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题名粳稻糖基转移酶Ⅰ基因家族全基因组鉴定及功能分析
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作者
周镇中
罗彪
骆鹰
夏敏
汪启明
饶力群
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机构
湖南农业大学生物科学技术学院
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出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2022年第6期50-62,共13页
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基金
湖南省高校创新平台开放基金项目(13K063)
科技部国家科技支撑计划项目(2014BAD01B04)。
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文摘
糖基转移酶Ⅰ(GTⅠ)家族是糖基转移酶中的一类,其主要功能涉及黄酮类化合物糖基的转移、淀粉和蔗糖的合成等。为揭示GTⅠ基因家族在粳稻生长发育以及抗逆中的作用,为粳稻GTⅠ基因家族成员的功能研究提供基础,为水稻的品种改良和提高水稻耐高温提供思路,采用生物信息学方法鉴定出30个GTⅠ基因家族成员,并分析了粳稻GTⅠ基因家族成员的基因结构、蛋白质理化性质、染色体定位及基因进化、系统发育关系、保守结构域和蛋白质三维结构建模等。结果显示,粳稻的30个GTⅠ基因家族成员在水稻12条染色体上均有分布,其基因结构、保守基序和遗传进化相对保守,家族成员启动子均预测到脱落酸响应元件,家族蛋白质的三维结构保守含有6个β-折叠和7个α-螺旋。通过转录组数据与实时荧光定量分析,GTⅠ基因家族大部分成员对高温胁迫的响应出现在高温处理后第6小时,其中OS-GT29表达量呈持续高表达。GTⅠ基因家族在拟南芥和粳稻功能存在相似。
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关键词
粳稻
糖基转移酶ⅰ
基因家族
生物信息学
高温胁迫响应
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Keywords
Japonica rice
Glycosyltransferaseⅰ
Gene family
Bioinformatics
High temperature stress response
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分类号
S511.03
[农业科学—作物学]
Q78
[生物学—分子生物学]
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