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StSOBIR1类似基因沉默对马铃薯应答虫害的影响 被引量:1
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作者 何文静 张亚东 +6 位作者 张超 仲键 陈楚真 葛洋 何舒琰 祝增荣 周文武 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期615-632,共18页
类受体激酶SOBIR1(suppressor of BIR1-1)在植物对病害的免疫应答中发挥重要作用。本研究在马铃薯中克隆了一个SOBIR1类似(StSOBIR1-like)基因,检测其在生物胁迫和非生物胁迫诱导下的表达特性;构建StSOBIR1-like基因沉默载体,并利用农... 类受体激酶SOBIR1(suppressor of BIR1-1)在植物对病害的免疫应答中发挥重要作用。本研究在马铃薯中克隆了一个SOBIR1类似(StSOBIR1-like)基因,检测其在生物胁迫和非生物胁迫诱导下的表达特性;构建StSOBIR1-like基因沉默载体,并利用农杆菌介导法获得该基因的沉默株系;通过马铃薯块茎蛾生物测定实验和转录组测序,深入探究该基因沉默对马铃薯应答虫害的影响。结果表明:StSOBIR1-like基因在马铃薯叶片中高表达,马铃薯块茎蛾的模拟虫害、机械损伤以及外源施用茉莉酸甲酯、水杨酸、脱落酸等均能诱导该基因的表达,说明该基因可能参与马铃薯对生物胁迫和非生物胁迫诱导的生理反应。StSOBIR1-like沉默株系与野生型植株相比生长表型无明显差异,但马铃薯块茎蛾幼虫在前者上取食后的生物量比后者低,说明取食StSOBIR1-like沉默株系后马铃薯块茎蛾幼虫生长受到抑制。转录组测序结果表明,沉默StSOBIR1-like基因后,马铃薯植株的虫害应答在基因表达水平受到较大影响,特别是茉莉酸、水杨酸等防御激素合成通路相关基因的相对表达量总体呈上升趋势。综上所述,StSOBIR1-like基因可能负调控马铃薯对虫害的应答。本研究首次解析了StSOBIR1-like基因在马铃薯应答虫害中的功能,为进一步探究该基因调控作物抗虫的分子机制提供了依据。 展开更多
关键词 马铃薯 马铃薯块茎蛾 StSOBIR1类似基因 虫害应答 植物激素
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木薯FRK1类似基因的分离及表达分析
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作者 吴金山 陆小静 +4 位作者 王思琦 黄家权 张逸杰 贾迎雪 陈银华 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第8期1525-1533,共9页
FRK1是拟南芥先天免疫下游标记基因,该基因的表达意味着PTI途径的启动。本研究以拟南芥FRK1蛋白序列采用Blastp的方法,从木薯本地基因组数据库中筛选FRK1类似基因共8个,经生物信息学分析发现此8个类似基因均编码类受体蛋白激酶,其氨基... FRK1是拟南芥先天免疫下游标记基因,该基因的表达意味着PTI途径的启动。本研究以拟南芥FRK1蛋白序列采用Blastp的方法,从木薯本地基因组数据库中筛选FRK1类似基因共8个,经生物信息学分析发现此8个类似基因均编码类受体蛋白激酶,其氨基酸长度位于804~921 aa之间,蛋白质序列平均长度为863 aa;8个类似基因在木薯染色体上呈不均匀分布,主要分布在11号和4号染色体上。对其基因结构分析发现,8个类似基因可分为两大类,与进化树分析结果一致。根据保守基序的位置、氨基酸残基长度等信息分析发现,8个类似FRK蛋白与AtFRK1具有3个相同的保守基序,且长度位于50~250 aa之间。经与AtFRK1比对,综合蛋白基序、染色体定位以及进化关系等结果,候选MeFRK1基因为木薯基因组中先天免疫下游标记基因。以木薯SC8组培幼苗为材料,分别利用激素SA、JA和病原菌Xam进行处理后,利用荧光定量PCR测定MeFRK1基因在叶片中的表达量。结果表明:3个处理表达量基本均呈先上升后下降的变化趋势。激素SA、JA处理在15 min时均达到最大值,且SA的表达量略高于JA,而在病原菌Xam处理后第4天时达到最大值,此时表达量明显高于SA、JA处理,是SA的2.84倍,JA的3.06倍。由此可知,MeFRK1在响应SA和JA信号途径时,短时间内具有正调控作用,且反应较为迅速。在病原菌Xam胁迫中,能更好地诱导该基因的表达,从而提高木薯对病原菌Xam的抗性。其结果可为进一步建立木薯抗病分子体系奠定基础。 展开更多
