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简并寡核苷酸引物PCR技术的建立及其检测灵敏度分析: 1; 作者邓建强刘宝琴 +3 位作者蔡继峰李文慧龙仁侯一平《法医学杂志》 CAS CSCD 2012年第1期41-43,共3页; 目的建立基于简并寡核苷酸引物PCR(degenerate oligonucleotide primed-PCR,DOP-PCR)的全基因组检测体系,并对其可靠性、灵敏度进行研究。方法通过荧光标记STR复合扩增毛细管电泳检测系统,对DOP-PCR扩增产物进行检测,获得DOP-PCR检测体... 展开更多; 关键词法医遗传学基因扩增简并寡核苷酸引物PCR; 在线阅读下载PDF 职称材料

简并寡核苷酸引物PCR扩增单细胞基因组的影响因素研究被引量：1: 2; 作者王晶乔龙 +3 位作者孙海翔胡娅莉李洁李朝军《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第16期6675-6677,共3页; [目的]研究影响简并寡核苷酸引物聚合酶链反应(degenerate oligonucleotide primed PCR,DOP-PCR)扩增单细胞全基因组的因素。[方法]以单个人外周血淋巴细胞为材料,进行DOP-PCR,研究新鲜细胞与冷藏细胞及采用新鲜和冻存的细胞裂解物为模... 展开更多; 关键词单细胞简并寡核苷酸引物PCR 基因扩增全基因组; 在线阅读下载PDF 职称材料

三种荧光标记法对寡核苷酸芯片杂交信号的影响被引量：2: 3; 作者周文明赵建龙 +1 位作者曹慧敏张学军《安徽医科大学学报》 CAS 2003年第6期432-434,共3页; 目的　观察标记引物法、随机渗入标记法、末端转移标记法三种荧光标记法对寡核苷酸芯片杂交信号的影响。方法　将淋球菌 gyrA基因 91位密码子突变型探针倍比稀释成终浓度为 10 0 0 μmol/L～ 0 2 5 μmol/L的梯度浓度点样并制作寡核苷... 展开更多; 关键词荧光标记法寡核苷酸芯片杂交信号标记引物法随机渗入标记法末端转移标记法; 在线阅读下载PDF 职称材料

应用反向斑点杂交技术进行脐血HLA-DRB基因分型方法的建立被引量：4: 4; 作者黄以宁廖灿 +3 位作者汤雪薇李焱谢杏梅曾瑞萍《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2002年第2期148-152,共5页; HLA分子的多态性对于移植有十分重要的意义。常用的HLA基因分型方法中SSOP基因分型方法有较高分辨率 ,但操作过程复杂 ,仅适于大样本的HLA分型。PCR SSP基因分型方法分辨率较低 ,但操作过程简单 ,适于临床要求。有必要建立一种简便、快... 展开更多; 关键词反向斑点杂交技术 HLA-DRB基因分型脐血特异性序列引物PCR 序列特异性寡核苷酸探针白细胞抗原; 在线阅读下载PDF 职称材料

硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析被引量：2: 5; 作者梁楠松曾凡锁 +2 位作者李博郭梁詹亚光《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期69-74,共6页; 利用Tvl—copia类逆转座子逆转录酶（RT）的保守区域设计引物，优化了扩增条件后利用RT—PCR从白桦愈伤组织中得到了1条逆转录酶序列。利用硝普钠（SNP）和茉莉酸甲酯（MeJA）诱导后分别扩增克隆了11条和9条逆转录酶序列。这2l条逆转录... 展开更多; 关键词白桦 Tyl-copia类逆转座子逆转录酶转录活性系统进化异质性简并杂交寡核苷酸引物; 在线阅读下载PDF 职称材料

油菜油体钙蛋白基因BnClo1的克隆和表达被引量：12: 6; 作者丁勇陈庆波 +2 位作者徐春雷常玮甘莉《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1921-1928,共8页; 应用同源序列克隆法设计同源简并引物,结合RT-PCR和RACE-PCR技术,从甘蓝型油菜中分离克隆了编码28.1kD油体钙蛋白(caleosin)的基因BnClo1。其全长1058bp的BnClo1 mRNA(GenBank中序列号为AY966447)包含完整的开放阅读框和3′末端Poly(A)... 展开更多; 关键词油体钙蛋白 RACE 基因克隆同源简并引物序列分析 NORTHERN杂交; 在线阅读下载PDF 职称材料

