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苦荞类异黄酮还原酶基因(FtIRL)的克隆及序列分析
被引量:
3
1
作者
赵海霞
李成磊
+2 位作者
白悦辰
陈惠
吴琦
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012年第11期210-214,共5页
利用RT-PCR技术,从苦荞(Fagopyrum tatarium)中克隆得到类异黄酮还原酶基因(IRL)的开放阅读框序列(ORF),命名为FtIRL。序列分析表明:FtIRL含一个长942bp的ORF,编码313个氨基酸,其氨基酸序列与金荞异黄酮还原酶FcIFR(GenBank登录号ABV020...
利用RT-PCR技术,从苦荞(Fagopyrum tatarium)中克隆得到类异黄酮还原酶基因(IRL)的开放阅读框序列(ORF),命名为FtIRL。序列分析表明:FtIRL含一个长942bp的ORF,编码313个氨基酸,其氨基酸序列与金荞异黄酮还原酶FcIFR(GenBank登录号ABV02071)同源性最高,达到97%;与其他植物IRL同源性为44%~73%。生物信息学分析表明:FtIRL推导的蛋白质含有典型的底物结合口袋和保守的NADPH结合位点,符合短链脱氢酶家族的结构特征。构建基于氨基酸的系统发育树表明,苦荞FcIFR虽然在氨基酸序列上与其他植物的异黄酮还原酶(IFR)有较高的同源性,但其生物学功能可能更接近落叶松脂醇还原酶(PLR)。
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关键词
苦荞
类异黄酮还原酶
基因克隆
序列分析
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职称材料
甘蔗类异黄酮还原酶(IRL)基因的克隆与表达分析
被引量:
3
2
作者
谢晓娜
张小秋
+3 位作者
邵敏
朱惠
杨丽涛
李杨瑞
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期130-137,共8页
采用RT-PCR技术从甘蔗中克隆So IRL基因,用生物信息学方法对获得的氨基酸序列进行分析,利用荧光定量PCR技术研究So IRL基因在甘蔗不同组织和不同胁迫条件下的表达特性。结果表明,克隆获得甘蔗So IRL,Gen Bank登录号为KF808324。该c DNA...
采用RT-PCR技术从甘蔗中克隆So IRL基因,用生物信息学方法对获得的氨基酸序列进行分析,利用荧光定量PCR技术研究So IRL基因在甘蔗不同组织和不同胁迫条件下的表达特性。结果表明,克隆获得甘蔗So IRL,Gen Bank登录号为KF808324。该c DNA全长1 169 bp,含有1个927 bp的完整开放阅读框(ORF),编码309个氨基酸。系统进化树分析显示,甘蔗So IRL与玉米的IRL蛋白亲缘关系较近。q RT-PCR分析表明So IRL在甘蔗根、茎、叶中均有表达;在RSD病菌及低温(4℃)、聚乙二醇(PEG)、Na Cl和脱落酸(ABA)4种非生物胁迫下均被诱导表达,但表达模式不同。说明该基因可能参与甘蔗应答RSD过程,并可能在非生物胁迫中也发挥了作用。
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关键词
甘蔗
类异黄酮还原酶
基因克隆
表达分析
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职称材料
普通烟草IRL基因反义植物表达载体的构建
3
作者
陈伟
马建光
+1 位作者
李红勋
潘文杰
《湖北农业科学》
北大核心
2014年第19期4730-4733,共4页
异黄酮还原酶相似蛋白(IRL)是与异黄酮还原酶具有高度序列同源一致性而功能不同的一类蛋白。通过PCR扩增普通烟草(Nicotiana tabacum)品种龙里红花烟IRL基因的一段特异保守片段Nt IRLA,并将其亚克隆到中间载体p CAMBIA2301G中,构建了IR...