关键词 木薯 FRK1类似基因 生物信息学 表达分析
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家蚕胰岛素受体类似基因挖掘及在限食模型中的表达特征 被引量:1
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作者 周炳卿 孔祥宾 +2 位作者 卓微伟 司马杨虎 徐世清 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期264-272,共9页
家蚕素是家蚕胰岛素相关肽,与其受体(IR)结合激活胰岛素信号转导(IIS)途径。利用生物信息学方法,挖掘出具有胰岛素受体类似结构域的家蚕基因Ir-lp,其ORF长2 658 bp,编码885个氨基酸残基,蛋白质分子质量100.3 kD,pI为6.93,与果蝇等昆虫... 家蚕素是家蚕胰岛素相关肽,与其受体(IR)结合激活胰岛素信号转导(IIS)途径。利用生物信息学方法,挖掘出具有胰岛素受体类似结构域的家蚕基因Ir-lp,其ORF长2 658 bp,编码885个氨基酸残基,蛋白质分子质量100.3 kD,pI为6.93,与果蝇等昆虫的同源蛋白保守区域高度一致,NJ法分子进化分析显示家蚕IR-LP与昆虫胰岛素受体相关蛋白同源,但是家蚕Ir-lp编码蛋白缺少胰岛素受体酪氨酸激酶催化结构域,基因表达特征也与已知的家蚕Ir有显著差异。建立家蚕限食模型,调查限食后家蚕8个组织中Ir-lp与Ir表达变化的差异,探讨Ir-lp基因与IIS途径的关系,结果显示长期限食使得Ir-lp与Ir在脂肪体、性腺和表皮中上调表达,在马氏管中下调表达,其中Ir-lp的表达量变化幅度较大。综合分析,IR-LP可能在家蚕胚胎期、蛹期、蛾期等特定发育时期通过与IR竞争结合家蚕素来有效调控能量利用效率。 展开更多
关键词 家蚕 胰岛素受体 类似基因 限食模型 胰岛素信号转导 基因表达
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大黄鱼凝血酶原类似基因的克隆及其表达分析
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作者 卫玮 吴海珍 +2 位作者 徐红艳 常抗美 张元兴 《华东理工大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期48-53,共6页
采用快速末端cDNA扩增法,首次从大黄鱼中克隆到全长为2023bp的凝血酶原类似基因cDNA,编码为617个氨基酸,其中包括80bp的5’末端非编码区及89bp包含poly(A)尾的3’末端非编码区。预测1~15位的氨基酸处存在1个信号肽。推导的氨基酸... 采用快速末端cDNA扩增法,首次从大黄鱼中克隆到全长为2023bp的凝血酶原类似基因cDNA,编码为617个氨基酸,其中包括80bp的5’末端非编码区及89bp包含poly(A)尾的3’末端非编码区。预测1~15位的氨基酸处存在1个信号肽。推导的氨基酸序列与哺乳动物及其他鱼类进行同源性比较,发现其与红鳍东方纯有73%同源性,而与哺乳动物的同源性为50%~65%。凝血酶原类似基因虽然在大黄鱼的各个组织中组成型表达,但是在减毒鳗弧菌免疫的大黄鱼的脾脏和肾脏中表达明显上调,这表明凝血酶可能参与大黄鱼对细菌侵染的免疫应答。 展开更多
关键词 大黄鱼 凝血酶原类似基因 鳗弧菌 快速末端cDNA扩增法
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甘薯NBS类抗病基因类似物的分离与序列分析 被引量:26
5
作者 陈观水 周以飞 +1 位作者 林生 潘大仁 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期359-365,共7页
