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绿豆R2R3-MYB转录因子家族鉴定及其类黄酮合成调控基因的筛选
被引量：
2
1
作者
郭飞翔
李春霞
+3 位作者
周爽
郭彬彬
张均
马超
《作物学报》
CAS
北大核心
2025年第1期117-133,共17页
R2R3-MYB转录因子家族在植物次生代谢物合成、胁迫应答和生长发育等生命过程起着重要的调控作用。本研究基于生物信息学鉴定了绿豆(Vigna radiata L.)全基因组水平的R2R3-MYB转录因子,并对其理化性质、系统进化、染色体定位、启动子顺...
R2R3-MYB转录因子家族在植物次生代谢物合成、胁迫应答和生长发育等生命过程起着重要的调控作用。本研究基于生物信息学鉴定了绿豆(Vigna radiata L.)全基因组水平的R2R3-MYB转录因子,并对其理化性质、系统进化、染色体定位、启动子顺式作用元件及基因结构做了预测分析;此外,转录组数据和实时荧光定量PCR(QuantitativeReal-timePCR,RT-PCR)分析该转录因子在不同组织、逆境胁迫下的表达模式;并基于相关分析及蛋白互作网络,筛选到可能参与调控绿豆类黄酮生物合成的R2R3-MYB成员。结果表明,共鉴定到168个R2R3-MYB成员,其中145个分布于11条染色体, 23个成员染色体信息未知;大多数R2R3-MYB含有3个外显子,编码99~1645个氨基酸,均为亲水性蛋白;系统进化将绿豆R2R3-MYB基因家族分为30个亚组(V1~V30),不同亚组成员的基因结构存在差异;共线性分析表明,片段复制事件均进行了纯化选择;启动子顺式作用元件分析表明,绿豆R2R3-MYB基因启动子区含有大量激素响应、胁迫响应及少量的类黄酮合成响应等元件;基因表达分析表明,在叶片、叶柄、下胚轴和籽粒种皮中表达量较高的成员分别占15.5%、16.1%、16.1%和10.7%。RT-PCR分析发现,几乎所有的R2R3-MYB家族成员在低温胁迫下的相对表达量显著下调,不同成员对逆境胁迫有不同的响应模式。蛋白互作与相关性分析可知,VrMYB6、VrMYB77、VrMYB93这3个基因可能参与了绿豆类黄酮生物合成的调控。
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关键词
绿豆
R2R3-MYB转录因子
转录因子家族分析
类
黄
酮
合成
调控
基因
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职称材料
依据理化性质分析牡丹花色形成的影响因素
被引量：
15
2
作者
李想
段晶晶
+3 位作者
罗小宁
张延龙
牛立新
史倩倩
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期38-43,67,共7页
对5个不同花色的牡丹品种花瓣解剖结构、色素分布、理化性状及类黄酮合成相关基因的表达进行了观测与分析,结果表明:不同花色牡丹品种的表皮细胞形态存在差异,类黄酮和金属元素(Al和Fe)质量分数与牡丹花色值显著相关。类黄酮为主要影响...
对5个不同花色的牡丹品种花瓣解剖结构、色素分布、理化性状及类黄酮合成相关基因的表达进行了观测与分析,结果表明:不同花色牡丹品种的表皮细胞形态存在差异,类黄酮和金属元素(Al和Fe)质量分数与牡丹花色值显著相关。类黄酮为主要影响因素,天竺葵素、矢车菊素和芍药素作为主要色素,槲皮素和木樨草素作为辅助色素,共同参与了红色系的形成;查尔酮、芹菜素、槲皮素和金圣草黄素影响了黄色花的形成。结合8个类黄酮生物合成相关结构基因的表达模式分析显示,CHI、DFR、ANS基因控制花青苷的合成,CHI、F3H、F3’H和FLS基因控制黄酮、黄酮醇以及查尔酮的合成,分别在红色及黄色品种中高表达。因此,牡丹不同花色的形成主要受相关基因表达以及类黄酮质量分数的调控,而金属元素(Al、Fe)和花瓣表皮细胞形态也能在一定程度上影响花色的呈现。
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关键词
花色
表皮细胞
液泡pH值
金属元素
花色素
类黄酮合成基因
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职称材料
题名
绿豆R2R3-MYB转录因子家族鉴定及其类黄酮合成调控基因的筛选
被引量：
2
1
作者
郭飞翔
李春霞
周爽
郭彬彬
张均
马超
机构
河南科技大学农学院/河南省旱地农业工程技术研究中心
出处
《作物学报》
CAS
北大核心
2025年第1期117-133,共17页
基金
国家自然科学基金项目(32372227)
河南省高等学校青年骨干教师培养计划项目(2021GGJS050)
河南省现代农业产业技术体系建设专项(HARS-22-04-G2)资助。