STR滑脱模型的构建及其影响因素被引量：3: 7; 作者邓建强李英碧 +1 位作者吴谨侯一平《法医学杂志》 CAS CSCD 2006年第1期39-42,共4页; 目的探索建立体外STR滑脱模型,研究STR滑脱产生的影响因素,探讨STR的发生机制。方法首先通过全基因组扩增技术—简并寡核苷酸引物PCR(Degenerateoligonucleotide-primedPCR,DOP)对模板DNA样本进行扩增放大,然后以其产物作为后续STR分析... 展开更多; 关键词短串联重复滑脱模型简并寡核苷酸引物; 在线阅读下载PDF 职称材料

巴斯德杆菌属CODEHOP PCR检测方法的建立与初步应用: 8; 作者邢进冯育芳 +3 位作者岳秉飞贺争鸣孙晓梅代解杰《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2017年第1期85-90,共6页; 目的建立巴斯德杆菌的CODEHOP PCR快速检测方法,为实验动物的呼吸道细菌的控制提供参考。方法应用CODEHOP在线简并引物设计工具,比对Genbank中13株巴斯德杆菌的RNA聚合酶β亚基(rpo B)氨基酸序列设计简并引物。对建立CODEHOP PCR方法用2... 展开更多; 关键词巴斯德杆菌共有序列简并杂合寡核苷酸引物 PCR检测实验动物; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名简并寡核苷酸引物PCR技术的建立及其检测灵敏度分析: 1; 作者邓建强刘宝琴蔡继峰李文慧龙仁侯一平; 机构海南医学院法医鉴定中心西安现代妇产医院中南大学湘雅医学院法医学系四川大学华西基础医学与法医学院; 出处《法医学杂志》 CAS CSCD 2012年第1期41-43,共3页; 基金国家自然科学基金资助项目(30271446) 高校博士点专项科研基金资助项目(20020610044); 文摘目的建立基于简并寡核苷酸引物PCR(degenerate oligonucleotide primed-PCR,DOP-PCR)的全基因组检测体系,并对其可靠性、灵敏度进行研究。方法通过荧光标记STR复合扩增毛细管电泳检测系统,对DOP-PCR扩增产物进行检测,获得DOP-PCR检测体系的灵敏度、可靠性。结果成功建立了可靠的DOP-PCR检测体系,经过DOP-PCR预处理再进行STR分型检验,其检测灵敏度可达到5个细胞量(相当于30 pg)。结论本研究建立的DOP-PCR技术可靠且可提高法医学微量检材的检测灵敏度。; 关键词法医遗传学基因扩增简并寡核苷酸引物PCR; Keywords forensic genetics gene amplification degenerate oligonucleotide primed-PCR; 分类号 DF795.2 [医药卫生—法医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名简并寡核苷酸引物PCR扩增单细胞基因组的影响因素研究被引量：1: 2; 作者王晶乔龙孙海翔胡娅莉李洁李朝军; 机构南京师范大学生命科学院南京市鼓楼医院生殖中心南京市鼓楼医院妇产科南京市鼓楼医院遗传室; 出处《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第16期6675-6677,共3页; 基金南京市科技局社会发展重大项目(200504025); 文摘 [目的]研究影响简并寡核苷酸引物聚合酶链反应(degenerate oligonucleotide primed PCR,DOP-PCR)扩增单细胞全基因组的因素。[方法]以单个人外周血淋巴细胞为材料,进行DOP-PCR,研究新鲜细胞与冷藏细胞及采用新鲜和冻存的细胞裂解物为模板对扩增产物的均匀性及特异性的影响。[结果]以新鲜的淋巴细胞为模板与以冷藏的淋巴细胞为模板相比,扩增产物的均匀性相当,特异性上新鲜细胞较好。细胞裂解后立即进行扩增的效果在产物的均匀性及特异性方面均明显优于冻存的细胞裂解物。[结论]对单细胞应用DOP-PCR方法进行全基因组扩增时,应尽量选取新鲜细胞进行裂解,裂解后避免冻存以保证扩增的均匀性及特异性。