利用已克隆植物抗病基因NBS(Nucleotidebindingsite)序列中的保守模体(motif)“P-loop”和“GLPL”合成简并引物,以甘薯(Ipomoeabatatas)栽培品种青农2号基因组DNA为模板进行PCR扩增,通过T/A克隆、测序和序列分析,共得到15条具有连续OR... 利用已克隆植物抗病基因NBS(Nucleotidebindingsite)序列中的保守模体(motif)“P-loop”和“GLPL”合成简并引物,以甘薯(Ipomoeabatatas)栽培品种青农2号基因组DNA为模板进行PCR扩增,通过T/A克隆、测序和序列分析,共得到15条具有连续ORF的抗病基因类似物(Resistancegeneanalogues,RGAs)序列,它们之间核苷酸序列间的相似性系数在41.2%-99.4%之间,而相应推测的氨基酸序列间的相似性系数在20.6%-100%之间,同时对分离的RGAs的核苷酸和氨基酸序列进行系统发育树分析,表明甘薯RGAs可分为TIR(DrosophilaTollorhumaninterleukinreceptor-like)和nonTIR两类。对甘薯RGAs和5个已克隆植物NBS的氨基酸序列进行结构分析表明,它们包括“P-loop”、“Kinase-2”、“Kinase-3a”“、GLPL”4个抗病基因所共有的保守模体。这些表明甘薯与其它物种的NBS类RGAs可能具有同样的起源和进化机制。 展开更多
关键词 甘薯 NBS 抗病基因类似 基因分离 序列分析
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花生栽野杂交后代抗病基因类似物的克隆与分析 被引量:5
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作者 李忠 江立庚 +6 位作者 唐荣华 韩柱强 钟瑞春 贺粱琼 蒋菁 熊发前 唐秀梅 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2014年第11期32-38,共7页
【目的】在花生野生种、栽培种及栽野杂交后代中,克隆抗病基因类似物(Resistance gene analog,RGA)相关基因片段,为抗病基因的进一步分离、鉴定及利用奠定基础。【方法】以14个花生栽野杂交种和2个抗病花生亲本为材料,应用PCR方法扩增... 【目的】在花生野生种、栽培种及栽野杂交后代中,克隆抗病基因类似物(Resistance gene analog,RGA)相关基因片段,为抗病基因的进一步分离、鉴定及利用奠定基础。【方法】以14个花生栽野杂交种和2个抗病花生亲本为材料,应用PCR方法扩增来自基因组DNA的抗病基因类似物序列,并分析其同源性。【结果】扩增出15条来自基因组DNA的抗病基因类似物序列,序列长度在500bp左右,由此推导出的15条氨基酸序列含有典型的NBS保守区的N端糖基化位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、N-豆蔻酰化位点。15条花生RGA氨基酸序列间的同源性在73.2%~100.0%,与已发表的花生抗病基因类似物的相似性较高,达72.1%~100.0%;与已知的其他作物的抗病基因编码的氨基酸序列有34.1%~54.6%的同源性。【结论】分离到的15个花生抗病基因同源片段为抗病基因的部分序列。 展开更多
关键词 花生 抗病基因类似 克隆
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小麦NBS类抗病基因类似序列的多样性和进化关系研究 被引量:7
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作者 张立荣 杨文香 刘大群 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2011年第4期23-26,共4页
利用已克隆植物抗病基因NBS(Nucleotide binding site)序列中的保守结构P-loop和GLPL合成简并引物,以小麦近等基因系TcLr24基因组DNA为模板进行PCR扩增。得到13条具有连续ORF的抗病基因类似物(Resistancegene analogues,RGAs)序列,它们... 利用已克隆植物抗病基因NBS(Nucleotide binding site)序列中的保守结构P-loop和GLPL合成简并引物,以小麦近等基因系TcLr24基因组DNA为模板进行PCR扩增。得到13条具有连续ORF的抗病基因类似物(Resistancegene analogues,RGAs)序列,它们之间相应推测的氨基酸序列间的相似性系数在36.9%~98.3%之间。对甘薯RGAs和4个已克隆植物NBS的氨基酸序列进行结构分析表明,它们包括P-loop、Kinase-2、Kinase-3a、GLPL抗病基因所共有的保守结构。同时对分离的RGAs的氨基酸序列进行系统发育树分析,这些RGAs与Xa1、RPS2聚在一起,并且符合nonTIR RGAs类型。这些结果表明小麦与其他物种的NBS类RGAs可能具有同样的起源和进化机制。 展开更多
关键词 小麦 NBS 抗病基因类似