异黄酮还原酶相似蛋白(IRL)是与异黄酮还原酶具有高度序列同源一致性而功能不同的一类蛋白。通过PCR扩增普通烟草(Nicotiana tabacum)品种龙里红花烟IRL基因的一段特异保守片段Nt IRLA,并将其亚克隆到中间载体p CAMBIA2301G中,构建了IRL反义植物表达载体p CAMBIA2301G-IRLA。通过PCR鉴定、酶切鉴定证实载体构建成功,并转化到根癌农杆菌LBA4404菌株中形成工程菌株,为进一步利用转基因手段明确IRL基因在烟草次生代谢中的功能奠定了基础。
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关键词
类异黄酮还原酶
基因
反义表达载体
普通烟草
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职称材料
题名
苦荞类异黄酮还原酶基因(FtIRL)的克隆及序列分析
被引量:
3
1
作者
赵海霞
李成磊
白悦辰
陈惠
吴琦
机构
四川农业大学生命科学与理学院
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012年第11期210-214,共5页
文摘
利用RT-PCR技术,从苦荞(Fagopyrum tatarium)中克隆得到类异黄酮还原酶基因(IRL)的开放阅读框序列(ORF),命名为FtIRL。序列分析表明:FtIRL含一个长942bp的ORF,编码313个氨基酸,其氨基酸序列与金荞异黄酮还原酶FcIFR(GenBank登录号ABV02071)同源性最高,达到97%;与其他植物IRL同源性为44%~73%。生物信息学分析表明:FtIRL推导的蛋白质含有典型的底物结合口袋和保守的NADPH结合位点,符合短链脱氢酶家族的结构特征。构建基于氨基酸的系统发育树表明,苦荞FcIFR虽然在氨基酸序列上与其他植物的异黄酮还原酶(IFR)有较高的同源性,但其生物学功能可能更接近落叶松脂醇还原酶(PLR)。
关键词
苦荞
类异黄酮还原酶
基因克隆
序列分析
Keywords
Fagopyrum tataricum
isoflavone reductase-like protein
gene cloning
sequence analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S517.032 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
甘蔗类异黄酮还原酶(IRL)基因的克隆与表达分析
被引量:
3
2
作者
谢晓娜
张小秋
邵敏
朱惠
杨丽涛
李杨瑞
机构
广西大学农学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室
中国农业科学院甘蔗研究中心广西农业科院农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室广西甘蔗遗传改良重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期130-137,共8页
基金
国家"863"计划课题(2013AA102604)
国家自然科学基金项目(31360293)
+3 种基金
国家国际合作项目(2013DFA31600)
广西科技合作与交流计划项目(桂科合1347004-2)
广西自然科学基金创新团队项目(2011GXNSFF018002)
广西自然科学基金项目(2012GXNSFDA053 011)
文摘
采用RT-PCR技术从甘蔗中克隆So IRL基因,用生物信息学方法对获得的氨基酸序列进行分析,利用荧光定量PCR技术研究So IRL基因在甘蔗不同组织和不同胁迫条件下的表达特性。结果表明,克隆获得甘蔗So IRL,Gen Bank登录号为KF808324。该c DNA全长1 169 bp,含有1个927 bp的完整开放阅读框(ORF),编码309个氨基酸。系统进化树分析显示,甘蔗So IRL与玉米的IRL蛋白亲缘关系较近。q RT-PCR分析表明So IRL在甘蔗根、茎、叶中均有表达;在RSD病菌及低温(4℃)、聚乙二醇(PEG)、Na Cl和脱落酸(ABA)4种非生物胁迫下均被诱导表达,但表达模式不同。说明该基因可能参与甘蔗应答RSD过程,并可能在非生物胁迫中也发挥了作用。
关键词
甘蔗
类异黄酮还原酶
基因克隆
表达分析
Keywords
Sugarcane
SoIRL
Gene cloning
Expression analysis
分类号
S566.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
普通烟草IRL基因反义植物表达载体的构建
3
作者
陈伟
马建光
李红勋
潘文杰
机构
贵州省烟草科学研究院
贵州省威宁县烟草分公司
出处
《湖北农业科学》
北大核心
2014年第19期4730-4733,共4页
基金
贵州省科学技术基金项目[黔科合J字(2011)2340号]
国家烟草专卖局科技重大专项(Ts-02-20110015)
文摘
异黄酮还原酶相似蛋白(IRL)是与异黄酮还原酶具有高度序列同源一致性而功能不同的一类蛋白。通过PCR扩增普通烟草(Nicotiana tabacum)品种龙里红花烟IRL基因的一段特异保守片段Nt IRLA,并将其亚克隆到中间载体p CAMBIA2301G中,构建了IRL反义植物表达载体p CAMBIA2301G-IRLA。通过PCR鉴定、酶切鉴定证实载体构建成功,并转化到根癌农杆菌LBA4404菌株中形成工程菌株,为进一步利用转基因手段明确IRL基因在烟草次生代谢中的功能奠定了基础。
关键词
类异黄酮还原酶
基因
反义表达载体
普通烟草
Keywords
isoflavone reduetase-like gene
antisense vector
common tobacco
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苦荞类异黄酮还原酶基因(FtIRL)的克隆及序列分析
赵海霞
李成磊
白悦辰
陈惠
吴琦
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
甘蔗类异黄酮还原酶(IRL)基因的克隆与表达分析
谢晓娜
张小秋
邵敏
朱惠
杨丽涛
李杨瑞
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
普通烟草IRL基因反义植物表达载体的构建
陈伟
马建光
李红勋
潘文杰
《湖北农业科学》
北大核心
2014
0
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职称材料
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