; 关键词单细胞简并寡核苷酸引物PCR 基因扩增全基因组; Keywords Single cell Degenerate oligonucleotide primered PCR Gene amplification Whole genome; 分类号 Q789 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名三种荧光标记法对寡核苷酸芯片杂交信号的影响被引量：2: 3; 作者周文明赵建龙曹慧敏张学军; 机构安徽医科大学皮肤性病研究所中国科学院上海微系统与信息技术研究所; 出处《安徽医科大学学报》 CAS 2003年第6期432-434,共3页; 基金中国科学院生物科学与生物技术研究特别支持费课题 (编号 :STZ 0 0 0 3 ); 文摘目的　观察标记引物法、随机渗入标记法、末端转移标记法三种荧光标记法对寡核苷酸芯片杂交信号的影响。方法　将淋球菌 gyrA基因 91位密码子突变型探针倍比稀释成终浓度为 10 0 0 μmol/L～ 0 2 5 μmol/L的梯度浓度点样并制作寡核苷酸芯片 ,PCR扩增荧光标记包含gyrA基因突变的目的DNA片段 ,与芯片杂交 ,分别记录三种标记方法的杂交信号强度。结果　标记引物法的荧光信号最强 ,随机渗入标记法的荧光信号强度次之 ,其Cy5 dUTP最佳浓度为0 1mmol/L(dTTP :Cy5 dUTP =10∶1) ,末端转移标记法反应时间在 6 0min和 12 0min时荧光信号值相近。点样的探针浓度达到 31μmol/L以上 ,荧光信号为平台期。结论　明确了三种荧光标记法对寡核苷酸芯片杂交信号的影响。; 关键词荧光标记法寡核苷酸芯片杂交信号标记引物法随机渗入标记法末端转移标记法; Keywords oligonucleotide hybridize biological markers; 分类号 R394-33 [医药卫生—医学遗传学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名应用反向斑点杂交技术进行脐血HLA-DRB基因分型方法的建立被引量：4: 4; 作者黄以宁廖灿汤雪薇李焱谢杏梅曾瑞萍; 机构广州市妇婴医院中山医科大学医学遗传教研室; 出处《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2002年第2期148-152,共5页; 文摘 HLA分子的多态性对于移植有十分重要的意义。常用的HLA基因分型方法中SSOP基因分型方法有较高分辨率 ,但操作过程复杂 ,仅适于大样本的HLA分型。PCR SSP基因分型方法分辨率较低 ,但操作过程简单 ,适于临床要求。有必要建立一种简便、快速、价廉、高分辨率的基因分型方法。本研究取 6 3份已知HLA DRB型的脐血标本 ,经盐酸胍方法提取DNA用于反向斑点杂交 (RDB)基因分型 ,同时采用SSOP和PCR SSP方法进行比较。结果表明 ,所有样本用RDB方法基因分型均获得成功 ,可准确地分辨 6 0个HLA DRB等位基因 ,且结果与用SSOP和PCR SSP方法的结果完全一致。结论提示 ,RDB方法可准确地分辨HLA DRB等位基因 ,分辨率高 ,操作简单。; 关键词反向斑点杂交技术 HLA-DRB基因分型脐血特异性序列引物PCR 序列特异性寡核苷酸探针白细胞抗原; Keywords reverse dot blot hybridization technique HLA DRB genotyping cord blood PCR sequence specitic primer sequence specific oligonucleotides probe; 分类号 R446.62 [医药卫生—诊断学] Q503 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析被引量：2: 5; 作者梁楠松曾凡锁李博郭梁詹亚光; 机构东北林业大学; 出处《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期69-74,共6页; 基金国家自然科学基金(31070531) 黑龙江省高校青年学术骨干计划项目(1155G08); 文摘利用Tvl—copia类逆转座子逆转录酶（RT）的保守区域设计引物，优化了扩增条件后利用RT—PCR从白桦愈伤组织中得到了1条逆转录酶序列。利用硝普钠（SNP）和茉莉酸甲酯（MeJA）诱导后分别扩增克隆了11条和9条逆转录酶序列。这2l条逆转录酶序列（命名Bprtl-21）变化范围为205—290bp，一致性为71．93％，异质性为1．1％。50．9％，翻译成氨基酸的异质性为0～57．1％。经SNP和MeJA处理的样品中，获得的逆转录酶序列基本是分别聚类．