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转录因子7类似物2基因的rs7903146位点多态性与新疆维吾尔族人群2型糖尿病的相关性研究 被引量:7
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作者 王志强 李豫凯 +6 位作者 朱筠 马琦 苏银霞 王黎 陈志远 刘莉娜 姚华 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期1443-1448,共6页
目的:探讨新疆地区维吾尔族人群转录因子7类似物2(transcription factor 7-like 2,TCF7L2)基因的rs7903146位点多态性与2型糖尿病的相关性。方法:采用病例-对照研究方法,以经确诊的935例2型糖尿病患者作为2型糖尿病组,选取971例健康体... 目的:探讨新疆地区维吾尔族人群转录因子7类似物2(transcription factor 7-like 2,TCF7L2)基因的rs7903146位点多态性与2型糖尿病的相关性。方法:采用病例-对照研究方法,以经确诊的935例2型糖尿病患者作为2型糖尿病组,选取971例健康体检者作为正常对照组。应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析技术对TCF7L2基因多态性进行检测。结果:rs7903146位点基因型CC、CT和TT以及等位基因C和T在2型糖尿病组与正常对照组中分布的差异具有统计学意义(P<0.05)。T等位基因携带者患2型糖尿病的风险是C等位基因携带者的1.190倍(OR=1.190,95%CI为1.034~1.371),CT基因型携带者患2型糖尿病的风险是CC基因型携带者的1.374倍(OR=1.374,95%CI为1.122~1.683),CT+TT基因型携带者患2型糖尿病的风险是CC基因型携带者的1.307倍(OR=1.307,95%CI为1.090~1.567)。在全体人群中,rs7903146位点的CT+TT基因型携带者的空腹血糖、肌酐和尿素氮水平显著高于CC基因型携带者,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论:TCF7L2基因的rs7903146位点可能与新疆维吾尔族人群2型糖尿病的发生相关,T等位基因和CT基因型可能是2型糖尿病发生的危险因素。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 转录因子7类似物2基因 2型糖尿病 维吾尔族
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核转录因子7类似物2基因rs7903146多态性与汉族女性乳腺癌的关系研究 被引量:3
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作者 刘桂红 刘静普 +5 位作者 张松 张怡梅 周卫华 张玉娜 刘月芹 朱铁年 《中国全科医学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第33期4051-4055,共5页
目的探讨核转录因子7类似物2(TCF7L2)基因rs7903146多态性与汉族女性乳腺癌的关系。方法选取2011年1月—2012年1月于河北医科大学第四医院住院治疗且符合纳入标准的女性乳腺癌患者564例作为乳腺癌组,另选取白求恩国际和平医院同期体检... 目的探讨核转录因子7类似物2(TCF7L2)基因rs7903146多态性与汉族女性乳腺癌的关系。方法选取2011年1月—2012年1月于河北医科大学第四医院住院治疗且符合纳入标准的女性乳腺癌患者564例作为乳腺癌组,另选取白求恩国际和平医院同期体检健康的女性394例作为正常对照组。取受试者外周血提取DNA,采用聚合酶链式反应-连接酶检测反应(PCR-LDR)法对TCF7L2基因rs7903146位点进行基因分型。比较两组患者年龄、体质指数(BMI)以及TCF7L2基因rs7903146位点CC、CT基因型频率,并分析TCF7L2基因rs7903146位点CC、CT基因型频率与乳腺癌患者临床指标(诊断时年龄、绝经状态)和病理指标[雌激素受体(ER)状态、孕激素受体(PR)状态、人类表皮生长因子受体2(HER-2)状态、P53状态、Ki-67状态、淋巴结转移情况、肿瘤直径、组织学分级、肿瘤分期、分子分型]的关系。结果两组患者年龄比较,差异无统计学意义(P>0.05);乳腺癌组BMI大于对照组(P<0.001)。