文摘
R2R3-MYB转录因子家族在植物次生代谢物合成、胁迫应答和生长发育等生命过程起着重要的调控作用。本研究基于生物信息学鉴定了绿豆(Vigna radiata L.)全基因组水平的R2R3-MYB转录因子,并对其理化性质、系统进化、染色体定位、启动子顺式作用元件及基因结构做了预测分析;此外,转录组数据和实时荧光定量PCR(QuantitativeReal-timePCR,RT-PCR)分析该转录因子在不同组织、逆境胁迫下的表达模式;并基于相关分析及蛋白互作网络,筛选到可能参与调控绿豆类黄酮生物合成的R2R3-MYB成员。结果表明,共鉴定到168个R2R3-MYB成员,其中145个分布于11条染色体, 23个成员染色体信息未知;大多数R2R3-MYB含有3个外显子,编码99~1645个氨基酸,均为亲水性蛋白;系统进化将绿豆R2R3-MYB基因家族分为30个亚组(V1~V30),不同亚组成员的基因结构存在差异;共线性分析表明,片段复制事件均进行了纯化选择;启动子顺式作用元件分析表明,绿豆R2R3-MYB基因启动子区含有大量激素响应、胁迫响应及少量的类黄酮合成响应等元件;基因表达分析表明,在叶片、叶柄、下胚轴和籽粒种皮中表达量较高的成员分别占15.5%、16.1%、16.1%和10.7%。RT-PCR分析发现,几乎所有的R2R3-MYB家族成员在低温胁迫下的相对表达量显著下调,不同成员对逆境胁迫有不同的响应模式。蛋白互作与相关性分析可知,VrMYB6、VrMYB77、VrMYB93这3个基因可能参与了绿豆类黄酮生物合成的调控。
关键词
绿豆
R2R3-MYB转录因子
转录因子家族分析
类
黄
酮
合成
调控
基因
Keywords
mung bean
R2R3-MYB transcription factor
transcription factor family analysis
flavonoids synthesis regulatory genes
分类号
S522 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
依据理化性质分析牡丹花色形成的影响因素
被引量：
15
2
作者
李想
段晶晶
罗小宁
张延龙
牛立新
史倩倩
机构
西北农林科技大学
出处
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期38-43,67,共7页
基金
林业公益性行业重大专项(2014047001)
国家自然科学基金项目(3180599)
+1 种基金
陕西省自然科学青年基金项目(2017JQ3024)
博士后科学基金面上项目(2017M623267)
文摘
对5个不同花色的牡丹品种花瓣解剖结构、色素分布、理化性状及类黄酮合成相关基因的表达进行了观测与分析,结果表明:不同花色牡丹品种的表皮细胞形态存在差异,类黄酮和金属元素(Al和Fe)质量分数与牡丹花色值显著相关。类黄酮为主要影响因素,天竺葵素、矢车菊素和芍药素作为主要色素,槲皮素和木樨草素作为辅助色素,共同参与了红色系的形成;查尔酮、芹菜素、槲皮素和金圣草黄素影响了黄色花的形成。结合8个类黄酮生物合成相关结构基因的表达模式分析显示,CHI、DFR、ANS基因控制花青苷的合成,CHI、F3H、F3’H和FLS基因控制黄酮、黄酮醇以及查尔酮的合成,分别在红色及黄色品种中高表达。因此,牡丹不同花色的形成主要受相关基因表达以及类黄酮质量分数的调控,而金属元素(Al、Fe)和花瓣表皮细胞形态也能在一定程度上影响花色的呈现。
关键词
花色
表皮细胞
液泡pH值
金属元素
花色素
类黄酮合成基因
Keywords
Flower color
Epidermal cells
Cell sap pH
Metal-ions
Pigments
Flavonoid biosynthetic genes
分类号
S685.11 [农业科学—观赏园艺]
Q944.58 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
绿豆R2R3-MYB转录因子家族鉴定及其类黄酮合成调控基因的筛选
郭飞翔
李春霞
周爽
郭彬彬
张均
马超
《作物学报》
CAS
北大核心
2025
2
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职称材料
2
依据理化性质分析牡丹花色形成的影响因素
李想
段晶晶
罗小宁
张延龙
牛立新
史倩倩
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
15
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职称材料
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