初步证明不同的Tvl-copia类逆转座子能够分别响应不同的信号而被转录激活。分析所获得的21逆转录酶序列和苹果中19务逆转录转座子序列（DQ410748-DQ410766）进化关系发现．逆转录酶基本各自聚类。但是Bprt9、Bprtll和OQ4m750进化关系比较接近，Bprt15、Bprt19、DQ410751和DQ410753聚为一类，证明逆转座子存在水平传递。; 关键词白桦 Tyl-copia类逆转座子逆转录酶转录活性系统进化异质性简并杂交寡核苷酸引物; Keywords Betula platyphyUa Suk. Tyl-copia-like retrotransposons Transcriptional activity Evolution Heteroge-neity Consensus Degenerate Hybrid Oligonucleotide Primers （CODEHOP）; 分类号 Q789 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名油菜油体钙蛋白基因BnClo1的克隆和表达被引量：12: 6; 作者丁勇陈庆波徐春雷常玮甘莉; 机构华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室西南林学院资源学院中国科学院昆明植物研究所; 出处《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1921-1928,共8页; 基金国家自然科学基金项目(30170600) 湖北省自然科学基金项目(2001ABD113); 文摘应用同源序列克隆法设计同源简并引物,结合RT-PCR和RACE-PCR技术,从甘蓝型油菜中分离克隆了编码28.1kD油体钙蛋白(caleosin)的基因BnClo1。其全长1058bp的BnClo1 mRNA(GenBank中序列号为AY966447)包含完整的开放阅读框和3′末端Poly(A)尾巴结构,染色体DNA结构上含6个外显子和5个内含子。Northern杂交结果表明,油菜中BnClo1在种子形成中期开始丰富表达,在种子形成后期,即种子开始脱水成熟时期,高量稳定地表达。半定量PCR结果显示,BnClo1在油菜种子吸水膨胀后前2d的茎中明显表达。证明在油菜种子发育期间,BnClo1对mRNA的转录表达是由胚胎发育来调控的,具有显著的时空特性,并与油体的形成和积累密切有关。推测的caleosin蛋白为245个氨基酸残基(GenBank中序列号为AAY40837)组成的两性蛋白质,主要含3个结构域即由N末端1～16位氨基酸残基组成的α-螺旋和17～61位氨基酸残基组成的强亲水性的随机卷曲构成的N-末端亲水性结构域;由80～120位氨基酸残基组成的中间疏水性结构域和C-末端亲水性结构域。N-末端亲水性结构域包含一个潜在的结合Ca2+的EF-手结构。中间疏水性结构域包含一个潜在的脯氨酸-结(proline-knot)模体,在92～114位氨基酸残基组成的α-螺旋跨膜区域,推测在caleosin蛋白与单层磷脂层和油体锚定结合上及增加种子油体的稳定性上起着重要的作用。; 关键词油体钙蛋白 RACE 基因克隆同源简并引物序列分析 NORTHERN杂交; Keywords Caleosin RACE Gene cloning Homology-degenerate primer Sequence analysis Northern blotting; 分类号 S565.4 [农业科学—作物学] Q785 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名STR滑脱模型的构建及其影响因素被引量：3: 7; 作者邓建强李英碧吴谨侯一平; 机构司法部司法鉴定科学技术研究所四川大学华西基础医学与法医学院; 出处《法医学杂志》 CAS CSCD 2006年第1期39-42,共4页; 基金国家自然科学基金资助项目(30271446) 高校博士点专项基金资助项目(20020610044); 文摘目的探索建立体外STR滑脱模型,研究STR滑脱产生的影响因素,探讨STR的发生机制。方法首先通过全基因组扩增技术—简并寡核苷酸引物PCR(Degenerateoligonucleotide-primedPCR,DOP)对模板DNA样本进行扩增放大,然后以其产物作为后续STR分析的模板,对以上实验过程中的一系列实验条件进行控制,观察滑脱现象的产生情况。