对照组和乳腺癌组TCF7L2基因rs7903146位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),表明研究样本具有群体代表性。两组均未检测出TT基因型,两组TCF7L2基因rs7903146位点CC、CT基因型频率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。诊断时年龄≥50岁、绝经后的乳腺癌患者CT基因型频率高于诊断时年龄<50岁、绝经前的乳腺癌患者(P<0.05)。ER状态、PR状态、HER-2状态、P53状态、Ki-67状态、淋巴结转移情况、肿瘤直径、组织学分级、肿瘤分期及分子分型与乳腺癌患者CT基因型频率无关,差异无统计学意义(P>0.05)。结论 TCF7L2基因rs7903146多态性与乳腺癌的发生风险无关,其不是中国汉族女性乳腺癌的患病风险因子。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 多态现象 遗传 核转录因子7类似物2基因 汉族
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多花黑麦草抗病基因类似物的克隆及CAPS标记 被引量:4
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作者 丁成龙 沈益新 +1 位作者 顾洪如 三浦優一 《草业学报》 CSCD 2006年第3期107-114,共8页
多花黑麦草具有适应性强、生物产量高和品质好等优点,为我国南方及其他温带地区重要的牧草。本研究利用目前已克隆出的抗病基因(R基因)所编码的蛋白质结构上所具有的共同氨基酸基序NBS-LRR设计寡核苷酸简并引物,对多花黑麦草基因组进行... 多花黑麦草具有适应性强、生物产量高和品质好等优点,为我国南方及其他温带地区重要的牧草。本研究利用目前已克隆出的抗病基因(R基因)所编码的蛋白质结构上所具有的共同氨基酸基序NBS-LRR设计寡核苷酸简并引物,对多花黑麦草基因组进行抗病基因类似物(RGA)克隆。从克隆中筛选出具代表性的RGA克隆115个,设计RGA-STS引物113对。利用细胞质雄性不育(CMS)F1群体对RGA-STS引物进行筛选,并采用限制性内切酶酶切扩增多态序列(CAPS)法进行抗病类似物的分子标记,共检测到22对RGA-STS引物的扩增产物具多态性,22个RGA-CAPS标记均被标记于多花黑麦草遗传连锁图中。结果还表明RGA在多花黑麦草遗传连锁图中分布范围较广,并具有簇状分布特性。 展开更多
关键词 多花黑麦草 抗病基因类似 酶切扩增多态序列(CAPS) 遗传连锁图
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小麦抗病基因类似序列BRG1的分离与功能分析 被引量:2
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作者 李宁 黄茜 +4 位作者 刘燕 赵丹 刘艳 黄占景 张增艳 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期998-1004,共7页
利用cDNA-AFLP技术筛选到1个在抗黄矮病的小麦-中间偃麦草易位系YW642中特异表达的小麦抗病基因类似序列(BYDV resistance-related gene1,BRG1)的基因片段。利用cDNA末端快速扩增技术(RACE)和RT-PCR技术,从YW642中分离出BRG1基因全长cDN... 利用cDNA-AFLP技术筛选到1个在抗黄矮病的小麦-中间偃麦草易位系YW642中特异表达的小麦抗病基因类似序列(BYDV resistance-related gene1,BRG1)的基因片段。利用cDNA末端快速扩增技术(RACE)和RT-PCR技术,从YW642中分离出BRG1基因全长cDNA序列,获得了一个通读的抗病同源基因cDNA序列,编码由645个氨基酸组成的蛋白质,包含1个NB-ARC保守结构域和3个LRR结构域,该蛋白属于nucleotide-site binding,leucine-rich repeats(NBS-LRR)家族。荧光定量或半定量RT-PCR表达分析表明,BRG1在抗病小麦易位系YW642叶片中优势表达,受BYDV的诱导,BYDV接种后48h表达量最高,BRG1在感病小麦亲本中8601中表达量始终较低,随BYDV接种时间延长呈轻微的下调趋势;而且外源激素水杨酸(SA)与茉莉酸(JA)处理可上调该基因在YW642中的表达。利用病毒介导的基因沉默技术分析了BRG1基因的功能,结果表明该基因沉默的抗病小麦易位系YW642中BYDV相对含量增加,但未造成抗病性表型显著改变,说明该基因参与抗黄矮病反应,但不是小麦抗黄矮病重要基因。 展开更多
