic peripheral neuropathy,DPN)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索丹参和红花的活性成分及对应靶点,借助UniProt数据库对靶点进行规范化;通过人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、Disgenet、药物靶标数据库(therapeutic targetdatabase,TTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)获取DPN的相关靶点,并利用R语言筛选药物与疾病的交集靶点;通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白-蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络分析,并通过Bioconductor平台对交集靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;通过Cytoscape软件构建丹参-红花药对治疗DPN的“活性成分-疾病靶点”可视化调控网络及PPI调控网络,借助CytoNCA插件筛选并提取出核心调控网络得到的核心活性成分及作用靶点。结果:获得丹参-红花药对73个活性成分,对应215个作用靶点,其中与疾病的交集靶点96个;筛选出槲皮素、山柰酚、木犀草素、丹参酮ⅡA等16个核心活性成分,核心作用靶点包括AKT1、IL-1β等20个;GO功能富集分析涉及2497个条目,主要影响转录因子活性、酶活性、受体活性及生物化学过程调控等过程,KEGG通路富集分析得到158条,涉及到糖尿病并发症中的AGE-RAGE、IL-17、TNF等信号通路。结论:丹参-红花药对通过槲皮素、山柰酚、木犀草素、丹参酮ⅡA等活性成分干预AGE-RAGE等信号通路,并作用于AKT1等靶点,从而发挥治疗DPN的作用。