结果初步建立了STR的滑脱模型,观察到了STR滑脱现象的发生。结论STR的发生是一系列综合因素作用的结果,DNA模板用量、MgCl2的浓度、DNA聚合酶的性质、样本以及STR的基序组成等因素均可能参与了这一过程。; 关键词短串联重复滑脱模型简并寡核苷酸引物; Keywords short tandem repeat（STR） slippage model degenerate oligonucleotide- primed PCR; 分类号 R394 [医药卫生—医学遗传学] R684.7 [医药卫生—骨科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名巴斯德杆菌属CODEHOP PCR检测方法的建立与初步应用: 8; 作者邢进冯育芳岳秉飞贺争鸣孙晓梅代解杰; 机构中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所树鼩种质资源中心; 出处《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2017年第1期85-90,共6页; 基金国家科技支撑计划项目(2014BAI01B01); 文摘目的建立巴斯德杆菌的CODEHOP PCR快速检测方法,为实验动物的呼吸道细菌的控制提供参考。方法应用CODEHOP在线简并引物设计工具,比对Genbank中13株巴斯德杆菌的RNA聚合酶β亚基(rpo B)氨基酸序列设计简并引物。对建立CODEHOP PCR方法用21株参考菌株进行特异性和敏感性评价,并应用于实验动物中的巴斯德杆菌检测。结果简并引物Past F6/PastR5扩增标准菌株的目的片段为200 bp左右。能够区分受试的巴斯德杆菌和主要的实验动物呼吸道病原菌。敏感性为0.2 pg/μL^2 pg/μL。在受试的609只实验动物中呼吸道样品中检测出巴斯德杆菌阳性率为19.1%。样品阳性片段经测序验证,准确率为100%。结论所建立的方法具有良好的特异性和敏感性,可用于动物样品中巴斯德杆菌的检测。; 关键词巴斯德杆菌共有序列简并杂合寡核苷酸引物 PCR检测实验动物; Keywords Pasteurella spp. CODEHOP PCR detection Laboratory animals; 分类号 R-332 [医药卫生]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	简并寡核苷酸引物PCR技术的建立及其检测灵敏度分析	邓建强刘宝琴蔡继峰李文慧龙仁侯一平	《法医学杂志》 CAS CSCD	2012	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	简并寡核苷酸引物PCR扩增单细胞基因组的影响因素研究	王晶乔龙孙海翔胡娅莉李洁李朝军	《安徽农业科学》 CAS 北大核心	2008	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	三种荧光标记法对寡核苷酸芯片杂交信号的影响	周文明赵建龙曹慧敏张学军	《安徽医科大学学报》 CAS	2003	2	在线阅读下载PDF 职称材料
4	应用反向斑点杂交技术进行脐血HLA-DRB基因分型方法的建立	黄以宁廖灿汤雪薇李焱谢杏梅曾瑞萍	《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD	2002	4	在线阅读下载PDF 职称材料
5	硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析	梁楠松曾凡锁李博郭梁詹亚光	《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2013	2	在线阅读下载PDF 职称材料
6	油菜油体钙蛋白基因BnClo1的克隆和表达	丁勇陈庆波徐春雷常玮甘莉	《作物学报》 CAS CSCD 北大核心	2008	12	在线阅读下载PDF 职称材料
7	STR滑脱模型的构建及其影响因素	邓建强李英碧吴谨侯一平	《法医学杂志》 CAS CSCD	2006	3	在线阅读下载PDF 职称材料
8	巴斯德杆菌属CODEHOP PCR检测方法的建立与初步应用	邢进冯育芳岳秉飞贺争鸣孙晓梅代解杰	《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心	2017	0	在线阅读下载PDF 职称材料