关键词 小麦-中间偃麦草易位系 小麦黄矮病抗性 CDNA-AFLP 抗病基因类似序列 病毒介导的基因沉默
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广东普通野生稻中抗病类似物基因的克隆及序列分析 被引量:1
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作者 冯荣坤 邢姗姗 胡汉桥 《湛江海洋大学学报》 CAS 2006年第3期94-97,共4页
关键词 抗病基因类似 普通野生水稻 聚类分析 广东
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hGLP-1类似物基因转染对糖尿病大鼠血糖、血清胰岛素水平及胰岛细胞的影响 被引量:2
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作者 李晓丽 刘振 +1 位作者 马卫列 张志珍 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期260-263,共4页
目的研究尾静脉注射人胰高血糖素样肽-1(hGLP-1)类似物基因(2×Val2-hGLP-1)重组表达质粒对糖尿病模型大鼠血糖、血清胰岛素水平及胰岛细胞的影响。方法建立链脲佐菌素(STZ)诱导SD糖尿病大鼠模型,随机分为含有hGLP-1类似物基因的重... 目的研究尾静脉注射人胰高血糖素样肽-1(hGLP-1)类似物基因(2×Val2-hGLP-1)重组表达质粒对糖尿病模型大鼠血糖、血清胰岛素水平及胰岛细胞的影响。方法建立链脲佐菌素(STZ)诱导SD糖尿病大鼠模型,随机分为含有hGLP-1类似物基因的重组质粒(pIRES2-EGFP/Val2-hGLP-1)转染组、空质粒(pIRES2-EGFP)转染组、糖尿病模型对照组,每组8只。另取8只未经处理的SD大鼠作为正常对照组。重组质粒转染组和空质粒转染组分别通过尾静脉注射含相应质粒(110μg/只)的溶液,糖尿病模型对照组和正常对照组给予等量的生理盐水。实验动物共干预30d,实验结束后,观察各组大鼠血糖及血清胰岛素水平的变化,采用糖耐量及胰岛素耐量实验检测大鼠胰岛素敏感性然后处死动物,HE染色观察胰岛细胞病变情况,免疫组化法分析胰岛素分泌情况。结果与正常对照组、糖尿病模型对照组和空质粒转染组比较,重组质粒转染组血糖水平明显降低(P<0.01),血清胰岛素水平显著升高(P<0.01)。基因治疗改善了糖尿病大鼠的糖耐量,降低了胰岛素抵抗,提高了机体对胰岛素的敏感性(P<0.01)。空质粒转染组与糖尿病模型对照组比较,以上指标的差异均无统计学意义(P>0.05)。同时,重组质粒转染组的胰岛素分泌水平提高,与糖尿病模型对照组比较,胰岛细胞病变程度明显改善。结论hGLP-1类似物基因转染可促进胰岛细胞增殖,提高胰岛素敏感性,从而显著降低糖尿病大鼠的血糖水平,并改善胰岛组织病变程度。 展开更多
关键词 糖尿病 基因 hGLP-1类似 转染 葡萄糖耐量试验 胰岛
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柠檬苦素类似物糖基转移酶基因(citLGT)在转基因锦橙中的异位表达分析 被引量:1
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作者 马园园 邹修平 +3 位作者 彭爱红 许兰珍 何永睿 陈善春 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期181-186,I0001,共7页
【目的】分析柠檬苦素类似物糖基转移酶基因(citLGT)在柑橘中的异位表达。【方法】构建了CaMV 35S启动子控制下citLGT的超量和RNAi抑制表达载体。采用农杆菌介导的遗传转化方法将上述植物表达载体分别转化‘锦橙’[Citrus sinensis(Linn... 【目的】分析柠檬苦素类似物糖基转移酶基因(citLGT)在柑橘中的异位表达。【方法】构建了CaMV 35S启动子控制下citLGT的超量和RNAi抑制表达载体。采用农杆菌介导的遗传转化方法将上述植物表达载体分别转化‘锦橙’[Citrus sinensis(Linn.)Osbeck‘Jincheng’]上胚轴。经GUS组织化学染色及PCR检测共获得20株转基因阳性植株。利用qRT-PCR分析转基因植株中citLGT基因的表达。【结果】超量表达citLGT的转基因植株中citLGT的表达量显著高于对照,而RNAi转基因植株中citLGT的表达量则被显著抑制。【结论】本实验为阐明了citLGT基因影响后苦味性状的分子机制和基因工程改良柑橘延迟苦味性状提供了有价值的材料。 展开更多
