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全基因组关联定位籼稻种质资源外观和加工品质QTL
被引量：
9
1
作者
方雅洁
朱亚军
+4 位作者
吴志超
陈凯
申聪聪
石英尧
徐建龙
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期32-42,共11页
以400份籼稻变异丰富的种质资源材料在2个环境下考察外观与加工品质性状表型,利用404k高密度SNP基因型进行全基因组关联分析,挖掘影响外观与加工品质性状的重要位点。结果表明,粒形和籼米的外观和加工品质密切相关,垩白性状降低稻米的...
以400份籼稻变异丰富的种质资源材料在2个环境下考察外观与加工品质性状表型,利用404k高密度SNP基因型进行全基因组关联分析,挖掘影响外观与加工品质性状的重要位点。结果表明,粒形和籼米的外观和加工品质密切相关,垩白性状降低稻米的精米率和整精米率,除粒形外,籼稻的外观和加工品质明显受到环境影响。全基因组关联分析共鉴定到39个QTL,其中17个为新位点,6个新位点(q MRR9、q GL2、q GL10、q GW1、q GLWR1和q GLWR2.1)在2个环境下均被检测到,暗示这6个位点在水稻外观与加工品质上可能是不依赖于环境稳定表达的QTL。此外,21个控制稻米外观品质的位点很可能具一因多效。结合前人研究结果,我们推论q SW5、GSE5和GS3在籼稻外观和加工品质性状上扮演着关键性角色。研究结果为克隆新的外观与加工品质基因,以及通过分子手段加速培育优质高产籼稻新品种提供了指导信息。
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关键词
籼稻种质资源
外观与加工品质
全基因组关联分析
数量性状座位
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职称材料
题名
全基因组关联定位籼稻种质资源外观和加工品质QTL
被引量：
9
1
作者
方雅洁
朱亚军
吴志超
陈凯
申聪聪
石英尧
徐建龙
机构
安徽农业大学
中国农业科学院作物科学研究所
中国农业科学院农业基因组研究所
中国农业科学院深圳生物育种创新研究院
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期32-42,共11页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2014AA10A601)
农业部引进国际先进农业科学技术(948)项目(2016-X16)
+1 种基金
深圳孔雀团队计划(20130415095710361)
中国农业科学院科技创新工程团队项目资助~~
文摘
以400份籼稻变异丰富的种质资源材料在2个环境下考察外观与加工品质性状表型,利用404k高密度SNP基因型进行全基因组关联分析,挖掘影响外观与加工品质性状的重要位点。结果表明,粒形和籼米的外观和加工品质密切相关,垩白性状降低稻米的精米率和整精米率,除粒形外,籼稻的外观和加工品质明显受到环境影响。全基因组关联分析共鉴定到39个QTL,其中17个为新位点,6个新位点(q MRR9、q GL2、q GL10、q GW1、q GLWR1和q GLWR2.1)在2个环境下均被检测到,暗示这6个位点在水稻外观与加工品质上可能是不依赖于环境稳定表达的QTL。此外,21个控制稻米外观品质的位点很可能具一因多效。结合前人研究结果,我们推论q SW5、GSE5和GS3在籼稻外观和加工品质性状上扮演着关键性角色。研究结果为克隆新的外观与加工品质基因,以及通过分子手段加速培育优质高产籼稻新品种提供了指导信息。
关键词
籼稻种质资源
外观与加工品质
全基因组关联分析
数量性状座位
Keywords
indica germplasms
appearance and milling quality
GWAS
quantitative trait loci/locus (QTL)
分类号
S511.21 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
全基因组关联定位籼稻种质资源外观和加工品质QTL
方雅洁
朱亚军
吴志超
陈凯
申聪聪
石英尧
徐建龙
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
9
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