关键词 柠檬苦素类似物葡萄糖基转移酶基因 RNAI 遗传转化 表达分析 基因'锦橙’
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棉花NBS类抗病基因类似物的生物信息学分析 被引量:4
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作者 孙涛 卢美光 +1 位作者 简桂良 林凤 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2005年第3期182-183,共2页
关键词 生物信息学分析 抗病基因类似 S类 NB 棉花 保守结构域 进化过程 相互作用 协同进化 抗病机制 分子水平 防御反应 候选基因 同源序列 植物 病原物 抗病性 氨基酸 分析表 可能性 克隆 介导
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野生稻NBS类抗病基因同源序列的分离与序列分析 被引量:8
16
作者 张向明 韦靖鸾 +3 位作者 张丹 王春台 刘学群 刘新琼 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期741-748,共8页
为了挖掘野生稻中的抗病资源,根据已克隆的植物抗病基因核苷酸结合位点序列中的保守结构域设计3对简并引物,从疣粒、药用、高秆、宽叶和斑点野生稻基因组DNA中分离出13条NBS类抗病基因类似物,其中11条具有连续的ORF,具有NBS类R基因的保... 为了挖掘野生稻中的抗病资源,根据已克隆的植物抗病基因核苷酸结合位点序列中的保守结构域设计3对简并引物,从疣粒、药用、高秆、宽叶和斑点野生稻基因组DNA中分离出13条NBS类抗病基因类似物,其中11条具有连续的ORF,具有NBS类R基因的保守基元P-loop、kinas-2、kinas-3a和GLPL。在NCBI上进行同源性搜索发现,其中12条RGAs的核苷酸序列与水稻已知的NBS类R基因具有66%~94%的同源性,与其他植物已知R基因具有67%~84%的同源性;其对应的氨基酸序列与水稻已知的NBS类R基因具有43%~93%的同源性,与其他植物已知R基因具有37%~79%的同源性。另外1条的核苷酸序列与水稻假定的NBS类R基因具有76%的同源性,其氨基酸序列与水稻假定的NBS类R基因具有74%的同源性。根据序列分析结果设计6对不同基因特异性引物,并利用RT-PCR技术进行表达分析,结果表明,RN1BD5、RN1BD10、RN1GG2和RN1YY6均能表达,说明这些片段可能是功能性抗病基因的部分序列;而RN1KY9和RN1GG5没有表达,可能是假基因。 展开更多
关键词 野生稻 抗病基因类似 基因分离 序列分析
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黄瓜RGA基因的半定量RT-PCR表达分析 被引量:6
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作者 丁国华 许春梅 +2 位作者 于虹 周秀艳 秦智伟 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期659-664,共6页
以黄瓜(Cucumis sativusL.)抗霜霉病品种东农129为材料,利用RT-PCR半定量法研究了接种霜霉病菌(Pseudoperonospora cubensisRostow)、喷施水杨酸(SA)和氯化钙(CaCl2)等不同处理对黄瓜抗病基因类似序列(RGA)表达的影响.结果表明:CsRGA1和... 以黄瓜(Cucumis sativusL.)抗霜霉病品种东农129为材料,利用RT-PCR半定量法研究了接种霜霉病菌(Pseudoperonospora cubensisRostow)、喷施水杨酸(SA)和氯化钙(CaCl2)等不同处理对黄瓜抗病基因类似序列(RGA)表达的影响.结果表明:CsRGA1和CsRGA5基因的表达受霜霉病菌的侵染而启动或加强,外施SA和CaCl2都能够增强其表达;CsRGA4和CsRGA8属于组成型表达基因,其表达可能与霜霉病菌的侵染无关;CsRGA2的表达与外施SA和CaCl2缺乏密切关联. 展开更多
关键词 黄瓜 抗病基因类似序列 半定量RT-PCR 表达分析
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小麦抗叶锈病基因Lr35的RGA分析 被引量:7
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作者 高倩 王海燕 +2 位作者 刘大群 李星 杨文香 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2008年第6期50-53,共4页
根据已知植物抗病基因的NBS,LRR等保守结构域设计引物,对小麦全套抗叶锈病近等基因系材料进行RGA分析。引物对Pto-kin1IN/XLRR-INV1从近等基因系TcLr35中扩增获得一条747 bp的特异性片段。序列分析表明,该片段与小麦基因片段Triticum ur... 根据已知植物抗病基因的NBS,LRR等保守结构域设计引物,对小麦全套抗叶锈病近等基因系材料进行RGA分析。引物对Pto-kin1IN/XLRR-INV1从近等基因系TcLr35中扩增获得一条747 bp的特异性片段。序列分析表明,该片段与小麦基因片段Triticum urartu clone BAC 210J24,Triticum monococcum DV92的BAC克隆231A16等具有较高同源性,为Lr35的克隆奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦叶锈病 抗病基因 LR35 抗病基因类似序列
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树木抗病基因研究进展 被引量:4
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作者 张谦 林善枝 +3 位作者 林元震 张志毅 王泽亮 杨俊杰 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期1921-1930,共10页
在长期进化过程中,植物形成了一系列防御机制,抵抗各类病原物入侵,抗病R基因在其中发挥着关键作用.R基因的研究,在农作物中取得很大进展,已成为植物病理学的研究热点.相比之下,树木抗病基因研究较为落后,虽从苹果、杨树和柚子中已分离... 在长期进化过程中,植物形成了一系列防御机制,抵抗各类病原物入侵,抗病R基因在其中发挥着关键作用.R基因的研究,在农作物中取得很大进展,已成为植物病理学的研究热点.相比之下,树木抗病基因研究较为落后,虽从苹果、杨树和柚子中已分离了几个与已知R基因具有类似结构与功能的基因,但还没有真正的树木抗病R基因被克隆出来;目前,大部分研究主要集中在利用分子标记构建连锁图谱,寻找抗病数量性状位点(Q uan titativetra it loc i,QTL)和与R基因紧密连锁或共分离的质量性状标记;其中一些标记已经应用在分子辅助选育中,并显示了诱人的应用前景.另外,利用已知抗病R基因的保守区域,从多种植物中已扩增出许多抗病基因类似序列,它们大多被转化为与R基因紧密连锁的标记或被当作抗病候选基因. 展开更多
关键词 QTL 遗传图谱 分子标记 R基因 抗病基因类似序列
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棉花NBS抗病基因的发掘 被引量:1
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作者 丁锦平 张庆琛 +1 位作者 魏理 李成伟 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期50-51,57,共3页
根据已克隆的R基因的保守序列设计引物,在棉花不同抗性品种中克隆出500 bp左右大小片段,克隆测序并在NCBI上进行Blast分析,发现这些序列除一个序列外均与已经克隆的抗病基因类似物(RGAs)同源,且同源性高达98%以上。将这些从棉花中克隆的... 根据已克隆的R基因的保守序列设计引物,在棉花不同抗性品种中克隆出500 bp左右大小片段,克隆测序并在NCBI上进行Blast分析,发现这些序列除一个序列外均与已经克隆的抗病基因类似物(RGAs)同源,且同源性高达98%以上。将这些从棉花中克隆的RGAs和植物中已克隆的几个典型的R基因序列建立进化树,棉花中的RGAs序列分别聚在3个不同的亚家族,可以通过后续的功能验证来确定这些序列片段的功能。 展开更多
关键词 棉花 抗病基因 抗病基因类似
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